SAXSdb — 3iyb

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Genome polyprotein

Human poliovirus 1 Mahoney

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 300	Genome polyprotein × 60 （P03302） Precursor polyprotein × 60 （Q9E912） VP1 core × 60	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Genome polyprotein × 1 （P03302） Precursor polyprotein × 1 （Q9E912） VP1 core × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Genome polyprotein × 5 （P03302） Precursor polyprotein × 5 （Q9E912） VP1 core × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	Genome polyprotein × 6 （P03302） Precursor polyprotein × 6 （Q9E912） VP1 core × 6	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Genome polyprotein × 1 （P03302） Precursor polyprotein × 1 （Q9E912） VP1 core × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POLG_POL1M
Isoform	—
PDB实体	1, 4
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–235； UniProt 647–881 作者链 4； PDB构建体 1–245； UniProt 97–341

Genome polyprotein

Poliovirus type 3 (strains P3/LEON/37 AND P3/LEON 12A[1]B)

UniProt P03302

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 300	Genome polyprotein × 60 （P03300） Precursor polyprotein × 60 （Q9E912） Genome polyprotein × 60 （P03300） VP1 core × 60	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Genome polyprotein × 1 （P03300） Precursor polyprotein × 1 （Q9E912） Genome polyprotein × 1 （P03300） VP1 core × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Genome polyprotein × 5 （P03300） Precursor polyprotein × 5 （Q9E912） Genome polyprotein × 5 （P03300） VP1 core × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	Genome polyprotein × 6 （P03300） Precursor polyprotein × 6 （Q9E912） Genome polyprotein × 6 （P03300） VP1 core × 6	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Genome polyprotein × 1 （P03300） Precursor polyprotein × 1 （Q9E912） Genome polyprotein × 1 （P03300） VP1 core × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POLG_POL3L
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–14； UniProt 83–96

Precursor polyprotein

Human poliovirus 1

UniProt Q9E912

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 300	Genome polyprotein × 60 （P03300） Genome polyprotein × 60 （P03302） Genome polyprotein × 60 （P03300） VP1 core × 60	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Genome polyprotein × 1 （P03300） Genome polyprotein × 1 （P03302） Genome polyprotein × 1 （P03300） VP1 core × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Genome polyprotein × 5 （P03300） Genome polyprotein × 5 （P03302） Genome polyprotein × 5 （P03300） VP1 core × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	Genome polyprotein × 6 （P03300） Genome polyprotein × 6 （P03302） Genome polyprotein × 6 （P03300） VP1 core × 6	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Genome polyprotein × 1 （P03300） Genome polyprotein × 1 （P03302） Genome polyprotein × 1 （P03300） VP1 core × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9E912_9ENTO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 1–231； UniProt 342–572

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3iyb
沉积日期 deposition_date	2009-07-21
结构标题 title	Poliovirus early RNA-release intermediate
关键词 keywords	;Picornavirus, poliovirus, intermediate, RNA release, 80S, ATP-binding, Capsid protein, Covalent protein-RNA linkage, Cytoplasmic vesicle, Helicase, Host-virus interaction, Hydrolase, Lipoprotein, Membrane, Myristate, Nucleotide-binding, Nucleotidyltransferase, Phosphoprotein, Protease, RNA replication, RNA-binding, RNA-directed RNA polymerase, Thiol protease, Transferase, Virion, VIRAL PROTEIN ;; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3iyb__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3iyb__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3iyb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	140.50 Å
总 Rg	140.60 Å
原子数	0
残基数	0
排除体积	5979500 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3iyb__assembly_1__model_1`	300-meric （300）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3iyb__assembly_2__model_1`	pentameric （5）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3	1	`3iyb__assembly_3__model_1`	25-meric （25）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4	1	`3iyb__assembly_4__model_1`	30-meric （30）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5	1	`3iyb__assembly_5__model_1`	pentameric （5）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Genome polyprotein
分子量 formula_weight	26559.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.29, 3.6.1.15, 3.4.22.28, 2.7.7.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1
原子数 atom_count	723

QHRSRSESSIESFFARGACVTIMTVDNPASTTNKDKLFAVWKITYKDTVQLRRKLEFFTYSRFDMELTFVVTANFTETNNGHALNQVYQIMYVPPGAPVPEKWDDYTWQTSSNPSIFYTYGTAPARISVPYVGISNAYSHFYDGFSKVPLKDQSAALGDSLYGAASLNDFGILAVRVVNDHNPTKVTSKIRVYLKPKHIRVWCPRPPRAVAYYGPGVDYKDGTLTPLSTKDLTTY

来源 Source

来源生物 organism	Human poliovirus 1 Mahoney
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12081

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Genome polyprotein
分子量 formula_weight	1518.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.29, 3.6.1.15, 3.4.22.28, 2.7.7.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

LQLTLGNSTITTQE

来源 Source

来源生物 organism	Poliovirus type 3 (strains P3/LEON/37 AND P3/LEON 12A[1]B)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12088

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Precursor polyprotein
分子量 formula_weight	25777.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

GLPVMNTPGSNQYLTADNFQSPCALPEFDVTPPIDIPGEVKNMMELAEIDTMIPFDLSATKKNTMEMYRVRLSDKPHTDDPILCLSLSPASDPRLSHTMLGEILNYYTHWAGSLKFTFLFCGSMMATGKLLVSYAPPGADPPKKRKEAMLGTHVIWDIGLQSSCTMVVPWISNTTYRQTIDDSFTEGGYISVFYQTRIVVPLSTPREMDILGFVSACNDFSVRLLRDTTHI

来源 Source

来源生物 organism	Human poliovirus 1
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12080

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Genome polyprotein
分子量 formula_weight	27181.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.29, 3.6.1.15, 3.4.22.28, 2.7.7.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4

AANSVVAYGRWPEYLRDSEANPVDQPTEPDVAACRFYTLDTVSWTKESRGWWWKLPDALRDMGLFGQNMYYHYLGRSGYTVHVQCNASKFHQGALGVFAVPEMCLAGDSNTTTMHTSYQNANPGEKGGTFTGTFTPDNNQTSPARRFCPVDYLLGNGTLLGNAFVFPHQIINLRTNNCATLVLPYVNSLSIDSMVKHNNWGIAILPLAPLNFASESSPEIPITLTIAPMCCEFNGLRNITLPRLQ

来源 Source

来源生物 organism	Human poliovirus 1 Mahoney
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12081

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	VP1 core
分子量 formula_weight	954.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	7

XXXXXXXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	Human poliovirus 1
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12080

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	10.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	PFT
颗粒数 num_particles	—

Poliovirus early RNA-release intermediate

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Precursor polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3iyb__assembly_1__model_1

3iyb__assembly_1__model_1 | I(q)

3iyb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Poliovirus early RNA-release intermediate

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Precursor polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3iyb__assembly_1__model_1

3iyb__assembly_1__model_1 | I(q)

3iyb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)