2l5x

Solution structure of IL1A-S100A13 complex

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin-1 alpha

Homo sapiens

UniProt P01583

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Protein S100-A13 × 2 (Q99584) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IL1A_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–151; UniProt 121–271 作者链 D; PDB构建体 1–151; UniProt 121–271

Protein S100-A13

Homo sapiens

UniProt Q99584

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Interleukin-1 alpha × 2 (P01583) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 S10AD_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–98; UniProt 1–98 作者链 C; PDB构建体 1–98; UniProt 1–98

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2l5x
沉积日期 deposition_date2010-11-09
结构标题 titleSolution structure of IL1A-S100A13 complex
关键词 keywords;Protein-protein complex, key component in non-classical pathway of IL-1a, Interleukin-1alpha, S100A13, CYTOKINE-TRANSPORT PROTEIN complex ;; CYTOKINE/TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2l5x__assembly_1__model_6

Assembly 1 · Model 6 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2l5x__assembly_1__model_6 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2l5x__assembly_1__model_6 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)30.55 Å
Rg(电子密度)30.47 Å
总 Rg30.91 Å
原子数8128
残基数498
排除体积72588 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2l5x__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2l5x__assembly_1__model_2 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2l5x__assembly_1__model_3 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2l5x__assembly_1__model_4 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2l5x__assembly_1__model_5 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2l5x__assembly_1__model_6 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2l5x__assembly_1__model_7 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2l5x__assembly_1__model_8 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2l5x__assembly_1__model_9 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2l5x__assembly_1__model_10 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2l5x__assembly_1__model_11 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2l5x__assembly_1__model_12 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2l5x__assembly_1__model_13 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2l5x__assembly_1__model_14 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2l5x__assembly_1__model_15 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2l5x__assembly_1__model_16 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2l5x__assembly_1__model_17 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2l5x__assembly_1__model_18 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2l5x__assembly_1__model_19 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2l5x__assembly_1__model_20 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd2l5xa_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamilyb.42.1 — Cytokine
家族 Family familyb.42.1.2 — Interleukin-1 (IL-1)
结构域编号 domain_idd2l5xb_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamilya.39.1 — EF-hand
家族 Family familya.39.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd2l5xc_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamilya.39.1 — EF-hand
家族 Family familya.39.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd2l5xd_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamilyb.42.1 — Cytokine
家族 Family familyb.42.1.2 — Interleukin-1 (IL-1)

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2l5xA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture80 — Trefoil
拓扑 Topology topology10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 —
结构域编号 domain_id2l5xB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id2l5xC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id2l5xD00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture80 — Trefoil
拓扑 Topology topology10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 —
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7. 引用文献 (1)