1hcp

DNA RECOGNITION BY THE OESTROGEN RECEPTOR: FROM SOLUTION TO THE CRYSTAL

Method: SOLUTION NMR Dmax: 49.1 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HUMAN/CHICKEN ESTROGEN RECEPTOR

Homo sapiens

UniProt P03372

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 176–254 未记录 ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 434 个其他 PDB 条目、522 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ESR1_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–76; UniProt 176–254

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1hcp

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1hcp
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1hcp
沉积日期 deposition_date1993-11-23
结构标题 titleDNA RECOGNITION BY THE OESTROGEN RECEPTOR: FROM SOLUTION TO THE CRYSTAL
关键词 keywordsTRANSCRIPTION REGULATION; TRANSCRIPTION REGULATION
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier12.39
回转半径 Rg (电子) rg_electron12.60
零角强度 I(0) i01226040000.00
分子量 molecular_weight265000.0 kDa
排除体积 excluded_volume317860 ų
包络体积 envelope_volume25134 ų
水化壳体积 shell_volume13689 ų
包络直径 envelope_diameter54.2
壳层 Rg shell_rg21.61
包络 Rg envelope_rg16.69
形状 Rg shape_rg12.60
总 Rg total_rg12.72
总原子数 total_atoms35129
残基数 n_residues2250
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax49.1
Rg (实空间) rg_real12.44
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.52
I(0) (实空间) i0_real1.2260e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.5550e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal12.44
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1226000000.0000
解质量估计 total_estimate0.7672
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary13.7
偏度 Skewness skewness0.542
峰度 Kurtosis kurtosis0.332
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha230000.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.443; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.647; Smooth: 0.993

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1hcpa_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.39 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain)
超家族 Superfamily superfamilyg.39.1 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain)
家族 Family familyg.39.1.2 — Nuclear receptor

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1hcpA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Erythroid Transcription Factor GATA-1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Erythroid Transcription Factor GATA-1, subunit A

8. 引用文献 (3)

9. 文件与曲线 (10)