2jex

Transcription activator structure reveals redox control of a replication initiation reaction

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

REGULATORY PROTEIN E2

BOVINE PAPILLOMAVIRUS TYPE 1

UniProt P03122

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VE2_BPV1
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–209; UniProt 1–209

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2jex
沉积日期 deposition_date2007-01-24
结构标题 titleTranscription activator structure reveals redox control of a replication initiation reaction
关键词 keywords;NUCLEAR PROTEIN, DNA REPLICATION, PHOSPHORYLATION, TRANSCRIPTION REGULATION, VIRAL TRANSCRIPTION FACTOR, BOVINE PAPILLOMAVIRUS, REPLICATION INITIATION, EARLY PROTEIN, TRANSCRIPTION, REDOX CONTROL, E1, E2, OXIDATION, ACTIVATOR, REPRESSOR, DNA-BINDING ;; TRANSCRIPTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2jex__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2jex__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2jex__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)21.47 Å
Rg(电子密度)20.63 Å
总 Rg21.44 Å
原子数1572
残基数197
排除体积27606 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2jex__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd2jexa_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.91 — E2 regulatory, transactivation domain
超家族 Superfamily superfamilyb.91.1 — E2 regulatory, transactivation domain
家族 Family familyb.91.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2jexA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — E2 (early) protein, N terminal domain, subdomain 1
结构域编号 domain_id2jexA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology200 — Regulatory Protein E2; Chain: A; Domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Papillomavirus E2 early protein domain

7. 引用文献 (1)