SAXSdb — 2hue

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Anti-silencing protein 1

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Histone H3 × 1 （Q92133） Histone H4 × 1 （P62799） ZINC ION × 1 GLYCEROL × 2 SULFATE ION × 2 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Histone H3 × 2 （Q92133） Histone H4 × 2 （P62799） ZINC ION × 2 GLYCEROL × 4 SULFATE ION × 4 water × 6	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Histone H3 × 2 （Q92133） Histone H4 × 2 （P62799） ZINC ION × 2 GLYCEROL × 4 SULFATE ION × 4 water × 6	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Histone H3 × 2 （Q92133） Histone H4 × 2 （P62799） ZINC ION × 2 GLYCEROL × 4 SULFATE ION × 4 water × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ASF1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 8–175； UniProt 2–169

Histone H3

Xenopus laevis

UniProt Q92133

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Anti-silencing protein 1 × 1 （P32447） Histone H4 × 1 （P62799） ZINC ION × 1 GLYCEROL × 2 SULFATE ION × 2 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Anti-silencing protein 1 × 2 （P32447） Histone H4 × 2 （P62799） ZINC ION × 2 GLYCEROL × 4 SULFATE ION × 4 water × 6	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Anti-silencing protein 1 × 2 （P32447） Histone H4 × 2 （P62799） ZINC ION × 2 GLYCEROL × 4 SULFATE ION × 4 water × 6	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Anti-silencing protein 1 × 2 （P32447） Histone H4 × 2 （P62799） ZINC ION × 2 GLYCEROL × 4 SULFATE ION × 4 water × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q92133_XENLA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 3–77； UniProt 62–136

Histone H4

Xenopus laevis

UniProt P62799

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Anti-silencing protein 1 × 1 （P32447） Histone H3 × 1 （Q92133） ZINC ION × 1 GLYCEROL × 2 SULFATE ION × 2 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Anti-silencing protein 1 × 2 （P32447） Histone H3 × 2 （Q92133） ZINC ION × 2 GLYCEROL × 4 SULFATE ION × 4 water × 6	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Anti-silencing protein 1 × 2 （P32447） Histone H3 × 2 （Q92133） ZINC ION × 2 GLYCEROL × 4 SULFATE ION × 4 water × 6	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Anti-silencing protein 1 × 2 （P32447） Histone H3 × 2 （Q92133） ZINC ION × 2 GLYCEROL × 4 SULFATE ION × 4 water × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H4_XENLA
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 2–84； UniProt 20–102

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2hue
沉积日期 deposition_date	2006-07-26
结构标题 title	Structure of the H3-H4 chaperone Asf1 bound to histones H3 and H4
关键词 keywords	mini beta sheet, elongated Beta sandwhich, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2hue__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2hue__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2hue__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.73 Å
Rg（电子密度）	21.71 Å
总 Rg	22.74 Å
原子数	2583
残基数	321
排除体积	46226 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2hue__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2hue__assembly_2__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2hue__assembly_3__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`2hue__assembly_4__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Anti-silencing protein 1
分子量 formula_weight	19664.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3080

PLGSPNSSIVSLLGIKVLNNPAKFTDPYEFEITFECLESLKHDLEWKLTYVGSSRSLDHDQELDSILVGPVPVGVNKFVFSADPPSAELIPASELVSVTVILLSCSYDGREFVRVGYYVNNEYDEEELRENPPAKVQVDHIVRNILAEKPRVTRFNIVWDNENEGDLYPPEQPGV

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Histone H3
分子量 formula_weight	8888.5 kDa
突变 mutation	G103A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MALIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	9540.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	367

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_id	d2huea1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.22 — ASF1-like
家族 Family family	b.1.22.1 — ASF1-like

结构域编号 domain_id	d2huea2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2hueb1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.22 — Histone-fold
超家族 Superfamily superfamily	a.22.1 — Histone-fold
家族 Family family	a.22.1.1 — Nucleosome core histones

结构域编号 domain_id	d2hueb2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2huec_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.22 — Histone-fold
超家族 Superfamily superfamily	a.22.1 — Histone-fold
家族 Family family	a.22.1.1 — Nucleosome core histones

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	2hueA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1490 — Histone chaperone ASF1-like

结构域编号 domain_id	2hueB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	2hueC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

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晶胞边长 a length_a	95.749 Å
晶胞边长 b length_b	95.749 Å
晶胞边长 c length_c	110.676 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 31 2 1
空间群编号 int_tables_number	152
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.700 Å
最低分辨率 resolution_low	11.980 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2090
R_free r_free	0.2390

Structure of the H3-H4 chaperone Asf1 bound to histones H3 and H4

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Anti-silencing protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Histone H3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2hue__assembly_1__model_1

2hue__assembly_1__model_1 | I(q)

2hue__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of the H3-H4 chaperone Asf1 bound to histones H3 and H4

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Anti-silencing protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2hue__assembly_1__model_1

2hue__assembly_1__model_1 | I(q)

2hue__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)