1hwh

1:1 COMPLEX OF HUMAN GROWTH HORMONE MUTANT G120R WITH ITS SOLUBLE BINDING PROTEIN

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 79.5 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GROWTH HORMONE

Homo sapiens

UniProt P01241

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 27–217 突变:G120R GROWTH HORMONE BINDING PROTEIN × 2 (P10912) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 6.75;THE PROTEIN COMPLEX WAS CRYSTALLISED FROM 1.6 M LISO4 AND 50 MM BIS TRIS AT PH 6.75 分辨率 2.90 Å R-free 0.317

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 7 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SOMA_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–191; UniProt 27–217

GROWTH HORMONE BINDING PROTEIN

Homo sapiens

UniProt P10912

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 19–255 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN GROWTH HORMONE × 2 (P01241) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 6.75;THE PROTEIN COMPLEX WAS CRYSTALLISED FROM 1.6 M LISO4 AND 50 MM BIS TRIS AT PH 6.75 分辨率 2.90 Å R-free 0.317

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 8 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GHR_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–237; UniProt 19–255

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1hwh

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1hwh
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1hwh
沉积日期 deposition_date1996-11-13
结构标题 title1:1 COMPLEX OF HUMAN GROWTH HORMONE MUTANT G120R WITH ITS SOLUBLE BINDING PROTEIN
关键词 keywordsCYTOKINE, HORMONE, RECEPTOR, HEMATOPOIETIC, COMPLEX (HORMONE-RECEPTOR), COMPLEX (HORMONE-RECEPTOR) complex; COMPLEX (HORMONE/RECEPTOR)
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier23.72
回转半径 Rg (电子) rg_electron23.13
零角强度 I(0) i030988500.00
分子量 molecular_weight43041.0 kDa
排除体积 excluded_volume53854 ų
包络体积 envelope_volume64910 ų
水化壳体积 shell_volume23916 ų
包络直径 envelope_diameter82.5
壳层 Rg shell_rg29.41
包络 Rg envelope_rg23.57
形状 Rg shape_rg23.12
总 Rg total_rg23.91
总原子数 total_atoms3034
残基数 n_residues381
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax79.5
Rg (实空间) rg_real23.71
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.43
I(0) (实空间) i0_real3.0990e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.0400e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal23.71
I(0) (倒空间) i0_reciprocal30990000.0000
解质量估计 total_estimate0.7226
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary27.3
偏度 Skewness skewness0.328
峰度 Kurtosis kurtosis-0.361
角度范围 angular_range— – 0.3350 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha10280000.0000
实空间数据点数 n_real_points65
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.857; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.286; Positv: 1.000; Valcen: 0.972; Smooth: 0.990

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1hwha_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamilya.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family familya.26.1.1 — Long-chain cytokines
结构域编号 domain_idd1hwhb1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.2 — Fibronectin type III
家族 Family familyb.1.2.1 — Fibronectin type III
结构域编号 domain_idd1hwhb2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.2 — Fibronectin type III
家族 Family familyb.1.2.1 — Fibronectin type III

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id1hwhA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1hwhB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1hwhB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)