3a98

Crystal structure of the complex of the interacting regions of DOCK2 and ELMO1

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dedicator of cytokinesis protein 2

Homo sapiens

UniProt Q92608

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Engulfment and cell motility protein 1 × 1 (Q92556) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Engulfment and cell motility protein 1 × 1 (Q92556) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DOCK2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 8–184; UniProt 1–177 作者链 C; PDB构建体 8–184; UniProt 1–177

Engulfment and cell motility protein 1

Homo sapiens

UniProt Q92556

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Dedicator of cytokinesis protein 2 × 1 (Q92608) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Dedicator of cytokinesis protein 2 × 1 (Q92608) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ELMO1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 8–203; UniProt 532–727 作者链 D; PDB构建体 8–203; UniProt 532–727

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3a98
沉积日期 deposition_date2009-10-21
结构标题 titleCrystal structure of the complex of the interacting regions of DOCK2 and ELMO1
关键词 keywords;protein-protein complex, DOCK2, ELMO1, SH3 domain, PH domain, helix bundle, proline-rich sequence, Cytoskeleton, Guanine-nucleotide releasing factor, Membrane, Phosphoprotein, Apoptosis, Cell membrane, Phagocytosis, SH3-binding, SIGNALING PROTEIN ;; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3a98__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3a98__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3a98__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)27.82 Å
Rg(电子密度)27.12 Å
总 Rg27.66 Å
原子数2825
残基数338
排除体积50831 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3a98__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3a98__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id3a98A01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — SH3 Domains
结构域编号 domain_id3a98A02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1270 — Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily350 — Dedicator of cytokinesis N-terminal subdomain
结构域编号 domain_id3a98B01
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology10 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 —
结构域编号 domain_id3a98B02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)
结构域编号 domain_id3a98C01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — SH3 Domains
结构域编号 domain_id3a98C02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1270 — Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily350 — Dedicator of cytokinesis N-terminal subdomain
结构域编号 domain_id3a98D01
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology10 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 —
结构域编号 domain_id3a98D02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)
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7. 引用文献 (1)