2lpb

Structure of the complex of the central activation domain of Gcn4 bound to the mediator co-activator domain 1 of Gal11/med15

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P19659

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 General control protein GCN4 × 1 (P03069) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MED15_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–81; UniProt 158–238

General control protein GCN4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P03069

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15 × 1 (P19659) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GCN4_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–34; UniProt 101–134

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2lpb
沉积日期 deposition_date2012-02-07
结构标题 titleStructure of the complex of the central activation domain of Gcn4 bound to the mediator co-activator domain 1 of Gal11/med15
关键词 keywords;Mediator, Activator, Co-Activator, Transcription, Nucleus, Phosphoprotein, Transcription regulation, amino acid biosynthesis, DNA-binding ;; TRANSCRIPTION
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2lpb__assembly_1__model_7

Assembly 1 · Model 7 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2lpb__assembly_1__model_7 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2lpb__assembly_1__model_7 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)18.41 Å
Rg(电子密度)17.26 Å
总 Rg18.31 Å
原子数1891
残基数115
排除体积16773 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2lpb__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2lpb__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2lpb__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2lpb__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2lpb__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2lpb__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2lpb__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2lpb__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2lpb__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2lpb__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2lpb__assembly_1__model_11 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2lpb__assembly_1__model_12 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2lpb__assembly_1__model_13 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2lpbA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily2920 —
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7. 引用文献 (1)