SAXSdb — 2gy7

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Angiopoietin-2

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 3 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 281–495	片段：Angiopoietin-2 Receptor binding domain (residues 281-495)	Angiopoietin-1 receptor × 1 （Q02763） ;2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；2.2 M Ammonium Sulfate, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.70 Å R-free 0.317

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2GY7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1Z3S Angiopoietin-2 Receptor Binding Domain 提交 2005-03-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 281–496（216 aa）片段：Receptor binding domain (residues 281-496)	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；PEG-4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.35 Å R-free 0.287
1Z3S Angiopoietin-2 Receptor Binding Domain 提交 2005-03-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 281–496（216 aa）片段：Receptor binding domain (residues 281-496)	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；PEG-4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.35 Å R-free 0.287
1Z3U Structure of the Angiopoietin-2 Recptor Binding Domain and Identification of Surfaces Involved in Tie2 Recognition 提交 2005-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 281–496（216 aa）片段：Receptor binding domain (residues 281-496)	突变：F469A, Y475A, Y476A	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；Ammonium Sulfate and PEG-4000, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.25 Å R-free 0.278
1Z3U Structure of the Angiopoietin-2 Recptor Binding Domain and Identification of Surfaces Involved in Tie2 Recognition 提交 2005-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 281–496（216 aa）片段：Receptor binding domain (residues 281-496)	突变：F469A, Y475A, Y476A	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；Ammonium Sulfate and PEG-4000, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.25 Å R-free 0.278
1Z3U Structure of the Angiopoietin-2 Recptor Binding Domain and Identification of Surfaces Involved in Tie2 Recognition 提交 2005-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 281–496（216 aa）片段：Receptor binding domain (residues 281-496)	突变：F469A, Y475A, Y476A	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；Ammonium Sulfate and PEG-4000, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.25 Å R-free 0.278
1Z3U Structure of the Angiopoietin-2 Recptor Binding Domain and Identification of Surfaces Involved in Tie2 Recognition 提交 2005-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 281–496（216 aa）片段：Receptor binding domain (residues 281-496)	突变：F469A, Y475A, Y476A	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；Ammonium Sulfate and PEG-4000, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.25 Å R-free 0.278
4JZC Angiopoietin-2 fibrinogen domain TAG mutant 提交 2013-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 279–496（218 aa）片段：fibrinogen-like receptor-binding domain	突变：P183T, Q184A, R185G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.0 M Na/K-tartate, 0.1 M Tris, 0.2 M LiSO4, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.248
4JZC Angiopoietin-2 fibrinogen domain TAG mutant 提交 2013-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 279–496（218 aa）片段：fibrinogen-like receptor-binding domain	突变：P183T, Q184A, R185G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.0 M Na/K-tartate, 0.1 M Tris, 0.2 M LiSO4, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.248
4ZFG Dual-specificity Fab 5A12 in complex with Angiopoietin 2 提交 2015-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 225–444（220 aa）片段：Receptor binding domain, UNP residues 225-444	未记录	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M lithium sulfate, 25% PEG 3350, 3% D(+)-sucrose	分辨率 2.27 Å R-free 0.223
8VGP CryoEM structure of Angiopoietin-2 in complex with engineered conformationally rigid Fab 5A12.6DS 提交 2023-12-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 225–444（220 aa）片段：Receptor binding domain, UNP residues 225-444	未记录	CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9HMI Crystal structure of the Calf domains of Integrin Alpha5 in complex with angiopoietin2 peptide 提交 2024-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 359–366（8 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M ammonium formate; 20% polyethylene glycol 3350 (wt/vol)	分辨率 2.78 Å R-free 0.306

共 6 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	ANGP2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–216； UniProt 281–495

Angiopoietin-1 receptor

Homo sapiens

UniProt Q02763

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 3 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 23–445	片段：Tie2 Ligand-binding domain (residues 23-445)	Angiopoietin-2 × 1 （O15123） ;2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；2.2 M Ammonium Sulfate, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.70 Å R-free 0.317

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2GY7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1FVR TIE2 KINASE DOMAIN 提交 2000-09-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 808–1124（317 aa）片段：KINASE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；2.5% PEG12000, 2.5% glycerol, 100mM Hepes, 10mM spermidine, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K	分辨率 2.20 Å R-free 0.225
1FVR TIE2 KINASE DOMAIN 提交 2000-09-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 808–1124（317 aa）片段：KINASE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；2.5% PEG12000, 2.5% glycerol, 100mM Hepes, 10mM spermidine, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K	分辨率 2.20 Å R-free 0.225
2GY5 Tie2 Ligand-Binding Domain Crystal Structure 提交 2006-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–445（423 aa）片段：Ligand-binding domain (residues 23-445)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 4 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；2.2M Ammonium Sulfate, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.294
2OO8 Synthesis, Structural Analysis, and SAR Studies of Triazine Derivatives as Potent, Selective Tie-2 Inhibitors 提交 2007-01-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 X 808–1124（317 aa）片段：Kinase domain	未记录	RAJ N-{3-[3-(DIMETHYLAMINO)PROPYL]-5-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL}-4-METHYL-3-[(3-PYRIMIDIN-4-YLPYRIDIN-2-YL)AMINO]BENZAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；14-18 % (w/v) PEG 3350, and 0.2 M tri-Potassium Citrate (pH 6.5-7.5), and 2% (v/v) isopropanol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.279
2OSC Synthesis, Structural Analysis, and SAR Studies of Triazine Derivatives as Potent, Selective Tie-2 Inhibitors 提交 2007-02-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 808–1124（317 aa）片段：Tie-2 Kinase domain	未记录	MUH N-{4-METHYL-3-[(3-PYRIMIDIN-4-YLPYRIDIN-2-YL)AMINO]PHENYL}-3-(TRIFLUOROMETHYL)BENZAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；14-18 % (w/v) PEG 3350, and 0.2 M tri-Potassium Citrate (pH 6.5-7.5), and 2% (v/v) isopropanol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.306
2P4I Evolution of a highly Selective and Potent 2-(Pyridin-2-yl)-1,3,5-triazine Tie-2 Kinase Inhibitor 提交 2007-03-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 808–1124（317 aa）	未记录	MR9 4-METHYL-3-({3-[2-(METHYLAMINO)PYRIMIDIN-4-YL]PYRIDIN-2-YL}OXY)-N-[2-MORPHOLIN-4-YL-5-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]BENZAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；14-18% PEG 3350, 0.2M tri-Potassium Citrate (pH 6.5-7.5) and 2% isopropanol., pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.303
2P4I Evolution of a highly Selective and Potent 2-(Pyridin-2-yl)-1,3,5-triazine Tie-2 Kinase Inhibitor 提交 2007-03-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 808–1124（317 aa）	未记录	MR9 4-METHYL-3-({3-[2-(METHYLAMINO)PYRIMIDIN-4-YL]PYRIDIN-2-YL}OXY)-N-[2-MORPHOLIN-4-YL-5-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]BENZAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；14-18% PEG 3350, 0.2M tri-Potassium Citrate (pH 6.5-7.5) and 2% isopropanol., pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.303
2WQB Structure of the Tie2 kinase domain in complex with a thiazolopyrimidine inhibitor 提交 2009-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 802–1124（323 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 802-1124	突变：YES	QQ1 2-[3-(CYCLOHEXYLMETHYL)-5-PHENYL-IMIDAZOL-4-YL]-[1,3]THIAZOLO[4,5-E]PYRIMIDIN-7-AMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；293 K；5 MG/ML PROTEIN, 5% (W/V) PEG6000, 5% (V/V) MPD, 100MM MOPS PH7.5, 293K	分辨率 2.95 Å R-free 0.259
3BEA cFMS tyrosine kinase (tie2 KID) in complex with a pyrimidinopyridone inhibitor 提交 2007-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 917–935（19 aa）	突变：A695L	SO4 SULFATE ION × 3 IXH 8-(2,3-dihydro-1H-inden-5-yl)-2-({4-[(3R,5S)-3,5-dimethylpiperazin-1-yl]phenyl}amino)-5-oxo-5,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；298 K；PEG 3350, sodium acetate, Li2SO4, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.02 Å R-free 0.230
3L8P Crystal structure of cytoplasmic kinase domain of Tie2 complexed with inhibitor CEP11207 提交 2010-01-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 808–1124（317 aa）片段：Tie2 fragment 808-1124	未记录	0CE 2-methyl-11-(1-methylethyl)-8-[(2S)-tetrahydro-2H-pyran-2-yl]-2,11,12,13-tetrahydro-4H-indazolo[5,4-a]pyrrolo[3,4-c]carbazol-4-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；8% PEG 3350, 0.2M Tri-Ammonium Citrate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.40 Å R-free 0.265
4X3J Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key 提交 2014-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 802–1122（321 aa）片段：Kinase domain, UNP residues 802-1122	突变：D964N	3WR 1-[4-(4-amino-5-oxopyrido[2,3-d]pyrimidin-8(5H)-yl)phenyl]-3-[2-fluoro-5-(trifluoromethyl)phenyl]urea × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Tris/HCl pH 7.0 0.05 M NaCl 0.03 M Lithiumsulfat	分辨率 2.50 Å R-free 0.293
5MYA Homodimerization of Tie2 Fibronectin-like domains 1-3 in space group C2 提交 2017-01-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 443–742（300 aa）链 B 443–742（300 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M Tris buffer at pH 7.0 - 8.5 and 14-20% PEG 3350 (w/v)	分辨率 2.90 Å R-free 0.277
5MYB Homodimerization of Tie2 Fibronectin-like domains 2 and 3 in space group P21 提交 2017-01-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 443–742（300 aa）链 B 443–742（300 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；0.1 M Tris buffer at pH 7.0 - 8.5 and 14-20% PEG 3350 (w/v)	分辨率 2.60 Å R-free 0.278
5UTK Crystal structure of the membrane proximal three fibronectin type III (FNIII) domains of Tie2 (Tie2[FNIIIa-c]) 提交 2017-02-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 399–698（300 aa）片段：unp residues 399-698 链 B 399–698（300 aa）片段：unp residues 399-698	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；25-40% glycerol, 2.5-15% PEG 3K, 100 mM sodium acetate, 100 mM sodium phosphate, pH 4.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.247
6MWE CRYSTAL STRUCTURE OF TIE2 IN COMPLEX WITH DECIPERA COMPOUND DP1919 提交 2018-10-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 808–1124（317 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 919 4-[4-({[3-tert-butyl-1-(quinolin-6-yl)-1H-pyrazol-5-yl]carbamoyl}amino)-3-fluorophenoxy]-N-methylpyridine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；290 K；JCSG+ screen e4: 1.26M ammonium sulphate: 200mM lithium sulphate, 100mM Tris pH 8.5: cryo: 25% EG in 3 steps	分辨率 2.05 Å R-free 0.166
6MWE CRYSTAL STRUCTURE OF TIE2 IN COMPLEX WITH DECIPERA COMPOUND DP1919 提交 2018-10-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 808–1124（317 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 919 4-[4-({[3-tert-butyl-1-(quinolin-6-yl)-1H-pyrazol-5-yl]carbamoyl}amino)-3-fluorophenoxy]-N-methylpyridine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；290 K；JCSG+ screen e4: 1.26M ammonium sulphate: 200mM lithium sulphate, 100mM Tris pH 8.5: cryo: 25% EG in 3 steps	分辨率 2.05 Å R-free 0.166
7E72 Crystal structure of Tie2-agonistic antibody in complex with human Tie2 Fn2-3 提交 2021-02-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 541–735（195 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 22	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292.15 K；100 mM Bis-Tris propane pH 8.5, 110 mM potassium dihydrogen phosphate, 15% (w/v) polyethylene glycol 3350	分辨率 2.09 Å R-free 0.233
7E72 Crystal structure of Tie2-agonistic antibody in complex with human Tie2 Fn2-3 提交 2021-02-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 541–735（195 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292.15 K；100 mM Bis-Tris propane pH 8.5, 110 mM potassium dihydrogen phosphate, 15% (w/v) polyethylene glycol 3350	分辨率 2.09 Å R-free 0.233
9LV4 Cryo-EM Structure of Human Tie2/minibinder tw1102_4 helices Complex 提交 2025-02-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 23–452（430 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging	分辨率 2.67 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIE2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–423； UniProt 23–445

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2gy7
沉积日期 deposition_date	2006-05-09
结构标题 title	Angiopoietin-2/Tie2 Complex Crystal Structure
关键词 keywords	Receptor-Ligand Complex, Signaling Protein; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	33.68 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	34.04 Å
零角强度 I(0) i0	92367300.00
分子量 molecular_weight	73900.0 kDa
排除体积 excluded_volume	91274 Å³
包络体积 envelope_volume	118830 Å³
水化壳体积 shell_volume	32038 Å³
包络直径 envelope_diameter	124.2 Å
壳层 Rg shell_rg	36.58 Å
包络 Rg envelope_rg	34.13 Å
形状 Rg shape_rg	34.08 Å
总 Rg total_rg	34.08 Å
总原子数 total_atoms	5169
残基数 n_residues	639
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	117.2 Å
Rg (实空间) rg_real	34.04 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.27 Å
I(0) (实空间) i0_real	9.2370e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.6210e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	33.82 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	92350000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7708
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	27.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.601
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.291
角度范围 angular_range	— – 0.2350 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	19090000.0000
实空间数据点数 n_real_points	48
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.617; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.502; Smooth: 0.664

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Angiopoietin-2
分子量 formula_weight	24752.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	5169

EFRDCAEVFKSGHTTNGIYTLTFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLGNEFVSQLTNQQRYVLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSISQPGNDFSTKDGDNDKCICKCSQMLTGGWWFDACGPSNLNGMYYPQRQNTNKFNGIKWYYWKGSGYSLKATTMMIRPAD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Angiopoietin-1 receptor
分子量 formula_weight	47186.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.10.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

AMDLILINSLPLVSDAETSLTCIASGWRPHEPITIGRDFEALMNQHQDPLEVTQDVTREWAKKVVWKREKASKINGAYFCEGRVRGEAIRIRTMKMRQQASFLPATLTMTVDKGDNVNISFKKVLIKEEDAVIYKNGSFIHSVPRHEVPDILEVHLPHAQPQDAGVYSARYIGGNLFTSAFTRLIVRRCEAQKWGPECNHLCTACMNNGVCHEDTGECICPPGFMGRTCEKACELHTFGRTCKERCSGQEGCKSYVFCLPDPYGCSCATGWKGLQCNEACHPGFYGPDCKLRCSCNNGEMCDRFQGCLCSPGWQGLQCEREGIPRMTPKIVDLPDHIEVNSGKFNPICKASGWPLPTNEEMTLVKPDGTVLHPKDFNHTDHFSVAIFTIHRILPPDSGVWVCSVNTVAGMVEKPFNISVKVLP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	;2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	830.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	2gy7A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	215 — Gamma Fibrinogen; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Gamma Fibrinogen, chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	2gy7A02
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	530 — Gamma-fibrinogen Carboxyl Terminal Fragment; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Gamma-fibrinogen Carboxyl Terminal Fragment, domain 2

结构域编号 domain_id	2gy7B01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	2gy7B02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	2gy7B03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	300 — Tie2 ligand-binding domain fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tie2 ligand-binding domain superfamily

结构域编号 domain_id	2gy7B04
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	165.636 Å
晶胞边长 b length_b	165.636 Å
晶胞边长 c length_c	115.310 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.700 Å
最低分辨率 resolution_low	8.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2400
R_free r_free	0.3170

fit	/app/data/saxs_computation/gy/2gy7/2gy7.fit
pddf	/app/data/pr_computation/gy/2gy7/2gy7.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/gy/2gy7/2gy7.dat

Angiopoietin-2/Tie2 Complex Crystal Structure

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Angiopoietin-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Angiopoietin-1 receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)