1hwg

1:2 COMPLEX OF HUMAN GROWTH HORMONE WITH ITS SOLUBLE BINDING PROTEIN

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 95.8 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GROWTH HORMONE

Homo sapiens

UniProt P01241

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 27–217 未记录 GROWTH HORMONE BINDING PROTEIN × 2 (P10912) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 6.5;THE PROTEIN COMPLEX WAS CRYSTALLISED AT PH 6.5 USING 45% (W/V) LISO4 WITH 2% PEG-500 DME AND SOAKED TO PH 5.5 PRIOR TO DATA COLLECTION 分辨率 2.50 Å R-free 0.287

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 7 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SOMA_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–191; UniProt 27–217

GROWTH HORMONE BINDING PROTEIN

Homo sapiens

UniProt P10912

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 19–255 链 C; UniProt 19–255 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN GROWTH HORMONE × 1 (P01241) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 6.5;THE PROTEIN COMPLEX WAS CRYSTALLISED AT PH 6.5 USING 45% (W/V) LISO4 WITH 2% PEG-500 DME AND SOAKED TO PH 5.5 PRIOR TO DATA COLLECTION 分辨率 2.50 Å R-free 0.287

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 8 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GHR_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–237; UniProt 19–255 作者链 C; PDB构建体 1–237; UniProt 19–255

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1hwg

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1hwg
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1hwg
沉积日期 deposition_date1996-11-13
结构标题 title1:2 COMPLEX OF HUMAN GROWTH HORMONE WITH ITS SOLUBLE BINDING PROTEIN
关键词 keywordsCYTOKINE, HORMONE, RECEPTOR, HEMATOPOIETIC, COMPLEX (HORMONE-RECEPTOR), COMPLEX (HORMONE-RECEPTOR) complex; COMPLEX (HORMONE/RECEPTOR)
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier28.17
回转半径 Rg (电子) rg_electron27.56
零角强度 I(0) i066332800.00
分子量 molecular_weight64409.0 kDa
排除体积 excluded_volume80689 ų
包络体积 envelope_volume98422 ų
水化壳体积 shell_volume30416 ų
包络直径 envelope_diameter100.6
壳层 Rg shell_rg34.11
包络 Rg envelope_rg27.61
形状 Rg shape_rg27.57
总 Rg total_rg28.19
总原子数 total_atoms4543
残基数 n_residues569
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax95.8
Rg (实空间) rg_real28.16
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.62
I(0) (实空间) i0_real6.6330e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.9490e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal28.17
I(0) (倒空间) i0_reciprocal66330000.0000
解质量估计 total_estimate0.6822
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary32.5
偏度 Skewness skewness0.309
峰度 Kurtosis kurtosis-0.408
角度范围 angular_range— – 0.2800 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha11180000.0000
实空间数据点数 n_real_points57
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.861; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.109; Positv: 1.000; Valcen: 0.961; Smooth: 0.992

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_idd1hwga_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamilya.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family familya.26.1.1 — Long-chain cytokines
结构域编号 domain_idd1hwgb1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.2 — Fibronectin type III
家族 Family familyb.1.2.1 — Fibronectin type III
结构域编号 domain_idd1hwgb2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.2 — Fibronectin type III
家族 Family familyb.1.2.1 — Fibronectin type III
结构域编号 domain_idd1hwgc1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.2 — Fibronectin type III
家族 Family familyb.1.2.1 — Fibronectin type III
结构域编号 domain_idd1hwgc2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.2 — Fibronectin type III
家族 Family familyb.1.2.1 — Fibronectin type III

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id1hwgA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1hwgB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1hwgB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1hwgC01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1hwgC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)