Burkholderia cepacia
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 4 | SODIUM ION × 4 LITHIUM ION × 4 PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 4 water × 4 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | DGDA_BURCE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–432； UniProt 1–432 |
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| 条目编号 entry_id | 1dgd |
| 沉积日期 deposition_date | 1994-06-29 |
| 结构标题 title | AN ALKALI METAL ION SIZE-DEPENDENT SWITCH IN THE ACTIVE SITE STRUCTURE OF DIALKYLGLYCINE DECARBOXYLASE |
| 关键词 keywords | LYASE; LYASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 37.46 Å |
| Rg（电子密度） | 36.66 Å |
| 总 Rg | 37.18 Å |
| 原子数 | 13104 |
| 残基数 | 1724 |
| 排除体积 | 233850 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1dgda_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.67 — PLP-dependent transferase-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.67.1 — PLP-dependent transferases |
| 家族 Family family | c.67.1.4 — GABA-aminotransferase-like |
| 结构域编号 domain_id | 1dgdA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 90 — Alpha-Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Aspartate Aminotransferase, domain 1 |
| 结构域编号 domain_id | 1dgdA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 640 — Aspartate Aminotransferase; domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) |