SAXSdb — 2xny

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FIBRINOGEN ALPHA CHAIN

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	FIBRINOGEN BETA CHAIN × 1 （P02675） FIBRINOGEN GAMMA CHAIN × 1 （P02679）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	FIBRINOGEN BETA CHAIN × 1 （P02675） FIBRINOGEN GAMMA CHAIN × 1 （P02679）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FIBA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–87； UniProt 130–216 作者链 D； PDB构建体 1–87； UniProt 130–216

FIBRINOGEN BETA CHAIN

物种未注明

UniProt P02675

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	FIBRINOGEN ALPHA CHAIN × 1 （P02671） FIBRINOGEN GAMMA CHAIN × 1 （P02679）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	FIBRINOGEN ALPHA CHAIN × 1 （P02671） FIBRINOGEN GAMMA CHAIN × 1 （P02679）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FIBB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–328； UniProt 164–491 作者链 E； PDB构建体 1–328； UniProt 164–491

FIBRINOGEN GAMMA CHAIN

物种未注明

UniProt P02679

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	FIBRINOGEN ALPHA CHAIN × 1 （P02671） FIBRINOGEN BETA CHAIN × 1 （P02675）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	FIBRINOGEN ALPHA CHAIN × 1 （P02671） FIBRINOGEN BETA CHAIN × 1 （P02675）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FIBG_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–319； UniProt 114–432 作者链 F； PDB构建体 1–319； UniProt 114–432

M PROTEIN

STREPTOCOCCUS PYOGENES

UniProt Q48WD8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
3	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q48WD8_STRP1
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 3–96； UniProt 42–135 作者链 N； PDB构建体 3–96； UniProt 42–135

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2xny
沉积日期 deposition_date	2010-08-06
结构标题 title	A fragment of streptococcal M1 protein in complex with human fibrinogen
关键词 keywords	CELL ADHESION, VIRULENCE FACTOR, STREPTOCOCCAL TOXIC SHOCK SYNDROME; CELL ADHESION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2xny__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2xny__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2xny__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	31.41 Å
Rg（电子密度）	31.53 Å
总 Rg	31.90 Å
原子数	5166
残基数	643
排除体积	90727 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2xny__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2xny__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2xny__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	FIBRINOGEN ALPHA CHAIN
分子量 formula_weight	10245.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D
原子数 atom_count	10956

VSEDLRSRIEVLKRKVIEKVQHIQLLQKNVRAQLVDMKRLEVDIDIKIRSCRGSCSRALAREVDLKDYEDQQKQLEQVIAKDLLPSR

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	FIBRINOGEN BETA CHAIN
分子量 formula_weight	37692.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E

DNENVVNEYSSELEKHQLYIDETVNSNIPTNLRVLRSILENLRSKIQKLESDVSAQMEYCRTPCTVSCNIPVVSGKECEEIIRKGGETSEMYLIQPDSSVKPYRVYCDMNTENGGWTVIQNRQDGSVDFGRKWDPYKQGFGNVATNTDGKNYCGLPGEYWLGNDKISQLTRMGPTELLIEMEDWKGDKVKAHYGGFTVQNEANKYQISVNKYRGTAGNALMDGASQLMGENRTMTIHNGMFFSTYDRDNDGWLTSDPRKQCSKEDGGGWWYNRCHAANPNGRYYWGGQYTWDMAKHGTDDGVVWMNWKGSWYSMRKMSMKIRPFFPQQ

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	FIBRINOGEN GAMMA CHAIN
分子量 formula_weight	36223.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F

KMLEEIMKYEASILTHDSSIRYLQEIYNSNNQKIVNLKEKVAQLEAQCQEPCKDTVQIHDITGKDCQDIANKGAKQSGLYFIKPLKANQQFLVYCEIDGSGNGWTVFQKRLDGSVDFKKNWIQYKEGFGHLSPTGTTEFWLGNEKIHLISTQSAIPYALRVELEDWNGRTSTADYAMFKVGPEADKYRLTYAYFAGGDAGDAFDGFDFGDDPSDKFFTSHNGMQFSTWDNDNDKFEGNCAEQDGSGWWMNKCHAGHLNGVYYQGGTYSKASTPNGYDNGIIWATWKTRWYSMKKTTMKIIPFNRLTIGEGQQHHLGGAK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	M PROTEIN
分子量 formula_weight	12066.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,N

MVNGDGNPREVIEDLAANNPAIQNIRLRHENKDLKARLENAMEVAGRDFKRAEELEKAKQALEDQRKDLETKLKELQQDYDLAKESTSWDRQRLEKHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	STREPTOCOCCUS PYOGENES
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1314
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

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晶胞边长 a length_a	165.687 Å
晶胞边长 b length_b	165.687 Å
晶胞边长 c length_c	289.652 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 32 2 1
空间群编号 int_tables_number	154
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	7.500 Å
最低分辨率 resolution_low	142.860 Å
R 因子 r_factor	0.4230
R_work r_work	0.4240
R_free r_free	0.4080

A fragment of streptococcal M1 protein in complex with human fibrinogen

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FIBRINOGEN ALPHA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

FIBRINOGEN BETA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

FIBRINOGEN GAMMA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

M PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2xny__assembly_1__model_1

2xny__assembly_1__model_1 | I(q)

2xny__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

A fragment of streptococcal M1 protein in complex with human fibrinogen

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FIBRINOGEN ALPHA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

FIBRINOGEN BETA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

FIBRINOGEN GAMMA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

M PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2xny__assembly_1__model_1

2xny__assembly_1__model_1 | I(q)

2xny__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)