1ez9

STRUCTURE OF MALTOTETRAITOL BOUND TO OPEN-FORM MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN IN P1 CRYSTAL FORM

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 103.3 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合单体蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 27–396	未记录	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-D-glucose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；298 K；PEG 3350, MES, sodium azide, maltotetraitol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.235
2	其他组合单体蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 27–396	未记录	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-D-glucose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；298 K；PEG 3350, MES, sodium azide, maltotetraitol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1EZ9	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1A7L DOMINANT B-CELL EPITOPE FROM THE PRES2 REGION OF HEPATITIS B VIRUS IN THE FORM OF AN INSERTED PEPTIDE SEGMENT IN MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN 提交 1998-03-16	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–389（363 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；PROTEIN CONCENTRATION 3.0MG/ML, BUFFER 0.1M TRIS-HCL PH 8.5 WITH 0.2 M MGCL2, 1 MM MALTOSE, 26% PEG 4000.	分辨率 2.90 Å R-free 0.286
1A7L DOMINANT B-CELL EPITOPE FROM THE PRES2 REGION OF HEPATITIS B VIRUS IN THE FORM OF AN INSERTED PEPTIDE SEGMENT IN MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN 提交 1998-03-16	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–389（363 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；PROTEIN CONCENTRATION 3.0MG/ML, BUFFER 0.1M TRIS-HCL PH 8.5 WITH 0.2 M MGCL2, 1 MM MALTOSE, 26% PEG 4000.	分辨率 2.90 Å R-free 0.286
1A7L DOMINANT B-CELL EPITOPE FROM THE PRES2 REGION OF HEPATITIS B VIRUS IN THE FORM OF AN INSERTED PEPTIDE SEGMENT IN MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN 提交 1998-03-16	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 27–389（363 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；PROTEIN CONCENTRATION 3.0MG/ML, BUFFER 0.1M TRIS-HCL PH 8.5 WITH 0.2 M MGCL2, 1 MM MALTOSE, 26% PEG 4000.	分辨率 2.90 Å R-free 0.286
1A7L DOMINANT B-CELL EPITOPE FROM THE PRES2 REGION OF HEPATITIS B VIRUS IN THE FORM OF AN INSERTED PEPTIDE SEGMENT IN MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN 提交 1998-03-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 27–389（363 aa）链 B 27–389（363 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；PROTEIN CONCENTRATION 3.0MG/ML, BUFFER 0.1M TRIS-HCL PH 8.5 WITH 0.2 M MGCL2, 1 MM MALTOSE, 26% PEG 4000.	分辨率 2.90 Å R-free 0.286
1ANF MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN WITH BOUND MALTOSE 提交 1997-06-25	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.2；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 18% PEG 8000, 10 MM CITRATE, PH 6.2	分辨率 1.67 Å
1DMB REFINED 1.8 ANGSTROMS STRUCTURE REVEALS THE MECHANISM OF BINDING OF A CYCLIC SUGAR, BETA-CYCLODEXTRIN, TO THE MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN 提交 1993-06-10	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
1EZO GLOBAL FOLD OF MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH BETA-CYCLODEXTRIN 提交 2000-05-11	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：I28T	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；310 K；压力 ambient NMR样品组成 1.4 mM maltodextrin binding protein U-15N,13C,2H, with 1H amide and methyl on Val, Leu, and Ile(delta1) 2mM beta-cyclodextrin, 20 mM sodium phosphate pH 7.2, 3uM NaN3, 100uM EDTA. \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1EZP GLOBAL FOLD OF MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH BETA-CYCLODEXTRIN USING PEPTIDE ORIENTATIONS FROM DIPOLAR COUPLINGS 提交 2000-05-11	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：I28T	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；310 K；压力 ambient NMR测量条件 pH 7.2；310 K；压力 ambient NMR样品组成 1.4 mM maltodextrin binding protein U-15N,13C,2H, with 1H amide and methyl on Val, Leu, and Ile(delta1) 2mM beta-cyclodextrin, 20 mM sodium phosphate pH 7.2, 3uM NaN3, 100uM EDTA. \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.4 mM maltodextrin binding protein U-15N,13C,2H, with 1H amide and methyl on Val, Leu, and Ile(delta1) 2mM beta-cyclodextrin, 20 mM sodium phosphate pH 7.2, 3uM NaN3, 100uM EDTA. ~19mg/ml pf1 bacteriophage \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1FQA STRUCTURE OF MALTOTETRAITOL BOUND TO OPEN-FORM MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN IN P2(1)CRYSTAL FORM 提交 2000-09-04	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；273 K；PEG 3350, NaN3, MES, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.215
1FQB STRUCTURE OF MALTOTRIOTOL BOUND TO OPEN-FORM MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN IN P2(1)CRYSTAL FORM 提交 2000-09-04	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；273 K；PEG 3350, NaN3, MES, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K	分辨率 1.90 Å R-free 0.218
1FQC CRYSTAL STRUCTURE OF MALTOTRIOTOL BOUND TO CLOSED-FORM MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN 提交 2000-09-04	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；PEG 6000, Mes, NaN3, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.246
1FQD CRYSTAL STRUCTURE OF MALTOTETRAITOL BOUND TO CLOSED-FORM MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN 提交 2000-09-04	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；PEG 6000, Mes, NaN3, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.244
1IUD MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN INSERTION/DELETION MUTANT WITH AN INSERTED B-CELL EPITOPE FROM THE PRES2 REGION OF HEPATITIS B VIRUS 提交 1996-05-29	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：INSERTED B-CELL EPITOPE FROM THE PRES2 REGION OF HEPATITIS B VIRUS	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å R-free 0.281
1JVX Maltodextrin-binding protein variant D207C/A301GS/P316C cross-linked in crystal 提交 2001-08-31	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：D207C/A301GS/P316C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；277 K；PEG 6000, sodium MES, maltose, sodium azide, beta-mercaptoethanol, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.304
1JVY Maltodextrin-binding protein variant D207C/A301GS/P316C with beta-mercaptoethanol mixed disulfides 提交 2001-08-31	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：D207C/A301GS/P316C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；277 K；PEG 6000, sodium MES, maltose, sodium azide, beta-mercaptoethanol, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.90 Å R-free 0.273
1JW4 Structure of ligand-free maltodextrin-binding protein 提交 2001-09-02	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；298 K；PEG 20k, Mes, sodium azide, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.00 Å R-free 0.260
1JW5 Structure of Maltose Bound to Open-form Maltodextrin-binding Protein in P1 Crystal 提交 2001-09-02	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；PEG 20k, Mes, sodium azide, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.00 Å R-free 0.253
1LAX CRYSTAL STRUCTURE OF MALE31, A DEFECTIVE FOLDING MUTANT OF MALTOSE-BINDING PROTEIN 提交 2002-03-29	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）片段：MALE31	突变：G32D I33P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；PEG 4000, TRIS/HCl, ISOPROPANOL, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 1.85 Å R-free 0.202
1LAX CRYSTAL STRUCTURE OF MALE31, A DEFECTIVE FOLDING MUTANT OF MALTOSE-BINDING PROTEIN 提交 2002-03-29	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 27–396（370 aa）片段：MALE31	突变：G32D I33P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；PEG 4000, TRIS/HCl, ISOPROPANOL, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 1.85 Å R-free 0.202
1LLS CRYSTAL STRUCTURE OF UNLIGANDED MALTOSE BINDING PROTEIN WITH XENON 提交 2002-04-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	未记录	XE XENON × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；298 K；10 mM Sodium Citrate, 23% PEG 8000, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.226
1MDP REFINED STRUCTURES OF TWO INSERTION(SLASH)DELETION MUTANTS PROBE FUNCTION OF THE MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN 提交 1994-08-10	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 1 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å
1MDP REFINED STRUCTURES OF TWO INSERTION(SLASH)DELETION MUTANTS PROBE FUNCTION OF THE MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN 提交 1994-08-10	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 2 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å
1MDQ REFINED STRUCTURES OF TWO INSERTION(SLASH)DELETION MUTANTS PROBE FUNCTION OF THE MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN 提交 1994-08-10	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
1MG1 HTLV-1 GP21 ECTODOMAIN/MALTOSE-BINDING PROTEIN CHIMERA 提交 1999-03-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 31–387（357 aa）片段：GP21 ECTODOMAIN (GP62 RESIDUES 338-425)	未记录	CL CHLORIDE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.7；pH 4.7	分辨率 2.50 Å R-free 0.305
1MH3 maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form I 提交 2002-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	突变：E359A, K362A, D363A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；amonium sulfate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.262
1MH4 maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form II 提交 2002-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	突变：E359A, K362A, D363A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；PEG 6000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.293
1MPB MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN (MALTOSE-BINDING PROTEIN) MUTANT, WITH ARGININE REPLACING TRYPTOPHAN AT POSITION 230 (TRP-230-ARG) 提交 1995-07-25	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：W230R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1MPC MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN (MALTOSE-BINDING PROTEIN) MUTANT, WITH ARGININE REPLACING TRYPTOPHAN AT POSITION 230 (TRP-230-ARG) 提交 1995-07-25	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：W230R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å
1MPD MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN (MALTOSE-BINDING PROTEIN) MUTANT, WITH ARGININE REPLACING TRYPTOPHAN AT POSITION 230 (TRP-230-ARG), COMPLEXED WITH MALTOSE 提交 1995-07-25	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：W230R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å
1N3W Engineered High-Affinity Maltose-Binding Protein 提交 2002-10-29	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：Deletion of residues 172,173,175,176	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290 K；PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.60 Å R-free 0.295
1N3X Ligand-free High-Affinity Maltose-Binding Protein 提交 2002-10-29	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：Deletion of residues 172,173,175,176.	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290 K；PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.50 Å R-free 0.241
1NL5 Engineered High-affinity Maltose-Binding Protein 提交 2003-01-06	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：M321A Q325A, deletion of residues 172,173,175,176	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；PEG 3350, Zinc Chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K	分辨率 2.10 Å R-free 0.290
1NMU MBP-L30 提交 2003-01-10	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Sodium Citrate, Tris, Sodium Chloride, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.31 Å R-free 0.254
1NMU MBP-L30 提交 2003-01-10	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 27–392（366 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Sodium Citrate, Tris, Sodium Chloride, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.31 Å R-free 0.254
1OMP CRYSTALLOGRAPHIC EVIDENCE OF A LARGE LIGAND-INDUCED HINGE-TWIST MOTION BETWEEN THE TWO DOMAINS OF THE MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN INVOLVED IN ACTIVE TRANSPORT AND CHEMOTAXIS 提交 1992-09-14	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
1PEB LIGAND-FREE HIGH-AFFINITY MALTOSE-BINDING PROTEIN 提交 2003-05-21	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：M321A, Q325A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；312 K；PEG 3500, cacodylic acid, zinc acetate, sodium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 312K	分辨率 2.60 Å R-free 0.242
1R6Z The Crystal Structure of the Argonaute2 PAZ domain (as a MBP fusion) 提交 2003-10-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 27–392（366 aa）片段：MBP (residues 28-392) fused with Argonaute2 PAZ domain (residues 591-726) 链 P 27–392（366 aa）片段：MBP (residues 28-392) fused with Argonaute2 PAZ domain (residues 591-726) 链 Z 27–392（366 aa）片段：MBP (residues 28-392) fused with Argonaute2 PAZ domain (residues 591-726)	未记录	NI NICKEL (II) ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；PEG2KMME, NiCl2, TrisHCl, NaF, meso-erythritol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.80 Å R-free 0.281
1R6Z The Crystal Structure of the Argonaute2 PAZ domain (as a MBP fusion) 提交 2003-10-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 P 27–392（366 aa）片段：MBP (residues 28-392) fused with Argonaute2 PAZ domain (residues 591-726)	未记录	NI NICKEL (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；PEG2KMME, NiCl2, TrisHCl, NaF, meso-erythritol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.80 Å R-free 0.281
1R6Z The Crystal Structure of the Argonaute2 PAZ domain (as a MBP fusion) 提交 2003-10-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）片段：MBP (residues 28-392) fused with Argonaute2 PAZ domain (residues 591-726)	未记录	NI NICKEL (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；PEG2KMME, NiCl2, TrisHCl, NaF, meso-erythritol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.80 Å R-free 0.281
1R6Z The Crystal Structure of the Argonaute2 PAZ domain (as a MBP fusion) 提交 2003-10-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 Z 27–392（366 aa）片段：MBP (residues 28-392) fused with Argonaute2 PAZ domain (residues 591-726)	未记录	NI NICKEL (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；PEG2KMME, NiCl2, TrisHCl, NaF, meso-erythritol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.80 Å R-free 0.281
1SVX Crystal structure of a designed selected Ankyrin Repeat protein in complex with the Maltose Binding Protein 提交 2004-03-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 29–392（364 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 6000, 0.1M Tris, 0.1M NaCl, pH 8-9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.24 Å R-free 0.249
1T0K Joint X-ray and NMR Refinement of Yeast L30e-mRNA complex 提交 2004-04-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；Lithium Sulfate, Sodium Cacodylate, Magnesium Chloride, Jeffamine, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 3.24 Å R-free 0.320
1Y4C Designed Helical Protein fusion MBP 提交 2004-11-30	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.90 Å R-free 0.225
1YTV Maltose-binding protein fusion to a C-terminal fragment of the V1a vasopressin receptor 提交 2005-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 27–392（366 aa）片段：c-terminal residues 27-392 链 B 27–392（366 aa）片段：c-terminal residues 27-392	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.2M Ammonium sulfate, 25%(v/v)PEG 400 and 25%(v/v) glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.80 Å R-free 0.225
1ZIU Crystal Structure of nickel-bound engineered Maltose Binding Protein 提交 2005-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）片段：residues 27-396	突变：A63H, R66H, E111M, Y155E, W340E	NI NICKEL (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 2000 MME, sodium acetate, nickel chloride, Tris-HCl, sodium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.243
1ZJL Crystal structure of zinc-bound engineered maltose binding protein 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）片段：residues 27-396	突变：A63H, R66H, E111M, Y155E, W340E	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 2000 MME, sodium acetate, zinc acetate, HEPES, sodium chloride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.232
1ZKB Zinc-free Engineered maltose binding protein 提交 2005-05-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）片段：RESIDUES 27-396	突变：A66H, R63H, E111M, Y155E, W340E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 2000 MME, sodium acetate, Tris-HcL, sodium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.285
1ZMG Crystal structure of copper-bound engineered maltose binding protein 提交 2005-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）片段：RESIDUES 27-396	突变：A63H, R66H, E111M, Y155E, W340E	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 2000 MME, copper sulphate, sodium acetate, Tris-HCl, sodium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.268
3MBP MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN WITH BOUND MALTOTRIOSE 提交 1997-06-25	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.2；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 18% PEG 8000, 10 MM CITRATE, PH 6.2	分辨率 1.70 Å
4MBP MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN WITH BOUND MALTETROSE 提交 1997-08-17	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.2；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 18% PEG 8000, 10 MM CITRATE, PH 6.2	分辨率 1.70 Å

共 41 个其他 PDB 条目、50 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MALE_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–370； UniProt 27–396 作者链 B； PDB构建体 1–370； UniProt 27–396

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ez9
沉积日期 deposition_date	2000-05-10
结构标题 title	STRUCTURE OF MALTOTETRAITOL BOUND TO OPEN-FORM MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN IN P1 CRYSTAL FORM
关键词 keywords	protein-carbohydrate complex, SUGAR BINDING PROTEIN; SUGAR BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	31.44 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	30.80 Å
零角强度 I(0) i0	101485000.00
分子量 molecular_weight	82738.0 kDa
排除体积 excluded_volume	104700 Å³
包络体积 envelope_volume	126890 Å³
水化壳体积 shell_volume	34996 Å³
包络直径 envelope_diameter	111.3 Å
壳层 Rg shell_rg	37.21 Å
包络 Rg envelope_rg	30.54 Å
形状 Rg shape_rg	30.77 Å
总 Rg total_rg	31.48 Å
总原子数 total_atoms	5846
残基数 n_residues	740
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	103.3 Å
Rg (实空间) rg_real	31.49 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.66 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0150e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.6190e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	31.47 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	101500000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8929
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	33.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.349
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.466
角度范围 angular_range	— – 0.2500 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha	46530000.0000
实空间数据点数 n_real_points	51
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.895; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.981; Smooth: 0.937

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
分子量 formula_weight	40753.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	6609

KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-D-glucose
分子量 formula_weight	666.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	763

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1ez9a_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamily	c.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family family	c.94.1.1 — Phosphate binding protein-like

结构域编号 domain_id	d1ez9b_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamily	c.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family family	c.94.1.1 — Phosphate binding protein-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1ez9A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Periplasmic binding protein-like II

结构域编号 domain_id	1ez9A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Periplasmic binding protein-like II

结构域编号 domain_id	1ez9B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Periplasmic binding protein-like II

结构域编号 domain_id	1ez9B02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Periplasmic binding protein-like II

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	51.745 Å
晶胞边长 b length_b	57.900 Å
晶胞边长 c length_c	64.594 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	89.31 °
晶胞夹角 β angle_beta	81.78 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	71.97 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	15.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1920
R_free r_free	0.2350

fit	/app/data/saxs_computation/ez/1ez9/1ez9.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ez/1ez9/1ez9.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ez/1ez9/1ez9.dat