2n55

Structure of constitutively monomeric CXCL12 in complex with the CXCR4 N-terminus

Method: SOLUTION NMR
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Stromal cell-derived factor 1

Homo sapiens

UniProt P48061

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 C-X-C chemokine receptor type 4 × 1 (P61073) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SDF1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–70; UniProt 22–89

C-X-C chemokine receptor type 4

Homo sapiens

UniProt P61073

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Stromal cell-derived factor 1 × 1 (P48061) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CXCR4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 3–40; UniProt 1–38

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2n55
沉积日期 deposition_date2015-07-07
结构标题 titleStructure of constitutively monomeric CXCL12 in complex with the CXCR4 N-terminus
关键词 keywordsCXL12, CXCR4, chemokine, GPCR, SDF1, CYTOKINE-Signaling Protein complex; CYTOKINE/Signaling Protein
实验方法 methodSOLUTION NMR
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2n55__assembly_1__model_18

Assembly 1 · Model 18 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2n55__assembly_1__model_18 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2n55__assembly_1__model_18 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)15.37 Å
Rg(电子密度)14.29 Å
总 Rg15.52 Å
原子数1741
残基数110
排除体积15565 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2n55__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2n55__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2n55__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2n55__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2n55__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2n55__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2n55__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2n55__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2n55__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2n55__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2n55__assembly_1__model_11 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2n55__assembly_1__model_12 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2n55__assembly_1__model_13 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2n55__assembly_1__model_14 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2n55__assembly_1__model_15 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2n55__assembly_1__model_16 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2n55__assembly_1__model_17 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2n55__assembly_1__model_18 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2n55__assembly_1__model_19 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2n55__assembly_1__model_20 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2n55a1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.9 — IL8-like
超家族 Superfamily superfamilyd.9.1 — Interleukin 8-like chemokines
家族 Family familyd.9.1.1 — Interleukin 8-like chemokines
结构域编号 domain_idd2n55a2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2n55A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 —
▶

7. 引用文献 (1)