Histone acetyltransferase MYST3
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 501–784 | 片段:HAT domain | ZN ZINC ION × 1 ACO ACETYL COENZYME *A × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;298 K;sodium cacodylate, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K | 分辨率 3.00 Å R-free 0.283 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2RC4 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1M36 Solution Structure of a CCHC Zinc Finger from MOZ 提交 2002-06-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
533–563(31 aa)
片段:residues 3-33
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.6;298 K;压力 ambient
NMR样品组成
0.5mM MOZ protein (533-563), 1mM TCEP, 0.7mM ZnSO4, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LN0 Structure of MOZ 提交 2011-12-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
204–313(110 aa)
片段:UNP RESIDUES 204-313
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1;压力 ambient
NMR样品组成
50 mM HEPES-1, 100 mM sodium chloride-2, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
50 mM HEPES-4, 100 mM sodium chloride-5, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-6, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2OZU Crystal structure of human MYST histone acetyltransferase 3 in complex with acetylcoenzyme A 提交 2007-02-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
497–780(284 aa)
片段:Catalytic region: residues 497-780
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ZN ZINC ION × 1 ACO ACETYL COENZYME *A × 1 ACM ACETAMIDE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;300 K;12% PEG 5000, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.245 |
| 3V43 Crystal structure of MOZ 提交 2011-12-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
204–313(110 aa)
片段:UNP RESIDUES 204-313
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293 K;0.2M ammonium acetate, 0.1M tri-sodium citrate, 30% w/v PEG 4000, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.176 |
| 4LJN Crystal Structure of MOZ double PHD finger 提交 2013-07-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
194–323(130 aa)
片段:unp residues 194-323
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;60% tacsimate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.242 |
| 4LK9 Crystal Structure of MOZ double PHD finger histone H3 tail complex 提交 2013-07-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
194–323(130 aa)
片段:unp residues 194-323
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;283 K;100 mM Na-Hepes, 1.4 M sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 283K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.186 |
| 4LKA Crystal Structure of MOZ double PHD finger histone H3K9ac complex 提交 2013-07-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
194–323(130 aa)
片段:unp residues 194-323
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;283 K;100 mM Na-Hepes, 1.4 M sodium citrate, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 283K
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.185 |
| 4LLB Crystal Structure of MOZ double PHD finger histone H3K14ac complex 提交 2013-07-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
194–323(130 aa)
片段:unp residues 194-323
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;283 K;100 mM Tris-Cl, 200 mM Li2SO4, 30% PEG 4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 283K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.266 |
| 4LLB Crystal Structure of MOZ double PHD finger histone H3K14ac complex 提交 2013-07-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
194–323(130 aa)
片段:unp residues 194-323
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;283 K;100 mM Tris-Cl, 200 mM Li2SO4, 30% PEG 4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 283K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.266 |
| 5B75 Crystal structure of MOZ double PHD finger in complex with histone H3 butyrylation at K14 提交 2016-06-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
194–323(130 aa)
片段:UNP residues 194-323
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;polyethylene glycol 4000, lithium sulfate, Tris
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.195 |
| 5B76 Crystal structure of MOZ double PHD finger domain in complex with histone H3 crotonylation at K14 提交 2016-06-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
194–323(130 aa)
片段:UNP residues 194-323
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;polyethylene glycol 4000, lithium sulfate, Tris
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.236 |
| 5B77 Crystal structrue of MOZ double PHD finger in complex with histone H3 propionylation at K14 提交 2016-06-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
194–323(130 aa)
片段:UNP residues 194-323
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;polyethylene glycol 4000, lithium sulfate, Tris
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.204 |
| 5B78 Crystal structure of MOZ double PHD finger mutant-S210D/N235R in complex with histone H3 crotonylation at K14 提交 2016-06-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
194–323(130 aa)
片段:UNP residues 194-323
|
突变:S210D, N235R | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;polyethylene glycol 4000, lithium sulfate, Tris
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.187 |
| 6LSB Crystal Structure of DPF domain of MOZ in complex with H3K14bz peptide 提交 2020-01-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
194–323(130 aa)
片段:DPF domain of MOZ
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 1.4 M sodium citrate tribasic dehydrate.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.205 |
| 7Y43 Crystal structure of the KAT6A WH domain and its bound double stranded DNA 提交 2022-06-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–85(85 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2 M magnesium acetate tetrahydrate, 20% polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.235 |
| 8DD5 Crystal structure of KAT6A in complex with inhibitor CTx-648 (PF-9363) 提交 2022-06-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
501–784(284 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | R7L 2,6-dimethoxy-N-{4-methoxy-6-[(1H-pyrazol-1-yl)methyl]-1,2-benzoxazol-3-yl}benzene-1-sulfonamide × 1 ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;100 mM sodium chloride
100 mM HEPES (pH 6.64)
1.8 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.263 |
| 8H7A Crystal structure of the dimer form KAT6A WH domain with its bound double stranded DNA 提交 2022-10-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–85(85 aa)
链 B
1–85(85 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.01 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.005 M Nickel(II) chloride hexahydrate, 0.1 M HEPES sodium pH 7.0, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.235 |
| 8H7A Crystal structure of the dimer form KAT6A WH domain with its bound double stranded DNA 提交 2022-10-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 E
1–85(85 aa)
链 F
1–85(85 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.01 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.005 M Nickel(II) chloride hexahydrate, 0.1 M HEPES sodium pH 7.0, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.235 |
| 9ARO Crystal structure of AF9 YEATS domain in complex with acetylated at K1007 MOZ 提交 2024-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 E
1005–1008(4 aa)
链 F
1005–1008(4 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | FMT FORMIC ACID × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;291 K;0.2 M Sodium formate pH 7.2, 20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.273 |
| 9ARO Crystal structure of AF9 YEATS domain in complex with acetylated at K1007 MOZ 提交 2024-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 G
1005–1008(4 aa)
链 H
1005–1008(4 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | FMT FORMIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;291 K;0.2 M Sodium formate pH 7.2, 20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.273 |
| 9ARR Crystal structure of AF9 YEATS domain in complex with dicrotonylated at K1007 and K1014 MOZ 提交 2024-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
1005–1017(13 aa)
片段:residues 1005-1017 (Uniprot numbering)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | LI LITHIUM ION × 2 NO3 NITRATE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;291 K;0.2 M Lithium nitrate pH 7.1, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.247 |
| 9DZN KAT6A MYST domain complexed with a H3K14-CoA bisubstrate inhibitor 提交 2024-10-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
501–784(284 aa)
片段:MYST domain
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 1 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.4;294.15 K;1.25 M NH4SO4, 0.28 M NaCl, and 0.1 M HEPES pH 6.4
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.245 |
| 9FKR KAT6A IN COMPLEX WITH SMALL MOLECULE INHIBITOR BAY-184 提交 2024-06-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
509–778(270 aa)
链 B
509–778(270 aa)
|
突变:R507G, C508S, C638S, C646S, C723S, C773S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:R507G, C508S, C638S, C646S, C723S, C773S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ZN ZINC ION × 2 A1IDR 6-(dimethylamino)-~{N}-(2-phenylphenyl)sulfonyl-1-benzofuran-2-carboxamide × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;298 K;RESERVOIR 100 MILLIMOLAR HEPES PH 7.1-7.5, 17-21% PEG 3350 (W/V). PROTEIN CONCENTRATION 7.1 MG/ML, PROTEIN PREINCUBATED WITH 4 MILLIMOLAR ACETYL-COA. DROPS MADE FROM 0.8 MICROLITER PROTEIN AND 0.8 MICROLITER RESERVOIR SOLUTION.
CRYSTAL WASHED IN RESERVOIR SOLUTION, THEN COMPOUND BACKSOAKED FOR 10 DAYS AT 10 MILLIMOLAR.
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.238 |
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| UniProt名称 | MYST3_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–284; UniProt 501–784 |