SAXSdb — 3evs

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Growth/differentiation factor 5

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 387–501	片段：UNP residues 387-501	Bone morphogenetic protein receptor type-1B × 2 （P36898）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 5.25；294 K；0.1M sodium acetate, 50% PPG 400, 30mM magnesium sulfate, pH 5.25, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 2.10 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3EVS	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1WAQ Crystal structure of human Growth and Differentiation Factor 5 (GDF-5) 提交 2004-10-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 387–501（115 aa）片段：RESIDUES 387-501 (RESIDUES 6-120 OF MATURE GDF-5)	未记录	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 25% 2-METHLY-2,4-PENTANEDIOL, 0.1M SODIUM CITRATE PH 4.0	分辨率 2.28 Å R-free 0.237
2BHK Crystal structure of human growth and differentiation factor 5 (GDF5) 提交 2005-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 382–501（120 aa）	未记录	IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；100 MM SODIUM ACETATE, PH 5.0 30% ISOPROPANOL 14 MG/ML PROTEIN HANGING DROP	分辨率 2.40 Å R-free 0.220
3QB4 Crystal structure of a TGF-beta ligand-receptor complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 387–501（115 aa）片段：GDF-5, residues 387-501	突变：R57A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；0.1M Hepes pH 7.5, 0.2M NaCl 20% (w/v) PEG3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.28 Å R-free 0.241
3QB4 Crystal structure of a TGF-beta ligand-receptor complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 387–501（115 aa）片段：GDF-5, residues 387-501	突变：R57A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；0.1M Hepes pH 7.5, 0.2M NaCl 20% (w/v) PEG3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.28 Å R-free 0.241
3QB4 Crystal structure of a TGF-beta ligand-receptor complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 387–501（115 aa）片段：GDF-5, residues 387-501 链 C 387–501（115 aa）片段：GDF-5, residues 387-501	突变：R57A 突变：R57A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；0.1M Hepes pH 7.5, 0.2M NaCl 20% (w/v) PEG3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.28 Å R-free 0.241
5HK5 Structure of the Grem2-GDF5 Inhibitory Complex 提交 2016-01-13	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 382–501（120 aa）链 C 382–501（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；HEPES, ammonium chloride, ethylammonium nitrate	分辨率 2.90 Å R-free 0.282
5HK5 Structure of the Grem2-GDF5 Inhibitory Complex 提交 2016-01-13	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 382–501（120 aa）链 C 382–501（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；HEPES, ammonium chloride, ethylammonium nitrate	分辨率 2.90 Å R-free 0.282
5HK5 Structure of the Grem2-GDF5 Inhibitory Complex 提交 2016-01-13	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 382–501（120 aa）链 D 382–501（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；HEPES, ammonium chloride, ethylammonium nitrate	分辨率 2.90 Å R-free 0.282
5HK5 Structure of the Grem2-GDF5 Inhibitory Complex 提交 2016-01-13	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 382–501（120 aa）链 D 382–501（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；HEPES, ammonium chloride, ethylammonium nitrate	分辨率 2.90 Å R-free 0.282
6Z3G Repulsive Guidance Molecule A (RGMA) in complex with Growth Differentiation Factor 5 (GDF5) 提交 2020-05-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 387–501（115 aa）	未记录	CIT CITRIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 24% v/v polyethylene glycol (PEG) 400.	分辨率 2.78 Å R-free 0.288
6Z3H Repulsive Guidance Molecule B (RGMB) in complex with Growth Differentiation Factor 5 (GDF5) (crystal form 2) 提交 2020-05-20	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 387–501（115 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M sodium acetate pH 4.6, 35% w/v pentaerythritol ethoxylate (15/4 EO/OH; average MW 797 Da)	分辨率 3.16 Å R-free 0.268
6Z3J Repulsive Guidance Molecule B (RGMB) in complex with Growth Differentiation Factor 5 (GDF5) (crystal form 1) 提交 2020-05-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 387–501（115 aa）链 B 387–501（115 aa）	突变：Y487K, Q489D 突变：Y487K, Q489D	SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CL CHLORIDE ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；294 K；0.2 M Li2SO4, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% v/v PEG 3350.	分辨率 1.65 Å R-free 0.219
6Z3L Repulsive Guidance Molecule C (RGMC, Hemojuvelin, HJV, HFE2) in complex with Growth Differentiation Factor 5 (GDF5) 提交 2020-05-20	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 387–501（115 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；1 M LiCl, 0.1 M citric acid pH 4.0, 8% gamma-butyrolactone.	分辨率 2.51 Å R-free 0.267
6Z3M Repulsive Guidance Molecule B (RGMB) in complex with Growth Differentiation Factor 5 (GDF5) and Neogenin 1 (NEO1). 提交 2020-05-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 387–501（115 aa）链 B 387–501（115 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M NaCl, 20 mM MES pH 6.7, 6.6% w/v PEG 4000	分辨率 5.50 Å R-free 0.428
6Z3M Repulsive Guidance Molecule B (RGMB) in complex with Growth Differentiation Factor 5 (GDF5) and Neogenin 1 (NEO1). 提交 2020-05-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 G 387–501（115 aa）链 H 387–501（115 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M NaCl, 20 mM MES pH 6.7, 6.6% w/v PEG 4000	分辨率 5.50 Å R-free 0.428
6Z3M Repulsive Guidance Molecule B (RGMB) in complex with Growth Differentiation Factor 5 (GDF5) and Neogenin 1 (NEO1). 提交 2020-05-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 M 387–501（115 aa）链 N 387–501（115 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M NaCl, 20 mM MES pH 6.7, 6.6% w/v PEG 4000	分辨率 5.50 Å R-free 0.428
7ZJF R399E, a mutated form of GDF5, for disease modification of osteoarthritis 提交 2022-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 382–501（120 aa）链 B 382–501（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.15；293 K；01 M Hepes, 32% PEG 400, 230 mM MgCl2, pH 8.15	分辨率 1.30 Å R-free 0.222
8BWL Crystal structure of human Twisted gastrulation protein homolog 1 (TWSG1) in complex with human Growth Differentiation factor 5 (GDF5) and calcium 提交 2022-12-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 382–501（120 aa）链 B 382–501（120 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；12.1% w/v PEG 1000, 12.1% w/v PEG 3350, 12.1% v/v MPD, 97 mM CaCl2, 0.097 M Bicine/Trizma pH 8.5	分辨率 1.96 Å R-free 0.212
8BWM Crystal structure of human Twisted gastrulation protein homolog 1 (TWSG1) in complex with human Growth Differentiation factor 5 (GDF5) and calcium, long-wavelength X-ray dataset (4042 eV) 提交 2022-12-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 382–501（120 aa）链 B 382–501（120 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；12.1% w/v PEG 1000, 12.1% w/v PEG 3350, 12.1% v/v MPD, 97 mM CaCl2, 0.097 M Bicine/Trizma pH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.278
8BWN Crystal structure of human Twisted gastrulation protein homolog 1 (TWSG1) in complex with human Growth Differentiation Factor 5 (GDF5) and calcium, long-wavelength X-ray dataset (4010 eV) 提交 2022-12-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 382–501（120 aa）链 B 382–501（120 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD, 100 mM CaCl2, 0.1 M MOPS/HEPES-Na pH 7.5	分辨率 2.57 Å R-free 0.283
8E3G BMP2/GDF5 heterodimer 提交 2022-08-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 382–501（120 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris, magnesium formate	分辨率 2.80 Å R-free 0.234
8E3G BMP2/GDF5 heterodimer 提交 2022-08-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 382–501（120 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris, magnesium formate	分辨率 2.80 Å R-free 0.234

共 14 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GDF5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 3–117； UniProt 387–501

Bone morphogenetic protein receptor type-1B

Mus musculus

UniProt P36898

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 14–126	片段：Extracellular domain	Growth/differentiation factor 5 × 2 （P43026）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 5.25；294 K；0.1M sodium acetate, 50% PPG 400, 30mM magnesium sulfate, pH 5.25, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 2.10 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BMR1B_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 7–119； UniProt 14–126

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3evs
沉积日期 deposition_date	2008-10-13
结构标题 title	Crystal structure of the GDF-5:BMP receptor IB complex.
关键词 keywords	;ligand-receptor complex, cystin-knot ligand; three-finger toxn fold (receptor), Cleavage on pair of basic residues, Cytokine, Disease mutation, Dwarfism, Glycoprotein, Growth factor, Secreted, ATP-binding, Kinase, Magnesium, Manganese, Membrane, Metal-binding, Nucleotide-binding, Receptor, Serine/threonine-protein kinase, Transferase, Transmembrane, CYTOKINE-Transferase Receptor COMPLEX ;; CYTOKINE/Transferase Receptor
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	20.76 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	20.06 Å
零角强度 I(0) i0	9343500.00
分子量 molecular_weight	21355.0 kDa
排除体积 excluded_volume	26038 Å³
包络体积 envelope_volume	35230 Å³
水化壳体积 shell_volume	15275 Å³
包络直径 envelope_diameter	62.5 Å
壳层 Rg shell_rg	25.60 Å
包络 Rg envelope_rg	19.47 Å
形状 Rg shape_rg	20.05 Å
总 Rg total_rg	20.87 Å
总原子数 total_atoms	1483
残基数 n_residues	189
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	62.8 Å
Rg (实空间) rg_real	20.65 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.37 Å
I(0) (实空间) i0_real	9.3430e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.2230e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	20.67 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	9344000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9001
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	32.8 Å
偏度 Skewness skewness	-0.028
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.719
角度范围 angular_range	— – 0.3850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	938600.0000
实空间数据点数 n_real_points	70
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.901; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.998

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Growth/differentiation factor 5
分子量 formula_weight	13405.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	1587

MKRQGKRPSKNLKARCSRKALHVNFKDMGWDDWIIAPLEYEAFHCEGLCEFPLRSHLEPTNHAVIQTLMNSMDPESTPPTCCVPTRLSPISILFIDSANNVVYKQYEDMVVESCGCR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Bone morphogenetic protein receptor type-1B
分子量 formula_weight	13214.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

GSGAMAKKEDGESTAPTPRPKILRCKCHHHCPEDSVNNICSTDGYCFTMIEEDDSGMPVVTSGCLGLEGSDFQCRDTPIPHQRRSIECCTERNECNKDLHPTLPPLKDRDFVDGPIHHK

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	51

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d3evsb_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.17 — Cystine-knot cytokines
超家族 Superfamily superfamily	g.17.1 — Cystine-knot cytokines
家族 Family family	g.17.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3evsc_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.7 — Snake toxin-like
超家族 Superfamily superfamily	g.7.1 — Snake toxin-like
家族 Family family	g.7.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	3evsB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cystine-knot cytokines

结构域编号 domain_id	3evsC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — CD59

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	76.455 Å
晶胞边长 b length_b	76.455 Å
晶胞边长 c length_c	82.784 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 42 21 2
空间群编号 int_tables_number	94
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	34.190 Å
R 因子 r_factor	0.2170
R_work r_work	0.2150
R_free r_free	0.2560

fit	/app/data/saxs_computation/ev/3evs/3evs.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ev/3evs/3evs.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ev/3evs/3evs.dat

Crystal structure of the GDF-5:BMP receptor IB complex.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Growth/differentiation factor 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Bone morphogenetic protein receptor type-1B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)