1oey

Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 129.6 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NEUTROPHIL CYTOSOL FACTOR 2

HOMO SAPIENS

UniProt P19878

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 352–429	片段：PB1 DOMAIN, RESIDUES 352-429 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NEUTROPHIL CYTOSOL FACTOR 4 × 1 （Q15080）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 9；18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.252
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 352–429	片段：PB1 DOMAIN, RESIDUES 352-429 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NEUTROPHIL CYTOSOL FACTOR 4 × 1 （Q15080）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 9；18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.252
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 352–429	片段：PB1 DOMAIN, RESIDUES 352-429 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NEUTROPHIL CYTOSOL FACTOR 4 × 1 （Q15080）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 9；18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.252
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 352–429	片段：PB1 DOMAIN, RESIDUES 352-429 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NEUTROPHIL CYTOSOL FACTOR 4 × 1 （Q15080）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 9；18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.252

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1OEY	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1E96 Structure of the Rac/p67phox complex 提交 2000-10-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–203（203 aa）片段：YES	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 10.5；0.1 M CAPS PH 10.5, 0.2 M LI ACETATE, 0.8 M NAH2PO4, 1.2 M K2HPO4	分辨率 2.40 Å R-free 0.284
1HH8 The active N-terminal region of p67phox: Structure at 1.8 Angstrom resolution and biochemical characterizations of the A128V mutant implicated in chronic granulomatous disease 提交 2000-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–213（213 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-213	未记录	FLC CITRATE ANION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；100 MM NA CITRATE PH 4.5, 17% PEG 2K MME, 10% GLYCEROL	分辨率 1.80 Å R-free 0.204
1K4U Solution structure of the C-terminal SH3 domain of p67phox complexed with the C-terminal tail region of p47phox 提交 2001-10-08	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 S 455–516（62 aa）片段：C-TERMINAL SH3 DOMAIN (RESIDUES 455-516)	突变：C499S/C514S	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM KCl；压力 1 NMR样品组成 0.7mM p67SH3(C) U-15N,13C; 0.77mM p47 tail peptide; 5mM MOPSO buffer; 30 mM d10-DTT; 100mM KCl \| 90% H2O, 10% D2O; 100% D2O NMR样品组成 0.5mM p47 tail peptide U-15N,13C; 0.55mM p67SH3(C); 5mM MOPSO buffer; 30mM d10-DTT; 100mM KCl \| 90% H2O, 10% D2O; 100% D2O	分辨率未提供
1WM5 Crystal structure of the N-terminal TPR domain (1-203) of p67phox 提交 2004-07-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–203（203 aa）片段：TPR domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；277 K；ammonium sulfate, HEPES, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.95 Å R-free 0.224
2DMO Refined solution structure of the 1st SH3 domain from human Neutrophil cytosol factor 2 (NCF-2) 提交 2006-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 242–297（56 aa）片段：SH3 domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；296 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient NMR样品组成 1.3mM SH3 domain U-15N,13C; 20mM d-Tris HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NCF2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–83； UniProt 352–429 作者链 B； PDB构建体 6–83； UniProt 352–429 作者链 C； PDB构建体 6–83； UniProt 352–429 作者链 D； PDB构建体 6–83； UniProt 352–429

NEUTROPHIL CYTOSOL FACTOR 4

HOMO SAPIENS

UniProt Q15080

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 237–339	片段：PB1 DOMAIN, RESIDUES 237-339 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NEUTROPHIL CYTOSOL FACTOR 2 × 1 （P19878）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 9；18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.252
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 237–339	片段：PB1 DOMAIN, RESIDUES 237-339 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NEUTROPHIL CYTOSOL FACTOR 2 × 1 （P19878）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 9；18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.252
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 237–339	片段：PB1 DOMAIN, RESIDUES 237-339 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NEUTROPHIL CYTOSOL FACTOR 2 × 1 （P19878）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 9；18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.252
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 M； UniProt 237–339	片段：PB1 DOMAIN, RESIDUES 237-339 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NEUTROPHIL CYTOSOL FACTOR 2 × 1 （P19878）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 9；18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.252

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1OEY	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1H6H Structure of the PX domain from p40phox bound to phosphatidylinositol 3-phosphate 提交 2001-06-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–144（143 aa）片段：PX DOMAIN RESIDUES 2-144	未记录	PIB 2-(BUTANOYLOXY)-1-{[(HYDROXY{[2,3,4,6-TETRAHYDROXY-5-(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL)OXY]METHYL}ETHYL BUTANOATE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.50	分辨率 1.70 Å R-free 0.232
1W6X SH3 domain of p40phox, component of the NADPH oxidase 提交 2004-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–228（55 aa）片段：SH3 DOMAIN, RESIDUES 174-228	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；287 K；VAPOR DIFFUSION AT 14 DEGRE C, PROTEIN AT 14 MG/ML, 20 MM HEPES PH 7.5, 150 MM NACL MIXED WITH 40% PEG2K MME, 100 MM AS 200 MM NA AC PH 4.6.	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
1W6X SH3 domain of p40phox, component of the NADPH oxidase 提交 2004-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 174–228（55 aa）片段：SH3 DOMAIN, RESIDUES 174-228	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；287 K；VAPOR DIFFUSION AT 14 DEGRE C, PROTEIN AT 14 MG/ML, 20 MM HEPES PH 7.5, 150 MM NACL MIXED WITH 40% PEG2K MME, 100 MM AS 200 MM NA AC PH 4.6.	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
1W70 SH3 domain of p40phox complexed with C-terminal polyProline region of p47phox 提交 2004-08-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 174–228（55 aa）片段：SH3 DOMAIN, RESIDUES 174-228	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；VAPOR DIFFUSION AT 20 DEGRE C AT 14MG/ML OF P40PHOX SH3 WITH A1/5 RATIO WITH POLYPROLINE PEPTIDE, 20 MM HEPES PH 7.5, 150 MM NACL MIXED WITH 100 MM NA-CITRATE/CITRIC ACID PH5, 2.4 M SA	分辨率 1.46 Å R-free 0.207
1W70 SH3 domain of p40phox complexed with C-terminal polyProline region of p47phox 提交 2004-08-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 174–228（55 aa）片段：SH3 DOMAIN, RESIDUES 174-228	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 TFA trifluoroacetic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；VAPOR DIFFUSION AT 20 DEGRE C AT 14MG/ML OF P40PHOX SH3 WITH A1/5 RATIO WITH POLYPROLINE PEPTIDE, 20 MM HEPES PH 7.5, 150 MM NACL MIXED WITH 100 MM NA-CITRATE/CITRIC ACID PH5, 2.4 M SA	分辨率 1.46 Å R-free 0.207
1Z9Q Solution structure of SH3 domain of p40phox 提交 2005-04-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 168–233（66 aa）片段：SH3 domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 0.5mM p40phoxSH3 U-13C, 15N; 50mM NaPi pH7.0; 150mM NaCl \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2DYB The crystal structure of human p40(phox) 提交 2006-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–339（339 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；5% PEG 20000, 200mM Bis-tris-HCl, 10mM sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.302
2DYB The crystal structure of human p40(phox) 提交 2006-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–339（339 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；5% PEG 20000, 200mM Bis-tris-HCl, 10mM sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.302

共 5 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NCF4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 5–107； UniProt 237–339 作者链 K； PDB构建体 5–107； UniProt 237–339 作者链 L； PDB构建体 5–107； UniProt 237–339 作者链 M； PDB构建体 5–107； UniProt 237–339

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1oey
沉积日期 deposition_date	2003-04-02
结构标题 title	Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase
关键词 keywords	IMMUNE SYSTEM, PB1 HETERODIMER-COMPLEX, NADPH OXIDASE, PB1 DOMAIN, HETERODIMERIZATION; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	38.17 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	37.86 Å
零角强度 I(0) i0	120626000.00
分子量 molecular_weight	86990.0 kDa
排除体积 excluded_volume	108070 Å³
包络体积 envelope_volume	156970 Å³
水化壳体积 shell_volume	36850 Å³
包络直径 envelope_diameter	138.0 Å
壳层 Rg shell_rg	40.82 Å
包络 Rg envelope_rg	37.36 Å
形状 Rg shape_rg	37.82 Å
总 Rg total_rg	38.18 Å
总原子数 total_atoms	6032
残基数 n_residues	696
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	129.6 Å
Rg (实空间) rg_real	38.28 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.44 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.2060e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.1450e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	38.21 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	120600000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8579
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	50.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.296
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.397
角度范围 angular_range	— – 0.2050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	7925000.0000
实空间数据点数 n_real_points	42
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.851; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.923; Smooth: 0.671

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	NEUTROPHIL CYTOSOL FACTOR 2
分子量 formula_weight	9940.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	6382

GSHMAYTLKVHYKYTVVMKTQPGLPYSQVRDMVSKKLELRLEHTKLSYRPRDSNELVPLSEDSMKDAWGQVKNYCLTLWCENT

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	NEUTROPHIL CYTOSOL FACTOR 4
分子量 formula_weight	12848.1 kDa
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,K,L,M

GSHMTNWLRVYYYEDTISTIKDIAVEEDLSSTPLLKDLLELTRREFQREDIALNYRDAEGDLVRLLSDEDVALMVRQARGLPSQKRLFPWKLHITQKDNYRVYNTMP

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	343

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 19 domains

SCOP 2.08 (11 domains)

结构域编号 domain_id	d1oeya1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d1oeya2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1oeyb1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d1oeyb2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1oeyc_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d1oeyd1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d1oeyd2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1oeyj_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d1oeyk_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d1oeyl_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d1oeym_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	1oeyA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	1oeyB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	1oeyC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	1oeyD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	1oeyJ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	1oeyK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	1oeyL00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	1oeyM00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	151.422 Å
晶胞边长 b length_b	151.422 Å
晶胞边长 c length_c	68.317 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 64
空间群编号 int_tables_number	172
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	100.000 Å
R 因子 r_factor	0.2120
R_work r_work	0.2100
R_free r_free	0.2520

fit	/app/data/saxs_computation/oe/1oey/1oey.fit
pddf	/app/data/pr_computation/oe/1oey/1oey.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/oe/1oey/1oey.dat

Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NEUTROPHIL CYTOSOL FACTOR 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

NEUTROPHIL CYTOSOL FACTOR 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 19 domains

SCOP 2.08 (11 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)