2wtk

Structure of the heterotrimeric LKB1-STRADalpha-MO25alpha complex

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CALCIUM-BINDING PROTEIN 39

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	STE20-RELATED KINASE ADAPTER PROTEIN ALPHA × 1 （Q7RTN6） SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 11 × 1 （Q15831） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 SULFATE ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	STE20-RELATED KINASE ADAPTER PROTEIN ALPHA × 1 （Q7RTN6） SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 11 × 1 （Q15831） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CAB39_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–341； UniProt 1–341 作者链 D； PDB构建体 1–341； UniProt 1–341

STE20-RELATED KINASE ADAPTER PROTEIN ALPHA

HOMO SAPIENS

UniProt Q7RTN6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	CALCIUM-BINDING PROTEIN 39 × 1 （Q9Y376） SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 11 × 1 （Q15831） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 SULFATE ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	CALCIUM-BINDING PROTEIN 39 × 1 （Q9Y376） SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 11 × 1 （Q15831） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	STRAA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–373； UniProt 59–431 作者链 E； PDB构建体 1–373； UniProt 59–431

SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 11

HOMO SAPIENS

UniProt Q15831

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	CALCIUM-BINDING PROTEIN 39 × 1 （Q9Y376） STE20-RELATED KINASE ADAPTER PROTEIN ALPHA × 1 （Q7RTN6） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 SULFATE ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	CALCIUM-BINDING PROTEIN 39 × 1 （Q9Y376） STE20-RELATED KINASE ADAPTER PROTEIN ALPHA × 1 （Q7RTN6） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	STK11_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–305； UniProt 43–347 作者链 F； PDB构建体 1–305； UniProt 43–347

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2wtk
沉积日期 deposition_date	2009-09-16
结构标题 title	Structure of the heterotrimeric LKB1-STRADalpha-MO25alpha complex
关键词 keywords	;TRANSFERASE-METAL-BINDING PROTEIN COMPLEX, TRANSFERASE METAL-BINDING PROTEIN COMPLEX, KINASE, NUCLEUS, SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE, PSEUDOKINASE, PHOSPHOPROTEIN, SIGNAL TRANSDUCTION, TRANSFERASE, NUCLEOTIDE-BINDING ;; TRANSFERASE/METAL-BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2wtk__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2wtk__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2wtk__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.92 Å
Rg（电子密度）	30.00 Å
总 Rg	30.72 Å
原子数	7440
残基数	917
排除体积	133350 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2wtk__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2wtk__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CALCIUM-BINDING PROTEIN 39
分子量 formula_weight	39922.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D
原子数 atom_count	14850

MPFPFGKSHKSPADIVKNLKESMAVLEKQDISDKKAEKATEEVSKNLVAMKEILYGTNEKEPQTEAVAQLAQELYNSGLLSTLVADLQLIDFEGKKDVAQIFNNILRRQIGTRTPTVEYICTQQNILFMLLKGYESPEIALNCGIMLRECIRHEPLAKIILWSEQFYDFFRYVEMSTFDIASDAFATFKDLLTRHKLLSAEFLEQHYDRFFSEYEKLLHSENYVTKRQSLKLLGELLLDRHNFTIMTKYISKPENLKLMMNLLRDKSRNIQFEAFHVFKVFVANPNKTQPILDILLKNQAKLIEFLSKFQNDRTEDEQFNDEKTYLVKQIRDLKRPAQQEA

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	SPODOPTERA FRUGIPERDA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	STE20-RELATED KINASE ADAPTER PROTEIN ALPHA
分子量 formula_weight	41748.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E

MSSFLPEGGCYELLTVIGKGFEDLMTVNLARYKPTGEYVTVRRINLEACSNEMVTFLQGELHVSKLFNHPNIVPYRATFIADNELWVVTSFMAYGSAKDLICTHFMDGMNELAIAYILQGVLKALDYIHHMGYVHRSVKASHILISVDGKVYLSGLRSNLSMISHGQRQRVVHDFPKYSVKVLPWLSPEVLQQNLQGYDAKSDIYSVGITACELANGHVPFKDMPATQMLLEKLNGTVPCLLDTSTIPAEELTMSPSRSVANSGLSDSLTTSTPRPSNGDSPSHPYHRTFSPHFHHFVEQCLQRNPDARPSASTLLNHSFFKQIKRRASEALPELLRPVTPITNFEGSQSQDHSGIFGLVTNLEELEVDDWEF

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	SPODOPTERA FRUGIPERDA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 11
分子量 formula_weight	34299.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F

AKLIGKYLMGDLLGEGSYGKVKEVLDSETLCRRAVKILKKKKLRRIPNGEANVKKEIQLLRRLRHKNVIQLVDVLYNEEKQKMYMVMEYCVCGMQEMLDSVPEKRFPVCQAHGYFCQLIDGLEYLHSQGIVHKDIKPGNLLLTTGGTLKISALGVAEALHPFAADDTCRTSQGSPAFQPPEIANGLDTFSGFKVDIWSAGVTLYNITTGLYPFEGDNIYKLFENIGKGSYAIPGDCGPPLSDLLKGMLEYEPAKRFSIRQIRQHSWFRKKHPPAEAPVPIPPSPDTKDRWRSMTVVPYLEDLHGA

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	SPODOPTERA FRUGIPERDA

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER
分子量 formula_weight	506.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	102

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d2wtka_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.1 — ARM repeat
家族 Family family	a.118.1.15 — Mo25 protein

结构域编号 domain_id	d2wtkc1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2wtkd_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.1 — ARM repeat
家族 Family family	a.118.1.15 — Mo25 protein

结构域编号 domain_id	d2wtkf1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id	2wtkA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Leucine-rich Repeat Variant

结构域编号 domain_id	2wtkB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	2wtkB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	2wtkC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	2wtkC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	2wtkD01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Leucine-rich Repeat Variant

结构域编号 domain_id	2wtkE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	2wtkE02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	2wtkF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	2wtkF02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

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晶胞边长 a length_a	118.360 Å
晶胞边长 b length_b	118.360 Å
晶胞边长 c length_c	390.012 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 31 2 1
空间群编号 int_tables_number	152
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.650 Å
最低分辨率 resolution_low	19.900 Å
R 因子 r_factor	0.2400
R_work r_work	0.2400
R_free r_free	0.2910

Structure of the heterotrimeric LKB1-STRADalpha-MO25alpha complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CALCIUM-BINDING PROTEIN 39

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

STE20-RELATED KINASE ADAPTER PROTEIN ALPHA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2wtk__assembly_2__model_1

2wtk__assembly_2__model_1 | I(q)

2wtk__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of the heterotrimeric LKB1-STRADalpha-MO25alpha complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CALCIUM-BINDING PROTEIN 39

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

STE20-RELATED KINASE ADAPTER PROTEIN ALPHA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2wtk__assembly_2__model_1

2wtk__assembly_2__model_1 | I(q)

2wtk__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)