1jqm

Fitting of L11 protein and elongation factor G (EF-G) in the cryo-em map of e. coli 70S ribosome bound with EF-G, GDP and fusidic acid

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

50S Ribosomal protein L11

物种未注明

UniProt P29395

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Elongation Factor G × 1 (P13551) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL11_THEMA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–139; UniProt 1–139

Elongation Factor G

物种未注明

UniProt P13551

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 50S Ribosomal protein L11 × 1 (P29395) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EFG_THETH
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–691; UniProt 1–691

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1jqm
沉积日期 deposition_date2001-08-07
结构标题 titleFitting of L11 protein and elongation factor G (EF-G) in the cryo-em map of e. coli 70S ribosome bound with EF-G, GDP and fusidic acid
关键词 keywordsL11, EF-G, cryo-EM, 70s E.coli ribosome, GDP state, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1jqm__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1jqm__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1jqm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)36.35 Å
Rg(电子密度)36.11 Å
总 Rg36.29 Å
原子数0
残基数0
排除体积112480 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1jqm__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1jqma_
类 Class classi — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold foldi.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamilyi.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family familyi.1.1.1 — Ribosome complexes
结构域编号 domain_idd1jqmb_
类 Class classi — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold foldi.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamilyi.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family familyi.1.1.1 — Ribosome complexes
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7. 引用文献 (6)