2k8m

S100A13-C2A binary complex structure

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Putative uncharacterized protein

Homo sapiens

UniProt Q6AI31

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Protein S100-A13 × 2 (Q99584) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6AI31_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–128; UniProt 143–268 作者链 D; PDB构建体 3–128; UniProt 143–268

Protein S100-A13

Homo sapiens

UniProt Q99584

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Putative uncharacterized protein × 2 (Q6AI31) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 S10AD_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–98; UniProt 1–98 作者链 C; PDB构建体 1–98; UniProt 1–98

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2k8m
沉积日期 deposition_date2008-09-14
结构标题 titleS100A13-C2A binary complex structure
关键词 keywordsProtein-Protein complex, S100A13, C2A, PROTEIN TRANSPORT; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2k8m__assembly_1__model_19

Assembly 1 · Model 19 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2k8m__assembly_1__model_19 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2k8m__assembly_1__model_19 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)34.74 Å
Rg(电子密度)35.57 Å
总 Rg35.32 Å
原子数7451
残基数452
排除体积66539 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2k8m__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2k8m__assembly_1__model_2 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2k8m__assembly_1__model_3 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2k8m__assembly_1__model_4 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2k8m__assembly_1__model_5 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2k8m__assembly_1__model_6 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2k8m__assembly_1__model_7 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2k8m__assembly_1__model_8 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2k8m__assembly_1__model_9 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2k8m__assembly_1__model_10 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2k8m__assembly_1__model_11 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2k8m__assembly_1__model_12 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2k8m__assembly_1__model_13 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2k8m__assembly_1__model_14 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2k8m__assembly_1__model_15 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2k8m__assembly_1__model_16 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2k8m__assembly_1__model_17 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2k8m__assembly_1__model_18 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2k8m__assembly_1__model_19 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2k8m__assembly_1__model_20 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd2k8ma1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.7 — C2 domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.7.1 — C2 domain (Calcium/lipid-binding domain, CaLB)
家族 Family familyb.7.1.2 — Synaptotagmin-like (S variant)
结构域编号 domain_idd2k8ma2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd2k8mb_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamilya.39.1 — EF-hand
家族 Family familya.39.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd2k8mc_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamilya.39.1 — EF-hand
家族 Family familya.39.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd2k8md1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.7 — C2 domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.7.1 — C2 domain (Calcium/lipid-binding domain, CaLB)
家族 Family familyb.7.1.2 — Synaptotagmin-like (S variant)
结构域编号 domain_idd2k8md2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2k8mA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — C2 domain
结构域编号 domain_id2k8mB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id2k8mC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id2k8mD00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — C2 domain
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7. 引用文献 (1)