SAXSdb — 2le8

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA replication licensing factor MCM6

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 708–821	片段：UNP residues 708-821 突变：C18S	DNA replication factor Cdt1 × 1 （Q9H211）	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6.5；310 K；离子强度（mmCIF原始值）3；压力 ambient NMR样品组成：25 mM MES-1, 300 mM sodium chloride-2, 1 % glycerol-3, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_2-4, 1 mM entity_1-5, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：25 mM [U-100% 15N] MES-6, 300 mM sodium chloride-7, 1 % glycerol-8, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-9, 1.0 mM entity_2-10, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：25 mM MES-11, 300 mM sodium chloride-12, 1 % glycerol-13, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-14, 1.0 mM entity_2-15, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成：25 mM MES-16, 300 mM sodium chloride-17, 1 % glycerol-18, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_2-19, 1.0 mM entity_1-20, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2LE8	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
22VT Structure of human MCM2-7 single hexamer with MCM3-WHD attached to MCM2-CTD, containing Meier-Gorlin Syndrome mutation (MCM3-Q761L) 提交 2026-01-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
2KLQ The solution structure of CBD of human MCM6 提交 2009-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 708–821（114 aa）片段：RESIDUES 708-821	突变：C721S	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.5；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CBD,MES,EDTA,Glycerol,NaCl-1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CBD,MES,EDTA,Glycerol,NaCl-2, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.5 mM CBD,MES,EDTA,Glycerol,NaCl-3, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
6XTX CryoEM structure of human CMG bound to ATPgammaS and DNA 提交 2020-01-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å
6XTY CryoEM structure of human CMG bound to AND-1 (CMGA) 提交 2020-01-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.77 Å
7PFO Core human replisome 提交 2021-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 SO4 SULFATE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7PLO H. sapiens replisome-CUL2/LRR1 complex 提交 2021-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 SO4 SULFATE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7W1Y Human MCM double hexamer bound to natural DNA duplex (polyAT/polyTA) 提交 2021-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 6 1–821（821 aa）链 E 1–821（821 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions were made fresh from concentrated to avoid microbial contamination cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.59 Å
7W68 human single hexameric Mcm2-7 complex 提交 2021-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–821（821 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 4.40 Å
8B9D Human replisome bound by Pol Alpha 提交 2022-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8RWV Human OCCM DNA licensing intermediate 提交 2024-02-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.68 Å
8S09 H. sapiens MCM2-7 double hexamer bound to double stranded DNA 提交 2024-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 6 1–821（821 aa）链 E 1–821（821 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8S0A H. sapiens MCM2-7 hexamer bound to double stranded DNA 提交 2024-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8S0B H. sapiens MCM bound to double stranded DNA and ORC6 as part of the MCM-ORC complex 提交 2024-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8S0D H. sapiens MCM bound to double stranded DNA and ORC1-6 提交 2024-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8S0E H. sapiens OCCM bound to double stranded DNA 提交 2024-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8S0F H. sapiens OC1M bound to double stranded DNA 提交 2024-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8W0E Cryo-EM structure of a human MCM2-7 single hexamer on dsDNA 提交 2024-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8W0F Cryo-EM structure of a human MCM2-7 double hexamer on dsDNA 提交 2024-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 6 1–821（821 aa）链 E 1–821（821 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 10 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8W0G Cryo-EM structure of a human MCM2-7 dimer 提交 2024-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 6 1–821（821 aa）链 E 1–821（821 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 10 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8W0I Cryo-EM structure of the human MCM2-7 heterohexamer 提交 2024-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9C6G Mcm double hexamer from human 提交 2024-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 6 1–821（821 aa）链 B 1–821（821 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.26 Å
9CAQ Cryo-EM structure of a human MCM2-7 double hexamer formed from independently loaded MCM2-7 single hexamers 提交 2024-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 6 1–821（821 aa）链 E 1–821（821 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9E2Z Cryo-EM structure of human CMG helicase stalled at G4-containing DNA template 提交 2024-10-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ZN ZINC ION × 4 K POTASSIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 second wait time after sample application; 30 second blot time, blot force 0	分辨率 2.60 Å
9LXD Structure of DNA-free MCM SH at 3.2 Angstroms resolution 提交 2025-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
9LXE Structure of compacted DNA-free MCM DH at 3.9 Angstroms resolution 提交 2025-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 6 1–821（821 aa）链 G 1–821（821 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.96 Å
9LXF Structure of extended DNA-free MCM DH at 3.8 Angstroms resolution 提交 2025-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 6 1–821（821 aa）链 G 1–821（821 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.86 Å
9UQ0 Structure of human MCM2-7 single hexamer with MCM3-WHD attached to MCM2-CTD 提交 2025-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
9VLN Structure of human MCM2-7 single hexamer without MCM3 CTE, state 1 提交 2025-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ZN ZINC ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
9VLW Structure of human MCM2-7 single hexamer without MCM3 CTE, state 2 提交 2025-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 6 1–821（821 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ZN ZINC ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.06 Å

共 29 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MCM6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–114； UniProt 708–821

DNA replication factor Cdt1

Homo sapiens

UniProt Q9H211

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 413–440	片段：UNP residues 413-440	DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （Q14566）	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6.5；310 K；离子强度（mmCIF原始值）3；压力 ambient NMR样品组成：25 mM MES-1, 300 mM sodium chloride-2, 1 % glycerol-3, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_2-4, 1 mM entity_1-5, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：25 mM [U-100% 15N] MES-6, 300 mM sodium chloride-7, 1 % glycerol-8, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-9, 1.0 mM entity_2-10, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：25 mM MES-11, 300 mM sodium chloride-12, 1 % glycerol-13, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-14, 1.0 mM entity_2-15, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成：25 mM MES-16, 300 mM sodium chloride-17, 1 % glycerol-18, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_2-19, 1.0 mM entity_1-20, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2LE8	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2WVR Human Cdt1:Geminin complex 提交 2009-10-19	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–546（546 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；PH 7.5 100-150 MM NACL CAPILLARY GRADIENT	分辨率 3.30 Å R-free 0.301
6QCG PCNA complex with Cdt1 N-terminal PIP-box peptide 提交 2018-12-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 1–14（14 aa）链 H 1–14（14 aa）链 I 1–14（14 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；300 K；15% (w/v) PEG 400, 100 mM calcium acetate, 100 mM MES/HCl	分辨率 3.40 Å R-free 0.253
6QCG PCNA complex with Cdt1 N-terminal PIP-box peptide 提交 2018-12-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 J 1–14（14 aa）链 K 1–14（14 aa）链 L 1–14（14 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；300 K；15% (w/v) PEG 400, 100 mM calcium acetate, 100 mM MES/HCl	分辨率 3.40 Å R-free 0.253
8RWV Human OCCM DNA licensing intermediate 提交 2024-02-05	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 G 158–546（389 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.68 Å
8S0E H. sapiens OCCM bound to double stranded DNA 提交 2024-02-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 8 1–546（546 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8S0F H. sapiens OC1M bound to double stranded DNA 提交 2024-02-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 8 1–546（546 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å

共 5 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CDT1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–28； UniProt 413–440

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2le8
沉积日期 deposition_date	2011-06-14
结构标题 title	The protein complex for DNA replication
关键词 keywords	DNA replication, REPLICATION; REPLICATION
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	18.48 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	17.83 Å
零角强度 I(0) i0	1386960000.00
分子量 molecular_weight	316040.0 kDa
排除体积 excluded_volume	396450 Å³
包络体积 envelope_volume	68596 Å³
水化壳体积 shell_volume	25108 Å³
包络直径 envelope_diameter	84.3 Å
壳层 Rg shell_rg	30.10 Å
包络 Rg envelope_rg	23.75 Å
形状 Rg shape_rg	17.82 Å
总 Rg total_rg	18.15 Å
总原子数 total_atoms	44802
残基数 n_residues	2717
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	73.2 Å
Rg (实空间) rg_real	18.54 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.67 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3870e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.8690e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	18.53 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1387000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6973
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	19.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.474
峰度 Kurtosis kurtosis	0.021
角度范围 angular_range	— – 0.4300 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	1222000.0000
实空间数据点数 n_real_points	74
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.478; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.627; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DNA replication licensing factor MCM6
分子量 formula_weight	13303.9 kDa
突变 mutation	C18S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	44802

APKASLRLGFSEYSRISNLIVLHLRKVEEEEDESALKRSELVNWYLKEIESEIDSEEELINKKRIIEKVIHRLTHYDHVLIELTQAGLKGSTEGSESYEEDPYLVVNPNYLLED

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA replication factor Cdt1
分子量 formula_weight	3361.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

SALKGVSQDLLERIRAKEAQKQLAQMTRW

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	2le8A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	870 —

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8. 引用文献 (1)

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fit	/app/data/saxs_computation/le/2le8/2le8.fit
pddf	/app/data/pr_computation/le/2le8/2le8.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/le/2le8/2le8.dat

The protein complex for DNA replication

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA replication licensing factor MCM6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

DNA replication factor Cdt1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)