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2ljz

Structure of the C-terminal domain of HPV16 E6 oncoprotein

Method: SOLUTION NMR Dmax: 40.1 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein E6

Human papillomavirus

UniProt P03126

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 87–158 片段：Zinc finger containing residues 87-158 突变：C80S, C97S, C111S, C140S ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6.8；286 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成：1 mM E6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] E6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：1 mM [U-100% 15N] E6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2LJZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FK4 Solution structure of the C-terminal zinc binding domain of the HPV16 E6 oncoprotein 提交 2006-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 87–158（72 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN
突变：C4S, C20S, C34S, C63S ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；288 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 ambient
NMR测量条件 pH 6.8；288 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 ambient
NMR样品组成 1.0 mM E6C U-15N; 20 mM TRIS-HCl, 50 mM NaCl, 1mM DTT | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM E6C, 20 mM TRIS-HCl, 50 mM NaCl, 1mM DTT | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2KPL MAGI-1 PDZ1 / E6CT 提交 2009-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 148–157（10 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；295 K；压力 ambient
NMR样品组成 0.2-0.6mM MAGI-1 PDZ1-1, 0.02-0.10mM sodium phosphate-2, 50mM sodium chloride-3, 2mM DTT-4, 0.6-1.8mM E6CT-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2-0.6mM [U-15N] MAGI-1 PDZ1-6, 0.02-0.10mM sodium phosphate-7, 50mM sodium chloride-8, 2mM DTT-9, 0.6-1.8mM E6CT-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2-0.6mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MAGI-1 PDZ1-11, 0.02-0.10mM sodium phosphate-12, 50mM sodium chloride-13, 2mM DTT-14, 0.6-1.8mM E6CT-15, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2LJX Structure of the monomeric N-terminal domain of HPV16 E6 oncoprotein 提交 2011-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 7–89（83 aa） 片段：Zinc finger containing residues 7-89
突变：F47R, C80S ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；296 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 ambient
NMR样品组成 1 mM E6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] E6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] E6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2LJY Haddock model structure of the N-terminal domain dimer of HPV16 E6 提交 2011-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 7–89（83 aa） 片段：Zinc finger containing residues 7-86
链 B 7–89（83 aa） 片段：Zinc finger containing residues 7-86
突变：C80S 突变：C80S ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；296 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成 0.3 mM E6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.3 mM [U-100% 15N] E6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] E6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
4GIZ Crystal structure of full-length human papillomavirus oncoprotein E6 in complex with LXXLL peptide of ubiquitin ligase E6AP at 2.55 A resolution 提交 2012-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 9–150（142 aa） 片段：unp residues 9-150
突变：F47R,C80S,C97S,C111S,C140S ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；290 K；10% peg8000, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
分辨率 2.55 Å R-free 0.196
4GIZ Crystal structure of full-length human papillomavirus oncoprotein E6 in complex with LXXLL peptide of ubiquitin ligase E6AP at 2.55 A resolution 提交 2012-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 9–150（142 aa） 片段：unp residues 9-150
突变：F47R,C80S,C97S,C111S,C140S ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；290 K；10% peg8000, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
分辨率 2.55 Å R-free 0.196
4JOP CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ bound to HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide (TRRETQL) 提交 2013-03-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 152–158（7 aa） 片段：HPV16 E6 peptide
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；32% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.125 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.219
4JOP CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ bound to HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide (TRRETQL) 提交 2013-03-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 152–158（7 aa） 片段：HPV16 E6 peptide
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；32% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.125 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.219
4XR8 Crystal structure of the HPV16 E6/E6AP/p53 ternary complex at 2.25 A resolution 提交 2015-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 8–158（151 aa）
突变：C80S,C97S,C111S,C140S PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 ZN ZINC ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；290 K；7.5 % PEG 20K, 0.05 M MES pH 6.5
分辨率 2.25 Å R-free 0.246
4XR8 Crystal structure of the HPV16 E6/E6AP/p53 ternary complex at 2.25 A resolution 提交 2015-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 8–158（151 aa）
突变：C80S,C97S,C111S,C140S PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；290 K；7.5 % PEG 20K, 0.05 M MES pH 6.5
分辨率 2.25 Å R-free 0.246
6HKS Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 148–158（11 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% w/v PEG 3350 0.2 mM KI pH 7
分辨率 2.19 Å R-free 0.247
6HKS Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 148–158（11 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% w/v PEG 3350 0.2 mM KI pH 7
分辨率 2.19 Å R-free 0.247
6HKS Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 148–158（11 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% w/v PEG 3350 0.2 mM KI pH 7
分辨率 2.19 Å R-free 0.247
6HKS Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 148–158（11 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% w/v PEG 3350 0.2 mM KI pH 7
分辨率 2.19 Å R-free 0.247
6HKS Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 148–158（11 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% w/v PEG 3350 0.2 mM KI pH 7
分辨率 2.19 Å R-free 0.247
6HKS Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 148–158（11 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% w/v PEG 3350 0.2 mM KI pH 7
分辨率 2.19 Å R-free 0.247
6SIV Structure of HPV16 E6 oncoprotein in complex with mutant IRF3 LxxLL motif 提交 2019-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 6–158（153 aa）
突变：F1047R,C1080S,C1097S,C1111S,C1140S ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；PEG 1500 30%
分辨率 1.75 Å R-free 0.220
6SJA Structure of HPV16 E6 oncoprotein in complex with IRF3 LxxLL motif 提交 2019-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 7–158（152 aa）
突变：F1047R,C1080S,C1097S,C1111S,C1140S ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.8；298 K；PEG 1500 30%
分辨率 1.50 Å R-free 0.191
6TWU MAGI1_2 complexed with a phosphomimetic 16E6 peptide 提交 2020-01-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 149–158（10 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 CIT CITRIC ACID × 2 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；22% PEG3000, 100mM Na-citrate (pH5.5), 100mM Na-citrate
分辨率 2.40 Å R-free 0.255
7UAJ Crystal structure of apo HPV16 E6 提交 2022-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 8–158（151 aa）
链 B 8–158（151 aa）
链 C 8–158（151 aa）
链 D 8–158（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M HEPES, 8% ethylene glycol and 10% PEG 8000 at pH 7.5
分辨率 3.25 Å R-free 0.282
8GCR HPV16 E6-E6AP-p53 complex 提交 2023-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–158（158 aa）
突变：C87S,C104S,C118S,C147S ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
8JRN Structure of E6AP-E6 complex in Att1 state 提交 2023-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–158（158 aa）
链 D 1–158（158 aa）
突变：C87S/C104S/C118S/C147S 突变：C87S/C104S/C118S/C147S ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8JRO Structure of E6AP-E6 complex in Att2 state 提交 2023-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–158（158 aa）
链 D 1–158（158 aa）
突变：C87S/C104S/C118S/C147S 突变：C87S/C104S/C118S/C147S ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
8JRP Structure of E6AP-E6 complex in Att3 state 提交 2023-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 9–149（141 aa）
链 D 9–149（141 aa）
突变：C87S/C104S/C118S/C147S 突变：C87S/C104S/C118S/C147S ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
8JRQ Structure of E6AP-E6 complex in Det1 state 提交 2023-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–158（158 aa）
链 D 1–158（158 aa）
突变：C87S/C104S/C118S/C147S 突变：C87S/C104S/C118S/C147S ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.15 Å
8JRR Structure of E6AP-E6 complex in Det2 state 提交 2023-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 12–146（135 aa）
链 D 12–146（135 aa）
突变：C87S/C104S/C118S 突变：C87S/C104S/C118S ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.35 Å
8R1F Monomeric E6AP-E6-p53 ternary complex 提交 2023-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–158（158 aa）
突变：C80S,C97S,C111S,C140S ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.67 Å
8R1G Dimeric ternary structure of E6AP-E6-p53 提交 2023-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–158（158 aa）
链 E 1–158（158 aa）
突变：C80S,C97S,C111S,C140S 突变：C80S,C97S,C111S,C140S ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.99 Å
9CHT Human E3 ligase E6AP in complex with HPV16-E6 and p53 提交 2024-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 8–158（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å

共 21 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VE6_HPV16
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 4–75； UniProt 87–158

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2ljz

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2ljz
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2ljz
沉积日期 deposition_date2011-09-30
结构标题 titleStructure of the C-terminal domain of HPV16 E6 oncoprotein
关键词 keywordsMETAL BINDING PROTEIN; METAL BINDING PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier11.80 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron11.75 Å
零角强度 I(0) i0534140000.00
分子量 molecular_weight179250.0 kDa
排除体积 excluded_volume218360 ų
包络体积 envelope_volume18472 ų
水化壳体积 shell_volume11465 ų
包络直径 envelope_diameter45.3 Å
壳层 Rg shell_rg19.49 Å
包络 Rg envelope_rg14.42 Å
形状 Rg shape_rg11.71 Å
总 Rg total_rg12.03 Å
总原子数 total_atoms24880
残基数 n_residues1500
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax40.1 Å
Rg (实空间) rg_real11.77 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.36 Å
I(0) (实空间) i0_real5.3410e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error6.0850e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal11.78 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal534100000.0000
解质量估计 total_estimate0.7918
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary34.5 Å
偏度 Skewness skewness0.288
峰度 Kurtosis kurtosis-0.210
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha127400.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.769; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.985; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2ljza1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.90 — E6 C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.90.1 — E6 C-terminal domain-like
家族 Family familyg.90.1.1 — E6 C-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd2ljza2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2ljzA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology240 — CRO Repressor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — E6 early regulatory protein
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)