1hgd

BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 142.8 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HEMAGGLUTININ, CHAIN HA1

Influenza A virus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合同源多聚体蛋白 × 6 其他聚合物 3 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 17–344 链 B； UniProt 346–520 链 C； UniProt 17–344 链 D； UniProt 346–520 链 E； UniProt 17–344 链 F； UniProt 346–520	未记录	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1HGD	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1EO8 INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ COMPLEXED WITH A NEUTRALIZING ANTIBODY 提交 2000-03-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 17–344（328 aa）片段：BROMELAIN RELEASED FRAGMENT 链 B 346–520（175 aa）片段：BROMELAIN RELEASED FRAGMENT	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；28%(w:v) PEG 600, 100 mM Sodium Phosphate, 150 mM NaCl, 0.05% NaN3 , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.298
1FYT CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX OF A HUMAN ALPHA/BETA-T CELL RECEPTOR, INFLUENZA HA ANTIGEN PEPTIDE, AND MHC CLASS II MOLECULE, HLA-DR1 提交 2000-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 322–334（13 aa）片段：ANTIGEN PEPTIDE	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；11% PEG 8000, 1 M NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 18K	分辨率 2.60 Å R-free 0.255
1HA0 HEMAGGLUTININ PRECURSOR HA0 提交 1998-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 25–518（494 aa）片段：HA1, HA2	突变：R329Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.50	分辨率 2.80 Å R-free 0.302
1HGE BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1991-11-01	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–344（328 aa）链 B 346–520（175 aa）链 C 17–344（328 aa）链 D 346–520（175 aa）链 E 17–344（328 aa）链 F 346–520（175 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 MNA 2-O-methyl-5-N-acetyl-alpha-D-neuraminic acid × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å
1HGF BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1991-11-01	结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–344（328 aa）链 B 346–520（175 aa）链 C 17–344（328 aa）链 D 346–520（175 aa）链 E 17–344（328 aa）链 F 346–520（175 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
1HGG BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1991-11-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–344（328 aa）链 B 346–520（175 aa）链 C 17–344（328 aa）链 D 346–520（175 aa）链 E 17–344（328 aa）链 F 346–520（175 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å
1HGH BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1991-11-01	配体/离子不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–344（328 aa）链 B 346–520（175 aa）链 C 17–344（328 aa）链 D 346–520（175 aa）链 E 17–344（328 aa）链 F 346–520（175 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 MNA 2-O-methyl-5-N-acetyl-alpha-D-neuraminic acid × 6	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1HGI BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1991-11-01	配体/离子不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–344（328 aa）链 B 346–520（175 aa）链 C 17–344（328 aa）链 D 346–520（175 aa）链 E 17–344（328 aa）链 F 346–520（175 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ANA methyl 4-O-acetyl-5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosidonic acid × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1HGJ BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1991-11-01	配体/离子不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–344（328 aa）链 B 346–520（175 aa）链 C 17–344（328 aa）链 D 346–520（175 aa）链 E 17–344（328 aa）链 F 346–520（175 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 AMN methyl 5-acetamido-9-amino-3,5,9-trideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosidonic acid × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1HTM STRUCTURE OF INFLUENZA HAEMAGGLUTININ AT THE PH OF MEMBRANE FUSION 提交 1994-11-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–43（27 aa）链 B 383–520（138 aa）链 C 17–43（27 aa）链 D 383–520（138 aa）链 E 17–43（27 aa）链 F 383–520（138 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.291
1J8H Crystal Structure of a Complex of a Human alpha/beta-T cell Receptor, Influenza HA Antigen Peptide, and MHC Class II Molecule, HLA-DR4 提交 2001-05-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 322–334（13 aa）片段：Antigen Peptide	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；13% PEG 8000, 1 M NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.40 Å R-free 0.246
1KEN INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ COMPLEXED WITH AN ANTIBODY THAT PREVENTS THE HEMAGGLUTININ LOW PH FUSOGENIC TRANSITION 提交 2001-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 B 346–520（175 aa）片段：FAB fragment of antibody 链 D 346–520（175 aa）片段：FAB fragment of antibody 链 F 346–520（175 aa）片段：FAB fragment of antibody	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；peg 20000, calcium chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.50 Å R-free 0.323
1QFU INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ COMPLEXED WITH A NEUTRALIZING ANTIBODY 提交 1999-04-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 17–344（328 aa）片段：BROMELAIN DIGESTED 链 B 346–520（175 aa）片段：BROMELAIN DIGESTED	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.284
1QU1 CRYSTAL STRUCTURE OF EHA2 (23-185) 提交 1999-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 376–530（155 aa）链 B 376–530（155 aa）链 C 376–530（155 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.4；2% PEG 4000, 30-150 MM NACL, pH 4.40	分辨率 1.90 Å R-free 0.250
1QU1 CRYSTAL STRUCTURE OF EHA2 (23-185) 提交 1999-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 376–530（155 aa）链 E 376–530（155 aa）链 F 376–530（155 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.4；2% PEG 4000, 30-150 MM NACL, pH 4.40	分辨率 1.90 Å R-free 0.250
2HMG REFINEMENT OF THE INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ BY SIMULATED ANNEALING 提交 1989-09-11	结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–344（328 aa）链 B 346–520（175 aa）链 C 17–344（328 aa）链 D 346–520（175 aa）链 E 17–344（328 aa）链 F 346–520（175 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
2VIR INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ COMPLEXED WITH A NEUTRALIZING ANTIBODY 提交 1997-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 44–325（282 aa）片段：;PROTEOLYTIC FRAGMENT "HA TOP" CONTAINING HA1 RESIDUES 28 - 328 ;	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.25 Å R-free 0.249
2VIS INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ, (ESCAPE) MUTANT WITH THR 131 REPLACED BY ILE, COMPLEXED WITH A NEUTRALIZING ANTIBODY 提交 1997-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 44–325（282 aa）片段：;PROTEOLYTIC FRAGMENT "HA TOP" CONTAINING HA1 RESIDUES 28 - 328 ;	突变：T131I	ZN ZINC ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.25 Å R-free 0.267
2VIT INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ, MUTANT WITH THR 155 REPLACED BY ILE, COMPLEXED WITH A NEUTRALIZING ANTIBODY 提交 1997-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 44–325（282 aa）片段：;PROTEOLYTIC FRAGMENT "HA TOP" CONTAINING HA1 RESIDUES 28 - 328 ;	突变：T155I	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.25 Å R-free 0.237
2VIU INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ 提交 1997-12-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–344（328 aa）链 B 346–520（175 aa）	突变：CHAIN A, T131I 突变：CHAIN A, T131I	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.242
2YPG Haemagglutinin of 1968 Human H3N2 Virus in Complex with Human Receptor Analogue LSTc 提交 2012-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–344（328 aa）链 B 346–520（175 aa）片段：HA2 OF BROMELAIN RELEASED ECTODOMAIN, RESIDUES 346-520 链 C 17–344（328 aa）链 D 346–520（175 aa）片段：HA2 OF BROMELAIN RELEASED ECTODOMAIN, RESIDUES 346-520 链 E 17–344（328 aa）链 F 346–520（175 aa）片段：HA2 OF BROMELAIN RELEASED ECTODOMAIN, RESIDUES 346-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 FLC CITRATE ANION × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1.7-2 M TRIAMMONIUM CITRATE PH 6.5	分辨率 2.85 Å R-free 0.190
3EYM Structure of Influenza Haemagglutinin in complex with an inhibitor of membrane fusion 提交 2008-10-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 25–345（321 aa）链 B 346–517（172 aa）链 C 25–345（321 aa）链 D 346–517（172 aa）链 E 25–345（321 aa）链 F 346–517（172 aa）	未记录	EYK 2-tert-butylbenzene-1,4-diol × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Ammonium citratre, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.217
3HMG REFINEMENT OF THE INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ BY SIMULATED ANNEALING 提交 1989-09-11	结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–344（328 aa）链 B 346–520（175 aa）链 C 17–344（328 aa）链 D 346–520（175 aa）链 E 17–344（328 aa）链 F 346–520（175 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å
3VUN Crystal structure of a influenza A virus (A/Aichi/2/1968 H3N2) hemagglutinin in C2 space group. 提交 2012-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–345（329 aa）链 B 346–520（175 aa）链 C 17–345（329 aa）链 D 346–520（175 aa）链 E 17–345（329 aa）链 F 346–520（175 aa）	突变：G144S, I182V 突变：E132D 突变：G144S, I182V 突变：E132D 突变：G144S, I182V 突变：E132D	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.25；293 K；0.2M imidazole (pH 7.0), 27% Jeffamine ED-2001 (pH 7.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.275
3ZTJ Structure of influenza A neutralizing antibody selected from cultures of single human plasma cells in complex with human H3 Influenza haemagglutinin. 提交 2011-07-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 17–345（329 aa）链 B 346–520（175 aa）片段：RESIDUES 346-520 链 C 17–345（329 aa）链 D 346–520（175 aa）片段：RESIDUES 346-520 链 E 17–345（329 aa）链 F 346–520（175 aa）片段：RESIDUES 346-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.41 Å R-free 0.284
4HMG REFINEMENT OF THE INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ BY SIMULATED ANNEALING 提交 1989-09-11	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–344（328 aa）链 B 346–520（175 aa）链 C 17–344（328 aa）链 D 346–520（175 aa）链 E 17–344（328 aa）链 F 346–520（175 aa）	未记录	SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
5HMG REFINEMENT OF THE INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ BY SIMULATED ANNEALING 提交 1989-09-11	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–344（328 aa）链 B 346–520（175 aa）链 C 17–344（328 aa）链 D 346–520（175 aa）链 E 17–344（328 aa）链 F 346–520（175 aa）	未记录	SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.20 Å
5Y2L Crystal structure of a group 2 HA binding antibody AF4H1K1 Fab in complex with the 1968 H3N2 pandemic (H3-AC/68) hemagglutinin 提交 2017-07-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 17–345（329 aa）链 B 346–521（176 aa）片段：UNP residues 346-521	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.19 mM CYMAL7, 0.1M HEPES pH 7.5, 40% ployethylene glycol 400	分辨率 2.90 Å R-free 0.244
6E56 Human antibody H2214 in complex with influenza hemagglutinin A/Aichi/2/1968 (X-31) (H3N2) 提交 2018-07-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 53–335（283 aa）片段：head domain (UNP residues 53-335)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291.15 K；100 mM sodium chloride, 100 mM sodium acetate, pH 5.0, 20% w/v PEG2000 MME	分辨率 2.00 Å R-free 0.214
6E56 Human antibody H2214 in complex with influenza hemagglutinin A/Aichi/2/1968 (X-31) (H3N2) 提交 2018-07-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 53–335（283 aa）片段：head domain (UNP residues 53-335)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291.15 K；100 mM sodium chloride, 100 mM sodium acetate, pH 5.0, 20% w/v PEG2000 MME	分辨率 2.00 Å R-free 0.214
6N5D Broadly protective antibodies directed to a subdominant influenza hemagglutinin epitope 提交 2018-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 53–334（282 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M sodium bromide, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.244
6N5D Broadly protective antibodies directed to a subdominant influenza hemagglutinin epitope 提交 2018-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 53–334（282 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M sodium bromide, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.244
6N5D Broadly protective antibodies directed to a subdominant influenza hemagglutinin epitope 提交 2018-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 53–334（282 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M sodium bromide, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.244
6N5E Broadly protective antibodies directed to a subdominant influenza hemagglutinin epitope 提交 2018-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 53–334（282 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES, pH 6.5, 20% w/v PEG8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.287
6N5E Broadly protective antibodies directed to a subdominant influenza hemagglutinin epitope 提交 2018-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 53–334（282 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES, pH 6.5, 20% w/v PEG8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.287
6N5E Broadly protective antibodies directed to a subdominant influenza hemagglutinin epitope 提交 2018-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 53–334（282 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES, pH 6.5, 20% w/v PEG8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.287
6XPX Human antibody S1V2-51 in complex with the influenza hemagglutinin head domain of A/Aichi/2/1968 (X-31)(H3N2) 提交 2020-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 53–335（283 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 BCN BICINE × 2 GOL GLYCEROL × 7 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291.15 K；0.3 M Magnesium chloride, 25% (w/v) PEG 2000, 15% (w/v) Glycerol, 0.1 M BICINE, pH 9.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.215
6Y5G Ectodomain of X-31 Haemagglutinin at pH 8 提交 2020-02-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 24–341（318 aa）链 B 346–517（172 aa）链 C 24–341（318 aa）链 D 346–517（172 aa）链 E 24–341（318 aa）链 F 346–517（172 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6Y5H Ectodomain of X-31 Haemagglutinin at pH 5 (State I) 提交 2020-02-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 24–341（318 aa）链 B 346–517（172 aa）链 C 24–341（318 aa）链 D 346–517（172 aa）链 E 24–341（318 aa）链 F 346–517（172 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6Y5I Dilated form 1 of X-31 Influenza Haemagglutinin at pH 5 (State II) 提交 2020-02-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 24–341（318 aa）链 B 346–517（172 aa）链 C 24–341（318 aa）链 D 346–517（172 aa）链 E 24–341（318 aa）链 F 346–517（172 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.50 Å
6Y5J Dilated form 2 of X-31 Influenza Haemagglutinin at pH 5 (State III) 提交 2020-02-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 24–341（318 aa）链 B 346–517（172 aa）链 C 24–341（318 aa）链 D 346–517（172 aa）链 E 24–341（318 aa）链 F 346–517（172 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
6Y5K Extended Intermediate form of X-31 Influenza Haemagglutinin at pH 5 (State IV) 提交 2020-02-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 24–341（318 aa）链 B 346–517（172 aa）链 C 24–341（318 aa）链 D 346–517（172 aa）链 E 24–341（318 aa）链 F 346–517（172 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6Y5L Signal Subtracted Extended Intermediate form of X-31 Influenza Haemagglutinin at pH 5 (State IV) 提交 2020-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 346–517（172 aa）链 D 346–517（172 aa）链 F 346–517（172 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7ZJ6 X-31 Hemagglutinin Precursor HA0 at pH 7.5 提交 2022-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 17–520（504 aa）链 B 17–520（504 aa）链 C 17–520（504 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4s blot	分辨率 2.60 Å
7ZJ7 X-31 Hemagglutinin Precursor HA0 at pH 4.8 提交 2022-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 17–520（504 aa）链 B 17–520（504 aa）链 C 17–520（504 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 4.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4s blot	分辨率 3.95 Å
7ZJ8 X-31 Hemagglutinin Precursor HA0 at pH 7.5 after reneutralization 提交 2022-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 17–520（504 aa）链 B 17–520（504 aa）链 C 17–520（504 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4s blot	分辨率 3.10 Å
8G5B Influenza A H3N2 X-31 Hemagglutinin in complex with FL-1061 提交 2023-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 53–335（283 aa）片段：head fragment	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8PK3 CryoEM reconstruction of hemagglutinin HK68 of Influenza A virus bound to an Affimer reagent 提交 2023-06-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 D 346–520（175 aa）链 E 346–520（175 aa）链 F 346–520（175 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 42 个其他 PDB 条目、48 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HEMA_IAAIC
Isoform	—
PDB实体	1, 2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–328； UniProt 17–344 作者链 C； PDB构建体 1–328； UniProt 17–344 作者链 E； PDB构建体 1–328； UniProt 17–344 作者链 B； PDB构建体 1–175； UniProt 346–520 作者链 D； PDB构建体 1–175； UniProt 346–520 作者链 F； PDB构建体 1–175； UniProt 346–520

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1hgd
沉积日期 deposition_date	1991-11-01
结构标题 title	BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY
关键词 keywords	INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ, Viral protein; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	42.60 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	42.12 Å
零角强度 I(0) i0	477823000.00
分子量 molecular_weight	173090.0 kDa
排除体积 excluded_volume	213960 Å³
包络体积 envelope_volume	273570 Å³
水化壳体积 shell_volume	56332 Å³
包络直径 envelope_diameter	146.1 Å
壳层 Rg shell_rg	45.23 Å
包络 Rg envelope_rg	41.90 Å
形状 Rg shape_rg	42.13 Å
总 Rg total_rg	42.25 Å
总原子数 total_atoms	15216
残基数 n_residues	1509
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	142.8 Å
Rg (实空间) rg_real	42.87 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.25 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.7780e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.2420e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	42.60 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	477700000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8252
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	42.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.506
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.454
角度范围 angular_range	— – 0.1850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	50110000.0000
实空间数据点数 n_real_points	38
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.726; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.942; Smooth: 0.602

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	HEMAGGLUTININ, CHAIN HA1
分子量 formula_weight	36165.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E
原子数 atom_count	15432

QDLPGNDNSTATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGRSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGIHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIGSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQT

来源 Source

来源生物 organism	Influenza A virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	132504

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	HEMAGGLUTININ, CHAIN HA1
分子量 formula_weight	20212.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F

GLFGAIAGFIENGWEGMIDGWYGFRHQNSEGTGQAADLKSTQAAIDQINGKLNRVIEKTNEKFHQIEKEFSEVEGRIQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALENQHTIDLTDSEMNKLFEKTRRQLRENAEEMGNGCFKIYHKCDNACIESIRNGTYDHDVYRDEALNNRFQIKG

来源 Source

来源生物 organism	Influenza A virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	132504

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	72

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d1hgda_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.19 — Viral protein domain
超家族 Superfamily superfamily	b.19.1 — Viral protein domain
家族 Family family	b.19.1.2 — Influenza hemagglutinin headpiece

结构域编号 domain_id	d1hgdb_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.3 — Stalk segment of viral fusion proteins
超家族 Superfamily superfamily	h.3.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
家族 Family family	h.3.1.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)

结构域编号 domain_id	d1hgdc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.19 — Viral protein domain
超家族 Superfamily superfamily	b.19.1 — Viral protein domain
家族 Family family	b.19.1.2 — Influenza hemagglutinin headpiece

结构域编号 domain_id	d1hgdd_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.3 — Stalk segment of viral fusion proteins
超家族 Superfamily superfamily	h.3.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
家族 Family family	h.3.1.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)

结构域编号 domain_id	d1hgde_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.19 — Viral protein domain
超家族 Superfamily superfamily	b.19.1 — Viral protein domain
家族 Family family	b.19.1.2 — Influenza hemagglutinin headpiece

结构域编号 domain_id	d1hgdf_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.3 — Stalk segment of viral fusion proteins
超家族 Superfamily superfamily	h.3.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
家族 Family family	h.3.1.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	1hgdA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain

结构域编号 domain_id	1hgdB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1hgdC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain

结构域编号 domain_id	1hgdD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1hgdE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain

结构域编号 domain_id	1hgdF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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8. 引用文献 (10)

;Binding of influenza virus hemagglutinin to analogs of its cell-surface receptor, sialic acid: analysis by proton nuclear magnetic resonance spectroscopy and X-ray crystallography. ;

Biochemistry (1992)

PMID: 1327122 · DOI: 10.1021/bi00155a013 PRIMARY

Crystallographic Detection of a Second Ligand Binding Site in Influenza Virus Hemagglutinin

Proc.Natl.Acad.Sci.USA (1992)

The Structure of a Membrane Fusion Mutant of the Influenza Virus Hemagglutinin

Embo J. (1990)

Refinement of the Influenza Virus Hemagglutinin by Simulated Annealing

J.Mol.Biol. (1990)

Structure of the Influenza Virus Hemagglutinin Complexed with its Receptor, Sialic Acid

Nature (1988)

The Refinement of the Hemagglutinin Membrane Glycoprotein of Influenza Virus

Acta Crystallogr.,Sect.B (1986)

Three-Dimensional Structure of an Antigenic Mutant of the Influenza Virus Hemagglutinin

Nature (1984)

Structure of the Hemagglutinin Membrane Glycoprotein of Influenza Virus at 3 Angstroms Resolution

Nature (1981)

;Structural Identification of the Antibody-Binding Sites of Hong Kong Influenza Hemagglutinin and Their Involvement in Antigenic Variation ;

Nature (1981)

Crystallization and X-Ray Diffraction Studies on the Hemagglutinin Glycoprotein from the Membrane of Influenza Virus

J.Mol.Biol. (1977)

▶

晶胞边长 a length_a	163.300 Å
晶胞边长 b length_b	163.300 Å
晶胞边长 c length_c	176.700 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 41
空间群编号 int_tables_number	76
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	7.000 Å
R 因子 r_factor	0.2240
R_work r_work	0.2240
R_free r_free	—

fit	/app/data/saxs_computation/hg/1hgd/1hgd.fit
pddf	/app/data/pr_computation/hg/1hgd/1hgd.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/hg/1hgd/1hgd.dat

BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HEMAGGLUTININ, CHAIN HA1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (10)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)