GTP-BINDING NUCLEAR PROTEIN GSP1/CNR1
SACCHAROMYCES CEREVISIAE
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 8–179 | 片段:RESIDUES 8-179 突变:YES | IMPORTIN-13 × 1 (O94829) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 6;100MM BIS-TRIS PH 6 23% 9W/V) PEG 3350 100MM NA-THIIOCYANATE RT | 分辨率 2.80 Å R-free 0.268 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2X19 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3ICQ Karyopherin nuclear state 提交 2009-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric |
链 B
9–179(171 aa)
片段:Ran, UNP residues 9-179
|
突变:Q71L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;100mM Bis-Tris, pH5.5, 20% PEG3350, 180mM sodium acetate at 18 degrees, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.294 |
| 3ICQ Karyopherin nuclear state 提交 2009-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric |
链 C
9–179(171 aa)
片段:Ran, UNP residues 9-179
|
突变:Q71L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;100mM Bis-Tris, pH5.5, 20% PEG3350, 180mM sodium acetate at 18 degrees, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.294 |
| 3M1I Crystal structure of yeast CRM1 (Xpo1p) in complex with yeast RanBP1 (Yrb1p) and yeast RanGTP (Gsp1pGTP) 提交 2010-03-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–219(219 aa)
|
突变:Q71L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;293 K;0.1M Bis-Tris, 0.2M ammonium nitrate, 18% PEG3350, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 8DYO Cryo-EM structure of Importin-4 bound to RanGTP 提交 2022-08-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–219(219 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 8F19 Cryo-EM structure of Kap114 bound to Gsp1 (RanGTP) 提交 2022-11-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–179(179 aa)
|
突变:Q71L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Tris pH 7.5, 300 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM TCEP, and 0.1% NP-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.49 Å |
| 8F1E Cryo-EM structure of Kap114 bound to Gsp1 (RanGTP) and H2A-H2B 提交 2022-11-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 D
1–179(179 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.28 Å |
| 8F7A Cryo-EM structure of Importin-9 bound to RanGTP 提交 2022-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–219(219 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 8QYZ Crystal structure of hiNES2 in complex with Xpo1 and RanGTP 提交 2023-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–182(182 aa)
|
突变:1-182, Q71L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;Tris, PEG 20K, magnesium acetate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.247 |
| 8QYZ Crystal structure of hiNES2 in complex with Xpo1 and RanGTP 提交 2023-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 B
1–182(182 aa)
|
突变:1-182, Q71L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;Tris, PEG 20K, magnesium acetate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.247 |
| 8QYZ Crystal structure of hiNES2 in complex with Xpo1 and RanGTP 提交 2023-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 E
1–182(182 aa)
|
突变:1-182, Q71L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;Tris, PEG 20K, magnesium acetate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.247 |
| 8QYZ Crystal structure of hiNES2 in complex with Xpo1 and RanGTP 提交 2023-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 G
1–182(182 aa)
|
突变:1-182, Q71L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;Tris, PEG 20K, magnesium acetate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.247 |
| 9D45 Cryo-EM structure of yeast Exportin Msn5 bound to cargo Pho4 and RanGTP 提交 2024-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 B
2–179(178 aa)
|
突变:Q71L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9DXM Cryo-EM structure of yeast Exportin Msn5 bound to RanGTP and Pho4 (not modeled) (State 2-1) 提交 2024-10-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
2–179(178 aa)
|
突变:Q71L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9DZ6 Cryo-EM structure of yeast Exportin Msn5 bound to RanGTP and Pho4 (not modeled) (State 3-1) 提交 2024-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
2–179(178 aa)
|
突变:Q71L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9OGB Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with selinexor and bound to yeast RAN-GTP and human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 B
1–179(179 aa)
片段:residues 1-179
|
突变:Q71L | V6A selinexor, bound form × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
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| UniProt名称 | GSP1_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–172; UniProt 8–179 |