1udi

NUCLEOTIDE MIMICRY IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE URACIL-DNA GLYCOSYLASE-URACIL GLYCOSYLASE INHIBITOR PROTEIN COMPLEX

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

URACIL-DNA GLYCOSYLASE

物种未注明

UniProt P10186

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 URACIL-DNA GLYCOSYLASE INHIBITOR PROTEIN × 1 (P14739) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UNG_HHV11
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–244; UniProt 91–334

URACIL-DNA GLYCOSYLASE INHIBITOR PROTEIN

物种未注明

UniProt P14739

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 URACIL-DNA GLYCOSYLASE × 1 (P10186) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UNGI_BPPB2
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–83; UniProt 2–84

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1udi
沉积日期 deposition_date1995-10-30
结构标题 titleNUCLEOTIDE MIMICRY IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE URACIL-DNA GLYCOSYLASE-URACIL GLYCOSYLASE INHIBITOR PROTEIN COMPLEX
关键词 keywordsHYDROLASE-INHIBITOR complex; HYDROLASE/INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1udi__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1udi__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1udi__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)20.60 Å
Rg(电子密度)19.41 Å
总 Rg20.37 Å
原子数2472
残基数310
排除体积43908 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1udi__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1udie_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.18 — Uracil-DNA glycosylase-like
超家族 Superfamily superfamilyc.18.1 — Uracil-DNA glycosylase-like
家族 Family familyc.18.1.1 — Uracil-DNA glycosylase
结构域编号 domain_idd1udii_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.17.5 — Uracil-DNA glycosylase inhibitor protein
家族 Family familyd.17.5.1 — Uracil-DNA glycosylase inhibitor protein

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1udiE00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology470 — Uracil-DNA Glycosylase, subunit E
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Uracil-DNA glycosylase-like domain
结构域编号 domain_id1udiI00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology450 — Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Bacteriophage PBS2, uracil-glycosylase inhibitor

7. 引用文献 (4)