2a1t

Structure of the human MCAD:ETF E165betaA complex

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Acyl-CoA dehydrogenase, medium-chain specific, mitochondrial precursor

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Electron transfer flavoprotein alpha-subunit, mitochondrial precursor × 1 （P13804） Electron transfer flavoprotein beta-subunit × 1 （P38117） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 5 ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 water × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACADM_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–421； UniProt 1–421 作者链 B； PDB构建体 1–421； UniProt 1–421 作者链 C； PDB构建体 1–421； UniProt 1–421 作者链 D； PDB构建体 1–421； UniProt 1–421

Electron transfer flavoprotein alpha-subunit, mitochondrial precursor

Homo sapiens

UniProt P13804

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Acyl-CoA dehydrogenase, medium-chain specific, mitochondrial precursor × 4 （P11310） Electron transfer flavoprotein beta-subunit × 1 （P38117） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 5 ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 water × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ETFA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–333； UniProt 1–333

Electron transfer flavoprotein beta-subunit

Homo sapiens

UniProt P38117

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Acyl-CoA dehydrogenase, medium-chain specific, mitochondrial precursor × 4 （P11310） Electron transfer flavoprotein alpha-subunit, mitochondrial precursor × 1 （P13804） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 5 ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 water × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ETFB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–255； UniProt 1–255

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2a1t
沉积日期 deposition_date	2005-06-21
结构标题 title	Structure of the human MCAD:ETF E165betaA complex
关键词 keywords	;electron transfer, domain dynamics, conformational sampling, protein:protein complex, fatty acid b-degradation, OXIDOREDUCTASE-ELECTRON TRANSPORT COMPLEX ;; OXIDOREDUCTASE/ELECTRON TRANSPORT
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2a1t__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2a1t__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2a1t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	40.18 Å
Rg（电子密度）	39.90 Å
总 Rg	40.20 Å
原子数	16125
残基数	2100
排除体积	286920 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2a1t__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Acyl-CoA dehydrogenase, medium-chain specific, mitochondrial precursor
分子量 formula_weight	46648.3 kDa
EC 编号 ec_number	1.3.99.3
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	16189

MAAGFGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQTAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYKN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Electron transfer flavoprotein alpha-subunit, mitochondrial precursor
分子量 formula_weight	35121.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MFRAAAPGQLRRAASLLRFQSTLVIAEHANDSLAPITLNTITAATRLGGEVSCLVAGTKCDKVAQDLCKVAGIAKVLVAQHDVYKGLLPEELTPLILATQKQFNYTHICAGASAFGKNLLPRVAAKLEVAPISDIIAIKSPDTFVRTIYAGNALCTVKCDEKVKVFSVRGTSFDAAATSGGSASSEKASSTSPVEISEWLDQKLTKSDRPELTGAKVVVSGGRGLKSGENFKLLYDLADQLHAAVGASRAAVDAGFVPNDMQVGQTGKIVAPELYIAVGISGAIQHLAGMKDSKTIVAINKDPEAPIFQVADYGIVADLFKVVPEMTEILKKK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Electron transfer flavoprotein beta-subunit
分子量 formula_weight	27827.6 kDa
突变 mutation	E165A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MAELRVLVAVKRVIDYAVKIRVKPDRTGVVTDGVKHSMNPFCEIAVEEAVRLKEKKLVKEVIAVSCGPAQCQETIRTALAMGADRGIHVEVPPAEAERLGPLQVARVLAKLAEKEKVDLVLLGKQAIDDDCNQTGQMTAGFLDWPQGTFASQVTLEGDKLKVERAIDGGLETLRLKLPAVVTADLRLNEPRYATLPNIMKAKKKKIEVIKPGDLGVDLTSKLSVISVEDPPQRTAGVKVETTEDLVAKLKEIGRI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	785.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	ADENOSINE MONOPHOSPHATE
分子量 formula_weight	347.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	64

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 26 domains

SCOP 2.08 (11 domains)

结构域编号 domain_id	d2a1ta1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.29 — Bromodomain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.29.3 — Acyl-CoA dehydrogenase C-terminal domain-like
家族 Family family	a.29.3.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2a1ta2
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.6 — Acyl-CoA dehydrogenase NM domain-like
超家族 Superfamily superfamily	e.6.1 — Acyl-CoA dehydrogenase NM domain-like
家族 Family family	e.6.1.1 — Medium chain acyl-CoA dehydrogenase, NM (N-terminal and middle) domains

结构域编号 domain_id	d2a1tb1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.29 — Bromodomain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.29.3 — Acyl-CoA dehydrogenase C-terminal domain-like
家族 Family family	a.29.3.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2a1tb2
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.6 — Acyl-CoA dehydrogenase NM domain-like
超家族 Superfamily superfamily	e.6.1 — Acyl-CoA dehydrogenase NM domain-like
家族 Family family	e.6.1.1 — Medium chain acyl-CoA dehydrogenase, NM (N-terminal and middle) domains

结构域编号 domain_id	d2a1tc1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.29 — Bromodomain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.29.3 — Acyl-CoA dehydrogenase C-terminal domain-like
家族 Family family	a.29.3.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2a1tc2
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.6 — Acyl-CoA dehydrogenase NM domain-like
超家族 Superfamily superfamily	e.6.1 — Acyl-CoA dehydrogenase NM domain-like
家族 Family family	e.6.1.1 — Medium chain acyl-CoA dehydrogenase, NM (N-terminal and middle) domains

结构域编号 domain_id	d2a1td1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.29 — Bromodomain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.29.3 — Acyl-CoA dehydrogenase C-terminal domain-like
家族 Family family	a.29.3.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2a1td2
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.6 — Acyl-CoA dehydrogenase NM domain-like
超家族 Superfamily superfamily	e.6.1 — Acyl-CoA dehydrogenase NM domain-like
家族 Family family	e.6.1.1 — Medium chain acyl-CoA dehydrogenase, NM (N-terminal and middle) domains

结构域编号 domain_id	d2a1tr1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.26 — Adenine nucleotide alpha hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.26.2 — Adenine nucleotide alpha hydrolases-like
家族 Family family	c.26.2.3 — ETFP subunits

结构域编号 domain_id	d2a1tr2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.31 — DHS-like NAD/FAD-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	c.31.1 — DHS-like NAD/FAD-binding domain
家族 Family family	c.31.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2a1ts1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.26 — Adenine nucleotide alpha hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.26.2 — Adenine nucleotide alpha hydrolases-like
家族 Family family	c.26.2.3 — ETFP subunits

CATH v4.4 (15 domains)

结构域编号 domain_id	2a1tA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	540 — Butyryl-Coa Dehydrogenase, subunit A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2a1tA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	110 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A, domain 2

结构域编号 domain_id	2a1tA03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A, domain 3

结构域编号 domain_id	2a1tB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	540 — Butyryl-Coa Dehydrogenase, subunit A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2a1tB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	110 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A, domain 2

结构域编号 domain_id	2a1tB03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A, domain 3

结构域编号 domain_id	2a1tC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	540 — Butyryl-Coa Dehydrogenase, subunit A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2a1tC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	110 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A, domain 2

结构域编号 domain_id	2a1tC03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A, domain 3

结构域编号 domain_id	2a1tD01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	540 — Butyryl-Coa Dehydrogenase, subunit A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2a1tD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	110 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A, domain 2

结构域编号 domain_id	2a1tD03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A, domain 3

结构域编号 domain_id	2a1tR01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	620 — HUPs

结构域编号 domain_id	2a1tR02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1220 — TPP-binding domain

结构域编号 domain_id	2a1tS01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	620 — HUPs

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晶胞边长 a length_a	94.184 Å
晶胞边长 b length_b	100.659 Å
晶胞边长 c length_c	244.384 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	19.980 Å
R 因子 r_factor	0.2025
R_work r_work	0.1990
R_free r_free	0.2686

Structure of the human MCAD:ETF E165betaA complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Acyl-CoA dehydrogenase, medium-chain specific, mitochondrial precursor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Electron transfer flavoprotein alpha-subunit, mitochondrial precursor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Electron transfer flavoprotein beta-subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2a1t__assembly_1__model_1

2a1t__assembly_1__model_1 | I(q)

2a1t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 26 domains

SCOP 2.08 (11 domains)

CATH v4.4 (15 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of the human MCAD:ETF E165betaA complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Acyl-CoA dehydrogenase, medium-chain specific, mitochondrial precursor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Electron transfer flavoprotein alpha-subunit, mitochondrial precursor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Electron transfer flavoprotein beta-subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2a1t__assembly_1__model_1

2a1t__assembly_1__model_1 | I(q)

2a1t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 26 domains

SCOP 2.08 (11 domains)

CATH v4.4 (15 domains)

7. 引用文献 (1)