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2kzt

Structure of the Tandem MA-3 Region of Pdcd4

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Programmed cell death protein 4

Homo sapiens

UniProt Q53EL6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Programmed cell death protein 4 × 1 （Q61823） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
2rg8 2rg8 3eij 3eij

共 4 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2kzt 2zu6 2zu6 8xxl 8xxm 8xxn 9bkd 9bln 9tes

共 9 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PDCD4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–163； UniProt 157–318

Programmed cell death protein 4

Mus musculus

UniProt Q61823

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Programmed cell death protein 4 × 1 （Q53EL6） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
2hm8 2iol 2iol 2ion 2ios 2nsz

共 6 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2kzt 3eiq

共 2 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PDCD4_MOUSE
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–131； UniProt 319–449

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2kzt
沉积日期 deposition_date2010-06-24
结构标题 titleStructure of the Tandem MA-3 Region of Pdcd4
关键词 keywordsPdcd4, MA-3, eIF4A, HEAT, Apoptosis; APOPTOSIS
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2kzt__assembly_1__model_60

Assembly 1 · Model 60 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2kzt__assembly_1__model_60 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2kzt__assembly_1__model_60 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）23.98 Å
Rg（电子密度）23.29 Å
总 Rg23.99 Å
原子数2792
残基数294
排除体积41068 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2kzt__assembly_1__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2kzt__assembly_1__model_2 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2kzt__assembly_1__model_3 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2kzt__assembly_1__model_4 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2kzt__assembly_1__model_5 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2kzt__assembly_1__model_6 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2kzt__assembly_1__model_7 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2kzt__assembly_1__model_8 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2kzt__assembly_1__model_9 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2kzt__assembly_1__model_10 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2kzt__assembly_1__model_11 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2kzt__assembly_1__model_12 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2kzt__assembly_1__model_13 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2kzt__assembly_1__model_14 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2kzt__assembly_1__model_15 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2kzt__assembly_1__model_16 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2kzt__assembly_1__model_17 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2kzt__assembly_1__model_18 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2kzt__assembly_1__model_19 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2kzt__assembly_1__model_20 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 21 2kzt__assembly_1__model_21 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 22 2kzt__assembly_1__model_22 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 23 2kzt__assembly_1__model_23 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 24 2kzt__assembly_1__model_24 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 25 2kzt__assembly_1__model_25 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 26 2kzt__assembly_1__model_26 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 27 2kzt__assembly_1__model_27 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 28 2kzt__assembly_1__model_28 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 29 2kzt__assembly_1__model_29 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 30 2kzt__assembly_1__model_30 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 31 2kzt__assembly_1__model_31 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 32 2kzt__assembly_1__model_32 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 33 2kzt__assembly_1__model_33 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 34 2kzt__assembly_1__model_34 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 35 2kzt__assembly_1__model_35 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 36 2kzt__assembly_1__model_36 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 37 2kzt__assembly_1__model_37 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 38 2kzt__assembly_1__model_38 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 39 2kzt__assembly_1__model_39 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 40 2kzt__assembly_1__model_40 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 41 2kzt__assembly_1__model_41 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 42 2kzt__assembly_1__model_42 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 43 2kzt__assembly_1__model_43 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 44 2kzt__assembly_1__model_44 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 45 2kzt__assembly_1__model_45 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 46 2kzt__assembly_1__model_46 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 47 2kzt__assembly_1__model_47 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 48 2kzt__assembly_1__model_48 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 49 2kzt__assembly_1__model_49 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 50 2kzt__assembly_1__model_50 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 51 2kzt__assembly_1__model_51 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 52 2kzt__assembly_1__model_52 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 53 2kzt__assembly_1__model_53 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 54 2kzt__assembly_1__model_54 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 55 2kzt__assembly_1__model_55 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 56 2kzt__assembly_1__model_56 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 57 2kzt__assembly_1__model_57 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 58 2kzt__assembly_1__model_58 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 59 2kzt__assembly_1__model_59 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 60 2kzt__assembly_1__model_60 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 61 2kzt__assembly_1__model_61 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 62 2kzt__assembly_1__model_62 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 63 2kzt__assembly_1__model_63 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 64 2kzt__assembly_1__model_64 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 65 2kzt__assembly_1__model_65 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 66 2kzt__assembly_1__model_66 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 67 2kzt__assembly_1__model_67 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 68 2kzt__assembly_1__model_68 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 69 2kzt__assembly_1__model_69 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 70 2kzt__assembly_1__model_70 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 71 2kzt__assembly_1__model_71 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 72 2kzt__assembly_1__model_72 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 73 2kzt__assembly_1__model_73 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd2kztb_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.118.1 — ARM repeat
家族 Family familya.118.1.14 — MIF4G domain-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2kztA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily180 —
结构域编号 domain_id2kztB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily180 —
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7. 引用文献 (1)