9e2z

Cryo-EM structure of human CMG helicase stalled at G4-containing DNA template

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 183.1 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9e2z

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9e2z
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9e2z
沉积日期 deposition_date2024-10-23
最后修订 last_revision2025-03-26
结构标题 titleCryo-EM structure of human CMG helicase stalled at G4-containing DNA template
关键词 keywordshelicase, DNA replication, cell division, fork stalling, translocation, REPLICATION, REPLICATION-DNA complex; REPLICATION/DNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier56.17
回转半径 Rg (电子) rg_electron56.08
零角强度 I(0) i05127380000.00
分子量 molecular_weight585330.0 kDa
排除体积 excluded_volume725820 ų
包络体积 envelope_volume1051400 ų
水化壳体积 shell_volume148680 ų
包络直径 envelope_diameter201.0
壳层 Rg shell_rg64.21
包络 Rg envelope_rg55.02
形状 Rg shape_rg56.13
总 Rg total_rg56.09
总原子数 total_atoms81374
残基数 n_residues5025
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax183.1
Rg (实空间) rg_real55.97
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.67
I(0) (实空间) i0_real5.1270e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1710e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal56.32
I(0) (倒空间) i0_reciprocal5130000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8647
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary71.9
偏度 Skewness skewness0.259
峰度 Kurtosis kurtosis-0.325
角度范围 angular_range— – 0.1400 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha684900000.0000
实空间数据点数 n_real_points29
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.843; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.965; Smooth: 0.742

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (19)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)