2lpz

Atomic model of the Type-III Secretion System Needle

Method: SOLID-STATE NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein prgI

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium

UniProt P41784

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 29 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRGI_SALTY
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 B; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 C; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 D; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 E; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 F; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 G; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 H; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 I; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 J; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 K; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 L; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 M; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 N; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 O; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 P; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 Q; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 R; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 S; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 T; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 U; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 V; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 W; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 X; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 Y; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 Z; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 a; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 b; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80 作者链 c; PDB构建体 1–80; UniProt 1–80

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2lpz
沉积日期 deposition_date2012-02-21
结构标题 titleAtomic model of the Type-III Secretion System Needle
关键词 keywordstype three secretion system, filament, needle, helical assembly, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodSOLID-STATE NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2lpz__assembly_1__model_8

Assembly 1 · Model 8 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2lpz__assembly_1__model_8 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2lpz__assembly_1__model_8 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)45.64 Å
Rg(电子密度)45.82 Å
总 Rg46.14 Å
原子数35960
残基数2320
排除体积321850 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2lpz__assembly_1__model_1 29-meric (29) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2lpz__assembly_1__model_2 29-meric (29) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2lpz__assembly_1__model_3 29-meric (29) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2lpz__assembly_1__model_4 29-meric (29) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2lpz__assembly_1__model_5 29-meric (29) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2lpz__assembly_1__model_6 29-meric (29) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2lpz__assembly_1__model_7 29-meric (29) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2lpz__assembly_1__model_8 29-meric (29) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2lpz__assembly_1__model_9 29-meric (29) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2lpz__assembly_1__model_10 29-meric (29) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 引用文献 (1)