SAXSdb — 1d5f

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E6AP HECT CATALYTIC DOMAIN, E3 LIGASE

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 495–852 链 B； UniProt 495–852 链 C； UniProt 495–852	未记录	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG1500, AMMONIUM ACETATE,SODIUM CHLORIDE, HEPES-NA, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.80 Å R-free 0.283

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1D5F	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1C4Z STRUCTURE OF AN E6AP-UBCH7 COMPLEX: INSIGHTS INTO THE UBIQUITINATION PATHWAY 提交 1999-10-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 518–875（358 aa）片段：HECT CATALYTIC DOMAIN 链 B 518–875（358 aa）片段：HECT CATALYTIC DOMAIN 链 C 518–875（358 aa）片段：HECT CATALYTIC DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG1500, MAGNESIUM CHLORIDE, MES-NA, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.60 Å R-free 0.290
1EQX SOLUTION STRUCTURE DETERMINATION AND MUTATIONAL ANALYSIS OF THE PAPILLOMAVIRUS E6-INTERACTING PEPTIDE OF E6AP 提交 2000-04-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 401–418（18 aa）片段：E6-INTERACTING PEPTIDE	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.2；288 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM Na3PO4；压力 ambient NMR样品组成 2 mM E6ap; 10 mM phosphate buffer; 40% TFE, 60% H2O \| 40% TFE, 60% H2O	分辨率未提供
4GIZ Crystal structure of full-length human papillomavirus oncoprotein E6 in complex with LXXLL peptide of ubiquitin ligase E6AP at 2.55 A resolution 提交 2012-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 403–414（12 aa）片段：unp residues 27-392/403-414	突变：D83A,K84A,K240A,E360A,D364A,K363A	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；290 K；10% peg8000, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K	分辨率 2.55 Å R-free 0.196
4GIZ Crystal structure of full-length human papillomavirus oncoprotein E6 in complex with LXXLL peptide of ubiquitin ligase E6AP at 2.55 A resolution 提交 2012-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 403–414（12 aa）片段：unp residues 27-392/403-414	突变：D83A,K84A,K240A,E360A,D364A,K363A	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；290 K；10% peg8000, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K	分辨率 2.55 Å R-free 0.196
6SJV Structure of HPV18 E6 oncoprotein in complex with mutant E6AP LxxLL motif 提交 2019-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 403–417（15 aa）	突变：;K84A,K240A,E360A,K363A,D364A,F1049R,L2386F,E2393R,K84A,K240A,E360A,K363A,D364A,F1049R,L2386F,E2393R,K84A,K240A,E360A,K363A,D364A,F1049R,L2386F,E2393R ;	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；298 K；Sodium Cacodylate 100 mM pH 6.5, PEG 8000 5%, 2-methyl-2,4-pentanediol 40%	分辨率 2.03 Å R-free 0.242
6SLM Crystal structure of full-length HPV31 E6 oncoprotein in complex with LXXLL peptide of ubiquitin ligase E6AP 提交 2019-08-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 403–417（15 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200mM tri-lithium citrate, 20% PEG 33350 protein concentration: 30mg/ml cryo condition: 35% glycerol	分辨率 2.80 Å R-free 0.268
6TGK Domain swapped E6AP C-lobe dimer 提交 2019-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 765–869（105 aa）	未记录	ACT ACETATE ION × 4 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.1 M CaCl 0.1 M Sodiumacetat 30% PEG400	分辨率 1.30 Å R-free 0.207
6U19 Solution Structure of the RAZUL domain from 26S proteasome subunit hRpn10/S5a complexed with the AZUL domain from E3 ligase E6AP/UBE3A 提交 2019-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–87（64 aa）片段：UNP Residues 24-87	未记录	ZN ZINC ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-35% 2H] 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 (305-377), 0.75 mM Ubiquitin-protein ligase E3A (24-87), 10 mM MOPS, 50 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 10 uM zinc sulphate, 0.1 % sodium azide, 1 mM pefabloc, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-35% 2H] 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 (305-377), 0.75 mM Ubiquitin-protein ligase E3A (24-87), 10 mM MOPS, 50 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 10 uM zinc sulphate, 0.1 % sodium azide, 1 mM pefabloc, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin-protein ligase E3A (24-87), 0.75 mM 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 (305-377), 10 mM MOPS, 50 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 10 uM zinc sulphate, 0.1 % sodium azide, 1 mM pefabloc, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin-protein ligase E3A (24-87), 0.75 mM 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 (305-377), 10 mM MOPS, 50 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 10 uM zinc sulphate, 0.1 % sodium azide, 1 mM pefabloc, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
7QPB Catalytic C-lobe of the HECT-type ubiquitin ligase E6AP in complex with a hybrid foldamer-peptide macrocycle 提交 2022-01-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 741–852（112 aa）链 C 741–852（112 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；12% PEG 8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1 M calcium acetate pH 5.5	分辨率 2.34 Å R-free 0.263
7QPB Catalytic C-lobe of the HECT-type ubiquitin ligase E6AP in complex with a hybrid foldamer-peptide macrocycle 提交 2022-01-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 741–852（112 aa）链 C 741–852（112 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；12% PEG 8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1 M calcium acetate pH 5.5	分辨率 2.34 Å R-free 0.263
7QPB Catalytic C-lobe of the HECT-type ubiquitin ligase E6AP in complex with a hybrid foldamer-peptide macrocycle 提交 2022-01-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 741–852（112 aa）链 D 741–852（112 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；12% PEG 8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1 M calcium acetate pH 5.5	分辨率 2.34 Å R-free 0.263
7QPB Catalytic C-lobe of the HECT-type ubiquitin ligase E6AP in complex with a hybrid foldamer-peptide macrocycle 提交 2022-01-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 741–852（112 aa）链 D 741–852（112 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；12% PEG 8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1 M calcium acetate pH 5.5	分辨率 2.34 Å R-free 0.263
8ENP UBE3A isoform 3 AZUL 提交 2022-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–84（84 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）450；压力 1 NMR样品组成 1.7 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] UBE3A iso 3 AZUL, 10 mM MOPS, 450 mM sodium chloride, 10 mM beta-mercaptoethanol, 10 uM zinc sulfate, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
8EPT UBE3A isoform 2 AZUL domain 提交 2022-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–87（87 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）450；压力 1 NMR样品组成 1.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] UBE3A iso2 AZUL, 10 mM MOPS, 450 mM sodium chloride, 10 mM beta-mercaptoethanol, 10 uM zinc sulfate, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
8GCR HPV16 E6-E6AP-p53 complex 提交 2023-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 R 1–875（875 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
8JRN Structure of E6AP-E6 complex in Att1 state 提交 2023-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–875（875 aa）链 C 1–875（875 aa）	突变：C843A 突变：C843A	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8JRO Structure of E6AP-E6 complex in Att2 state 提交 2023-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–875（875 aa）链 C 1–875（875 aa）	突变：C843A 突变：C843A	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.01 Å
8JRP Structure of E6AP-E6 complex in Att3 state 提交 2023-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–875（875 aa）链 C 1–875（875 aa）	突变：C843A 突变：C843A	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.58 Å
8JRQ Structure of E6AP-E6 complex in Det1 state 提交 2023-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–875（875 aa）链 C 1–875（875 aa）	突变：C843A 突变：C843A	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
8JRR Structure of E6AP-E6 complex in Det2 state 提交 2023-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–875（875 aa）链 C 1–875（875 aa）	突变：T798A/D799A/C843A 突变：T798A/D799A/C843A	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.35 Å
8R1F Monomeric E6AP-E6-p53 ternary complex 提交 2023-11-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–875（875 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.67 Å
8R1G Dimeric ternary structure of E6AP-E6-p53 提交 2023-11-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–875（875 aa）链 D 1–875（875 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.99 Å
9CHT Human E3 ligase E6AP in complex with HPV16-E6 and p53 提交 2024-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–875（875 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.54 Å
9L3L Crystal structure of the C lobe of E6AP in complex with K48-linked diUb 提交 2024-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 765–872（108 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% v/v Polyethylene glycol 400	分辨率 2.59 Å R-free 0.269
9VG5 NMR Solution Structure of the Monomeric Catalytic C-terminal Lobe of the E6AP HECT E3 Ubiquitin Ligase 提交 2025-06-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 762–875（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 AMBIENT NMR样品组成 20 mM NaPi, 100 mM NaCl, 0.15 mM DSS, 5 mM DTT, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供

共 21 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	UBE3A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–358； UniProt 495–852 作者链 B； PDB构建体 1–358； UniProt 495–852 作者链 C； PDB构建体 1–358； UniProt 495–852

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1d5f
沉积日期 deposition_date	1999-10-07
结构标题 title	STRUCTURE OF E6AP: INSIGHTS INTO UBIQUITINATION PATHWAY
关键词 keywords	BILOBAL STRUCTURE, ELONGATED SHAPE, E3 LIGASE, LIGASE; LIGASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	32.97 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	31.71 Å
零角强度 I(0) i0	219956000.00
分子量 molecular_weight	121760.0 kDa
排除体积 excluded_volume	153660 Å³
包络体积 envelope_volume	194070 Å³
水化壳体积 shell_volume	49604 Å³
包络直径 envelope_diameter	103.7 Å
壳层 Rg shell_rg	39.80 Å
包络 Rg envelope_rg	31.65 Å
形状 Rg shape_rg	31.69 Å
总 Rg total_rg	32.46 Å
总原子数 total_atoms	8583
残基数 n_residues	1050
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	103.0 Å
Rg (实空间) rg_real	32.76 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.67 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.2000e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.1600e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	32.85 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	220000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8971
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	42.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.173
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.449
角度范围 angular_range	— – 0.2400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	60450000.0000
实空间数据点数 n_real_points	49
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.906; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.987; Smooth: 0.953

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d1d5fa_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.148 — Hect, E3 ligase catalytic domain
超家族 Superfamily superfamily	d.148.1 — Hect, E3 ligase catalytic domain
家族 Family family	d.148.1.1 — Hect, E3 ligase catalytic domain

结构域编号 domain_id	d1d5fb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.148 — Hect, E3 ligase catalytic domain
超家族 Superfamily superfamily	d.148.1 — Hect, E3 ligase catalytic domain
家族 Family family	d.148.1.1 — Hect, E3 ligase catalytic domain

结构域编号 domain_id	d1d5fc_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.148 — Hect, E3 ligase catalytic domain
超家族 Superfamily superfamily	d.148.1 — Hect, E3 ligase catalytic domain
家族 Family family	d.148.1.1 — Hect, E3 ligase catalytic domain

CATH v4.4 (9 domains)

结构域编号 domain_id	1d5fA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1750 — Hect, E3 ligase catalytic domain fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hect, E3 ligase catalytic domains

结构域编号 domain_id	1d5fA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	2160 — Hect, E3 ligase catalytic domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hect, E3 ligase catalytic domain

结构域编号 domain_id	1d5fA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	2410 — Hect, E3 ligase catalytic fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hect, E3 ligase catalytic domain

结构域编号 domain_id	1d5fB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1750 — Hect, E3 ligase catalytic domain fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hect, E3 ligase catalytic domains

结构域编号 domain_id	1d5fB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	2160 — Hect, E3 ligase catalytic domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hect, E3 ligase catalytic domain

结构域编号 domain_id	1d5fB03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	2410 — Hect, E3 ligase catalytic fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hect, E3 ligase catalytic domain

结构域编号 domain_id	1d5fC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1750 — Hect, E3 ligase catalytic domain fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hect, E3 ligase catalytic domains

结构域编号 domain_id	1d5fC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	2160 — Hect, E3 ligase catalytic domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hect, E3 ligase catalytic domain

结构域编号 domain_id	1d5fC03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	2410 — Hect, E3 ligase catalytic fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hect, E3 ligase catalytic domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	101.500 Å
晶胞边长 b length_b	113.700 Å
晶胞边长 c length_c	125.200 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	15.000 Å
R 因子 r_factor	0.2280
R_work r_work	0.2300
R_free r_free	0.2830

描述 description	E6AP HECT CATALYTIC DOMAIN, E3 LIGASE
分子量 formula_weight	41540.4 kDa
EC 编号 ec_number	6.3.2.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	8583

STRUCTURE OF E6AP: INSIGHTS INTO UBIQUITINATION PATHWAY

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E6AP HECT CATALYTIC DOMAIN, E3 LIGASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (9 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

fit	/app/data/saxs_computation/d5/1d5f/1d5f.fit
pddf	/app/data/pr_computation/d5/1d5f/1d5f.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/d5/1d5f/1d5f.dat