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3j42

Obstruction of Dengue Virus Maturation by Fab Fragments of the 2H2 Antibody

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Envelope protein E

物种未注明

UniProt O11875

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 720 PrM × 180 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 180 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 180 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
2 信息不足 异源复合物 蛋白 12 PrM × 3 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
3 信息不足 异源复合物 蛋白 60 PrM × 15 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 15 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 15 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
4 信息不足 异源复合物 蛋白 72 PrM × 18 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 18 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 18 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
5 信息不足 异源复合物 蛋白 12 PrM × 3 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
3c6d 3c6d 3c6d 3c6d 3c6d 3ixy 3ixy 3ixy 3ixy 3ixy 3j42 3j42

共 16 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 O11875_9FLAV
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–390； UniProt 281–675 作者链 B； PDB构建体 1–390； UniProt 281–675 作者链 C； PDB构建体 1–390； UniProt 281–675

PrM

物种未注明

UniProt Q3BCY5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 720 Envelope protein E × 180 （O11875） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 180 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 180 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
2 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Envelope protein E × 3 （O11875） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
3 信息不足 异源复合物 蛋白 60 Envelope protein E × 15 （O11875） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 15 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 15 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
4 信息不足 异源复合物 蛋白 72 Envelope protein E × 18 （O11875） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 18 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 18 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
5 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Envelope protein E × 3 （O11875） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
3j42 3j42 3j42 3j42 3j42

共 5 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q3BCY5_9FLAV
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81 作者链 E； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81 作者链 F； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera

Mus musculus

UniProt P01783

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 720 Envelope protein E × 180 （O11875） PrM × 180 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 180 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
2 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
3 信息不足 异源复合物 蛋白 60 Envelope protein E × 15 （O11875） PrM × 15 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 15 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
4 信息不足 异源复合物 蛋白 72 Envelope protein E × 18 （O11875） PrM × 18 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 18 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
5 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1igc 3j42 3j42 3j42 3j42 3j42 4kvc

共 7 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HVM16_MOUSE
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–103； UniProt 17–119 作者链 I； PDB构建体 1–103； UniProt 17–119 作者链 K； PDB构建体 1–103； UniProt 17–119

Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera

Mus musculus

UniProt Q6PIP8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 720 Envelope protein E × 180 （O11875） PrM × 180 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 180 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
2 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
3 信息不足 异源复合物 蛋白 60 Envelope protein E × 15 （O11875） PrM × 15 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 15 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
4 信息不足 异源复合物 蛋白 72 Envelope protein E × 18 （O11875） PrM × 18 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 18 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致
5 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2ai0 2ai0 2ai0 2ai0 2ai0 2ai0 2ai0 2ai0 2ai0 2ai0 2ai0 2ai0

共 19 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6PIP8_MOUSE
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 106–216； UniProt 120–230 作者链 I； PDB构建体 106–216； UniProt 120–230 作者链 K； PDB构建体 106–216； UniProt 120–230

Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera

Mus musculus

UniProt P01634

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 720 Envelope protein E × 180 （O11875） PrM × 180 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 180 （P01783,Q6PIP8） 与蛋白数一致
2 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） 与蛋白数一致
3 信息不足 异源复合物 蛋白 60 Envelope protein E × 15 （O11875） PrM × 15 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 15 （P01783,Q6PIP8） 与蛋白数一致
4 信息不足 异源复合物 蛋白 72 Envelope protein E × 18 （O11875） PrM × 18 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 18 （P01783,Q6PIP8） 与蛋白数一致
5 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1igc 3j42 3j42 3j42 3j42 3j42 4kvc

共 7 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KV5A2_MOUSE
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–107； UniProt 30–136 作者链 J； PDB构建体 1–107； UniProt 30–136 作者链 L； PDB构建体 1–107； UniProt 30–136

Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera

Mus musculus

UniProt Q7TS98

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 720 Envelope protein E × 180 （O11875） PrM × 180 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 180 （P01783,Q6PIP8） 与蛋白数一致
2 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） 与蛋白数一致
3 信息不足 异源复合物 蛋白 60 Envelope protein E × 15 （O11875） PrM × 15 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 15 （P01783,Q6PIP8） 与蛋白数一致
4 信息不足 异源复合物 蛋白 72 Envelope protein E × 18 （O11875） PrM × 18 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 18 （P01783,Q6PIP8） 与蛋白数一致
5 信息不足 异源复合物 蛋白 12 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1d5b 1d5b 1d5b 1d5i 1d6v 3j42 3j42 3j42 3j42 3j42 4kvc 5tr8

共 13 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q7TS98_MOUSE
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 108–212； UniProt 130–234 作者链 J； PDB构建体 108–212； UniProt 130–234 作者链 L； PDB构建体 108–212； UniProt 130–234

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3j42
沉积日期 deposition_date2013-06-13
结构标题 titleObstruction of Dengue Virus Maturation by Fab Fragments of the 2H2 Antibody
关键词 keywordsDengue, maturation, immature, antibody, VIRUS-IMMUNE SYSTEM complex; VIRUS/IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3j42__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3j42__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 1012 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3j42__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）0.00 Å
Rg（电子密度）263.60 Å
总 Rg207.00 Å
原子数588780
残基数77040
排除体积21926000 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3j42__assembly_1__model_1 720-meric （720） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3j42__assembly_2__model_1 dodecameric （12） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 3j42__assembly_3__model_1 60-meric （60） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 3j42__assembly_4__model_1 72-meric （72） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 3j42__assembly_5__model_1 dodecameric （12） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 引用文献 (1)