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3g0c

Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with a pyrimidinedione inhibitor 1

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 191.9 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dipeptidyl peptidase 4

Homo sapiens

UniProt P27487

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 同源多聚体 蛋白 × 2 其他聚合物 3 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 39–766 链 B； UniProt 39–766 片段：UNP residues 39-766 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 RUF 7-(2-chlorobenzyl)-1,3-dimethyl-8-piperazin-1-yl-3,7-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K 分辨率 2.69 Å R-free 0.248
2 其他组合 同源多聚体 蛋白 × 2 其他聚合物 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 39–766 链 D； UniProt 39–766 片段：UNP residues 39-766 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 RUF 7-(2-chlorobenzyl)-1,3-dimethyl-8-piperazin-1-yl-3,7-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K 分辨率 2.69 Å R-free 0.248
3 其他组合 单体 蛋白 × 1 其他聚合物 2 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 39–766 片段：UNP residues 39-766 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 RUF 7-(2-chlorobenzyl)-1,3-dimethyl-8-piperazin-1-yl-3,7-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K 分辨率 2.69 Å R-free 0.248
4 其他组合 单体 蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 39–766 片段：UNP residues 39-766 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 RUF 7-(2-chlorobenzyl)-1,3-dimethyl-8-piperazin-1-yl-3,7-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K 分辨率 2.69 Å R-free 0.248
5 其他组合 单体 蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 39–766 片段：UNP residues 39-766 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 RUF 7-(2-chlorobenzyl)-1,3-dimethyl-8-piperazin-1-yl-3,7-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K 分辨率 2.69 Å R-free 0.248
6 其他组合 单体 蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 39–766 片段：UNP residues 39-766 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 RUF 7-(2-chlorobenzyl)-1,3-dimethyl-8-piperazin-1-yl-3,7-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K 分辨率 2.69 Å R-free 0.248

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3G0C Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1J2E Crystal structure of Human Dipeptidyl peptidase IV 提交 2002-12-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 33–766（734 aa） 片段：residues 33-772
链 B 33–766（734 aa） 片段：residues 33-772
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；18% PEG4000, 0.18M Sodium acetate, 0.18M Gly-NaOH, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.60 Å R-free 0.302
1N1M Human Dipeptidyl Peptidase IV/CD26 in complex with an inhibitor 提交 2002-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：Extracellular domain
链 B 39–766（728 aa） 片段：Extracellular domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 HG MERCURY (II) ION × 4 A3M 2-AMINO-3-METHYL-1-PYRROLIDIN-1-YL-BUTAN-1-ONE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG4000, Sodium acetate, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.263
1NU6 Crystal structure of human Dipeptidyl Peptidase IV (DPP-IV) 提交 2003-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 HG MERCURY (II) ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；PEG, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.266
1NU8 Crystal structure of human dipeptidyl peptidase IV (DPP-IV) in complex with Diprotin A (IPI) 提交 2003-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；Peg, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.282
1PFQ crystal structure of human apo dipeptidyl peptidase IV / CD26 提交 2003-05-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 36–766（731 aa）
链 B 36–766（731 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.298
1R9M Crystal Structure of Human Dipeptidyl Peptidase IV at 2.1 Ang. Resolution. 提交 2003-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.249
1R9M Crystal Structure of Human Dipeptidyl Peptidase IV at 2.1 Ang. Resolution. 提交 2003-10-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.249
1R9M Crystal Structure of Human Dipeptidyl Peptidase IV at 2.1 Ang. Resolution. 提交 2003-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.249
1R9M Crystal Structure of Human Dipeptidyl Peptidase IV at 2.1 Ang. Resolution. 提交 2003-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.249
1R9N Crystal Structure of human dipeptidyl peptidase IV in complex with a decapeptide (tNPY) at 2.3 Ang. Resolution 提交 2003-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.25；298 K；PEG 2000, Bicine, pH 8.25, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.251
1R9N Crystal Structure of human dipeptidyl peptidase IV in complex with a decapeptide (tNPY) at 2.3 Ang. Resolution 提交 2003-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.25；298 K；PEG 2000, Bicine, pH 8.25, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.251
1R9N Crystal Structure of human dipeptidyl peptidase IV in complex with a decapeptide (tNPY) at 2.3 Ang. Resolution 提交 2003-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.25；298 K；PEG 2000, Bicine, pH 8.25, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.251
1RWQ Human Dipeptidyl peptidase IV in complex with 5-aminomethyl-6-(2,4-dichloro-phenyl)-2-(3,5-dimethoxy-phenyl)-pyrimidin-4-ylamine 提交 2003-12-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 5AP 5-(AMINOMETHYL)-6-(2,4-DICHLOROPHENYL)-2-(3,5-DIMETHOXYPHENYL)PYRIMIDIN-4-AMINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；22% PEG 3350, 200mM MgCl2, Tris, 15% glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.290
1TK3 Crystal Structure Of Human Apo Dipeptidyl Peptidase IV/CD26 提交 2004-06-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：Extracellular domain
链 B 39–766（728 aa） 片段：Extracellular domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.272
1TKR Human Dipeptidyl Peptidase IV/CD26 inhibited with Diisopropyl FluoroPhosphate 提交 2004-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：Extracellular domain
链 B 39–766（728 aa） 片段：Extracellular domain
未记录 DFP DIISOPROPYL PHOSPHONATE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, Sodium acetate, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.268
1U8E HUMAN DIPEPTIDYL PEPTIDASE IV/CD26 MUTANT Y547F 提交 2004-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
链 B 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
突变：Y547F 突变：Y547F NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.268
1W1I Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV (DPPIV or CD26) in complex with adenosine deaminase 提交 2004-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN 39 - 766
链 B 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN 39 - 766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.00
分辨率 3.03 Å R-free 0.257
1W1I Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV (DPPIV or CD26) in complex with adenosine deaminase 提交 2004-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN 39 - 766
链 D 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN 39 - 766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.00
分辨率 3.03 Å R-free 0.257
1WCY Crystal Structure Of Human Dipeptidyl Peptidase IV (DPPIV) Complex With Diprotin A 提交 2004-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 33–766（734 aa） 片段：residues 33-772
链 B 33–766（734 aa） 片段：residues 33-772
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；18% PEG4000, 0.18M Sodium acetate, 0.18M Gly-NaOH, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
1X70 HUMAN DIPEPTIDYL PEPTIDASE IV IN COMPLEX WITH A BETA AMINO ACID INHIBITOR 提交 2004-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：extracellular domain
链 B 39–766（728 aa） 片段：extracellular domain
突变：S39T 突变：S39T NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 NA SODIUM ION × 1 715 (2R)-4-OXO-4-[3-(TRIFLUOROMETHYL)-5,6-DIHYDRO[1,2,4]TRIAZOLO[4,3-A]PYRAZIN-7(8H)-YL]-1-(2,4,5-TRIFLUOROPHENYL)BUTAN-2-A MINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 8.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
2AJL X-ray Structure of Novel Biaryl-Based Dipeptidyl peptidase IV inhibitor 提交 2005-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 39–766（728 aa） 片段：Dipeptidyl peptidase 4 soluble form, residues 39-766
链 J 39–766（728 aa） 片段：Dipeptidyl peptidase 4 soluble form, residues 39-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 JNH 1-[2-(S)-AMINO-3-BIPHENYL-4-YL-PROPIONYL]-PYRROLIDINE-2-(S)-CARBONITRILE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG 4000, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.50 Å R-free 0.303
2BGN HIV-1 Tat protein derived N-terminal nonapeptide Trp2-Tat(1-9) bound to the active site of Dipeptidyl peptidase IV (CD26) 提交 2005-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 39-766
链 B 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 39-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.15 Å R-free 0.247
2BGN HIV-1 Tat protein derived N-terminal nonapeptide Trp2-Tat(1-9) bound to the active site of Dipeptidyl peptidase IV (CD26) 提交 2005-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 39-766
链 D 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 39-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.15 Å R-free 0.247
2BGR Crystal structure of HIV-1 Tat derived nonapeptides Tat(1-9) bound to the active site of Dipeptidyl peptidase IV (CD26) 提交 2005-01-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 29–766（738 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 29-766
链 B 29–766（738 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 29-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.203
2BUB Crystal Structure Of Human Dipeptidyl Peptidase IV (CD26) in Complex with a Reversed Amide Inhibitor 提交 2005-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 39-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FPB N-({(2S)-1-[(3R)-3-AMINO-4-(2-FLUOROPHENYL)BUTANOYL]PYRROLIDIN-2-YL}METHYL)BENZAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.66 Å R-free 0.329
2BUB Crystal Structure Of Human Dipeptidyl Peptidase IV (CD26) in Complex with a Reversed Amide Inhibitor 提交 2005-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 39-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FPB N-({(2S)-1-[(3R)-3-AMINO-4-(2-FLUOROPHENYL)BUTANOYL]PYRROLIDIN-2-YL}METHYL)BENZAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.66 Å R-free 0.329
2FJP Human dipeptidyl peptidase IV/CD26 in complex with an inhibitor 提交 2006-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
链 B 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
突变：Ser39Thr 突变：Ser39Thr NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 S14 6-(4-{(1S,2S)-2-AMINO-1-[(DIMETHYLAMINO)CARBONYL]-3-[(3S)-3-FLUOROPYRROLIDIN-1-YL]-3-OXOPROPYL}PHENYL)-1H-[1,2,4]TRIAZOLO[1,5-A]PYRIDIN-4-IUM × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG4000, SODIUM ACETATE, TRIS, PH 8.0, pH 8.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.40 Å R-free 0.240
2G5P Crystal structure of human dipeptidyl peptidase IV (DPPIV) complexed with cyanopyrrolidine (C5-pro-pro) inhibitor 21ac 提交 2006-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–764（726 aa） 片段：Dipeptidyl peptidase 4 soluble form
链 B 39–764（726 aa） 片段：Dipeptidyl peptidase 4 soluble form
未记录 ADF 4-{[(2R,5S)-5-{[(2S)-2-(AMINOMETHYL)PYRROLIDIN-1-YL]CARBONYL}PYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}-3-TERT-BUTYLBENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.271
2G5T Crystal structure of human dipeptidyl peptidase IV (DPPIV) complexed with cyanopyrrolidine (C5-pro-pro) inhibitor 21ag 提交 2006-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–764（726 aa） 片段：Dipeptidyl peptidase 4 soluble form
链 B 39–764（726 aa） 片段：Dipeptidyl peptidase 4 soluble form
未记录 ACF 3-{[(2R,5S)-5-{[(2S)-2-(AMINOMETHYL)PYRROLIDIN-1-YL]CARBONYL}PYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}-4-CHLOROBENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å R-free 0.243
2G63 Crystal structure of human dipeptidyl peptidase IV (DPPIV) complexed with cyanopyrrolidine (C5-pro-pro) inhibitor 24b 提交 2006-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–764（726 aa） 片段：Dipeptidyl peptidase 4 soluble form
链 B 39–764（726 aa） 片段：Dipeptidyl peptidase 4 soluble form
未记录 AAF METHYL 4-{[({[(2R,5S)-5-{[(2S)-2-(AMINOMETHYL)PYRROLIDIN-1-YL]CARBONYL}PYRROLIDIN-2-YL]METHYL}AMINO)CARBONYL]AMINO}BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2G63 Crystal structure of human dipeptidyl peptidase IV (DPPIV) complexed with cyanopyrrolidine (C5-pro-pro) inhibitor 24b 提交 2006-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–764（726 aa） 片段：Dipeptidyl peptidase 4 soluble form
链 D 39–764（726 aa） 片段：Dipeptidyl peptidase 4 soluble form
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2I03 Crystal structure of human dipeptidyl peptidase 4 (DPP IV) with potent alkynyl cyanopyrrolidine (ABT-279) 提交 2006-08-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–764（726 aa）
链 B 39–764（726 aa）
未记录 AXD 2-[4-({2-[(2S,5R)-2-(AMINOMETHYL)-5-ETHYNYLPYRROLIDIN-1-YL]-2-OXOETHYL}AMINO)-4-METHYLPIPERIDIN-1-YL]ISONICOTINIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；VAPOR DIFFUSION
分辨率 2.40 Å R-free 0.245
2I03 Crystal structure of human dipeptidyl peptidase 4 (DPP IV) with potent alkynyl cyanopyrrolidine (ABT-279) 提交 2006-08-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–764（726 aa）
链 D 39–764（726 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；VAPOR DIFFUSION
分辨率 2.40 Å R-free 0.245
2I78 Crystal structure of human dipeptidyl peptidase IV (DPP IV) complexed with ABT-341, a cyclohexene-constrained phenethylamine inhibitor 提交 2006-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–764（726 aa）
链 B 39–764（726 aa）
未记录 KIQ (1S,6R)-3-{[3-(TRIFLUOROMETHYL)-5,6-DIHYDRO[1,2,4]TRIAZOLO[4,3-A]PYRAZIN-7(8H)-YL]CARBONYL}-6-(2,4,5-TRIFLUOROPHENYL)CYCLOHEX-3-EN-1-AMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；VAPOR DIFFUSION
分辨率 2.50 Å R-free 0.275
2I78 Crystal structure of human dipeptidyl peptidase IV (DPP IV) complexed with ABT-341, a cyclohexene-constrained phenethylamine inhibitor 提交 2006-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–764（726 aa）
链 D 39–764（726 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；VAPOR DIFFUSION
分辨率 2.50 Å R-free 0.275
2IIT Human dipeptidyl peptidase 4 in complex with a diazepan-2-one inhibitor 提交 2006-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (residues 39-766)
链 B 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (residues 39-766)
突变：Ser39Thr 突变：Ser39Thr NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 NA SODIUM ION × 1 872 (3R)-4-[(3R)-3-AMINO-4-(2,4,5-TRIFLUOROPHENYL)BUTANOYL]-3-(2,2,2-TRIFLUOROETHYL)-1,4-DIAZEPAN-2-ONE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 8.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
2IIV Human dipeptidyl peptidase 4 in complex with a diazepan-2-one inhibitor 提交 2006-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (residues 39-766)
链 B 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (residues 39-766)
突变：Ser39Thr 突变：Ser39Thr NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 565 (3R)-4-[(3R)-3-AMINO-4-(2,4,5-TRIFLUOROPHENYL)BUTANOYL]-3-METHYL-1,4-DIAZEPAN-2-ONE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 8.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.15 Å R-free 0.229
2JID Human Dipeptidyl peptidase IV in complex with 1-(3,4-Dimethoxy-phenyl) -3-m-tolyl-piperidine-4-ylamine 提交 2007-02-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 31–766（736 aa） 片段：RESIDUES 31-766
链 B 31–766（736 aa） 片段：RESIDUES 31-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 GVB (3R,4S)-1-(3,4-DIMETHOXYPHENYL)-3-(3-METHYLPHENYL)PIPERIDIN-4-AMINE × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.303
2OAG Crystal structure of human dipeptidyl peptidase IV (DPPIV) with pyrrolidine-constrained phenethylamine 29g 提交 2006-12-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–764（726 aa）
链 B 39–764（726 aa）
未记录 DLI (3R,4S)-1-{6-[3-(METHYLSULFONYL)PHENYL]PYRIMIDIN-4-YL}-4-(2,4,5-TRIFLUOROPHENYL)PYRROLIDIN-3-AMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.240
2OAG Crystal structure of human dipeptidyl peptidase IV (DPPIV) with pyrrolidine-constrained phenethylamine 29g 提交 2006-12-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–764（726 aa）
链 D 39–764（726 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.240
2OGZ Crystal structure of DPP-IV complexed with Lilly aryl ketone inhibitor 提交 2007-01-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：DPP-IV extracellular domain, residues 39-766
链 B 39–766（728 aa） 片段：DPP-IV extracellular domain, residues 39-766
未记录 U1N 4-[(3R)-3-{[2-(4-FLUOROPHENYL)-2-OXOETHYL]AMINO}BUTYL]BENZAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；PEG4000, SODIUM ACETATE, pH 8, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.268
2OLE Crystal Structure Of Human Dipeptidyl Peptidase IV (DPPIV) Complex With Cyclic Hydrazine Derivatives 提交 2007-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 KR2 (2R)-4-(2-BENZOYL-1,2-DIAZEPAN-1-YL)-4-OXO-1-(2,4,5-TRIFLUOROPHENYL)BUTAN-2-AMINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；24% PEG 4000, 0.1M Tris, 0.3M Sodium acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.254
2ONC Crystal structure of human DPP-4 提交 2007-01-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 41–766（726 aa）
链 B 41–766（726 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 SY1 2-({2-[(3R)-3-AMINOPIPERIDIN-1-YL]-4-OXOQUINAZOLIN-3(4H)-YL}METHYL)BENZONITRILE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20% PEG2000MME, 0.1M Bicine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.55 Å R-free 0.254
2ONC Crystal structure of human DPP-4 提交 2007-01-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 41–766（726 aa）
链 D 41–766（726 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 SY1 2-({2-[(3R)-3-AMINOPIPERIDIN-1-YL]-4-OXOQUINAZOLIN-3(4H)-YL}METHYL)BENZONITRILE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20% PEG2000MME, 0.1M Bicine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.55 Å R-free 0.254
2ONC Crystal structure of human DPP-4 提交 2007-01-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 41–766（726 aa）
链 D 41–766（726 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 SY1 2-({2-[(3R)-3-AMINOPIPERIDIN-1-YL]-4-OXOQUINAZOLIN-3(4H)-YL}METHYL)BENZONITRILE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20% PEG2000MME, 0.1M Bicine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.55 Å R-free 0.254
2OPH Human dipeptidyl peptidase IV in complex with an alpha amino acid inhibitor 提交 2007-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
链 B 39–766（728 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
突变：T39S 突变：T39S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 NA SODIUM ION × 1 277 N-(TRANS-4-{(1S,2S)-2-AMINO-3-[(3S)-3-FLUOROPYRROLIDIN-1-YL]-1-METHYL-3-OXOPROPYL}CYCLOHEXYL)-N-METHYLACETAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, SODIUM ACETATE, TRIS, PH 8.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.238
2OQI Human Dipeptidyl Peptidase IV (DPP4) with Piperidinone-constrained phenethylamine 提交 2007-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 GGO (4R,5R)-5-AMINO-1-[2-(1,3-BENZODIOXOL-5-YL)ETHYL]-4-(2,4,5-TRIFLUOROPHENYL)PIPERIDIN-2-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.80 Å R-free 0.284
2OQI Human Dipeptidyl Peptidase IV (DPP4) with Piperidinone-constrained phenethylamine 提交 2007-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.80 Å R-free 0.284
2OQV Human Dipeptidyl Peptidase IV (DPP4) with piperidine-constrained phenethylamine 提交 2007-02-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–764（726 aa）
链 B 39–764（726 aa）
未记录 MA9 (3R,4R)-1-{6-[3-(METHYLSULFONYL)PHENYL]PYRIMIDIN-4-YL}-4-(2,4,5-TRIFLUOROPHENYL)PIPERIDIN-3-AMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.80 Å R-free 0.309
2P8S Human dipeptidyl peptidase IV/CD26 in complex with a cyclohexalamine inhibitor 提交 2007-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 40–766（727 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
链 B 40–766（727 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
突变：S39T 突变：S39T NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 NA SODIUM ION × 1 417 (1S,2R,5S)-5-[3-(TRIFLUOROMETHYL)-5,6-DIHYDRO[1,2,4]TRIAZOLO[4,3-A]PYRAZIN-7(8H)-YL]-2-(2,4,5-TRIFLUOROPHENYL)CYCLOHEXANAMINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 8.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.227
2QJR dipepdyl peptidase IV in complex with inhibitor PZF 提交 2007-07-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–766（736 aa） 片段：UNP residues 31-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PZF (3R,4S)-1-[6-(6-METHOXYPYRIDIN-3-YL)PYRIMIDIN-4-YL]-4-(2,4,5-TRIFLUOROPHENYL)PYRROLIDIN-3-AMINE × 1 LGU alpha-L-gulopyranuronic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.20 Å R-free 0.253
2QJR dipepdyl peptidase IV in complex with inhibitor PZF 提交 2007-07-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 31–766（736 aa） 片段：UNP residues 31-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PZF (3R,4S)-1-[6-(6-METHOXYPYRIDIN-3-YL)PYRIMIDIN-4-YL]-4-(2,4,5-TRIFLUOROPHENYL)PYRROLIDIN-3-AMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.20 Å R-free 0.253
2QJR dipepdyl peptidase IV in complex with inhibitor PZF 提交 2007-07-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 31–766（736 aa） 片段：UNP residues 31-766
链 B 31–766（736 aa） 片段：UNP residues 31-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PZF (3R,4S)-1-[6-(6-METHOXYPYRIDIN-3-YL)PYRIMIDIN-4-YL]-4-(2,4,5-TRIFLUOROPHENYL)PYRROLIDIN-3-AMINE × 2 LGU alpha-L-gulopyranuronic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.20 Å R-free 0.253
2QKY complex structure of dipeptidyl peptidase IV and a oxadiazolyl ketone 提交 2007-07-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 40–766（727 aa） 片段：extracellular domain
链 B 40–766（727 aa） 片段：extracellular domain
未记录 13Z 2-[(2-{(2S,4S)-2-[(R)-(5-tert-butyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)(hydroxy)methyl]-4-fluoropyrrolidin-1-yl}-2-oxoethyl)amino]-2-methylpropan-1-ol × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；24% PEG MME 2K, 0.1M Bicine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.293
2QKY complex structure of dipeptidyl peptidase IV and a oxadiazolyl ketone 提交 2007-07-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 40–766（727 aa） 片段：extracellular domain
链 D 40–766（727 aa） 片段：extracellular domain
未记录 13Z 2-[(2-{(2S,4S)-2-[(R)-(5-tert-butyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)(hydroxy)methyl]-4-fluoropyrrolidin-1-yl}-2-oxoethyl)amino]-2-methylpropan-1-ol × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；24% PEG MME 2K, 0.1M Bicine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.293
2QOE Human Dipeptidyl Peptidase IV in complex with a Triazolopiperazine-based beta amino acid Inhibitor 提交 2007-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：Catalytic Domain
链 B 39–766（728 aa） 片段：Catalytic Domain
突变：S39T 突变：S39T NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NA SODIUM ION × 1 448 (2R)-4-[(8R)-8-METHYL-2-(TRIFLUOROMETHYL)-5,6-DIHYDRO[1,2,4]TRIAZOLO[1,5-A]PYRAZIN-7(8H)-YL]-4-OXO-1-(2,4,5-TRIFLUOROPHENYL)BUTAN-2-AMINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG4000, SODIUM ACETATE, TRIS, PH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.212
2QT9 Human dipeptidyl peptidase iv/cd26 in complex with a 4-aryl cyclohexylalanine inhibitor 提交 2007-08-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：undecameric
链 A 1–766（766 aa）
链 B 1–766（766 aa）
突变：T39S 突变：T39S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 NA SODIUM ION × 1 524 (2S,3S)-3-AMINO-4-[(3S)-3-FLUOROPYRROLIDIN-1-YL]-N,N-DIMETHYL-4-OXO-2-(TRANS-4-[1,2,4]TRIAZOLO[1,5-A]PYRIDIN-5-YLCYCLOH EXYL)BUTANAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG4000, Sodium Acetate, TRIS, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K, pH 8.000000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
2QTB Human dipeptidyl peptidase iv/cd26 in complex with a 4-aryl cyclohexylalanine inhibitor 提交 2007-08-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：decameric
链 A 1–766（766 aa）
链 B 1–766（766 aa）
突变：T39S 突变：T39S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 NA SODIUM ION × 1 474 (2S,3S)-3-AMINO-4-(3,3-DIFLUOROPYRROLIDIN-1-YL)-N,N-DIMETHYL-4-OXO-2-(TRANS-4-[1,2,4]TRIAZOLO[1,5-A]PYRIDIN-6-YLCYCLOHEXYL)BUTANAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG4000, Sodium Acetate, TRIS, pH 8.000000, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.25 Å R-free 0.228
2RGU Crystal structure of complex of human DPP4 and inhibitor 提交 2007-10-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：Extracellular domain
链 B 39–766（728 aa） 片段：Extracellular domain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 356 8-[(3R)-3-Aminopiperidin-1-yl]-7-but-2-yn-1-yl-3-methyl-1-[(4-methylquinazolin-2-yl)methyl]-3,7-dihydro-1H-purine-2,6-d ione × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；25% PEG 3350, 150mM MgCl2, Tris-HCl pH 8.1, 15% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2RIP Structure of DPPIV in complex with an inhibitor 提交 2007-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 38–766（729 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 34Q (3R,4R)-4-(pyrrolidin-1-ylcarbonyl)-1-(quinoxalin-2-ylcarbonyl)pyrrolidin-3-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20%PEG, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.293
3BJM Crystal structure of human DPP-IV in complex with (1S,3S, 5S)-2-[(2S)-2-AMINO-2-(3-HYDROXYTRICYCLO[3.3.1.13,7]DEC-1- YL)ACETYL]-2-AZABICYCLO[3.1.0]HEXANE-3-CARBONITRILE (CAS), (1S,3S,5S)-2-((2S)-2-AMINO-2-(3-HYDROXYADAMANTAN-1- YL)ACETYL)-2-AZABICYCLO[3.1.0]HEXANE-3-CARBONITRILE (IUPAC), OR BMS-477118 提交 2007-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 BJM (2~{S})-2-azanyl-1-[(1~{S},3~{S},5~{S})-3-(iminomethyl)-2-azabicyclo[3.1.0]hexan-2-yl]-2-[(5~{R},7~{S})-3-oxidanyl-1-ad amantyl]ethanone × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.35 Å R-free 0.253
3C43 Human dipeptidyl peptidase IV/CD26 in complex with a flouroolefin inhibitor 提交 2008-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：Catalytic domain
链 B 39–766（728 aa） 片段：Catalytic domain
突变：S39T 突变：S39T NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 315 (2S,3S)-4-cyclopropyl-3-{(3R,5R)-3-[2-fluoro-4-(methylsulfonyl)phenyl]-1,2,4-oxadiazolidin-5-yl}-1-[(3S)-3-fluoropyrrolidin-1-yl]-1-oxobutan-2-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG4000, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 8.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.234
3C45 Human dipeptidyl peptidase IV/CD26 in complex with a fluoroolefin inhibitor 提交 2008-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：Catalytic domain
链 B 39–766（728 aa） 片段：Catalytic domain
突变：S39T 突变：S39T NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 NA SODIUM ION × 1 317 (2S,3S)-3-{3-[2-chloro-4-(methylsulfonyl)phenyl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl}-1-cyclopentylidene-4-cyclopropyl-1-fluorobutan-2-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG4000, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 8.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.05 Å R-free 0.218
3CCB Crystal Structure of Human DPP4 in complex with a benzimidazole derivative 提交 2008-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 B2Y 1-biphenyl-2-ylmethanamine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；22.5% PEG 2000mme, 0.1M Bicine, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.49 Å R-free 0.244
3CCB Crystal Structure of Human DPP4 in complex with a benzimidazole derivative 提交 2008-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 B2Y 1-biphenyl-2-ylmethanamine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；22.5% PEG 2000mme, 0.1M Bicine, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.49 Å R-free 0.244
3CCC Crystal Structure of Human DPP4 in complex with a benzimidazole derivative 提交 2008-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 7AC 7-(aminomethyl)-6-(2-chlorophenyl)-1-methyl-1H-benzimidazole-5-carbonitrile × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；22.5% PEG 2000mme, 0.1M Bicine, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.71 Å R-free 0.267
3CCC Crystal Structure of Human DPP4 in complex with a benzimidazole derivative 提交 2008-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 7AC 7-(aminomethyl)-6-(2-chlorophenyl)-1-methyl-1H-benzimidazole-5-carbonitrile × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；22.5% PEG 2000mme, 0.1M Bicine, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.71 Å R-free 0.267
3D4L Human dipeptidyl peptidase IV/CD26 in complex with a novel inhibitor 提交 2008-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：Extracellular domain (residues 39-766)
链 B 39–766（728 aa） 片段：Extracellular domain (residues 39-766)
突变：T39S 突变：T39S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 NA SODIUM ION × 1 605 4'-[(1R)-1-amino-2-(2,5-difluorophenyl)ethyl]biphenyl-3-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG4000, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 8.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.217
3EIO Crystal Structure Analysis of DPPIV Inhibitor 提交 2008-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 AJH 4-({4-[(3R)-3-amino-4-(2,4,5-trifluorophenyl)butanoyl]-1,4-diazepan-1-yl}carbonyl)benzoic acid × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；24% PEG 4000, 300mM Na Acetate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.272
3F8S Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with inhibitor 提交 2008-11-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–766（736 aa） 片段：UNP residues 31-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PF2 2-(4-{(3S,5S)-5-[(3,3-difluoropyrrolidin-1-yl)carbonyl]pyrrolidin-3-yl}piperazin-1-yl)pyrimidine × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.43 Å R-free 0.295
3F8S Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with inhibitor 提交 2008-11-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 31–766（736 aa） 片段：UNP residues 31-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PF2 2-(4-{(3S,5S)-5-[(3,3-difluoropyrrolidin-1-yl)carbonyl]pyrrolidin-3-yl}piperazin-1-yl)pyrimidine × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.43 Å R-free 0.295
3F8S Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with inhibitor 提交 2008-11-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 31–766（736 aa） 片段：UNP residues 31-766
链 B 31–766（736 aa） 片段：UNP residues 31-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PF2 2-(4-{(3S,5S)-5-[(3,3-difluoropyrrolidin-1-yl)carbonyl]pyrrolidin-3-yl}piperazin-1-yl)pyrimidine × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.43 Å R-free 0.295
3G0B Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with TAK-322 提交 2009-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
链 B 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 T22 2-({6-[(3R)-3-aminopiperidin-1-yl]-3-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl}methyl)benzonitrile × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；22% PEG MME 2000, 0.06M NP_Bicine_Na, 0.04M Bicine, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.25 Å R-free 0.242
3G0B Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with TAK-322 提交 2009-01-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
链 D 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 T22 2-({6-[(3R)-3-aminopiperidin-1-yl]-3-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl}methyl)benzonitrile × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；22% PEG MME 2000, 0.06M NP_Bicine_Na, 0.04M Bicine, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.25 Å R-free 0.242
3G0D Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with a pyrimidinedione inhibitor 2 提交 2009-01-27 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
链 B 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 XIH 2-({8-[(3R)-3-AMINOPIPERIDIN-1-YL]-1,3-DIMETHYL-2,6-DIOXO-1,2,3,6-TETRAHYDRO-7H-PURIN-7-YL}METHYL)BENZONITRILE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.39 Å R-free 0.239
3G0D Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with a pyrimidinedione inhibitor 2 提交 2009-01-27 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
链 D 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 XIH 2-({8-[(3R)-3-AMINOPIPERIDIN-1-YL]-1,3-DIMETHYL-2,6-DIOXO-1,2,3,6-TETRAHYDRO-7H-PURIN-7-YL}METHYL)BENZONITRILE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.39 Å R-free 0.239
3G0D Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with a pyrimidinedione inhibitor 2 提交 2009-01-27 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 XIH 2-({8-[(3R)-3-AMINOPIPERIDIN-1-YL]-1,3-DIMETHYL-2,6-DIOXO-1,2,3,6-TETRAHYDRO-7H-PURIN-7-YL}METHYL)BENZONITRILE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.39 Å R-free 0.239
3G0D Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with a pyrimidinedione inhibitor 2 提交 2009-01-27 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 XIH 2-({8-[(3R)-3-AMINOPIPERIDIN-1-YL]-1,3-DIMETHYL-2,6-DIOXO-1,2,3,6-TETRAHYDRO-7H-PURIN-7-YL}METHYL)BENZONITRILE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.39 Å R-free 0.239
3G0D Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with a pyrimidinedione inhibitor 2 提交 2009-01-27 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 5 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 XIH 2-({8-[(3R)-3-AMINOPIPERIDIN-1-YL]-1,3-DIMETHYL-2,6-DIOXO-1,2,3,6-TETRAHYDRO-7H-PURIN-7-YL}METHYL)BENZONITRILE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.39 Å R-free 0.239
3G0D Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with a pyrimidinedione inhibitor 2 提交 2009-01-27 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 6 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 XIH 2-({8-[(3R)-3-AMINOPIPERIDIN-1-YL]-1,3-DIMETHYL-2,6-DIOXO-1,2,3,6-TETRAHYDRO-7H-PURIN-7-YL}METHYL)BENZONITRILE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.39 Å R-free 0.239
3G0G Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with a pyrimidinone inhibitor 3 提交 2009-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
链 B 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 RUM 2-({2-[(3R)-3-aminopiperidin-1-yl]-5-bromo-6-oxopyrimidin-1(6H)-yl}methyl)benzonitrile × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
3G0G Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with a pyrimidinone inhibitor 3 提交 2009-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
链 D 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 RUM 2-({2-[(3R)-3-aminopiperidin-1-yl]-5-bromo-6-oxopyrimidin-1(6H)-yl}methyl)benzonitrile × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
3G0G Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with a pyrimidinone inhibitor 3 提交 2009-01-27 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 RUM 2-({2-[(3R)-3-aminopiperidin-1-yl]-5-bromo-6-oxopyrimidin-1(6H)-yl}methyl)benzonitrile × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
3G0G Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with a pyrimidinone inhibitor 3 提交 2009-01-27 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 RUM 2-({2-[(3R)-3-aminopiperidin-1-yl]-5-bromo-6-oxopyrimidin-1(6H)-yl}methyl)benzonitrile × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
3G0G Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with a pyrimidinone inhibitor 3 提交 2009-01-27 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 5 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 RUM 2-({2-[(3R)-3-aminopiperidin-1-yl]-5-bromo-6-oxopyrimidin-1(6H)-yl}methyl)benzonitrile × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
3G0G Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with a pyrimidinone inhibitor 3 提交 2009-01-27 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 6 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 RUM 2-({2-[(3R)-3-aminopiperidin-1-yl]-5-bromo-6-oxopyrimidin-1(6H)-yl}methyl)benzonitrile × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；22.5% PEG MME 200, 0.1M Bicine pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
3H0C Crystal Structure of Human Dipeptidyl Peptidase IV (CD26) in Complex with a Reversed Amide Inhibitor 提交 2009-04-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 PS4 N-({(2S)-1-[(3R)-3-amino-4-(3-chlorophenyl)butanoyl]pyrrolidin-2-yl}methyl)-3-(methylsulfonyl)benzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.66 Å R-free 0.271
3HAB The structure of DPP4 in complex with piperidine fused benzimidazole 25 提交 2009-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：Catalytic domain
链 B 39–766（728 aa） 片段：Catalytic domain
突变：S39T 突变：S39T NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NA SODIUM ION × 1 677 (2R,3R)-7-(methylsulfonyl)-3-(2,4,5-trifluorophenyl)-1,2,3,4-tetrahydropyrido[1,2-a]benzimidazol-2-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.211
3HAC The structure of DPP-4 in complex with piperidine fused imidazopyridine 34 提交 2009-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：Catalytic domain
链 B 39–766（728 aa） 片段：Catalytic domain
突变：S39T 突变：S39T NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NA SODIUM ION × 1 361 (7R,8R)-8-(2,4,5-trifluorophenyl)-6,7,8,9-tetrahydroimidazo[1,2-a:4,5-c']dipyridin-7-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.205
3KWF human DPP-IV with carmegliptin (S)-1-((2S,3S,11bS)-2-Amino-9,10-dimethoxy-1,3,4,6,7,11b-hexahydro-2H-pyrido[2,1-a]isoquinolin-3-yl)-4-fluoromethyl-pyrrolidin-2-one 提交 2009-12-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 B1Q (4S)-1-[(2S,3S,11bS)-2-amino-9,10-dimethoxy-1,3,4,6,7,11b-hexahydro-2H-pyrido[2,1-a]isoquinolin-3-yl]-4-(fluoromethyl)pyrrolidin-2-one × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.246
3KWJ Structure of human DPP-IV with (2S,3S,11bS)-3-(3-Fluoromethyl-phenyl)-9,10-dimethoxy-1,3,4,6,7,11b-hexahydro-2H-pyrido[2,1-a]isoquinolin-2-ylamine 提交 2009-12-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 23Q (2S,3S,11bS)-3-[3-(fluoromethyl)phenyl]-9,10-dimethoxy-1,3,4,6,7,11b-hexahydro-2H-pyrido[2,1-a]isoquinolin-2-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.276
3O95 Crystal Structure of Human DPP4 Bound to TAK-100 提交 2010-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 01T [5-(aminomethyl)-6-(2,2-dimethylpropyl)-2-ethyl-4-(4-methylphenyl)pyridin-3-yl]acetic acid × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG MME 2000, 100 mM Bicine, pH 8-8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.248
3O95 Crystal Structure of Human DPP4 Bound to TAK-100 提交 2010-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 01T [5-(aminomethyl)-6-(2,2-dimethylpropyl)-2-ethyl-4-(4-methylphenyl)pyridin-3-yl]acetic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG MME 2000, 100 mM Bicine, pH 8-8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.248
3O95 Crystal Structure of Human DPP4 Bound to TAK-100 提交 2010-08-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 01T [5-(aminomethyl)-6-(2,2-dimethylpropyl)-2-ethyl-4-(4-methylphenyl)pyridin-3-yl]acetic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG MME 2000, 100 mM Bicine, pH 8-8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.248
3O9V Crystal Structure of Human DPP4 Bound to TAK-986 提交 2010-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 10T 5-(aminomethyl)-2-methyl-4-(4-methylphenyl)-6-(2-methylpropyl)pyridine-3-carboxic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting drop, vapor diffusion；277 K；20% PEG MME 2000, 100 mM Bicine, pH 8-8.5, sitting drop, vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
3O9V Crystal Structure of Human DPP4 Bound to TAK-986 提交 2010-08-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 10T 5-(aminomethyl)-2-methyl-4-(4-methylphenyl)-6-(2-methylpropyl)pyridine-3-carboxic acid × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting drop, vapor diffusion；277 K；20% PEG MME 2000, 100 mM Bicine, pH 8-8.5, sitting drop, vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
3O9V Crystal Structure of Human DPP4 Bound to TAK-986 提交 2010-08-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 10T 5-(aminomethyl)-2-methyl-4-(4-methylphenyl)-6-(2-methylpropyl)pyridine-3-carboxic acid × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting drop, vapor diffusion；277 K；20% PEG MME 2000, 100 mM Bicine, pH 8-8.5, sitting drop, vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
3OC0 Structure of human DPP-IV with HTS hit (2S,3S,11bS)-3-butyl-9,10-dimethoxy-1,3,4,6,7,11b-hexahydro-2H-pyrido[2,1-a]isoquinolin-2-ylamine 提交 2010-08-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 B2Q (2S,3R,11bR)-3-butyl-9,10-dimethoxy-1,3,4,6,7,11b-hexahydro-2H-pyrido[2,1-a]isoquinolin-2-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å R-free 0.286
3OPM Crystal Structure of Human DPP4 Bound to TAK-294 提交 2010-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 39–766（728 aa） 片段：DPP4
链 B 39–766（728 aa） 片段：DPP4
链 C 39–766（728 aa） 片段：DPP4
链 D 39–766（728 aa） 片段：DPP4
突变：N-terminal His tag 突变：N-terminal His tag 突变：N-terminal His tag 突变：N-terminal His tag LUI 2-{[3-(aminomethyl)-2-(2-methylpropyl)-1-oxo-4-phenyl-1,2-dihydroisoquinolin-6-yl]oxy}acetamide × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 277 K；23.6% PEG MME 2000, 100 mM Bicine, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.72 Å R-free 0.254
3OPM Crystal Structure of Human DPP4 Bound to TAK-294 提交 2010-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：DPP4
链 B 39–766（728 aa） 片段：DPP4
突变：N-terminal His tag 突变：N-terminal His tag LUI 2-{[3-(aminomethyl)-2-(2-methylpropyl)-1-oxo-4-phenyl-1,2-dihydroisoquinolin-6-yl]oxy}acetamide × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 277 K；23.6% PEG MME 2000, 100 mM Bicine, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.72 Å R-free 0.254
3OPM Crystal Structure of Human DPP4 Bound to TAK-294 提交 2010-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa） 片段：DPP4
链 D 39–766（728 aa） 片段：DPP4
突变：N-terminal His tag 突变：N-terminal His tag LUI 2-{[3-(aminomethyl)-2-(2-methylpropyl)-1-oxo-4-phenyl-1,2-dihydroisoquinolin-6-yl]oxy}acetamide × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 277 K；23.6% PEG MME 2000, 100 mM Bicine, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.72 Å R-free 0.254
3Q0T Crystal structure of human dpp-iv in complex withsa-(+)- methyl2-(3-(aminomethyl)-4-(2,4-dichlorophenyl)-2-methyl- 7-oxo-5h-pyrrolo[3,4-b]pyridin-6(7h)-yl)acetate 提交 2010-12-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 LGE methyl [3-(aminomethyl)-4-(2,4-dichlorophenyl)-2-methyl-7-oxo-5,7-dihydro-6H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-6-yl]acetate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；CRYSTALS GROWN IN 2 UL EQUIVOLUME MIXTURE OF PROTEIN SOLUTION (0.1 M NACL, 20 MM TRIS-HCL BUFFER PH 7.8, 9.8 MG/ML PROTEIN) AND CRYSTALLIZATION SOLUTION (17% W/V PEG 3350, 15% W/V GLYCEROL, 200 MM MGCL2, 100 MM TRIS-HCL BUFFER PH 8.5). SUFFICIENT. 100 MM LIGAND STOCK SOLUTION (NEAT DMSO) ADDED TO ACHIEVE 1 MM LIGAND CONCENTRATION. SOAKED OVERNIGHT. HARVESTED DIRECTLY AND CRYO-STORED IN LN2. 2. temperature 298K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.40 Å R-free 0.260
3Q8W A b-aminoacyl containing thiazolidine derivative and DPPIV complex 提交 2011-01-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–764（726 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (UNP RESIDUES 39-764)
链 B 39–764（726 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (UNP RESIDUES 39-764)
未记录 AZV N-(4-{[({(2R)-3-[(3R)-3-amino-4-(2,4,5-trifluorophenyl)butanoyl]-1,3-thiazolidin-2-yl}carbonyl)amino]methyl}phenyl)-D-valine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；0.1 M Tris pH 8.0, 22 % (w/v) PEG 4000, 0.3M NaAcetate , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.64 Å R-free 0.324
3QBJ Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with inhibitor 提交 2011-01-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 31–766（736 aa）
链 B 31–766（736 aa）
突变：N150A, N520A 突变：N150A, N520A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NXZ 1-[(3S,4S)-4-amino-1-(6-phenylpyrimidin-4-yl)pyrrolidin-3-yl]piperidin-2-one × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.21 Å R-free 0.235
3SWW Crystal structure of human dpp-iv in complex with sa-(+)-3-(aminomethyl)-4-(2,4-dichlorophenyl)-6-(2-methoxyphenyl)- 2-methyl-5h-pyrrolo[3,4-b]pyridin-7(6h)-one 提交 2011-07-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：unp residues 39-766
链 B 39–766（728 aa） 片段：unp residues 39-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 KXB 3-(aminomethyl)-4-(2,4-dichlorophenyl)-6-(2-methoxyethyl)-2-methyl-5,6-dihydro-7H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-7-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；CRYSTALS GROWN IN 2 UL EQUIVOLUME MIXTURE OF PROTEIN SOLUTION (0.1 M NACL, 20 MM TRIS-HCL BUFFER PH 7.8, 9.8 MG/ML PROTEIN) AND CRYSTALLIZATION SOLUTION (17% W/V PEG 3350, 15% W/V GLYCEROL, 200 MM MGCL2, 100 MM TRIS-HCL). SUFFICIENT 100 MM LIGAND STOCK SOLUTION (NEAT DMSO) ADDED TO ACHIEVE 1 MM LIGAND CONCENTRATION. SOAKED OVERNIGHT. HARVESTED DIRECTLY AND CRYO-STORED IN LN2 VAPOR DIFFUSION / HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.234
3SX4 Crystal structure of human dpp-iv in complex with sa-(+)-3-(aminomethyl)-4-(2,4-dichlorophenyl)-6-(2-methoxyphenyl)- 2-methyl-5h-pyrrolo[3,4-b]pyridin-7(6h)-one 提交 2011-07-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：unp residues 39-766
链 B 39–766（728 aa） 片段：unp residues 39-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 KXA 3-(aminomethyl)-4-(2,4-dichlorophenyl)-6-(2-methoxyphenyl)-2-methyl-5,6-dihydro-7H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-7-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；CRYSTALS GROWN IN 2 UL EQUIVOLUME MIXTURE OF PROTEIN SOLUTION (0.1 M NACL, 20 MM TRIS-HCL BUFFER PH 7.8, 9.8 MG/ML PROTEIN) AND CRYSTALLIZATION SOLUTION (17% W/V PEG 3350, 15% W/V GLYCEROL, 200 MM MGCL2, 100 MM TRIS-HCL BUFFER PH 8.5). SUFFICIENT 100 MM LIGAND STOCK SOLUTION (NEAT DMSO) ADDED TO ACHIEVE 1 MM LIGAND CONCENTRATION. SOAKED OVERNIGHT. HARVESTED DIRECTLY AND CRYO-STORED IN LN2. 2. For crystal 2: <crystal_number =, VAPOR DIFFUSION / HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.275
3VJK Crystal structure of human depiptidyl peptidase IV (DPP-4) in complex with MP-513 提交 2011-10-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 33–766（734 aa） 片段：UNP residues 33-766
链 B 33–766（734 aa） 片段：UNP residues 33-766
未记录 M51 {(2S,4S)-4-[4-(3-methyl-1-phenyl-1H-pyrazol-5-yl)piperazin-1-yl]pyrrolidin-2-yl}(1,3-thiazolidin-3-yl)methanone × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；293 K；20% PEG 4000, 0.18M sodium acetate, 0.18M glycine-sodium hydroxide , pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.49 Å R-free 0.279
3VJL Crystal structure of human depiptidyl peptidase IV (DPP-4) in complex with a prolylthiazolidine inhibitor #2 提交 2011-10-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 33–766（734 aa） 片段：UNP residues 33-766
链 B 33–766（734 aa） 片段：UNP residues 33-766
未记录 W94 [(2S,4S)-4-{4-[1-phenyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-5-yl]piperidin-1-yl}pyrrolidin-2-yl](1,3-thiazolidin-3-yl)methanone × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；293 K；20% PEG 4000, 0.18M sodium acetate, 0.18M glycine-sodium hydroxide, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.39 Å R-free 0.230
3VJM Crystal structure of human depiptidyl peptidase IV (DPP-4) in complex with a prolylthiazolidine inhibitor #1 提交 2011-10-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 33–766（734 aa） 片段：UNP residues 33-766
链 B 33–766（734 aa） 片段：UNP residues 33-766
未记录 W61 1,3-thiazolidin-3-yl[(2S,4S)-4-{4-[2-(trifluoromethyl)quinolin-4-yl]piperazin-1-yl}pyrrolidin-2-yl]methanone × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；293 K；20% PEG 4000, 0.18M sodium acetate, 0.18M glycine-sodium hydroxide, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.224
3W2T Crystal structure of human depiptidyl peptidase IV (DPP-4) in complex with vildagliptin 提交 2012-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 33–766（734 aa） 片段：UNP residues 33-766
链 B 33–766（734 aa） 片段：UNP residues 33-766
未记录 LF7 2-{[(1r,3s,5R,7S)-3-hydroxytricyclo[3.3.1.1~3,7~]decan-1-yl]amino}-1-{(2S)-2-[(E)-iminomethyl]pyrrolidin-1-yl}ethan-1-o ne × 2 GOL GLYCEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；293 K；20% PEG 4000, 0.18M sodium acetate, 0.18M glycine-sodium hydroxide, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.36 Å R-free 0.231
3WQH Crystal Structure of human DPP-IV in complex with Anagliptin 提交 2014-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：UNP RESIDUES 39-766
链 B 39–766（728 aa） 片段：UNP RESIDUES 39-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 SKK N-[2-({2-[(2S)-2-cyanopyrrolidin-1-yl]-2-oxoethyl}amino)-2-methylpropyl]-2-methylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-6-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；293 K；18% PEG 4000, 15% PEG 1000, 0.15M Na/K-Phosphate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.85 Å R-free 0.288
4A5S CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DPP4 IN COMPLEX WITH A NOVAL HETEROCYCLIC DPP4 INHIBITOR 提交 2011-10-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 N7F 6-[(3S)-3-AMINOPIPERIDIN-1-YL]-5-BENZYL-4-OXO-3-(QUINOLIN-4-YLMETHYL)-4,5-DIHYDRO-3H-PYRROLO[3,2-D]PYRIMIDINE-7-CARBONITRILE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 2 UL PROTEIN, 0.4 UL RESERVOIR, 0.25 UL WATER; PROTEIN SOLUTION: 5.2 MG/ML DPP4, 25 MM TRIS PH 8, 25 MM NACL, 2 MM NVP-BIV988-AA-1, 2% DMSO; RESERVOIR SOLUTION: 40% PEG 1000, 200 MM TRIS PH 9.0, 200 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL
分辨率 1.62 Å R-free 0.179
4DSA Crystal Structure of DPP-IV with Compound C1 提交 2012-02-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：extracellular domain (residues 39-766)
链 B 39–766（728 aa） 片段：extracellular domain (residues 39-766)
未记录 D1C 4-[({[(2R)-2-amino-3-(2,4,5-trifluorophenyl)propyl]sulfamoyl}amino)methyl]benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；0.1M MES, 30%(w/v) PEG 1500, 0.01M Betaine hydrochloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.25 Å R-free 0.266
4DSZ Crystal Structure of DPP-IV with Compound C2 提交 2012-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：extracellular domain (residues 39-766)
链 B 39–766（728 aa） 片段：extracellular domain (residues 39-766)
未记录 DC3 (2R)-4-[4-(3-methylphenyl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl]-1-(2,4,5-trifluorophenyl)butan-2-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；0.1M MES, 30%(w/v) PEG 1500, 0.01M Betaine hydrochloride, pH 5.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 3.20 Å R-free 0.260
4DTC Crystal Structure of DPP-IV with Compound C5 提交 2012-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：extracellular domain (residues 39-766)
链 B 39–766（728 aa） 片段：extracellular domain (residues 39-766)
未记录 D5C N-[(3R)-3-amino-4-(2,4,5-trifluorophenyl)butyl]-3'-(trifluoromethyl)biphenyl-4-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；0.1M MES, 30%(w/v) PEG 1500, 0.01M Betaine hydrochloride, pH 5.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.268
4G1F Crystal Structure of human Dipeptidyl Peptidase IV in complex with a pyridopyrimidinedione analogue 提交 2012-07-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 0WG 7-amino-6-(aminomethyl)-5-(2-bromophenyl)-1,3-dimethylpyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；22.5% PEG 200mme, 0.1M Bicine pH 7.8 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.259
4G1F Crystal Structure of human Dipeptidyl Peptidase IV in complex with a pyridopyrimidinedione analogue 提交 2012-07-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 0WG 7-amino-6-(aminomethyl)-5-(2-bromophenyl)-1,3-dimethylpyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；22.5% PEG 200mme, 0.1M Bicine pH 7.8 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.259
4G1F Crystal Structure of human Dipeptidyl Peptidase IV in complex with a pyridopyrimidinedione analogue 提交 2012-07-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 0WG 7-amino-6-(aminomethyl)-5-(2-bromophenyl)-1,3-dimethylpyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；22.5% PEG 200mme, 0.1M Bicine pH 7.8 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.259
4G1F Crystal Structure of human Dipeptidyl Peptidase IV in complex with a pyridopyrimidinedione analogue 提交 2012-07-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 0WG 7-amino-6-(aminomethyl)-5-(2-bromophenyl)-1,3-dimethylpyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；22.5% PEG 200mme, 0.1M Bicine pH 7.8 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.259
4G1F Crystal Structure of human Dipeptidyl Peptidase IV in complex with a pyridopyrimidinedione analogue 提交 2012-07-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
链 B 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 0WG 7-amino-6-(aminomethyl)-5-(2-bromophenyl)-1,3-dimethylpyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；22.5% PEG 200mme, 0.1M Bicine pH 7.8 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.259
4G1F Crystal Structure of human Dipeptidyl Peptidase IV in complex with a pyridopyrimidinedione analogue 提交 2012-07-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
链 D 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 0WG 7-amino-6-(aminomethyl)-5-(2-bromophenyl)-1,3-dimethylpyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；22.5% PEG 200mme, 0.1M Bicine pH 7.8 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.259
4G1F Crystal Structure of human Dipeptidyl Peptidase IV in complex with a pyridopyrimidinedione analogue 提交 2012-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
链 B 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
链 C 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
链 D 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 0WG 7-amino-6-(aminomethyl)-5-(2-bromophenyl)-1,3-dimethylpyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；22.5% PEG 200mme, 0.1M Bicine pH 7.8 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.259
4J3J Crystal Structure of DPP-IV with Compound C3 提交 2013-02-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
链 B 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 D3C N-[(3R)-3-amino-4-(2,4,5-trifluorophenyl)butyl]-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydropyrrolo[1,2-a]pyrazine-2(1H)-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；28%(w/v) PEG1500, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.20 Å R-free 0.270
4JH0 Crystal structure of dipeptidyl-peptidase 4 (CD26, adenosine deaminase complexing protein 2) (DPP-IV-WT) complex with bms-767778 AKA 2-(3-(aminomethyl)-4-(2,4- dichlorophenyl)-2-methyl-5-oxo-5,7-dihydro-6h-pyrrolo[3,4- b]pyridin-6-yl)-n,n-dimethylacetamide 提交 2013-03-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 1MD 2-[3-(aminomethyl)-4-(2,4-dichlorophenyl)-2-methyl-5-oxo-5,7-dihydro-6H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-6-yl]-N,N-dimethylacetamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；100 mM Bis-Tris-Propane, pH 7.8, 200 mM MGCL2, 15.9%(W/V) PEG 3350, 15%(V/V) Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.35 Å R-free 0.272
4KR0 Complex structure of MERS-CoV spike RBD bound to CD26 提交 2013-05-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；291 K；6% v/v 2-propanol, 0.1M sodium acetate pH4.5, 26% PEG 550, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.70 Å R-free 0.232
4L72 Crystal structure of MERS-CoV complexed with human DPP4 提交 2013-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；20% PEG1500, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.253
4L72 Crystal structure of MERS-CoV complexed with human DPP4 提交 2013-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；20% PEG1500, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.253
4LKO Crystal structure of human DPP-IV in complex with BMS-744891 提交 2013-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 1WH 3-(aminomethyl)-4-(2,4-dichlorophenyl)-6-(2-methoxyethyl)-2-methyl-6,7-dihydro-5H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-5-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM Bis-Tris-Propane, pH 7.8?, 200 mM MGCL2, 15.9%(W/V) PEG 3350, 15%(V/V) Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.43 Å R-free 0.263
4N8D DPP4 complexed with syn-7aa 提交 2013-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
链 B 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 SO4 SULFATE ION × 6 2KS 1-(cis-1-phenyl-4-{[(2E)-3-phenylprop-2-en-1-yl]oxy}cyclohexyl)methanamine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；2 UL PROTEIN + 0.4 UL RESERVOIR + 0.25 UL WATER. PROTEIN SOLUTION: 5.2 MG/ML DPP-IV, 25 MM TRIS PH 8.0, 25 MM NACL, 0.9 MM SYN-7AA, 9% DMSO. RESERVOIR SOLUTION: 30% PEG 1000, 200 MM TRIS PH 8.0, 200 MM AMMONIUMSULFATE, 5% GLYCEROL. CRYO: DROP + 2.5 UL RESERVOIR PLUS 0.5 UL 1,6- HEXANDIOL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.65 Å R-free 0.170
4N8E DPP4 complexed with compound 12a 提交 2013-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
链 B 39–766（728 aa） 片段：UNP residues 39-766
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 SO4 SULFATE ION × 6 2KV 1-[cis-4-(aminomethyl)-4-(3-chlorophenyl)cyclohexyl]piperidin-2-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；2 UL PROTEIN + 0.4 UL RESERVOIR + 0.25 UL WATER. PROTEIN SOLUTION: 5.2 MG/ML DPP-IV, 25 MM TRIS PH 8.0, 25 MM NACL, 0.9 MM COMPOUND12A, 9% DMSO. RESERVOIR SOLUTION: 30% PEG 1000, 200 MM TRIS PH 8.0, 200 MM AMMONIUMSULFATE, 5% GLYCEROL. CRYO: DROP + 2.5 UL RESERVOIR PLUS 0.5 UL 1,6-HEXANDIOL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.218
4PNZ Human dipeptidyl peptidase IV/CD26 in complex with the long-acting inhibitor Omarigliptin (MK-3102) 提交 2014-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa） 片段：extracellular domain (UNP residues 39-766)
链 B 39–766（728 aa） 片段：extracellular domain (UNP residues 39-766)
突变：S39T 突变：S39T NA SODIUM ION × 1 2VH (2R,3S,5R)-5-[2-(methylsulfonyl)-2,6-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazol-5(4H)-yl]-2-(2,4,5-trifluorophenyl)tetrahydro-2H-pyran-3-amine × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；20-25% PEG4000, 200 mM sodium acetate, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.197
4PV7 Cocrystal structure of dipeptidyl-peptidase 4 with an indole scaffold inhibitor 提交 2014-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 CJP 1-[2-(2,4-dichlorophenyl)-1-(methylsulfonyl)-1H-indol-3-yl]methanamine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；20% PEG MME 2000, 0.1M Bicine, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289.0K
分辨率 3.24 Å R-free 0.264
4QZV Bat-derived coronavirus HKU4 uses MERS-CoV receptor human CD26 for cell entry 提交 2014-07-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M sodium citrate, pH 5.5, 15% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.59 Å R-free 0.224
4QZV Bat-derived coronavirus HKU4 uses MERS-CoV receptor human CD26 for cell entry 提交 2014-07-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M sodium citrate, pH 5.5, 15% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.59 Å R-free 0.224
5I7U Human DPP4 in complex with a novel tricyclic hetero-cycle inhibitor 提交 2016-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
突变：S39T 突变：S39T NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 6AJ 2-({2-[(3R)-3-aminopiperidin-1-yl]-5-methyl-6,9-dioxo-5,6,7,9-tetrahydro-1H-imidazo[1,2-a]purin-1-yl}methyl)-4-fluorobenzonitrile × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.27-0.30 M sodium acetate 17-18% polyethylene glycol 3350 0.1 M tris hydrochloride pH 8.0
分辨率 1.95 Å R-free 0.187
5ISM Human DPP4 in complex with a novel 5,5,6-tricyclic pyrrolidine inhibitor 提交 2016-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
突变：S39T 突变：S39T NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NA SODIUM ION × 1 6DG (2R,3S,5R)-2-(2,5-difluorophenyl)-5-(7H-pyrrolo[3',4':3,4]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-8(9H)-yl)oxan-3-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；20-25% PEG4000, 200 mM sodium acetate, 100 mM Tris, pH 8.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.201
5J3J Crystal Structure of human DPP-IV in complex with HL1 提交 2016-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 40–766（727 aa）
链 B 40–766（727 aa）
未记录 HL1 (2~{S},3~{R})-8,9-dimethoxy-3-[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]-2,3-dihydro-1~{H}-benzo[f]chromen-2-amine × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；289 K；100mM Tris pH 8, 18% PEG 3350, 200mM NaCl
分辨率 2.75 Å R-free 0.298
5KBY Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with SYR-472 提交 2016-06-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 6RL 2-[[6-[(3~{R})-3-azanylpiperidin-1-yl]-3-methyl-2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]methyl]-4-fluoranyl-benzenecarboni trile × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；22.2% PEG MME 2000, 0.1M Bicine pH 8.5
分辨率 2.24 Å R-free 0.215
5KBY Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with SYR-472 提交 2016-06-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 6RL 2-[[6-[(3~{R})-3-azanylpiperidin-1-yl]-3-methyl-2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]methyl]-4-fluoranyl-benzenecarboni trile × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；22.2% PEG MME 2000, 0.1M Bicine pH 8.5
分辨率 2.24 Å R-free 0.215
5KBY Crystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with SYR-472 提交 2016-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 6RL 2-[[6-[(3~{R})-3-azanylpiperidin-1-yl]-3-methyl-2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]methyl]-4-fluoranyl-benzenecarboni trile × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；22.2% PEG MME 2000, 0.1M Bicine pH 8.5
分辨率 2.24 Å R-free 0.215
5T4B Human DPP4 in complex with a ligand 34a 提交 2016-08-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 40–766（727 aa）
链 B 40–766（727 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 75N 2-[(3R)-3-aminopiperidin-1-yl]-3-(but-2-yn-1-yl)-5-[(4-methylquinazolin-2-yl)methyl]-3H-imidazo[2,1-b]purin-4(5H)-one × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.27-0.30 M sodium acetate 17-18% polyethylene glycol 3350 0.1 M tris hydrochloride pH 8.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.186
5T4E Human DPP4 in complex with ligand 19a 提交 2016-08-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 40–766（727 aa）
链 B 40–766（727 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 75L 2-[(3R)-3-aminopiperidin-1-yl]-3-(but-2-yn-1-yl)-6-[(4-methylquinazolin-2-yl)methyl]-6,7,8,9-tetrahydropyrimido[2,1-b]purin-4(3H)-one × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.27-0.30 M sodium acetate 17-18% polyethylene glycol 3350 0.1 M tris hydrochloride pH 8.0
分辨率 1.77 Å R-free 0.182
5T4F Human DPP4 in complex with ligand 34p 提交 2016-08-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 40–766（727 aa）
链 B 40–766（727 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 75M 4-({2-[(3R)-3-aminopiperidin-1-yl]-3-(but-2-yn-1-yl)-4-oxo-3,4-dihydro-5H-imidazo[2,1-b]purin-5-yl}methyl)benzonitrile × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.27-0.30 M sodium acetate 17-18% polyethylene glycol 3350 0.1 M tris hydrochloride pH 8.0
分辨率 1.90 Å R-free 0.187
5T4H Human DPP4 in complex with ligand 34n 提交 2016-08-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 40–766（727 aa）
链 B 40–766（727 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 75J 2-({2-[(3R)-3-aminopiperidin-1-yl]-3-(but-2-yn-1-yl)-4-oxo-3,4-dihydro-5H-imidazo[2,1-b]purin-5-yl}methyl)benzonitrile × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.27-0.30 M sodium acetate 17-18% polyethylene glycol 3350 0.1 M tris hydrochloride pH 8.0
分辨率 2.61 Å R-free 0.226
5Y7H Crystal structure of human DPP4 in complex with inhibitor3 提交 2017-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 8O3 (R)-4-(3-amino-4-(2,4,5-trifluorophenyl)butanoyl)piperazin-2-one × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；20~28% (w/v) polyethylene glycol 4000, 0.1M HEPES or Tris pH 7.5~8.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.245
5Y7J Crystal structure of human DPP4 in complex with inhibitor2 提交 2017-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 8OL (S)-4-((R)-3-amino-4-(2,4,5-trifluorophenyl)butanoyl)-3-(tert-butoxymethyl)piperazin-2-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；20~28% (w/v) polyethylene glycol 4000, 0.1M HEPES or Tris pH 7.5~8.5
分辨率 2.52 Å R-free 0.241
5Y7J Crystal structure of human DPP4 in complex with inhibitor2 提交 2017-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 8OL (S)-4-((R)-3-amino-4-(2,4,5-trifluorophenyl)butanoyl)-3-(tert-butoxymethyl)piperazin-2-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；20~28% (w/v) polyethylene glycol 4000, 0.1M HEPES or Tris pH 7.5~8.5
分辨率 2.52 Å R-free 0.241
5Y7K Crystal structure of human DPP4 in complex with inhibitor1 提交 2017-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 8VU (R)-4-((R)-3-amino-4-(2,4,5-trifluorophenyl)butanoyl)-3-(tert-butoxymethyl)piperazine-2-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；20~28% (w/v) polyethylene glycol 4000, 0.1M HEPES or Tris pH 7.5~8.5
分辨率 2.51 Å R-free 0.241
5Y7K Crystal structure of human DPP4 in complex with inhibitor1 提交 2017-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–766（728 aa）
链 D 39–766（728 aa）
未记录 8VU (R)-4-((R)-3-amino-4-(2,4,5-trifluorophenyl)butanoyl)-3-(tert-butoxymethyl)piperazine-2-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；20~28% (w/v) polyethylene glycol 4000, 0.1M HEPES or Tris pH 7.5~8.5
分辨率 2.51 Å R-free 0.241
5ZID Crystal Structure of human DPP-IV in complex with HL2 提交 2018-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 40–766（727 aa） 片段：Dipeptidyl peptidase 4 soluble form
链 B 40–766（727 aa） 片段：Dipeptidyl peptidase 4 soluble form
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 9EL (2S,3R)-2-amino-9-methoxy-3-(2,4,5-trifluorophenyl)-2,3-dihydro-1H-naphtho[2,1-b]pyran-8-carbonitrile × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；100mM Tris pH 8, 18% PEG 3350, 200mM NaCl
分辨率 3.00 Å R-free 0.253
6B1E The structure of DPP4 in complex with Vildagliptin 提交 2017-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
突变：S39T 突变：S39T LF7 2-{[(1r,3s,5R,7S)-3-hydroxytricyclo[3.3.1.1~3,7~]decan-1-yl]amino}-1-{(2S)-2-[(E)-iminomethyl]pyrrolidin-1-yl}ethan-1-o ne × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 8.0
分辨率 1.77 Å R-free 0.186
6B1O The structure of DPP4 in complex with Vildagliptin Analog 提交 2017-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
突变：S39T 突变：S39T NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 C8S (2S)-2-amino-1-[(1S,3S,5S)-3-(aminomethyl)-2-azabicyclo[3.1.0]hexan-2-yl]-2-[(1r,3R,5S,7S)-3,5-dihydroxytricyclo[3.3.1.1~3,7~]decan-1-yl]ethan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 8.0
分辨率 1.91 Å R-free 0.202
8WKU Complex structure of MjHKU4r-CoV-1 spike RBD bound to human CD26 提交 2023-09-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M Amino acids, 0.1 M buffer system 3 (Tris base; Bicine) and 30% v/v EDO_P8K
分辨率 3.50 Å R-free 0.237
8Z4T MERS-CoV S ectodomain trimer in complex with receptor DPP4-750E 提交 2024-04-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 39–766（728 aa）
链 I 39–766（728 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å
8ZDX Crystal structure of MjHKU4r-CoV-1 RBD bound to hDPP4 提交 2024-05-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 38–766（729 aa）
链 C 38–766（729 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES (pH 7.0) and 10% (wt/vol) PEG 6000
分辨率 2.60 Å R-free 0.252
9CAR human kidney Dipeptidyl peptidase 4 提交 2024-06-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–766（766 aa）
链 B 1–766（766 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
9D56 Human kidney Dipeptidyl peptidase 4 with N-ter TM 提交 2024-08-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–766（766 aa）
链 B 1–766（766 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9GOH Crystal structure of DPP4 in complex with sulphostin. 提交 2024-09-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 A1INF azanyl-oxidanylidene-(sulfoamino)phosphanium × 2 SO4 SULFATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BICINE: 0.10 M pH:9.00 ; LiSO4: 0.16M ; PEG 2K MME: 24 %w/v
分辨率 2.38 Å R-free 0.285
9JMJ Cryo-EM structure of the GD-BatCoV (BtCoV/Ii/GD/2014-422) RBD in complex with human DPP4 提交 2024-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 C 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9JMM Cryo-EM structure of the SE-PangolinCoV (MjHKU4r-CoV-1) RBD in complex with human DPP4 提交 2024-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 C 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9K9N Cryo-EM structure of MjHKU4r-CoV-1 receptor-binding domain complexed with human CD26 提交 2024-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 39–766（728 aa）
链 B 39–766（728 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.61 Å
9LBT DPPIV-VAMP 提交 2025-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 41–765（725 aa）
链 B 41–765（725 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；0.25 M Ammonium acetate, 0.1 M Tris pH 8.5, 21% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 1.99 Å R-free 0.195
9V2L Complex structure of 2014-422 spike RBD bound to human DPP4 提交 2025-05-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 40–766（727 aa）
链 C 40–766（727 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9V2P Complex structure of GX2012 spike RBD bound to human DPP4 提交 2025-05-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 40–766（727 aa）
链 B 40–766（727 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å

共 113 个其他 PDB 条目、164 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DPP4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 13–740； UniProt 39–766 作者链 B； PDB构建体 13–740； UniProt 39–766 作者链 C； PDB构建体 13–740； UniProt 39–766 作者链 D； PDB构建体 13–740； UniProt 39–766

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 3g0c

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 3g0c
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3g0c
沉积日期 deposition_date2009-01-27
结构标题 titleCrystal structure of dipeptidyl peptidase IV in complex with a pyrimidinedione inhibitor 1
关键词 keywords;DPP4, pyrimidinone, pyrimidindione, Aminopeptidase, Cell membrane, Glycoprotein, Hydrolase, Membrane, Protease, Secreted, Serine protease, Signal-anchor, Transmembrane, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex ;; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier58.61 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron58.61 Å
零角强度 I(0) i01629480000.00
分子量 molecular_weight341850.0 kDa
排除体积 excluded_volume428060 ų
包络体积 envelope_volume618770 ų
水化壳体积 shell_volume91658 ų
包络直径 envelope_diameter187.9 Å
壳层 Rg shell_rg56.01 Å
包络 Rg envelope_rg57.41 Å
形状 Rg shape_rg58.62 Å
总 Rg total_rg58.51 Å
总原子数 total_atoms24159
残基数 n_residues2900
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax191.9 Å
Rg (实空间) rg_real58.55 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.08 Å
I(0) (实空间) i0_real1.6290e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.4110e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal58.61 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1630000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8781
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary85.3 Å
偏度 Skewness skewness0.124
峰度 Kurtosis kurtosis-0.845
角度范围 angular_range— – 0.1350 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha324000000.0000
实空间数据点数 n_real_points28
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.879; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.965; Smooth: 0.809
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 17 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

结构域编号 domain_idd3g0ca1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.70 — 8-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamilyb.70.3 — DPP6 N-terminal domain-like
家族 Family familyb.70.3.1 — DPP6 N-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd3g0ca2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.69 — alpha/beta-Hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.69.1 — alpha/beta-Hydrolases
家族 Family familyc.69.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3g0cb1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.70 — 8-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamilyb.70.3 — DPP6 N-terminal domain-like
家族 Family familyb.70.3.1 — DPP6 N-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd3g0cb2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.69 — alpha/beta-Hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.69.1 — alpha/beta-Hydrolases
家族 Family familyc.69.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3g0cb3
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd3g0cc1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.70 — 8-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamilyb.70.3 — DPP6 N-terminal domain-like
家族 Family familyb.70.3.1 — DPP6 N-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd3g0cc2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.69 — alpha/beta-Hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.69.1 — alpha/beta-Hydrolases
家族 Family familyc.69.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3g0cd1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.70 — 8-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamilyb.70.3 — DPP6 N-terminal domain-like
家族 Family familyb.70.3.1 — DPP6 N-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd3g0cd2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.69 — alpha/beta-Hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.69.1 — alpha/beta-Hydrolases
家族 Family familyc.69.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id3g0cA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture140 — 8 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methanol Dehydrogenase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Dipeptidylpeptidase IV, N-terminal domain
结构域编号 domain_id3g0cA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1820 — Alpha/Beta hydrolase fold, catalytic domain
结构域编号 domain_id3g0cB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture140 — 8 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methanol Dehydrogenase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Dipeptidylpeptidase IV, N-terminal domain
结构域编号 domain_id3g0cB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1820 — Alpha/Beta hydrolase fold, catalytic domain
结构域编号 domain_id3g0cC01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture140 — 8 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methanol Dehydrogenase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Dipeptidylpeptidase IV, N-terminal domain
结构域编号 domain_id3g0cC02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1820 — Alpha/Beta hydrolase fold, catalytic domain
结构域编号 domain_id3g0cD01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture140 — 8 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methanol Dehydrogenase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Dipeptidylpeptidase IV, N-terminal domain
结构域编号 domain_id3g0cD02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1820 — Alpha/Beta hydrolase fold, catalytic domain
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)