SAXSdb — 2xdf

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PHOSPHOENOLPYRUVATE-PROTEIN PHOSPHOTRANSFERASE

ESCHERICHIA COLI

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR × 2 （P0AA06）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PT1_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–573； UniProt 1–573 作者链 B； PDB构建体 1–573； UniProt 1–573

PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR

ESCHERICHIA COLI

UniProt P0AA06

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	PHOSPHOENOLPYRUVATE-PROTEIN PHOSPHOTRANSFERASE × 2 （P08839）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PTHP_ECO57
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–85； UniProt 1–85 作者链 D； PDB构建体 1–85； UniProt 1–85

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2xdf
沉积日期 deposition_date	2010-04-30
结构标题 title	Solution Structure of the Enzyme I Dimer Complexed with HPr Using Residual Dipolar Couplings and Small Angle X-Ray Scattering
关键词 keywords	TRANSFERASE, SUGAR TRANSPORT; TRANSFERASE

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2xdf__assembly_1__model_2

Assembly 1 · Model 2 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2xdf__assembly_1__model_2 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2xdf__assembly_1__model_2 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	46.08 Å
Rg（电子密度）	46.90 Å
总 Rg	46.81 Å
原子数	20502
残基数	1316
排除体积	181750 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2xdf__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	2	`2xdf__assembly_1__model_2`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PHOSPHOENOLPYRUVATE-PROTEIN PHOSPHOTRANSFERASE
分子量 formula_weight	63419.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.3.9
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	41004

MISGILASPGIAFGKALLLKEDEIVIDRKKISADQVDQEVERFLSGRAKASAQLETIKTKAGETFGEEKEAIFEGHIMLLEDEELEQEIIALIKDKHMTADAAAHEVIEGQASALEELDDEYLKERAADVRDIGKRLLRNILGLKIIDLSAIQDEVILVAADLTPSETAQLNLKKVLGFITDAGGRTSHTSIMARSLELPAIVGTGSVTSQVKNDDYLILDAVNNQVYVNPTNEVIDKMRAVQEQVASEKAELAKLKDLPAITLDGHQVEVCANIGTVRDVEGAERNGAEGVGLYRTEFLFMDRDALPTEEEQFAAYKAVAEACGSQAVIVRTMDIGGDKELPYMNFPKEENPFLGWRAIRIAMDRREILRDQLRAILRASAFGKLRIMFPMIISVEEVRALRKEIEIYKQELRDEGKAFDESIEIGVMVETPAAATIARHLAKEVDFFSIGTNDLTQYTLAVDRGNDMISHLYQPMSPSVLNLIKQVIDASHAEGKWTGMCGELAGDERATLLLLGMGLDEFSMSAISIPRIKKIIRNTNFEDAKVLAEQALAQPTTDELMTLVNKFIEEKT

来源 Source

来源生物 organism	ESCHERICHIA COLI
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	469008
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR
分子量 formula_weight	9129.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MFQQEVTITAPNGLHTRPAAQFVKEAKGFTSEITVTSNGKSASAKSLFKLQTLGLTQGTVVTISAEGEDEQKAVEHLVKLMAELE

来源 Source

来源生物 organism	ESCHERICHIA COLI
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	469008
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d2xdfc_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.94 — HPr-like
超家族 Superfamily superfamily	d.94.1 — HPr-like
家族 Family family	d.94.1.1 — HPr-like

结构域编号 domain_id	d2xdfd_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.94 — HPr-like
超家族 Superfamily superfamily	d.94.1 — HPr-like
家族 Family family	d.94.1.1 — HPr-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2xdfA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Phosphoenolpyruvate-binding domains

结构域编号 domain_id	2xdfB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Phosphoenolpyruvate-binding domains

结构域编号 domain_id	2xdfC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1340 — Histidine-containing Protein; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — HPr-like

结构域编号 domain_id	2xdfD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1340 — Histidine-containing Protein; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — HPr-like

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

Solution Structure of the Enzyme I Dimer Complexed with HPr Using Residual Dipolar Couplings and Small Angle X-Ray Scattering

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PHOSPHOENOLPYRUVATE-PROTEIN PHOSPHOTRANSFERASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2xdf__assembly_1__model_2

2xdf__assembly_1__model_2 | I(q)

2xdf__assembly_1__model_2 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Solution Structure of the Enzyme I Dimer Complexed with HPr Using Residual Dipolar Couplings and Small Angle X-Ray Scattering

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PHOSPHOENOLPYRUVATE-PROTEIN PHOSPHOTRANSFERASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2xdf__assembly_1__model_2

2xdf__assembly_1__model_2 | I(q)

2xdf__assembly_1__model_2 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)