SAXSdb — 2x1g

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RNA-BINDING PROTEIN 8A

DROSOPHILA MELANOGASTER

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PROTEIN MAGO NASHI × 1 （P49028） CADMUS × 1 （Q9VEC5）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PROTEIN MAGO NASHI × 1 （P49028） CADMUS × 1 （Q9VEC5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RBM8A_DROME
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–165； UniProt 1–165 作者链 C； PDB构建体 1–165； UniProt 1–165

PROTEIN MAGO NASHI

DROSOPHILA MELANOGASTER

UniProt P49028

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	RNA-BINDING PROTEIN 8A × 1 （Q9V535） CADMUS × 1 （Q9VEC5）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	RNA-BINDING PROTEIN 8A × 1 （Q9V535） CADMUS × 1 （Q9VEC5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MGN_DROME
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147 作者链 D； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147

CADMUS

DROSOPHILA MELANOGASTER

UniProt Q9VEC5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	RNA-BINDING PROTEIN 8A × 1 （Q9V535） PROTEIN MAGO NASHI × 1 （P49028）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	RNA-BINDING PROTEIN 8A × 1 （Q9V535） PROTEIN MAGO NASHI × 1 （P49028）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9VEC5_DROME
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–971； UniProt 1–971 作者链 G； PDB构建体 1–971； UniProt 1–971

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2x1g
沉积日期 deposition_date	2009-12-23
结构标题 title	Crystal structure of Importin13 - Mago-Y14 complex
关键词 keywords	TRANSPORT PROTEIN, DEVELOPMENTAL PROTEIN, MRNA PROCESSING, NUCLEAR TRANSPORT, MRNA SPLICING, MRNA TRANSPORT; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2x1g__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2x1g__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2x1g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	34.15 Å
Rg（电子密度）	33.38 Å
总 Rg	34.05 Å
原子数	8038
残基数	1126
排除体积	142860 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2x1g__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2x1g__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	RNA-BINDING PROTEIN 8A
分子量 formula_weight	19042.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	16076

MADVLDIDNAEEFEVDEDGDQGIVRLKEKAKHRKGRGFGSDSNTREAIHSYERVRNEDDDELEPGPQRSVEGWILFVTSIHEEAQEDEIQEKFCDYGEIKNIHLNLDRRTGFSKGYALVEYETHKQALAAKEALNGAEIMGQTIQVDWCFVKGPKRVKKSEKRRR

来源 Source

来源生物 organism	DROSOPHILA MELANOGASTER
通用名 common_name	FRUIT FLY
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PROTEIN MAGO NASHI
分子量 formula_weight	17335.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

MSTEDFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEAFVHQSVMEELKRIIIDSEIMQEDDLPWPPPDRVGRQELEIVIGDEHISFTTSKTGSLVDVNRSKDPEGLRCFYYLVQDLKCLVFSLIGLHFKIKPI

来源 Source

来源生物 organism	DROSOPHILA MELANOGASTER
通用名 common_name	FRUIT FLY
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	CADMUS
分子量 formula_weight	111436.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,G

MEPIDIARLEEAVVSFYRSNSQNQAITHEWLTDAEASPQAWQFSWQLMQLGKSQEVQFFGAITLHSKLMKHWHEVPPENREELKQKILESIVRFAGGPKIVLNRLCISLGAYIVHMLGEWPGAIEEVINTFQNQRMPNVSADVQLWIMLEVLTAIPEEAQVIHTSVKRVVLRAEIAKRVQLVIHTVERYLKLQMNRVWDAEAYSNMNRAVKCVGTWIKNIGYTIEGCVTITAVLLEVVHKCYWPCIHAGDGCMTADENELAESCLKTMVNIIIQPDCHNYPKTAFVLIKMFLDSLSEITKTEWKRENDNEDIIVHIYMLFVSSVERHSTLLLSGITSADPELSILVHRIVQEILHCTDKPGIYPVEESCSTMALAFWYMLQDEVFAMSNDEQKHKCWEYIKPLYAHLTRILVRKSEQPDEKSLAKWSSDDLECFRCYRQDISDTFMYCYDVLNDYILEILAAMLDEAIADLQRHPTHWTKLEACIYSFQSVAEHFGGEEKRQIPRLMRVLAEIPYEKLNVKLLGTALETMGSYCNWLMENPAYIPPAINLLVRGLNSSMSAQATLGLKELCRDCQLQLKPYADPLLNACHASLNTGRMKNSDSVRLMFSIGKLMSLLRPEEIPKYLDIIVSPCFEELQAICQADSKTPAARIRTIFRLNMISTLFSSLNTDVDEQATDQPIVQPVLLVMQRTMPIFKRIAEMWVEEIDVLEAACSAMKHAITNLRSSFQPMLQDLCLFIVASFQTRCCAPTLEISKTAIVMFFKDEGCKPLMQQLLREFIQHSFKLFESTPEQNFSNISDTMETFFGCLTQIIKKIPQVLEDKTLAYDRLVFYAQRGMTLPESGAIRNSIQFLTHFVMQSRNHAHVTEVVLATGEQTLYTAMMCVGYLTPRSQVDKFADILLAMNRKYAAEMAVWMKSLMSTPNFPTQLITDADKTRYTALIIKEKVNKRLLQQHLSEMAMKTRGLTEKFQ

来源 Source

来源生物 organism	DROSOPHILA MELANOGASTER
通用名 common_name	FRUIT FLY
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	2x1gA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	330 — RRM (RNA recognition motif) domain

结构域编号 domain_id	2x1gB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1560 — Mago nashi protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Mago nashi

结构域编号 domain_id	2x1gC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	330 — RRM (RNA recognition motif) domain

结构域编号 domain_id	2x1gD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1560 — Mago nashi protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Mago nashi

结构域编号 domain_id	2x1gF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Leucine-rich Repeat Variant

结构域编号 domain_id	2x1gG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Leucine-rich Repeat Variant

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晶胞边长 a length_a	82.569 Å
晶胞边长 b length_b	100.792 Å
晶胞边长 c length_c	93.923 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	89.83 °
晶胞夹角 β angle_beta	110.18 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.63 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.350 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2670
R_work r_work	0.2670
R_free r_free	0.2890

Crystal structure of Importin13 - Mago-Y14 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RNA-BINDING PROTEIN 8A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PROTEIN MAGO NASHI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

CADMUS

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2x1g__assembly_1__model_1

2x1g__assembly_1__model_1 | I(q)

2x1g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of Importin13 - Mago-Y14 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RNA-BINDING PROTEIN 8A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PROTEIN MAGO NASHI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

CADMUS

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2x1g__assembly_1__model_1

2x1g__assembly_1__model_1 | I(q)

2x1g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)