2vcp

Crystal structure of N-Wasp VC domain in complex with skeletal actin

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE

物种未注明

UniProt P68135

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 NEURAL WISKOTT-ALDRICH SYNDROME PROTEIN × 1 (O00401) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 NEURAL WISKOTT-ALDRICH SYNDROME PROTEIN × 1 (O00401) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACTS_RABIT
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–375; UniProt 3–377 作者链 B; PDB构建体 1–375; UniProt 3–377

NEURAL WISKOTT-ALDRICH SYNDROME PROTEIN

HOMO SAPIENS

UniProt O00401

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE × 1 (P68135) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE × 1 (P68135) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CALCIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 WASL_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–93; UniProt 392–484 作者链 E; PDB构建体 1–93; UniProt 392–484

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2vcp
沉积日期 deposition_date2007-09-26
结构标题 titleCrystal structure of N-Wasp VC domain in complex with skeletal actin
关键词 keywords;ACTIN-BINDING, TRANSCRIPTION, MUSCLE PROTEIN, NUCLEOTIDE-BINDING, TRANSCRIPTION REGULATION, METHYLATION, ATP-BINDING, CYTOSKELETON, PHOSPHORYLATION, STRUCTURAL PROTEIN, WH2, WASP, ACTIN, NUCLEUS, TWINNING ;; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2vcp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2vcp__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2vcp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.91 Å
Rg(电子密度)21.92 Å
总 Rg22.72 Å
原子数3078
残基数390
排除体积54784 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2vcp__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2vcp__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id2vcpA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id2vcpA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Actin; Chain A, domain 2
结构域编号 domain_id2vcpA03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id2vcpA04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id2vcpB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id2vcpB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Actin; Chain A, domain 2
结构域编号 domain_id2vcpB03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id2vcpB04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
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7. 引用文献 (1)