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2jxo

Structure of the second PDZ domain of NHERF-1

Method: SOLUTION NMR Dmax: 44.4 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ezrin-radixin-moesin-binding phosphoprotein 50

Homo sapiens

UniProt O14745

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 150–240 片段：PDZ 2 domain 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7.5；288.1 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient NMR样品组成：1 mM PDZ2, HEPES, DTT, H2O, DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成：1 mM [U-100% 15N] PDZ2, HEPES, DTT, H2O, DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成：1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PDZ2, HEPES, DTT, H2O, DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2JXO Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1G9O FIRST PDZ DOMAIN OF THE HUMAN NA+/H+ EXCHANGER REGULATORY FACTOR 提交 2000-11-26 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 11–99（89 aa） 片段：PDZ1 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；291 K；potassium sodium tartrate, sodium citrate, ammonium sulfate, manganese chloride, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.50 Å R-free 0.201
1GQ4 STRUCTURAL DETERMINANTS OF THE NHERF INTERACTION WITH BETA2AR AND PDGFR 提交 2001-11-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 11–94（84 aa） 片段：PDZ1 DOMAIN, RESIDUES 11-94
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.24；CITRIC ACID, LITHIUM CHLORIDE, pH 4.24
分辨率 1.90 Å R-free 0.186
1GQ5 Structural Determinants of the NHERF Interaction with beta2-AR and PDGFR 提交 2001-11-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 11–94（84 aa） 片段：PDZ1 DOMAIN, RESIDUES 11-94
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；SODIUM ACETATE, SODIUM CHLORIDE, pH 4.60
分辨率 2.20 Å R-free 0.263
1I92 STRUCTURAL BASIS OF THE NHERF PDZ1-CFTR INTERACTION 提交 2001-03-16 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 11–94（84 aa） 片段：PDZ1 DOMAIN (RESIDUES 11-94)
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；Sodium Acetate, Sodium Chloride, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.70 Å R-free 0.217
1SGH Moesin FERM domain bound to EBP50 C-terminal peptide 提交 2004-02-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 321–358（38 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；Tris, PEG 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.401
2D10 Crystal structure of the Radixin FERM domain complexed with the NHERF-1 C-terminal tail peptide 提交 2005-08-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 330–357（28 aa） 片段：residues 331-358
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG4000, 5% Isopropanol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.268
2D10 Crystal structure of the Radixin FERM domain complexed with the NHERF-1 C-terminal tail peptide 提交 2005-08-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 330–357（28 aa） 片段：residues 331-358
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG4000, 5% Isopropanol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.268
2D10 Crystal structure of the Radixin FERM domain complexed with the NHERF-1 C-terminal tail peptide 提交 2005-08-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 330–357（28 aa） 片段：residues 331-358
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG4000, 5% Isopropanol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.268
2D10 Crystal structure of the Radixin FERM domain complexed with the NHERF-1 C-terminal tail peptide 提交 2005-08-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 330–357（28 aa） 片段：residues 331-358
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG4000, 5% Isopropanol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.268
2KJD Solution structure of extended PDZ2 domain from NHERF1 (150-270) 提交 2009-05-27 构建体不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 150–270（121 aa） 片段：Extended PDZ2 domain: UNP residues 150-270
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.150；压力 ambient
NMR样品组成 550 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] PDZ2-270-1, 20 mM HEPES-2, 0.5 mM DTT-3, 0.1 mM PMSF-4, 150 mM sodium chloride-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2KRG Solution Structure of human sodium/ hydrogen exchange regulatory factor 1(150-358) 提交 2009-12-17 构建体不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 150–358（209 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5；303 K；压力 ambient
NMR样品组成 557 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] NHERF1 (150-358), 20 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.1 mM PMSF, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 389 uM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-80% 2H] NHERF1 (150-358), 20 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.1 mM PMSF, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 413 uM [U-100% 13C; U-100% 15N]-Leu,Val,Phe NHERF1 (150-358), 20 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.1 mM PMSF, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2M0T Structural characterization of the extended PDZ1 domain from NHERF1 提交 2012-11-06 构建体不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 11–120（110 aa） 片段：PDZ1 domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 ambient
NMR样品组成 400 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] PDZ1, 20 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.5 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2M0U Complex structure of C-terminal CFTR peptide and extended PDZ1 domain from NHERF1 提交 2012-11-06 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 11–120（110 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 ambient
NMR样品组成 286 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] PDZ1, 20 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.5 mM EDTA, 275 uM CFTR, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2M0V Complex structure of C-terminal CFTR peptide and extended PDZ2 domain from NHERF1 提交 2012-11-06 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 150–270（121 aa） 片段：PDZ2 domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 ambient
NMR样品组成 400 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] PDZ2, 20 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.5 mM EDTA, 688 uM CFTR, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 200 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] PDZ2, 20 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.5 mM EDTA, 275 uM CFTR, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2OZF The crystal structure of the 2nd PDZ domain of the human NHERF-1 (SLC9A3R1) 提交 2007-02-26 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 150–235（86 aa） 片段：Second PDZ domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2M NaNO3, 0.1M BTProp, 20% PEG 3350, 10% Ethylene glycol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.211
4JL7 Crystal Structure of the Chemokine Receptor CXCR2 in Complex with the First PDZ Domain of NHERF1 提交 2013-03-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 11–95（85 aa） 片段：unp residues 11-95
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；100 mM sodium acetate, 2.7 M sodium chloride, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.16 Å R-free 0.208
4LMM Crystal structure of NHERF1 PDZ1 domain complexed with the CXCR2 C-terminal tail in P21 space group 提交 2013-07-10 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 11–94（84 aa） 片段：UNP residues 11-95
未记录 ACY ACETIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；293 K；100 mM sodium acetate, 0.2 M ammonium acetate, 24% PEG4000, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.10 Å R-free 0.217
4MPA Crystal structure of NHERF1-CXCR2 signaling complex in P21 space group 提交 2013-09-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 11–94（84 aa） 片段：SEE REMARK 999
未记录 ACY ACETIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；293 K；100 mM sodium acetate, pH 4.8, 0.2 M ammonium acetate, 24% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.10 Å R-free 0.157
4N6X Crystal Structure of the Chemokine Receptor CXCR2 in Complex with the First PDZ Domain of NHERF1 提交 2013-10-14 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 11–94（84 aa） 片段：First PDZ Domain (UNP residues 11-94)
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.7 M sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.05 Å R-free 0.163
4PQW Crystal Structure of Phospholipase C beta 3 in Complex with PDZ1 of NHERF1 提交 2014-03-04 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 11–94（84 aa） 片段：unp residues 11-94
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.5 M sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.47 Å R-free 0.196
4Q3H The crystal structure of NHERF1 PDZ2 CXCR2 complex revealed by the NHERF1 CXCR2 chimeric protein 提交 2014-04-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 150–234（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris HCl, pH 8.5, 8% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.44 Å R-free 0.195
4Q3H The crystal structure of NHERF1 PDZ2 CXCR2 complex revealed by the NHERF1 CXCR2 chimeric protein 提交 2014-04-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 150–234（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris HCl, pH 8.5, 8% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.44 Å R-free 0.195
6RQR Extended NHERF1 PDZ2 domain in complex with the PDZ-binding motif of CFTR 提交 2019-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 150–269（120 aa）
链 B 150–269（120 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；1.65 M ammonium sulphate, 100 mM tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.20 Å R-free 0.233
9RXQ Structure of the PDZ1 domain from human NHERF1 with the C-terminal residues (KSTQF) of human URAT1 transporter (SLC22A12) 提交 2025-07-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 11–94（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；293 K；100 mM sodium acetate pH 4.8 200 mM ammonium acetate 24% PEG 4000
分辨率 1.38 Å R-free 0.183
9RXQ Structure of the PDZ1 domain from human NHERF1 with the C-terminal residues (KSTQF) of human URAT1 transporter (SLC22A12) 提交 2025-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 11–94（84 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；293 K；100 mM sodium acetate pH 4.8 200 mM ammonium acetate 24% PEG 4000
分辨率 1.38 Å R-free 0.183
9RXT Structure of the PDZ1 domain from human NHERF1 with the C-terminal residues (NATRL) of the human sodium-dependent phosphate transporter 2A (NaPi-IIa, SLC34A1) 提交 2025-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 11–94（84 aa）
未记录 TOE 2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXYL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；100mM Bicine pH 9, 100mM NaCl, 30% PEG 550 MME
分辨率 1.36 Å R-free 0.198

共 21 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NHERF_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 8–98； UniProt 150–240

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2jxo

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2jxo
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2jxo
沉积日期 deposition_date2007-11-27
结构标题 titleStructure of the second PDZ domain of NHERF-1
关键词 keywords;NHERF-1, PDZ domain, PDZ2, Acetylation, Cell projection, Membrane, Phosphoprotein, Polymorphism, Wnt signaling pathway, PROTEIN BINDING ;; PROTEIN BINDING
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier13.43 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron13.36 Å
零角强度 I(0) i0255958000.00
分子量 molecular_weight128500.0 kDa
排除体积 excluded_volume158660 ų
包络体积 envelope_volume24421 ų
水化壳体积 shell_volume13670 ų
包络直径 envelope_diameter50.5 Å
壳层 Rg shell_rg21.00 Å
包络 Rg envelope_rg15.66 Å
形状 Rg shape_rg13.36 Å
总 Rg total_rg13.62 Å
总原子数 total_atoms17928
残基数 n_residues1176
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax44.4 Å
Rg (实空间) rg_real13.37 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.36 Å
I(0) (实空间) i0_real2.5600e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.0290e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal13.37 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal256000000.0000
解质量估计 total_estimate0.7973
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary17.4 Å
偏度 Skewness skewness0.182
峰度 Kurtosis kurtosis-0.270
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha163300.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.790; Stabil: 0.997; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2jxoa1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.36 — PDZ domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.36.1 — PDZ domain-like
家族 Family familyb.36.1.1 — PDZ domain
结构域编号 domain_idd2jxoa2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2jxoA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology42 — Pdz3 Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — PDZ domain
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)