SAXSdb — 1mv0

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myc proto-oncogene protein

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 55–68	片段：residues 55-68	Myc box-dependent-interacting protein 1 × 1 （O00499）	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300e-3；压力 ambient NMR样品组成：1.4 mM Bin1(402-482)/c-Myc(55-68) U-15N, 13C, 25 mM sodium phosphate, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 95% H2O, 5% D2O pH=6.5 \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1MV0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1A93 NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE C-MYC-MAX HETERODIMERIC LEUCINE ZIPPER, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1998-04-15	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 406–434（29 aa）片段：HETERODIMERIC LEUCINE ZIPPER	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM；压力 1 NMR样品组成 WATER	分辨率未提供
1EE4 CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST KARYOPHERIN (IMPORTIN) ALPHA IN A COMPLEX WITH A C-MYC NLS PEPTIDE 提交 2000-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 320–328（9 aa）片段：NLS (NUCLEAR LOCALIZATION SIGNAL) AT THE LARGER (FUNCTIONAL) BINDING SITE 链 D 320–328（9 aa）片段：NLS (NUCLEAR LOCALIZATION SIGNAL) AT THE LARGER (FUNCTIONAL) BINDING SITE	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.277
1EE4 CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST KARYOPHERIN (IMPORTIN) ALPHA IN A COMPLEX WITH A C-MYC NLS PEPTIDE 提交 2000-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 320–328（9 aa）片段：NLS (NUCLEAR LOCALIZATION SIGNAL) AT THE LARGER (FUNCTIONAL) BINDING SITE 链 F 320–328（9 aa）片段：NLS (NUCLEAR LOCALIZATION SIGNAL) AT THE LARGER (FUNCTIONAL) BINDING SITE	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.277
1NKP Crystal structure of Myc-Max recognizing DNA 提交 2003-01-03	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 353–434（82 aa）片段：bHLHZ region	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å R-free 0.263
1NKP Crystal structure of Myc-Max recognizing DNA 提交 2003-01-03	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 D 353–434（82 aa）片段：bHLHZ region	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å R-free 0.263
2A93 NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE C-MYC-MAX HETERODIMERIC LEUCINE ZIPPER, 40 STRUCTURES 提交 1998-06-09	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 406–434（29 aa）片段：LEUCINE ZIPPER	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM；压力 1 NMR样品组成 WATER	分辨率未提供
5I4Z Structure of apo OmoMYC 提交 2016-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 348–439（92 aa）片段：OmoMYC, UNP Residues 348-439 链 B 348–439（92 aa）片段：OmoMYC, UNP Residues 348-439	未记录	GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 3 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.15 K；MES, potassium sodium tartrate	分辨率 1.95 Å R-free 0.194
5I50 Structure of OmoMYC bound to double-stranded DNA 提交 2016-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 350–439（90 aa）片段：OmoMYC, UNP Residues 350-439 链 B 350–439（90 aa）片段：OmoMYC, UNP Residues 350-439	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293.15 K；MES, magnesium sulfate, potassium chloride, PEG 400	分辨率 2.70 Å R-free 0.279
6E16 Ternary structure of c-Myc-TBP-TAF1 提交 2018-07-09	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 96–125（30 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；291 K；20% (w/w) PEG8000, 0.2M ammonium sulfare, and 0.1M HEPES pH7.5	分辨率 2.40 Å R-free 0.220
6E24 Ternary structure of c-Myc-TBP-TAF1 提交 2018-07-10	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 96–125（30 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；16% W/V PEG3350 0.05M CITRIC ACID 0.05M BIS-TRIS PROPANE pH5.0	分辨率 3.00 Å R-free 0.224
6G6J The crystal structures of Human MYC:MAX bHLHZip complex 提交 2018-04-01	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 351–437（87 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；20% (w/v) PEG 3350 0.2M sodium sulfate decahydrate, pH 7	分辨率 2.25 Å R-free 0.236
6G6J The crystal structures of Human MYC:MAX bHLHZip complex 提交 2018-04-01	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 351–437（87 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；20% (w/v) PEG 3350 0.2M sodium sulfate decahydrate, pH 7	分辨率 2.25 Å R-free 0.236
6G6K The crystal structures of Human MYC:MAX bHLHZip complex 提交 2018-04-01	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 351–437（87 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；10% w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol, 0.075 %(w/v) of each Additive, 5 %(v/v) EtOH, 0.1 M MOPS/HEPES-Na, pH 7.5, Additive: 0.75 %(w/v) menthol, 0.75 %(w/v) caffeic acid, 0.75 %(w/v) D-quinic acid, 0.75 %(w/v) shikimic acid, 0.75 %(w/v) gallic acid monohydrate, 0.75 %(w/v) N-vanillylnonanamide.	分辨率 1.35 Å R-free 0.203
6G6K The crystal structures of Human MYC:MAX bHLHZip complex 提交 2018-04-01	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 351–437（87 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；10% w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol, 0.075 %(w/v) of each Additive, 5 %(v/v) EtOH, 0.1 M MOPS/HEPES-Na, pH 7.5, Additive: 0.75 %(w/v) menthol, 0.75 %(w/v) caffeic acid, 0.75 %(w/v) D-quinic acid, 0.75 %(w/v) shikimic acid, 0.75 %(w/v) gallic acid monohydrate, 0.75 %(w/v) N-vanillylnonanamide.	分辨率 1.35 Å R-free 0.203
6G6L The crystal structures of Human MYC:MAX bHLHZip complex 提交 2018-04-01	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 351–437（87 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10% w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol, 15% PEG 8000 15, 0.2M ammonium sulfate, pH 7	分辨率 2.20 Å R-free 0.268
6G6L The crystal structures of Human MYC:MAX bHLHZip complex 提交 2018-04-01	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 351–437（87 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10% w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol, 15% PEG 8000 15, 0.2M ammonium sulfate, pH 7	分辨率 2.20 Å R-free 0.268
6G6L The crystal structures of Human MYC:MAX bHLHZip complex 提交 2018-04-01	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 351–437（87 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10% w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol, 15% PEG 8000 15, 0.2M ammonium sulfate, pH 7	分辨率 2.20 Å R-free 0.268
6G6L The crystal structures of Human MYC:MAX bHLHZip complex 提交 2018-04-01	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 351–437（87 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10% w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol, 15% PEG 8000 15, 0.2M ammonium sulfate, pH 7	分辨率 2.20 Å R-free 0.268
8J2Q Crystal structure of Cypovirus Polyhedra mutant fused with c-Myc fragment 提交 2023-04-15	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 417–427（11 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 SMALL TUBES；293 K；cell-free crystallization	分辨率 1.92 Å R-free 0.245
8OTS OCT4 and MYC-MAX co-bound to a nucleosome 提交 2023-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 M 351–437（87 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8OTT MYC-MAX bound to a nucleosome at SHL+5.8 提交 2023-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 M 368–420（53 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8WLG Crystal structure of Cypovirus Polyhedra mutant fused with c-Myc fragment 提交 2023-09-29	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 417–426（10 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 SMALL TUBES；293 K；cell-free crystallization	分辨率 2.55 Å R-free 0.270
8X8S Crystal structure of Cypovirus Polyhedra mutant fused with c-Myc fragment 提交 2023-11-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 417–427（11 aa）	突变：R151K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 SMALL TUBES；293 K；cell-free crystallization	分辨率 2.04 Å R-free 0.265
8X8V Crystal structure of Cypovirus Polyhedra mutant fused with c-Myc fragment 提交 2023-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 417–427（11 aa）	突变：R151K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 SMALL TUBES；293 K；cell-free crystallization	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
9QNH Myc pS294 phosphopeptide binding to 14-3-3sigma 提交 2025-03-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 290–298（9 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 2 CA CALCIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400	分辨率 1.30 Å R-free 0.167

共 18 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MYC_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–14； UniProt 55–68

Myc box-dependent-interacting protein 1

Homo sapiens

UniProt O00499

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 513–593	片段：residues 513-593	Myc proto-oncogene protein × 1 （P01106）	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300e-3；压力 ambient NMR样品组成：1.4 mM Bin1(402-482)/c-Myc(55-68) U-15N, 13C, 25 mM sodium phosphate, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 95% H2O, 5% D2O pH=6.5 \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1MV0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1MUZ NMR STRUCTURE OF THE TUMOR SUPPRESSOR BIN1: ALTERNATIVE SPLICING IN MELANOMA AND INTERACTION WITH C-MYC 提交 2002-09-24	聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 513–593（81 aa）片段：residues 513-593	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300e-3；压力 ambient NMR样品组成 1.5 mM Bin1(402-482) U-15N, 13C 25 mM sodium phosphate buffer, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 95% H2O, 5% D2O pH=6.5 \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
1MV3 NMR STRUCTURE OF THE TUMOR SUPPRESSOR BIN1: ALTERNATIVE SPLICING IN MELANOMA AND INTERACTION WITH C-MYC 提交 2002-09-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 301–377（77 aa）片段：isoform BIN1+12A (residues 301-377, 458-594) 链 A 458–593（136 aa）片段：isoform BIN1+12A (residues 301-377, 458-594)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300e-3；压力 ambient NMR样品组成 1.3 mM Bin1(270-482,+12A) U-15N, 13C, 25 mM sodium phosphate, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 95 % H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2FIC The crystal structure of the BAR domain from human Bin1/Amphiphysin II and its implications for molecular recognition 提交 2005-12-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–241（241 aa）片段：BAR domain 链 B 1–241（241 aa）片段：BAR domain	未记录	XE XENON × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% monomethylether-PEG550, 100mM Tris (pH 8), 100mM NaCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.99 Å R-free 0.280
2FIC The crystal structure of the BAR domain from human Bin1/Amphiphysin II and its implications for molecular recognition 提交 2005-12-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–241（241 aa）片段：BAR domain	未记录	XE XENON × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% monomethylether-PEG550, 100mM Tris (pH 8), 100mM NaCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.99 Å R-free 0.280
2FIC The crystal structure of the BAR domain from human Bin1/Amphiphysin II and its implications for molecular recognition 提交 2005-12-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–241（241 aa）片段：BAR domain	未记录	XE XENON × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% monomethylether-PEG550, 100mM Tris (pH 8), 100mM NaCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.99 Å R-free 0.280
2RMY Structure of the N-terminal BARpeptide in SDS micelles 提交 2007-12-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–33（33 aa）片段：UNP residues 1-33	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient NMR样品组成 1mM [U-100% 15N] protein, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2RND Structure of the N-terminal BARpeptide in DPC micelles 提交 2007-12-16	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–33（33 aa）片段：BARpeptide, UNP residues 1-33	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient NMR样品组成 1mM [U-100% 15N] protein, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5I22 Amphiphysin SH3 in complex with Chikungunya virus nsP3 peptide 提交 2016-02-04	构建体不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 513–593（81 aa）片段：SH3 fragment, UNP residue 513-593	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298.15 K；压力 1 NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] amphiphysin 2 SH3, 0.5 mM [U-13C; U-15N] CHIKV nsP3 peptide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供

共 6 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BIN1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–81； UniProt 513–593

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1mv0
沉积日期 deposition_date	2002-09-24
结构标题 title	NMR STRUCTURE OF THE TUMOR SUPPRESSOR BIN1: ALTERNATIVE SPLICING IN MELANOMA AND INTERACTION WITH C-MYC
关键词 keywords	TUMOR SUPPRESSOR/ONCOPROTEIN, ENDOCYTOSIS/EXOCYTOSIS, TRANSCRIPTION COMPLEX, ENDOCYTOSIS-EXOCYTOSIS; ENDOCYTOSIS/EXOCYTOSIS, TRANSCRIPTION
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	16.47 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	16.30 Å
零角强度 I(0) i0	661829000.00
分子量 molecular_weight	215700.0 kDa
排除体积 excluded_volume	269450 Å³
包络体积 envelope_volume	67056 Å³
水化壳体积 shell_volume	25881 Å³
包络直径 envelope_diameter	76.6 Å
壳层 Rg shell_rg	28.95 Å
包络 Rg envelope_rg	21.62 Å
形状 Rg shape_rg	16.25 Å
总 Rg total_rg	16.84 Å
总原子数 total_atoms	30040
残基数 n_residues	1900
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	43.6 Å
Rg (实空间) rg_real	15.60 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.05 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.3000e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.7060e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	16.50 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	661800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6829
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	19.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.236
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.383
角度范围 angular_range	— – 0.4850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	2.6850
最高正则化参数 α highest_alpha	5491000.0000
实空间数据点数 n_real_points	79
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.005; Oscil: 0.979; Stabil: 0.985; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.993; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Myc proto-oncogene protein
分子量 formula_weight	1479.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	30040

LLPTPPLSPSRRSG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Myc box-dependent-interacting protein 1
分子量 formula_weight	9356.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

GRLDLPPGFMFKVQAQHDYTATDTDELQLKAGDVVLVIPFQNPEEQDEGWLMGVKESDWNQHKKLEKCRGVFPENFTERVP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1mv0b_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.34.2 — SH3-domain
家族 Family family	b.34.2.1 — SH3-domain

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	1mv0B00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — SH3 Domains

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8. 引用文献 (1)

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fit	/app/data/saxs_computation/mv/1mv0/1mv0.fit
pddf	/app/data/pr_computation/mv/1mv0/1mv0.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/mv/1mv0/1mv0.dat

NMR STRUCTURE OF THE TUMOR SUPPRESSOR BIN1: ALTERNATIVE SPLICING IN MELANOMA AND INTERACTION WITH C-MYC

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myc proto-oncogene protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Myc box-dependent-interacting protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)