Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 4 | C-X-C chemokine receptor type 4 × 2 （P61073） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | SDF1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 3–70； UniProt 22–89 作者链 C； PDB构建体 3–70； UniProt 22–89 |
Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 4 | Stromal cell-derived factor 1 × 2 （P48061） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | CXCR4_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 3–40； UniProt 1–38 作者链 D； PDB构建体 3–40； UniProt 1–38 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 2k05 |
| 沉积日期 deposition_date | 2008-01-24 |
| 结构标题 title | Structure of SDF1 in complex with the CXCR4 N-terminus containing sulfotyrosines at postitions 7, 12 and 21 |
| 关键词 keywords | ;stromal cell derived factor-1, SDF1-alpha, CXCL12, CXCR4, chemokine, sulfotyrosine, locked dimer, Alternative splicing, Chemotaxis, Cytokine, Growth factor, Secreted, G-protein coupled receptor, Glycoprotein, Host-virus interaction, Membrane, Receptor, Sulfation, Transducer, Transmembrane ;; CYTOKINE |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
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Assembly 1 · Model 8 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 18.58 Å |
| Rg（电子密度） | 17.32 Å |
| 总 Rg | 18.30 Å |
| 原子数 | 3429 |
| 残基数 | 206 |
| 排除体积 | 30841 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 2k05__assembly_1__model_1 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 2k05__assembly_1__model_2 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 2k05__assembly_1__model_3 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 2k05__assembly_1__model_4 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 2k05__assembly_1__model_5 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 2k05__assembly_1__model_6 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 2k05__assembly_1__model_7 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 2k05__assembly_1__model_8 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 2k05__assembly_1__model_9 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 2k05__assembly_1__model_10 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 11 | 2k05__assembly_1__model_11 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 12 | 2k05__assembly_1__model_12 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 13 | 2k05__assembly_1__model_13 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 14 | 2k05__assembly_1__model_14 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 15 | 2k05__assembly_1__model_15 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 16 | 2k05__assembly_1__model_16 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 17 | 2k05__assembly_1__model_17 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 18 | 2k05__assembly_1__model_18 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 19 | 2k05__assembly_1__model_19 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 20 | 2k05__assembly_1__model_20 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d2k05a_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.9 — IL8-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.9.1 — Interleukin 8-like chemokines |
| 家族 Family family | d.9.1.1 — Interleukin 8-like chemokines |
| 结构域编号 domain_id | d2k05c_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.9 — IL8-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.9.1 — Interleukin 8-like chemokines |
| 家族 Family family | d.9.1.1 — Interleukin 8-like chemokines |
| 结构域编号 domain_id | 2k05A00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — |
| 结构域编号 domain_id | 2k05C00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — |