1fbi

CRYSTAL STRUCTURE OF A CROSS-REACTION COMPLEX BETWEEN FAB F9.13.7 AND GUINEA-FOWL LYSOZYME

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 209.0 Å Quality: REASONABLE

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

IGG1 F9.13.7 FAB (HEAVY CHAIN)

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 1–99	未记录	IGG1 F9.13.7 FAB (LIGHT CHAIN) × 1 GUINEA FOWL LYSOZYME × 1 （P00704）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 3.00 Å
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 Q； UniProt 1–99	未记录	IGG1 F9.13.7 FAB (LIGHT CHAIN) × 1 GUINEA FOWL LYSOZYME × 1 （P00704）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 3.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1FBI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AI1 HIV-1 V3 LOOP MIMIC 提交 1996-11-06	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–100（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.80 Å
1CLO ANTI-CARCINOEMBRYONIC ANTIGEN MONOCLONAL ANTIBODY A5B7 提交 1996-05-01	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–101（101 aa）片段：ANTIGEN BINDING FRAGMENT, FAB	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å
1DBA THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF AN ANTI-STEROID FAB' AND PROGESTERONE-FAB' COMPLEX 提交 1992-11-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–100（100 aa）	未记录	EOH ETHANOL × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å
1DBB THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF AN ANTI-STEROID FAB' AND PROGESTERONE-FAB' COMPLEX 提交 1992-11-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–100（100 aa）	未记录	STR PROGESTERONE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1DBJ MOLECULAR BASIS OF CROSS-REACTIVITY AND THE LIMITS OF ANTIBODY-ANTIGEN COMPLEMENTARITY 提交 1993-08-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–100（100 aa）	未记录	AE2 AETIOCHOLANOLONE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1DBK MOLECULAR BASIS OF CROSS-REACTIVITY AND THE LIMITS OF ANTIBODY-ANTIGEN COMPLEMENTARITY 提交 1993-08-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–100（100 aa）	未记录	ANO 5-BETA-ANDROSTANE-3,17-DIONE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
1DBM MOLECULAR BASIS OF CROSS-REACTIVITY AND THE LIMITS OF ANTIBODY-ANTIGEN COMPLEMENTARITY 提交 1993-08-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–100（100 aa）	未记录	SIH PROGESTERONE-11-ALPHA-OL-HEMISUCCINATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1KEL CATALYTIC ANTIBODY 28B4 FAB FRAGMENT COMPLEXED WITH HAPTEN (1-[N-4'-NITROBENZYL-N-4'-CARBOXYBUTYLAMINO] METHYLPHOSPHONIC ACID) 提交 1996-04-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–99（99 aa）片段：VARIABLE REGIONS OF LIGHT AND HEAVY CHAINS	未记录	AAH 1-[N-4'-NITROBENZYL-N-4'-CARBOXYBUTYLAMINO]METHYLPHOSPHONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.258
1KEM CATALYTIC ANTIBODY 28B4 FAB FRAGMENT 提交 1996-04-16	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–99（99 aa）片段：VARIABLE REGIONS OF LIGHT AND HEAVY CHAINS	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.288
1NTL Model of mouse Crry-Ig determined by solution scattering, curve fitting and homology modelling 提交 2003-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 98–324（227 aa）片段：Q64735 residues 83-401,P01868 residues 98-324 链 B 98–324（227 aa）片段：Q64735 residues 83-401,P01868 residues 98-324	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION SCATTERING mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 30.00 Å
1OPG OPG2 FAB FRAGMENT 提交 1995-04-28	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1T2Q The Crystal Structure of an NNA7 Fab that recognizes an N-type blood group antigen 提交 2004-04-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–102（102 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG MME 5K, ammonium sulfate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.83 Å R-free 0.247
1YED STRUCTURE OF A CATALYTIC ANTIBODY IGG2A FAB FRAGMENT (D2.4) 提交 1997-04-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–102（102 aa）	未记录	PNB 4-NITRO-BENZYLPHOSPHONOBUTANOYL-GLYCINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 3.10 Å R-free 0.260
1YED STRUCTURE OF A CATALYTIC ANTIBODY IGG2A FAB FRAGMENT (D2.4) 提交 1997-04-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–102（102 aa）	未记录	PNB 4-NITRO-BENZYLPHOSPHONOBUTANOYL-GLYCINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 3.10 Å R-free 0.260
2ATY Complement receptor chimaeric conjugate CR2-Ig 提交 2005-08-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 98–324（227 aa）链 B 98–324（227 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION SCATTERING mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
2DBL MOLECULAR BASIS OF CROSS-REACTIVITY AND THE LIMITS OF ANTIBODY-ANTIGEN COMPLEMENTARITY 提交 1994-02-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–100（100 aa）	未记录	S5H 5-ALPHA-PREGNANE-3-BETA-OL-HEMISUCCINATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å
2DBL MOLECULAR BASIS OF CROSS-REACTIVITY AND THE LIMITS OF ANTIBODY-ANTIGEN COMPLEMENTARITY 提交 1994-02-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 H 1–100（100 aa）	未记录	S5H 5-ALPHA-PREGNANE-3-BETA-OL-HEMISUCCINATE × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å

共 15 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GC1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 123–221； UniProt 1–99 作者链 Q； PDB构建体 123–221； UniProt 1–99

GUINEA FOWL LYSOZYME

Numida meleagris

UniProt P00704

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 X； UniProt 1–129	未记录	IGG1 F9.13.7 FAB (LIGHT CHAIN) × 1 IGG1 F9.13.7 FAB (HEAVY CHAIN) × 1 （P01868）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 3.00 Å
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 Y； UniProt 1–129	未记录	IGG1 F9.13.7 FAB (LIGHT CHAIN) × 1 IGG1 F9.13.7 FAB (HEAVY CHAIN) × 1 （P01868）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 3.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1FBI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1HHL THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF PHEASANT AND GUINEA-FOWL EGG LYSOZYMES 提交 1993-05-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–129（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LYSC_NUMME
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–129； UniProt 1–129 作者链 Y； PDB构建体 1–129； UniProt 1–129

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1fbi
沉积日期 deposition_date	1995-01-19
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF A CROSS-REACTION COMPLEX BETWEEN FAB F9.13.7 AND GUINEA-FOWL LYSOZYME
关键词 keywords	COMPLEX (ANTIBODY-ANTIGEN), COMPLEX (ANTIBODY-ANTIGEN) complex; COMPLEX (ANTIBODY/ANTIGEN)
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	70.93 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	71.94 Å
零角强度 I(0) i0	217598000.00
分子量 molecular_weight	121200.0 kDa
排除体积 excluded_volume	150070 Å³
包络体积 envelope_volume	255330 Å³
水化壳体积 shell_volume	30227 Å³
包络直径 envelope_diameter	228.4 Å
壳层 Rg shell_rg	67.96 Å
包络 Rg envelope_rg	69.44 Å
形状 Rg shape_rg	71.91 Å
总 Rg total_rg	71.99 Å
总原子数 total_atoms	8521
残基数 n_residues	1128
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	209.0 Å
Rg (实空间) rg_real	71.60 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.93 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.1740e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.4700e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	67.62 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	215900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.5649
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	28.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.352
峰度 Kurtosis kurtosis	-1.129
角度范围 angular_range	— – 0.1100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0014
最高正则化参数 α highest_alpha	3980000.0000
实空间数据点数 n_real_points	23
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.075; Stabil: 0.998; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.056; Smooth: 0.063

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	IGG1 F9.13.7 FAB (LIGHT CHAIN)
分子量 formula_weight	23833.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,P
原子数 atom_count	8521

DIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISNYLNWYQKKPDGTVKLLIYYTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTIRNLEQEDIATYFCQQGYTLPYTFGGGTKLEIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	IGG1 F9.13.7 FAB (HEAVY CHAIN)
分子量 formula_weight	23634.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,Q

QVQLQQPGAELVKPGASVKLSCKASGYTFTSYWMHWVKQGPGQGLEWIGEIDPSDSYPNYNEKFKGKATLTVDKSSSTAYMQLSSLTSEDSAVYYCASLYYYGTSYGVLDYWGQGTSVTVSSAKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKGYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSPRPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVP

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	GUINEA FOWL LYSOZYME
分子量 formula_weight	14329.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.17
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,Y

KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNSQATNRNTDGSTDYGVLQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALQSSDITATANCAKKIVSDGNGMNAWVAWRKHCKGTDVRVWIKGCRL

来源 Source

来源生物 organism	Numida meleagris
通用名 common_name	helmeted guineafowl
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8996

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 22 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

结构域编号 domain_id	d1fbih1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1fbih2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1fbih3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1fbil1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1fbil2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1fbip1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1fbip2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1fbiq1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1fbiq2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1fbiq3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1fbix_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.2 — Lysozyme-like
超家族 Superfamily superfamily	d.2.1 — Lysozyme-like
家族 Family family	d.2.1.2 — C-type lysozyme

结构域编号 domain_id	d1fbiy_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.2 — Lysozyme-like
超家族 Superfamily superfamily	d.2.1 — Lysozyme-like
家族 Family family	d.2.1.2 — C-type lysozyme

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id	1fbiH01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1fbiH02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1fbiL01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1fbiL02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1fbiP01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1fbiP02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1fbiQ01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1fbiQ02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1fbiX00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	530 — Lysozyme
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1fbiY00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	530 — Lysozyme
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

▶

8. 引用文献 (3)

▶

晶胞边长 a length_a	83.700 Å
晶胞边长 b length_b	195.500 Å
晶胞边长 c length_c	50.200 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	108.50 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	7.000 Å
R 因子 r_factor	0.1900
R_work r_work	0.1900
R_free r_free	—

fit	/app/data/saxs_computation/fb/1fbi/1fbi.fit
pddf	/app/data/pr_computation/fb/1fbi/1fbi.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/fb/1fbi/1fbi.dat

CRYSTAL STRUCTURE OF A CROSS-REACTION COMPLEX BETWEEN FAB F9.13.7 AND GUINEA-FOWL LYSOZYME

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

IGG1 F9.13.7 FAB (HEAVY CHAIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

GUINEA FOWL LYSOZYME

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 22 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (10 domains)

8. 引用文献 (3)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)