SAXSdb — 1qdv

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

KV1.2 VOLTAGE-GATED POTASSIUM CHANNEL

Rattus norvegicus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 33–131 链 B； UniProt 33–131 链 C； UniProt 33–131 链 D； UniProt 33–131	片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 33-131	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；19% PEG 4000, 100 MM NH4 ACETATE, 21% METHANOL, MES PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.60 Å R-free 0.278

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1QDV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1DSX KV1.2 T1 DOMAIN, RESIDUES 33-119, T46V MUTANT 提交 2000-01-10	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119 链 B 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119 链 C 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119 链 D 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；22% PEG 1500, 5 % ISOPROPANOL, 200 MM NA ACETATE, 12 MM SRCL2, 50 MM TRIS, PH 8.5, pH 8.50	分辨率 1.60 Å R-free 0.279
1DSX KV1.2 T1 DOMAIN, RESIDUES 33-119, T46V MUTANT 提交 2000-01-10	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119 链 F 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119 链 G 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119 链 H 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；22% PEG 1500, 5 % ISOPROPANOL, 200 MM NA ACETATE, 12 MM SRCL2, 50 MM TRIS, PH 8.5, pH 8.50	分辨率 1.60 Å R-free 0.279
1QDW N-TERMINAL DOMAIN, VOLTAGE-GATED POTASSIUM CHANNEL KV1.2 RESIDUES 33-119 提交 1999-07-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE) 链 B 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE) 链 C 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE) 链 D 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；9% PEG 1500, 5% N-PROPANOL, 120 MM GDHCL 50 MM MES PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.10 Å R-free 0.266
1QDW N-TERMINAL DOMAIN, VOLTAGE-GATED POTASSIUM CHANNEL KV1.2 RESIDUES 33-119 提交 1999-07-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE) 链 F 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE) 链 G 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE) 链 H 33–119（87 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；9% PEG 1500, 5% N-PROPANOL, 120 MM GDHCL 50 MM MES PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.10 Å R-free 0.266
2A79 Mammalian Shaker Kv1.2 potassium channel- beta subunit complex 提交 2005-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 B 1–499（499 aa）	未记录	NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；peg 400, potassium chloride, tris buffer, EDTA, DTT, TCEP, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.252
3LNM F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera channel 提交 2010-02-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 D 1–266（266 aa）链 D 303–499（197 aa）	突变：C31S, C32S, N207Q, F233W, C431S, C478S 突变：C31S, C32S, N207Q, F233W, C431S, C478S	NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 K POTASSIUM ION × 20	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25-28% PEG 400, 50mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.247
3LNM F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera channel 提交 2010-02-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–266（266 aa）链 B 303–499（197 aa）	突变：C31S, C32S, N207Q, F233W, C431S, C478S 突变：C31S, C32S, N207Q, F233W, C431S, C478S	NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 48 K POTASSIUM ION × 20	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25-28% PEG 400, 50mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.247
3LUT A Structural Model for the Full-length Shaker Potassium Channel Kv1.2 提交 2010-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–499（499 aa）	突变：N207Q	NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 24	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å R-free 0.221
4JTA Crystal structure of Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in complex with Charybdotoxin 提交 2013-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–266（266 aa）链 B 304–499（196 aa）	未记录	NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 12 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 64	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；293 K；PEG 400, POTASSIUM CHLORIDE, TRIS , pH 8.9, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.236
4JTA Crystal structure of Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in complex with Charybdotoxin 提交 2013-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 Q 1–266（266 aa）链 Q 304–499（196 aa）	未记录	NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 12 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；293 K；PEG 400, POTASSIUM CHLORIDE, TRIS , pH 8.9, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.236
4JTC Crystal structure of Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in complex with Charybdotoxin in Cs+ 提交 2013-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–266（266 aa）链 B 304–499（196 aa）	未记录	NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 CS CESIUM ION × 16 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 64	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；293 K；PEG 400, Cesium CHLORIDE, TRIS BUFFER, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.56 Å R-free 0.262
4JTC Crystal structure of Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in complex with Charybdotoxin in Cs+ 提交 2013-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 H 1–266（266 aa）链 H 304–499（196 aa）	未记录	NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 CS CESIUM ION × 16 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；293 K；PEG 400, Cesium CHLORIDE, TRIS BUFFER, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.56 Å R-free 0.262
4JTD Crystal structure of Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in complex with Lys27Met mutant of Charybdotoxin 提交 2013-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–266（266 aa）链 B 304–499（196 aa）	未记录	NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 16 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 64	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；293 K；PEG 400, POTASSIUM CHLORIDE, TRIS , pH 8.9, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K	分辨率 2.54 Å R-free 0.235
4JTD Crystal structure of Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in complex with Lys27Met mutant of Charybdotoxin 提交 2013-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 H 1–266（266 aa）链 H 304–499（196 aa）	未记录	NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 16 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；293 K；PEG 400, POTASSIUM CHLORIDE, TRIS , pH 8.9, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K	分辨率 2.54 Å R-free 0.235
5WIE Crystal structure of a Kv1.2-2.1 chimera K+ channel V406W mutant in an inactivated state 提交 2017-07-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–42（42 aa）	突变：V406W	NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 20 K POTASSIUM ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；50 mM Tris-Cl pH 8.3, 29-31% PEG400	分辨率 3.30 Å R-free 0.243
5WIE Crystal structure of a Kv1.2-2.1 chimera K+ channel V406W mutant in an inactivated state 提交 2017-07-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 H 1–42（42 aa）	突变：V406W	NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 K POTASSIUM ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；50 mM Tris-Cl pH 8.3, 29-31% PEG400	分辨率 3.30 Å R-free 0.243
6EBK The voltage-activated Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in lipid nanodiscs 提交 2018-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–266（266 aa）链 B 303–499（197 aa）链 D 1–266（266 aa）链 D 303–499（197 aa）链 F 1–266（266 aa）链 F 303–499（197 aa）链 H 1–266（266 aa）链 H 303–499（197 aa）	未记录	NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；A 3 microliter sample was applied to a plasma-cleaned grid and blotted for 10 seconds.	分辨率 3.30 Å
6EBL The voltage-activated Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in lipid nanodiscs, cytosolic domain 提交 2018-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–266（266 aa）链 B 303–499（197 aa）链 D 1–266（266 aa）链 D 303–499（197 aa）链 F 1–266（266 aa）链 F 303–499（197 aa）链 H 1–266（266 aa）链 H 303–499（197 aa）	未记录	NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；A 3 microliter sample was applied to a plasma-cleaned grid and blotted for 10 seconds.	分辨率 3.00 Å
6EBM The voltage-activated Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in lipid nanodiscs, transmembrane domain of subunit alpha 提交 2018-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–266（266 aa）链 B 303–499（197 aa）链 D 1–266（266 aa）链 D 303–499（197 aa）链 F 1–266（266 aa）链 F 303–499（197 aa）链 H 1–266（266 aa）链 H 303–499（197 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；A 3 microliter sample was applied to a plasma-cleaned grid and blotted for 10 seconds.	分辨率 4.00 Å
8VC3 Voltage gated potassium ion channel Kv1.2 in complex with DTx 提交 2023-12-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–499（499 aa）链 C 1–499（499 aa）链 D 1–499（499 aa）链 E 1–499（499 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8VC4 Voltage gated potassium ion channel Kv1.2 in Sodium 提交 2023-12-13	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–499（499 aa）链 B 1–499（499 aa）链 C 1–499（499 aa）链 D 1–499（499 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.17 Å
8VC6 Voltage gated potassium ion channel Kv1.2 in Potassium 提交 2023-12-13	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–499（499 aa）链 B 1–499（499 aa）链 C 1–499（499 aa）链 D 1–499（499 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.17 Å
8VCH Voltage gated potassium ion channel Kv1.2 W366F, C-type inactivated 提交 2023-12-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–499（499 aa）链 B 1–499（499 aa）链 C 1–499（499 aa）链 D 1–499（499 aa）	突变：W366F 突变：W366F 突变：W366F 突变：W366F	K POTASSIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.55 Å

共 16 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCNA2_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–99； UniProt 33–131 作者链 B； PDB构建体 1–99； UniProt 33–131 作者链 C； PDB构建体 1–99； UniProt 33–131 作者链 D； PDB构建体 1–99； UniProt 33–131

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1qdv
沉积日期 deposition_date	1999-07-10
结构标题 title	N-TERMINAL DOMAIN, VOLTAGE-GATED POTASSIUM CHANNEL KV1.2 RESIDUES 33-131
关键词 keywords	VOLTAGE-GATED POTASSIUM CHANNEL, TETRAMERIZATION DOMAIN, INTRACELLULAR GATE, TETRAMER, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	22.78 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	21.53 Å
零角强度 I(0) i0	37516800.00
分子量 molecular_weight	47674.0 kDa
排除体积 excluded_volume	59757 Å³
包络体积 envelope_volume	70540 Å³
水化壳体积 shell_volume	26512 Å³
包络直径 envelope_diameter	71.4 Å
壳层 Rg shell_rg	28.92 Å
包络 Rg envelope_rg	21.65 Å
形状 Rg shape_rg	21.48 Å
总 Rg total_rg	22.60 Å
总原子数 total_atoms	3372
残基数 n_residues	396
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	69.6 Å
Rg (实空间) rg_real	22.61 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.30 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.7520e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.4830e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	22.65 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	37520000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7241
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	30.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.063
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.491
角度范围 angular_range	— – 0.3500 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha	10850000.0000
实空间数据点数 n_real_points	67
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.906; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.242; Positv: 1.000; Valcen: 0.973; Smooth: 0.992

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1qdva_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.42 — POZ domain
超家族 Superfamily superfamily	d.42.1 — POZ domain
家族 Family family	d.42.1.2 — Tetramerization domain of potassium channels

结构域编号 domain_id	d1qdvb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.42 — POZ domain
超家族 Superfamily superfamily	d.42.1 — POZ domain
家族 Family family	d.42.1.2 — Tetramerization domain of potassium channels

结构域编号 domain_id	d1qdvc_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.42 — POZ domain
超家族 Superfamily superfamily	d.42.1 — POZ domain
家族 Family family	d.42.1.2 — Tetramerization domain of potassium channels

结构域编号 domain_id	d1qdvd_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.42 — POZ domain
超家族 Superfamily superfamily	d.42.1 — POZ domain
家族 Family family	d.42.1.2 — Tetramerization domain of potassium channels

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1qdvA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	1qdvB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	1qdvC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	1qdvD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	51.768 Å
晶胞边长 b length_b	86.026 Å
晶胞边长 c length_c	96.279 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.600 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2380
R_free r_free	0.2780

描述 description	KV1.2 VOLTAGE-GATED POTASSIUM CHANNEL
分子量 formula_weight	11953.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	3608

N-TERMINAL DOMAIN, VOLTAGE-GATED POTASSIUM CHANNEL KV1.2 RESIDUES 33-131

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

KV1.2 VOLTAGE-GATED POTASSIUM CHANNEL

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	236

fit	/app/data/saxs_computation/qd/1qdv/1qdv.fit
pddf	/app/data/pr_computation/qd/1qdv/1qdv.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/qd/1qdv/1qdv.dat