Streptogrisin B
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 E; UniProt 115–299 | 未记录 | Ovomucoid × 1 (P68390) PO4 PHOSPHATE ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 10.7;0.4M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER AT PH 10.7 | 分辨率 1.80 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2SGD | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CSO CRYSTAL STRUCTURE OF THE OMTKY3 P1 VARIANT OMTKY3-ILE18I IN COMPLEX WITH SGPB 提交 1999-08-18 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;298 K;PEG 4000 sodium potassium phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å |
| 1CT0 CRYSTAL STRUCTURE OF THE OMTKY3 P1 VARIANT OMTKY3-SER18I IN COMPLEX WITH SGPB 提交 1999-08-18 | 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;298 K;PEG 4000 sodium potassium phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.80 Å |
| 1CT2 CRYSTAL STRUCTURE OF THE OMTKY3 P1 VARIANT OMTKY3-THR18I IN COMPLEX WITH SGPB 提交 1999-08-18 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;298 K;PEG 4000 sodium potassium phosphate , pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å |
| 1CT4 CRYSTAL STRUCTURE OF THE OMTKY3 P1 VARIANT OMTKY3-VAL18I IN COMPLEX WITH SGPB 提交 1999-08-18 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.1;298 K;PEG 4000 sodium potassium phosphate, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å |
| 1DS2 CRYSTAL STRUCTURE OF SGPB:OMTKY3-COO-LEU18I 提交 2000-01-06 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.1;298 K;PEG 4000, sodium potassium phosphate, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.70 Å |
| 1SGD ASP 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 6.5 提交 1999-03-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;0.4M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER AT PH 6.5
|
分辨率 1.80 Å |
| 1SGE GLU 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 6.5 提交 1999-03-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;0.4 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE buffer AT PH 6.5
|
分辨率 1.80 Å |
| 1SGN ASN 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B 提交 1999-03-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;2% PEG 6000, 50MM SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER AT PH 6.5, pH 6.50
|
分辨率 1.80 Å |
| 1SGP ALA 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B 提交 1995-05-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.40 Å |
| 1SGQ GLY 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B 提交 1995-05-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å |
| 1SGR LEU 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B 提交 1995-05-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1SGY TYR 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 6.5 提交 1999-03-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;0.4 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE buffer AT PH 6.5
|
分辨率 1.80 Å |
| 2GKV Crystal structure of the SGPB:P14'-Ala32 OMTKY3-del(1-5) complex 提交 2006-04-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;298 K;0.2M Na acetate trihydrate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 26% w/v PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.248 |
| 2NU0 Molecular structures of the complexes of SGPB with OMTKY3 aromatic P1 variants Trp18I, His18I, Phe18I, and Tyr18I 提交 2006-11-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
片段:residues 115-299
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.1;298 K;PEG 4000, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.95 Å |
| 2NU1 Molecular structures of the complexes of SGPB with OMTKY3 aromatic P1 variants Trp18I, His18I, Phe18I and Tyr18I 提交 2006-11-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
片段:residues 115-299
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.1;298 K;PEG 4000, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å |
| 2NU2 Accommodation of positively-charged residues in a hydrophobic specificity pocket: Crystal structures of SGPB in complex with OMTKY3 variants Lys18I and Arg18I 提交 2006-11-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
片段:residues 115-299
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.1;298 K;PEG 4000, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å |
| 2NU3 Accommodation of positively-charged residues in a hydrophobic specificity pocket: Crystal structures of SGPB in complex with OMTKY3 variants Lys18I and Arg18I 提交 2006-11-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
片段:residues 115-299
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.1;298 K;PEG 4000, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å |
| 2NU4 Accommodation of positively-charged residues in a hydrophobic specificity pocket: Crystal structures of SGPB in complex with OMTKY3 variants Lys18I and Arg18I 提交 2006-11-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
片段:residues 115-299
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;PEG 4000, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE at pH 7.1
24h before data collection, crystal was transferred to
PEG4000, NaKHPO4 at pH 10.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.75 Å |
| 2QA9 Crystal structure of the second tetrahedral intermediates of SGPB at pH 4.2 提交 2007-06-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;298 K;10 mg/mL SGPB in 10 mM MgCl2
0.7 M KH2PO4 pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.182 |
| 2QA9 Crystal structure of the second tetrahedral intermediates of SGPB at pH 4.2 提交 2007-06-14 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;298 K;10 mg/mL SGPB in 10 mM MgCl2
0.7 M KH2PO4 pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.182 |
| 2QAA Crystal structure of the second tetrahedral intermediates of SGPB at pH 7.3 提交 2007-06-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
115–299(185 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 TYR TYROSINE × 1 LEU LEUCINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACY ACETIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;298 K;10 mg/mL SGPB in 10 mM MgCl2
1.0 M Li2SO4, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.127 |
| 2QAA Crystal structure of the second tetrahedral intermediates of SGPB at pH 7.3 提交 2007-06-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
115–299(185 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 6 TYR TYROSINE × 1 LEU LEUCINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACY ACETIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;298 K;10 mg/mL SGPB in 10 mM MgCl2
1.0 M Li2SO4, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.127 |
| 2QAA Crystal structure of the second tetrahedral intermediates of SGPB at pH 7.3 提交 2007-06-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric |
链 A
115–299(185 aa)
链 B
115–299(185 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 60 CL CHLORIDE ION × 120 TYR TYROSINE × 24 LEU LEUCINE × 24 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 48 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 12 GOL GLYCEROL × 48 ACY ACETIC ACID × 36 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;298 K;10 mg/mL SGPB in 10 mM MgCl2
1.0 M Li2SO4, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.127 |
| 2SGE GLU 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 10.7 提交 1999-03-25 | 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 10.7;0.4M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER
AT PH 10.7
|
分辨率 1.80 Å |
| 2SGF PHE 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B 提交 1999-03-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;0.4 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE AT PH 6.5
|
分辨率 1.75 Å |
| 2SGP PRO 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 6.5 提交 1999-03-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;0.4 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER AT PH 6.5, pH 6.50
|
分辨率 1.80 Å |
| 2SGQ GLN 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 6.5 提交 1999-03-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;0.4 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE buffer AT PH 6.5
|
分辨率 1.80 Å |
| 3SGB STRUCTURE OF THE COMPLEX OF STREPTOMYCES GRISEUS PROTEASE B AND THE THIRD DOMAIN OF THE TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR AT 1.8 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1983-01-21 | 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 3SGQ GLN 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 10.7 提交 1999-03-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 10.7;0.4 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE buffer AT PH 10.7
|
分辨率 1.80 Å |
| 4SGB STRUCTURE OF THE COMPLEX OF STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AND POLYPEPTIDE CHYMOTRYPSIN INHIBITOR-1 FROM RUSSET BURBANK POTATO TUBERS AT 2.1 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1989-09-21 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
115–299(185 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å |
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| UniProt名称 | PRTB_STRGR |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 E; PDB构建体 1–185; UniProt 115–299 |