1n4r

Protein Geranylgeranyltransferase type-I Complexed with a Geranylgeranylated KKKSKTKCVIL Peptide Product

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha

Rattus norvegicus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta × 1 （P53610） Fusion protein consisting of transforming protein p21b and Ras related protein Rap-2b × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 GERAN-8-YL GERAN × 1 water × 3	与蛋白数一致
10	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta × 1 （P53610） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
11	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta × 1 （P53610） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
12	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta × 1 （P53610） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta × 1 （P53610） Fusion protein consisting of transforming protein p21b and Ras related protein Rap-2b × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 2 GERAN-8-YL GERAN × 1 water × 3	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta × 1 （P53610） Fusion protein consisting of transforming protein p21b and Ras related protein Rap-2b × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 GERAN-8-YL GERAN × 1 water × 3	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta × 1 （P53610） Fusion protein consisting of transforming protein p21b and Ras related protein Rap-2b × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 2 GERAN-8-YL GERAN × 1 water × 2	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta × 1 （P53610） Fusion protein consisting of transforming protein p21b and Ras related protein Rap-2b × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 GERAN-8-YL GERAN × 1 water × 3	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta × 1 （P53610） Fusion protein consisting of transforming protein p21b and Ras related protein Rap-2b × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 GERAN-8-YL GERAN × 1 water × 3	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta × 1 （P53610） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta × 1 （P53610） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
9	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta × 1 （P53610） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FNTA_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 C； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 E； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 G； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 I； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 K； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377

Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta

Rattus norvegicus

UniProt P53610

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha × 1 （Q04631） Fusion protein consisting of transforming protein p21b and Ras related protein Rap-2b × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 GERAN-8-YL GERAN × 1 water × 3	与蛋白数一致
10	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha × 1 （Q04631） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
11	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha × 1 （Q04631） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
12	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha × 1 （Q04631） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha × 1 （Q04631） Fusion protein consisting of transforming protein p21b and Ras related protein Rap-2b × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 2 GERAN-8-YL GERAN × 1 water × 3	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha × 1 （Q04631） Fusion protein consisting of transforming protein p21b and Ras related protein Rap-2b × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 GERAN-8-YL GERAN × 1 water × 3	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha × 1 （Q04631） Fusion protein consisting of transforming protein p21b and Ras related protein Rap-2b × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 2 GERAN-8-YL GERAN × 1 water × 2	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha × 1 （Q04631） Fusion protein consisting of transforming protein p21b and Ras related protein Rap-2b × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 GERAN-8-YL GERAN × 1 water × 3	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha × 1 （Q04631） Fusion protein consisting of transforming protein p21b and Ras related protein Rap-2b × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 GERAN-8-YL GERAN × 1 water × 3	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha × 1 （Q04631） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha × 1 （Q04631） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
9	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha × 1 （Q04631） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PGTB1_RAT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 D； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 F； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 H； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 J； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 L； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1n4r
沉积日期 deposition_date	2002-11-01
结构标题 title	Protein Geranylgeranyltransferase type-I Complexed with a Geranylgeranylated KKKSKTKCVIL Peptide Product
关键词 keywords	protein geranylgeranyltransferase type-I, GGTase, geranylgeranyl, protein prenylation, CaaX, lipid modification, rap2b, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1n4r__assembly_7__model_1

Assembly 7 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1n4r__assembly_7__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1n4r__assembly_7__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	27.03 Å
Rg（电子密度）	26.21 Å
总 Rg	26.95 Å
原子数	5321
残基数	660
排除体积	94180 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1n4r__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1n4r__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1n4r__assembly_3__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`1n4r__assembly_4__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`1n4r__assembly_5__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`1n4r__assembly_6__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`1n4r__assembly_7__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
8	1	`1n4r__assembly_8__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
9	1	`1n4r__assembly_9__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
10	1	`1n4r__assembly_10__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
11	1	`1n4r__assembly_11__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
12	1	`1n4r__assembly_12__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha
分子量 formula_weight	44098.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.5.1.58,2.5.1.59
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I,K
原子数 atom_count	33129

MAATEGVGESAPGGEPGQPEQPPPPPPPPPAQQPQEEEMAAEAGEAAASPMDDGFLSLDSPTYVLYRDRAEWADIDPVPQNDGPSPVVQIIYSEKFRDVYDYFRAVLQRDERSERAFKLTRDAIELNAANYTVWHFRRVLLRSLQKDLQEEMNYIIAIIEEQPKNYQVWHHRRVLVEWLKDPSQELEFIADILNQDAKNYHAWQHRQWVIQEFRLWDNELQYVDQLLKEDVRNNSVWNQRHFVISNTTGYSDRAVLEREVQYTLEMIKLVPHNESAWNYLKGILQDRGLSRYPNLLNQLLDLQPSHSSPYLIAFLVDIYEDMLENQCDNKEDILNKALELCEILAKEKDTIRKEYWRYIGRSLQSKHSRESDIPASV

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta
分子量 formula_weight	42466.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.5.1.59
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L

MAATEDDRLAGSGEGERLDFLRDRHVRFFQRCLQVLPERYSSLETSRLTIAFFALSGLDMLDSLDVVNKDDIIEWIYSLQVLPTEDRSNLDRCGFRGSSYLGIPFNPSKNPGTAHPYDSGHIAMTYTGLSCLIILGDDLSRVDKEACLAGLRALQLEDGSFCAVPEGSENDMRFVYCASCICYMLNNWSGMDMKKAISYIRRSMSYDNGLAQGAGLESHGGSTFCGIASLCLMGKLEEVFSEKELNRIKRWCIMRQQNGYHGRPNKPVDTCYSFWVGATLKLLKIFQYTNFEKNRNYILSTQDRLVGGFAKWPDSHPDALHAYFGICGLSLMEESGICKVHPALNVSTRTSERLRDLHQSWKTKDSKQCSDNVHISS

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Fusion protein consisting of transforming protein p21b and Ras related protein Rap-2b
分子量 formula_weight	1280.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,N,O,P,Q,R

KKKSKTKCVIL

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	195.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	GERAN-8-YL GERAN
分子量 formula_weight	274.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 9 Entity 9 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	590

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

结构域编号 domain_id	d1n4ra_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.6 — Protein prenylyltransferase
家族 Family family	a.118.6.1 — Protein prenylyltransferase

结构域编号 domain_id	d1n4rb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.102 — alpha/alpha toroid
超家族 Superfamily superfamily	a.102.4 — Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases
家族 Family family	a.102.4.3 — Protein prenyltransferases

结构域编号 domain_id	d1n4rc_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.6 — Protein prenylyltransferase
家族 Family family	a.118.6.1 — Protein prenylyltransferase

结构域编号 domain_id	d1n4rd_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.102 — alpha/alpha toroid
超家族 Superfamily superfamily	a.102.4 — Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases
家族 Family family	a.102.4.3 — Protein prenyltransferases

结构域编号 domain_id	d1n4re_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.6 — Protein prenylyltransferase
家族 Family family	a.118.6.1 — Protein prenylyltransferase

结构域编号 domain_id	d1n4rf_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.102 — alpha/alpha toroid
超家族 Superfamily superfamily	a.102.4 — Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases
家族 Family family	a.102.4.3 — Protein prenyltransferases

结构域编号 domain_id	d1n4rg_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.6 — Protein prenylyltransferase
家族 Family family	a.118.6.1 — Protein prenylyltransferase

结构域编号 domain_id	d1n4rh_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.102 — alpha/alpha toroid
超家族 Superfamily superfamily	a.102.4 — Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases
家族 Family family	a.102.4.3 — Protein prenyltransferases

结构域编号 domain_id	d1n4ri_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.6 — Protein prenylyltransferase
家族 Family family	a.118.6.1 — Protein prenylyltransferase

结构域编号 domain_id	d1n4rj_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.102 — alpha/alpha toroid
超家族 Superfamily superfamily	a.102.4 — Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases
家族 Family family	a.102.4.3 — Protein prenyltransferases

结构域编号 domain_id	d1n4rk_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.6 — Protein prenylyltransferase
家族 Family family	a.118.6.1 — Protein prenylyltransferase

结构域编号 domain_id	d1n4rl_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.102 — alpha/alpha toroid
超家族 Superfamily superfamily	a.102.4 — Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases
家族 Family family	a.102.4.3 — Protein prenyltransferases

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	1n4rA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 — Protein prenylyltransferase

结构域编号 domain_id	1n4rB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	50 — Alpha/alpha barrel
拓扑 Topology topology	10 — Glycosyltransferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1n4rC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 — Protein prenylyltransferase

结构域编号 domain_id	1n4rD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	50 — Alpha/alpha barrel
拓扑 Topology topology	10 — Glycosyltransferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1n4rE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 — Protein prenylyltransferase

结构域编号 domain_id	1n4rF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	50 — Alpha/alpha barrel
拓扑 Topology topology	10 — Glycosyltransferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1n4rG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 — Protein prenylyltransferase

结构域编号 domain_id	1n4rH00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	50 — Alpha/alpha barrel
拓扑 Topology topology	10 — Glycosyltransferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1n4rI00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 — Protein prenylyltransferase

结构域编号 domain_id	1n4rJ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	50 — Alpha/alpha barrel
拓扑 Topology topology	10 — Glycosyltransferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1n4rK00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 — Protein prenylyltransferase

结构域编号 domain_id	1n4rL00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	50 — Alpha/alpha barrel
拓扑 Topology topology	10 — Glycosyltransferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

▶

晶胞边长 a length_a	272.068 Å
晶胞边长 b length_b	268.801 Å
晶胞边长 c length_c	185.310 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	131.55 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	29.860 Å
R 因子 r_factor	0.2000
R_work r_work	0.2000
R_free r_free	0.2180

Protein Geranylgeranyltransferase type-I Complexed with a Geranylgeranylated KKKSKTKCVIL Peptide Product

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1n4r__assembly_7__model_1

1n4r__assembly_7__model_1 | I(q)

1n4r__assembly_7__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)

Protein Geranylgeranyltransferase type-I Complexed with a Geranylgeranylated KKKSKTKCVIL Peptide Product

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1n4r__assembly_7__model_1

1n4r__assembly_7__model_1 | I(q)

1n4r__assembly_7__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)