SAXSdb — 3bts

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Galactose/lactose metabolism regulatory protein GAL80

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Regulatory protein GAL4 × 2 （P04386） NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GAL80_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–438； UniProt 1–435 作者链 B； PDB构建体 4–438； UniProt 1–435

Regulatory protein GAL4

物种未注明

UniProt P04386

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Galactose/lactose metabolism regulatory protein GAL80 × 2 （P04387） NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GAL4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–21； UniProt 854–874 作者链 F； PDB构建体 1–21； UniProt 854–874

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3bts
沉积日期 deposition_date	2007-12-30
结构标题 title	Crystal structure of a ternary complex of the transcriptional repressor Gal80p (Gal80S0 [G301R]) and the acidic activation domain of Gal4p (aa 854-874) from Saccharomyces cerevisiae with NAD
关键词 keywords	;Eukaryotic transcription complex, NAD, Rossmann fold, Acetylation, Carbohydrate metabolism, DNA-binding, Galactose metabolism, Repressor, Transcription regulation, Activator, Metal-binding, Nucleus, Phosphoprotein, Zinc, TRANSCRIPTION ;; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3bts__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3bts__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3bts__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	31.75 Å
Rg（电子密度）	31.56 Å
总 Rg	32.02 Å
原子数	6253
残基数	788
排除体积	111700 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3bts__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Galactose/lactose metabolism regulatory protein GAL80
分子量 formula_weight	48754.4 kDa
突变 mutation	G301R
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	6432

GSHMDYNKRSSVSTVPNAAPIRVGFVGLNAAKGWAIKTHYPAILQLSSQFQITALYSPKIETSIATIQRLKLSNATAFPTLESFASSSTIDMIVIAIQVASHYEVVMPLLEFSKNNPNLKYLFVEWALACSLDQAESIYKAAAERGVQTIISLQGRKSPYILRAKELISQGYIGDINSIEIAGNGGWYGYERPVKSPKYIYEIGNGVDLVTTTFGHTIDILQYMTSSYFSRINAMVFNNIPEQELIDERGNRLGQRVPKTVPDHLLFQGTLLNGNVPVSCSFKGGKPTKKFTKNLVIDIHGTKRDLKLEGDAGFAEISNLVLYYSGTRANDFPLANGQQAPLDPGYDAGKEIMEVYHLRNYNAIVGNIHRLYQSISDFHFNTKKIPELPSQFVMQGFDFEGFPTLMDALILHRLIESVYKSNMMGSTLNVSNISHYSL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Regulatory protein GAL4
分子量 formula_weight	2507.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

GMFNTTTMDDVYNYLFDDEDT

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	663.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	127

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	3btsA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3btsA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	360 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2

结构域编号 domain_id	3btsB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3btsB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	360 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2

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晶胞边长 a length_a	88.071 Å
晶胞边长 b length_b	103.431 Å
晶胞边长 c length_c	106.880 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	46.570 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1750
R_free r_free	0.2320

Crystal structure of a ternary complex of the transcriptional repressor Gal80p (Gal80S0 [G301R]) and the acidic activation domain of Gal4p (aa 854-874) from Saccharomyces cerevisiae with NAD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Galactose/lactose metabolism regulatory protein GAL80

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Regulatory protein GAL4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3bts__assembly_1__model_1

3bts__assembly_1__model_1 | I(q)

3bts__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of a ternary complex of the transcriptional repressor Gal80p (Gal80S0 [G301R]) and the acidic activation domain of Gal4p (aa 854-874) from Saccharomyces cerevisiae with NAD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Galactose/lactose metabolism regulatory protein GAL80

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Regulatory protein GAL4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3bts__assembly_1__model_1

3bts__assembly_1__model_1 | I(q)

3bts__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)