SAXSdb — 1i1r

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

INTERLEUKIN-6 RECEPTOR BETA CHAIN

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 23–325	片段：DOMAINS 1, 2, 3 OF THE GP130 EXTRACELLULAR DOMAIN (RESIDUES 1-303)	VIRAL IL-6 × 2 （Q98823）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；MPEG 2000, sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1I1R	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BJ8 THIRD N-TERMINAL DOMAIN OF GP130, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1998-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 219–325（107 aa）片段：THIRD N-TERMINAL DOMAIN	突变：V1M, Y2D	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200 mM NACL；压力 1 NMR样品组成 WATER	分辨率未提供
1BQU CYTOKYNE-BINDING REGION OF GP130 提交 1998-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 119–333（215 aa）片段：CYTOKINE-BINDING REGION DOMAINS 链 B 119–333（215 aa）片段：CYTOKINE-BINDING REGION DOMAINS	未记录	SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；1.8-2.1M AMMONIUM SULFATE, 0.1M TRIS PH 8.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
1P9M Crystal structure of the hexameric human IL-6/IL-6 alpha receptor/gp130 complex 提交 2003-05-12	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 23–321（299 aa）片段：extracellular domains D1 - D3	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；Sodium formate, Sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.65 Å R-free 0.334
1PVH Crystal structure of leukemia inhibitory factor in complex with gp130 提交 2003-06-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 123–323（201 aa）片段：domains D2 and D3	未记录	IOD IODIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 3350, Sodium iodide, Imidazole, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.289
1PVH Crystal structure of leukemia inhibitory factor in complex with gp130 提交 2003-06-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 123–323（201 aa）片段：domains D2 and D3	未记录	IOD IODIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 3350, Sodium iodide, Imidazole, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.289
3L5H Crystal structure of the full ectodomain of human gp130: New insights into the molecular assembly of receptor complexes 提交 2009-12-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–612（589 aa）片段：ecotodomain	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6；298 K；1.5-2.0M (NH4)2SO4, 0.1M imidazole-malonate buffer, pH 6.0, EVAPORATION, temperature 298K	分辨率 3.60 Å R-free 0.335
3L5I Crystal structure of FnIII domains of human GP130 (Domains 4-6) 提交 2009-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 323–612（290 aa）片段：UNP residues 323-612	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；PEG 8000, NaCl, Tris-HCl, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.222
3L5J Crystal structure of FnIII domains of human GP130 (Domains 4-6) 提交 2009-12-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 323–610（288 aa）片段：UNP residues 323-610	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；PEG 8000, NaCl, Tris-HCl, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K	分辨率 3.04 Å R-free 0.265
3L5J Crystal structure of FnIII domains of human GP130 (Domains 4-6) 提交 2009-12-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 323–610（288 aa）片段：UNP residues 323-610	未记录	CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；PEG 8000, NaCl, Tris-HCl, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K	分辨率 3.04 Å R-free 0.265
7U7N IL-27 quaternary receptor signaling complex 提交 2022-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 23–321（299 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The grids were blotted for 3 seconds with an offset of 3.	分辨率 3.47 Å
8D6A Cryo-EM structure of human LIF signaling complex: model containing the interaction core region 提交 2022-06-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 23–619（597 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.54 Å
8D74 Cryo-EM structure of human CNTF signaling complex: model containing the interaction core region 提交 2022-06-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 23–619（597 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.03 Å
8D7R Cryo-EM structure of human CLCF1 signaling complex: model containing the interaction core region 提交 2022-06-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 23–619（597 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8D82 Cryo-EM structure of human IL-6 signaling complex in detergent: model containing full extracellular domains 提交 2022-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 23–700（678 aa）链 E 23–700（678 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.22 Å
8D85 Cryo-EM structure of human IL-27 signaling complex: model containing the interaction core region 提交 2022-06-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 23–619（597 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.81 Å
8DPS The structure of the interleukin 11 signalling complex, truncated gp130 提交 2022-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 22–324（303 aa）链 D 22–324（303 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5；TBS pH 85 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
8DPT The structure of the IL-11 signalling complex, with full-length extracellular gp130 提交 2022-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 22–612（591 aa）链 D 22–612（591 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8DPU The crystal structure of the IL-11 signalling complex 提交 2022-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 22–324（303 aa）链 D 22–324（303 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.25；293 K；180 mM magnesium chloride, 15.3% PEG 3350, 100 mM potassium sodium tartrate, 90 mM sodium HEPES pH 7.25 and 1.8% tert-butanol	分辨率 3.78 Å R-free 0.295
8DPU The crystal structure of the IL-11 signalling complex 提交 2022-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 22–324（303 aa）链 J 22–324（303 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.25；293 K；180 mM magnesium chloride, 15.3% PEG 3350, 100 mM potassium sodium tartrate, 90 mM sodium HEPES pH 7.25 and 1.8% tert-butanol	分辨率 3.78 Å R-free 0.295
8DPU The crystal structure of the IL-11 signalling complex 提交 2022-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 M 22–324（303 aa）链 P 22–324（303 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.25；293 K；180 mM magnesium chloride, 15.3% PEG 3350, 100 mM potassium sodium tartrate, 90 mM sodium HEPES pH 7.25 and 1.8% tert-butanol	分辨率 3.78 Å R-free 0.295
8UPA Structure of gp130 in complex with a de novo designed IL-6 mimetic 提交 2023-10-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 124–321（198 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.04M Potassium phosphate monobasic, 16% Polyethylene glycol 8,000, 20% Glycerol	分辨率 3.30 Å R-free 0.236
8UPA Structure of gp130 in complex with a de novo designed IL-6 mimetic 提交 2023-10-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 124–321（198 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.04M Potassium phosphate monobasic, 16% Polyethylene glycol 8,000, 20% Glycerol	分辨率 3.30 Å R-free 0.236
8V29 Cryo-EM structure of human type I OSM receptor complex: model for full extracellular assembly 提交 2023-11-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 23–619（597 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.99 Å
8V2A Cryo-EM structure of human type I OSM receptor complex: model for assembly core region 提交 2023-11-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 23–619（597 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.59 Å

共 19 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IL6RB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–303； UniProt 23–325

VIRAL IL-6

Human herpesvirus 8

UniProt Q98823

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 24–204	未记录	INTERLEUKIN-6 RECEPTOR BETA CHAIN × 2 （P40189）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；MPEG 2000, sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q98823_HHV8
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–181； UniProt 24–204

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1i1r
沉积日期 deposition_date	2001-02-02
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF A CYTOKINE/RECEPTOR COMPLEX
关键词 keywords	cytokine-receptor complex, gp130, viral IL-6, CYTOKINE; CYTOKINE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	33.96 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	34.22 Å
零角强度 I(0) i0	43761300.00
分子量 molecular_weight	53630.0 kDa
排除体积 excluded_volume	67740 Å³
包络体积 envelope_volume	92244 Å³
水化壳体积 shell_volume	25526 Å³
包络直径 envelope_diameter	119.7 Å
壳层 Rg shell_rg	35.78 Å
包络 Rg envelope_rg	34.66 Å
形状 Rg shape_rg	34.22 Å
总 Rg total_rg	34.34 Å
总原子数 total_atoms	3781
残基数 n_residues	468
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	112.8 Å
Rg (实空间) rg_real	34.27 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.09 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.3760e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.3080e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	34.08 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	43750000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8174
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	36.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.454
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.592
角度范围 angular_range	— – 0.2350 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	2745000.0000
实空间数据点数 n_real_points	48
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.779; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.529; Smooth: 0.757

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	INTERLEUKIN-6 RECEPTOR BETA CHAIN
分子量 formula_weight	34664.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4151

ELLDPCGYISPESPVVQLHSNFTAVCVLKEKCMDYFHVNANYIVWKTNHFTIPKEQYTIINRTASSVTFTDIASLNIQLTCNILTFGQLEQNVYGITIISGLPPEKPKNLSCIVNEGKKMRCEWDGGRETHLETNFTLKSEWATHKFADCKAKRDTPTSCTVDYSTVYFVNIEVWVEAENALGKVTSDHINFDPVYKVKPNPPHNLSVINSEELSSILKLTWTNPSIKSVIILKYNIQYRTKDASTWSQIPPEDTASTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIRCMKEDGKGYWSDWSEEASGITYEDR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	VIRAL IL-6
分子量 formula_weight	20857.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

LPDAPEFEKDLLIQRLNWMLWVIDECFRDLCYRTGICKGILEPAAIFHLKLPAINDTDHCGLIGFNETSCLKKLADGFFEFEVLFKFLTTEFGKSVINVDVMELLTKTLGWDIQEELNKLTKTHYSPPKFDRGLLGRLQGLKYWVRHFASFYVLSAMEKFAGQAVRVLDSIPDVTPDVHDK

来源 Source

来源生物 organism	Human herpesvirus 8
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	37296
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	370

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1i1ra1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.2 — Fibronectin type III
家族 Family family	b.1.2.1 — Fibronectin type III

结构域编号 domain_id	d1i1ra2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.2 — Fibronectin type III
家族 Family family	b.1.2.1 — Fibronectin type III

结构域编号 domain_id	d1i1ra3
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.2 — Fibronectin type III
家族 Family family	b.1.2.1 — Fibronectin type III

结构域编号 domain_id	d1i1rb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.1 — Long-chain cytokines

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1i1rA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1i1rA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1i1rA03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1i1rB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	103.000 Å
晶胞边长 b length_b	123.310 Å
晶胞边长 c length_c	76.790 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	112.03 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.400 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2130
R_work r_work	0.2130
R_free r_free	0.2560

fit	/app/data/saxs_computation/i1/1i1r/1i1r.fit
pddf	/app/data/pr_computation/i1/1i1r/1i1r.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/i1/1i1r/1i1r.dat

CRYSTAL STRUCTURE OF A CYTOKINE/RECEPTOR COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

INTERLEUKIN-6 RECEPTOR BETA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

VIRAL IL-6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)