1mk9

CRYSTAL STRUCTURE OF AN INTEGRIN BETA3-TALIN CHIMERA

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integrin Beta3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	TALIN × 1 （P54939） water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	TALIN × 1 （P54939） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	TALIN × 1 （P54939） water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	TALIN × 1 （P54939） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ITB3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–16； UniProt 765–776 作者链 C； PDB构建体 5–16； UniProt 765–776 作者链 E； PDB构建体 5–16； UniProt 765–776 作者链 G； PDB构建体 5–16； UniProt 765–776

TALIN

Gallus gallus

UniProt P54939

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Integrin Beta3 × 1 （P05106） water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Integrin Beta3 × 1 （P05106） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Integrin Beta3 × 1 （P05106） water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Integrin Beta3 × 1 （P05106） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TLN1_CHICK
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–192； UniProt 209–400 作者链 D； PDB构建体 1–192； UniProt 209–400 作者链 F； PDB构建体 1–192； UniProt 209–400 作者链 H； PDB构建体 1–192； UniProt 209–400

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1mk9
沉积日期 deposition_date	2002-08-28
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF AN INTEGRIN BETA3-TALIN CHIMERA
关键词 keywords	FOCAL ADHESION, INTEGRIN BINDING, FERM DOMAIN, CYTOSKELETON NPXY MOTIF, PTB DOMAIN, structural protein; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1mk9__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1mk9__assembly_3__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1mk9__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	21.42 Å
Rg（电子密度）	20.66 Å
总 Rg	21.47 Å
原子数	1646
残基数	202
排除体积	29521 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1mk9__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1mk9__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1mk9__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`1mk9__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Integrin Beta3
分子量 formula_weight	1836.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G
原子数 atom_count	6640

GSHMWDTANNPLYKEA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	TALIN
分子量 formula_weight	22150.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H

PVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGYQCQIQFGPHNEQKHKPGFLELKDFLPKEYIKQKGERKIFMAHKNCGNMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWSLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIIL

来源 Source

来源生物 organism	Gallus gallus
通用名 common_name	chicken
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	31

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d1mk9b1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.11 — Acyl-CoA binding protein-like
超家族 Superfamily superfamily	a.11.2 — Second domain of FERM
家族 Family family	a.11.2.1 — Second domain of FERM

结构域编号 domain_id	d1mk9b2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.55 — PH domain-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.55.1 — PH domain-like
家族 Family family	b.55.1.5 — Third domain of FERM

结构域编号 domain_id	d1mk9d1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.11 — Acyl-CoA binding protein-like
超家族 Superfamily superfamily	a.11.2 — Second domain of FERM
家族 Family family	a.11.2.1 — Second domain of FERM

结构域编号 domain_id	d1mk9d2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.55 — PH domain-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.55.1 — PH domain-like
家族 Family family	b.55.1.5 — Third domain of FERM

结构域编号 domain_id	d1mk9f1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.11 — Acyl-CoA binding protein-like
超家族 Superfamily superfamily	a.11.2 — Second domain of FERM
家族 Family family	a.11.2.1 — Second domain of FERM

结构域编号 domain_id	d1mk9f2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.55 — PH domain-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.55.1 — PH domain-like
家族 Family family	b.55.1.5 — Third domain of FERM

结构域编号 domain_id	d1mk9h1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.11 — Acyl-CoA binding protein-like
超家族 Superfamily superfamily	a.11.2 — Second domain of FERM
家族 Family family	a.11.2.1 — Second domain of FERM

结构域编号 domain_id	d1mk9h2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.55 — PH domain-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.55.1 — PH domain-like
家族 Family family	b.55.1.5 — Third domain of FERM

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	1mk9B01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	80 — Acyl-CoA Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1mk9B02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)

结构域编号 domain_id	1mk9D01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	80 — Acyl-CoA Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1mk9D02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)

结构域编号 domain_id	1mk9F01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	80 — Acyl-CoA Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1mk9F02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)

结构域编号 domain_id	1mk9H01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	80 — Acyl-CoA Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1mk9H02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)

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晶胞边长 a length_a	50.257 Å
晶胞边长 b length_b	141.763 Å
晶胞边长 c length_c	59.597 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.11 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	29.830 Å
R 因子 r_factor	0.2420
R_work r_work	0.2420
R_free r_free	0.3270

CRYSTAL STRUCTURE OF AN INTEGRIN BETA3-TALIN CHIMERA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integrin Beta3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

TALIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1mk9__assembly_3__model_1

1mk9__assembly_3__model_1 | I(q)

1mk9__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

CRYSTAL STRUCTURE OF AN INTEGRIN BETA3-TALIN CHIMERA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integrin Beta3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

TALIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1mk9__assembly_3__model_1

1mk9__assembly_3__model_1 | I(q)

1mk9__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)