1iar

INTERLEUKIN-4 / RECEPTOR ALPHA CHAIN COMPLEX

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 81.3 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (INTERLEUKIN-4)

Homo sapiens

UniProt P05112

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 25–153 未记录 PROTEIN (INTERLEUKIN-4 RECEPTOR ALPHA CHAIN) × 1 (P24394) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 8;pH 8.0 分辨率 2.30 Å R-free 0.289

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 27 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IL4_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–129; UniProt 25–153

PROTEIN (INTERLEUKIN-4 RECEPTOR ALPHA CHAIN)

Homo sapiens

UniProt P24394

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 26–232 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN 突变:M1F, C182A PROTEIN (INTERLEUKIN-4) × 1 (P05112) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 8;pH 8.0 分辨率 2.30 Å R-free 0.289

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IL4RA_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–207; UniProt 26–232

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1iar

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1iar
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1iar
沉积日期 deposition_date1999-02-25
结构标题 titleINTERLEUKIN-4 / RECEPTOR ALPHA CHAIN COMPLEX
关键词 keywordsCYTOKINE RECEPTOR, INTERLEUKIN-4, CYTOKINE-RECEPTOR COMPLEX; CYTOKINE/RECEPTOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier24.25
回转半径 Rg (电子) rg_electron23.46
零角强度 I(0) i023368800.00
分子量 molecular_weight36459.0 kDa
排除体积 excluded_volume45485 ų
包络体积 envelope_volume55999 ų
水化壳体积 shell_volume21021 ų
包络直径 envelope_diameter82.3
壳层 Rg shell_rg29.01
包络 Rg envelope_rg23.78
形状 Rg shape_rg23.46
总 Rg total_rg24.20
总原子数 total_atoms2565
残基数 n_residues317
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax81.3
Rg (实空间) rg_real24.27
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.61
I(0) (实空间) i0_real2.3370e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.2230e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal24.27
I(0) (倒空间) i0_reciprocal23370000.0000
解质量估计 total_estimate0.8872
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary24.5
偏度 Skewness skewness0.304
峰度 Kurtosis kurtosis-0.472
角度范围 angular_range— – 0.3250 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha5140000.0000
实空间数据点数 n_real_points64
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.889; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.891; Smooth: 0.972

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1iara_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamilya.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family familya.26.1.2 — Short-chain cytokines
结构域编号 domain_idd1iarb1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.2 — Fibronectin type III
家族 Family familyb.1.2.1 — Fibronectin type III
结构域编号 domain_idd1iarb2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.2 — Fibronectin type III
家族 Family familyb.1.2.1 — Fibronectin type III

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id1iarA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1iarB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1iarB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)