SAXSdb — 2ozf

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ezrin-radixin-moesin-binding phosphoprotein 50

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 150–235	片段：Second PDZ domain	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2M NaNO3, 0.1M BTProp, 20% PEG 3350, 10% Ethylene glycol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.211

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2OZF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1G9O FIRST PDZ DOMAIN OF THE HUMAN NA+/H+ EXCHANGER REGULATORY FACTOR 提交 2000-11-26	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 11–99（89 aa）片段：PDZ1 DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；291 K；potassium sodium tartrate, sodium citrate, ammonium sulfate, manganese chloride, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.50 Å R-free 0.201
1GQ4 STRUCTURAL DETERMINANTS OF THE NHERF INTERACTION WITH BETA2AR AND PDGFR 提交 2001-11-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 11–94（84 aa）片段：PDZ1 DOMAIN, RESIDUES 11-94	未记录	CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.24；CITRIC ACID, LITHIUM CHLORIDE, pH 4.24	分辨率 1.90 Å R-free 0.186
1GQ5 Structural Determinants of the NHERF Interaction with beta2-AR and PDGFR 提交 2001-11-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 11–94（84 aa）片段：PDZ1 DOMAIN, RESIDUES 11-94	未记录	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；SODIUM ACETATE, SODIUM CHLORIDE, pH 4.60	分辨率 2.20 Å R-free 0.263
1I92 STRUCTURAL BASIS OF THE NHERF PDZ1-CFTR INTERACTION 提交 2001-03-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 11–94（84 aa）片段：PDZ1 DOMAIN (RESIDUES 11-94)	未记录	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；Sodium Acetate, Sodium Chloride, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.70 Å R-free 0.217
1SGH Moesin FERM domain bound to EBP50 C-terminal peptide 提交 2004-02-23	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 321–358（38 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；Tris, PEG 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.50 Å R-free 0.401
2D10 Crystal structure of the Radixin FERM domain complexed with the NHERF-1 C-terminal tail peptide 提交 2005-08-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 330–357（28 aa）片段：residues 331-358	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG4000, 5% Isopropanol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.268
2D10 Crystal structure of the Radixin FERM domain complexed with the NHERF-1 C-terminal tail peptide 提交 2005-08-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 330–357（28 aa）片段：residues 331-358	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG4000, 5% Isopropanol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.268
2D10 Crystal structure of the Radixin FERM domain complexed with the NHERF-1 C-terminal tail peptide 提交 2005-08-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 330–357（28 aa）片段：residues 331-358	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG4000, 5% Isopropanol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.268
2D10 Crystal structure of the Radixin FERM domain complexed with the NHERF-1 C-terminal tail peptide 提交 2005-08-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 330–357（28 aa）片段：residues 331-358	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG4000, 5% Isopropanol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.268
2JXO Structure of the second PDZ domain of NHERF-1 提交 2007-11-27	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 150–240（91 aa）片段：PDZ 2 domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；288.1 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient NMR样品组成 1 mM PDZ2, HEPES, DTT, H2O, DSS, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] PDZ2, HEPES, DTT, H2O, DSS, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PDZ2, HEPES, DTT, H2O, DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2KJD Solution structure of extended PDZ2 domain from NHERF1 (150-270) 提交 2009-05-27	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 150–270（121 aa）片段：Extended PDZ2 domain: UNP residues 150-270	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.150；压力 ambient NMR样品组成 550 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] PDZ2-270-1, 20 mM HEPES-2, 0.5 mM DTT-3, 0.1 mM PMSF-4, 150 mM sodium chloride-5, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2KRG Solution Structure of human sodium/ hydrogen exchange regulatory factor 1(150-358) 提交 2009-12-17	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 150–358（209 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；303 K；压力 ambient NMR样品组成 557 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] NHERF1 (150-358), 20 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.1 mM PMSF, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 389 uM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-80% 2H] NHERF1 (150-358), 20 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.1 mM PMSF, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 413 uM [U-100% 13C; U-100% 15N]-Leu,Val,Phe NHERF1 (150-358), 20 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.1 mM PMSF, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2M0T Structural characterization of the extended PDZ1 domain from NHERF1 提交 2012-11-06	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 11–120（110 aa）片段：PDZ1 domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 ambient NMR样品组成 400 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] PDZ1, 20 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.5 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2M0U Complex structure of C-terminal CFTR peptide and extended PDZ1 domain from NHERF1 提交 2012-11-06	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 11–120（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 ambient NMR样品组成 286 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] PDZ1, 20 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.5 mM EDTA, 275 uM CFTR, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2M0V Complex structure of C-terminal CFTR peptide and extended PDZ2 domain from NHERF1 提交 2012-11-06	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 150–270（121 aa）片段：PDZ2 domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 ambient NMR样品组成 400 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] PDZ2, 20 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.5 mM EDTA, 688 uM CFTR, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 200 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] PDZ2, 20 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.5 mM EDTA, 275 uM CFTR, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
4JL7 Crystal Structure of the Chemokine Receptor CXCR2 in Complex with the First PDZ Domain of NHERF1 提交 2013-03-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 11–95（85 aa）片段：unp residues 11-95	未记录	CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；100 mM sodium acetate, 2.7 M sodium chloride, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.16 Å R-free 0.208
4LMM Crystal structure of NHERF1 PDZ1 domain complexed with the CXCR2 C-terminal tail in P21 space group 提交 2013-07-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 11–94（84 aa）片段：UNP residues 11-95	未记录	ACY ACETIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；293 K；100 mM sodium acetate, 0.2 M ammonium acetate, 24% PEG4000, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.10 Å R-free 0.217
4MPA Crystal structure of NHERF1-CXCR2 signaling complex in P21 space group 提交 2013-09-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 11–94（84 aa）片段：SEE REMARK 999	未记录	ACY ACETIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；293 K；100 mM sodium acetate, pH 4.8, 0.2 M ammonium acetate, 24% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.10 Å R-free 0.157
4N6X Crystal Structure of the Chemokine Receptor CXCR2 in Complex with the First PDZ Domain of NHERF1 提交 2013-10-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 11–94（84 aa）片段：First PDZ Domain (UNP residues 11-94)	未记录	CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.7 M sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.05 Å R-free 0.163
4PQW Crystal Structure of Phospholipase C beta 3 in Complex with PDZ1 of NHERF1 提交 2014-03-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 11–94（84 aa）片段：unp residues 11-94	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.5 M sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.47 Å R-free 0.196
4Q3H The crystal structure of NHERF1 PDZ2 CXCR2 complex revealed by the NHERF1 CXCR2 chimeric protein 提交 2014-04-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 150–234（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris HCl, pH 8.5, 8% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.44 Å R-free 0.195
4Q3H The crystal structure of NHERF1 PDZ2 CXCR2 complex revealed by the NHERF1 CXCR2 chimeric protein 提交 2014-04-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 150–234（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris HCl, pH 8.5, 8% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.44 Å R-free 0.195
6RQR Extended NHERF1 PDZ2 domain in complex with the PDZ-binding motif of CFTR 提交 2019-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 150–269（120 aa）链 B 150–269（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；1.65 M ammonium sulphate, 100 mM tri-sodium citrate pH 5.6	分辨率 2.20 Å R-free 0.233
9RXQ Structure of the PDZ1 domain from human NHERF1 with the C-terminal residues (KSTQF) of human URAT1 transporter (SLC22A12) 提交 2025-07-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 11–94（84 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；293 K；100 mM sodium acetate pH 4.8 200 mM ammonium acetate 24% PEG 4000	分辨率 1.38 Å R-free 0.183
9RXQ Structure of the PDZ1 domain from human NHERF1 with the C-terminal residues (KSTQF) of human URAT1 transporter (SLC22A12) 提交 2025-07-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 11–94（84 aa）	未记录	ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；293 K；100 mM sodium acetate pH 4.8 200 mM ammonium acetate 24% PEG 4000	分辨率 1.38 Å R-free 0.183
9RXT Structure of the PDZ1 domain from human NHERF1 with the C-terminal residues (NATRL) of the human sodium-dependent phosphate transporter 2A (NaPi-IIa, SLC34A1) 提交 2025-07-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 11–94（84 aa）	未记录	TOE 2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXYL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；100mM Bicine pH 9, 100mM NaCl, 30% PEG 550 MME	分辨率 1.36 Å R-free 0.198

共 21 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NHERF_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–88； UniProt 150–235

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2ozf
沉积日期 deposition_date	2007-02-26
结构标题 title	The crystal structure of the 2nd PDZ domain of the human NHERF-1 (SLC9A3R1)
关键词 keywords	PDZ domain, Structural Genomics, Structural Genomics Consortium, SGC, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	14.17 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	12.81 Å
零角强度 I(0) i0	2298530.00
分子量 molecular_weight	9728.0 kDa
排除体积 excluded_volume	11986 Å³
包络体积 envelope_volume	14549 Å³
水化壳体积 shell_volume	9955 Å³
包络直径 envelope_diameter	52.0 Å
壳层 Rg shell_rg	18.12 Å
包络 Rg envelope_rg	13.42 Å
形状 Rg shape_rg	12.80 Å
总 Rg total_rg	14.13 Å
总原子数 total_atoms	680
残基数 n_residues	92
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	53.6 Å
Rg (实空间) rg_real	14.11 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.42 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.2990e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.5240e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	14.12 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	2299000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7998
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	17.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.306
峰度 Kurtosis kurtosis	0.116
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	516400.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.488; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.938; Smooth: 0.993

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d2ozfa1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.36 — PDZ domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.36.1 — PDZ domain-like
家族 Family family	b.36.1.1 — PDZ domain

结构域编号 domain_id	d2ozfa2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2ozfa3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	2ozfA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	42 — Pdz3 Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — PDZ domain

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	43.304 Å
晶胞边长 b length_b	54.715 Å
晶胞边长 c length_c	96.724 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	I 2 2 2
空间群编号 int_tables_number	23
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.500 Å
最低分辨率 resolution_low	39.530 Å
R 因子 r_factor	0.1724
R_work r_work	0.1703
R_free r_free	0.2106

描述 description	Ezrin-radixin-moesin-binding phosphoprotein 50
分子量 formula_weight	9944.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	850

The crystal structure of the 2nd PDZ domain of the human NHERF-1 (SLC9A3R1)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ezrin-radixin-moesin-binding phosphoprotein 50

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	146

fit	/app/data/saxs_computation/oz/2ozf/2ozf.fit
pddf	/app/data/pr_computation/oz/2ozf/2ozf.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/oz/2ozf/2ozf.dat