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3j42

Obstruction of Dengue Virus Maturation by Fab Fragments of the 2H2 Antibody

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 221.1 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Envelope protein E

物种未注明

UniProt O11875

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 720 PDB 声明：720-meric（720） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 281–675 链 B； UniProt 281–675 链 C； UniProt 281–675 片段：UNP residues 281-675 PrM × 180 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 180 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 180 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
2 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 281–675 链 B； UniProt 281–675 链 C； UniProt 281–675 片段：UNP residues 281-675 PrM × 3 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
3 信息不足 异源复合物 蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 281–675 链 B； UniProt 281–675 链 C； UniProt 281–675 片段：UNP residues 281-675 PrM × 15 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 15 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 15 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
4 信息不足 异源复合物 蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric（72） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 281–675 链 B； UniProt 281–675 链 C； UniProt 281–675 片段：UNP residues 281-675 PrM × 18 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 18 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 18 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
5 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 281–675 链 B； UniProt 281–675 链 C； UniProt 281–675 片段：UNP residues 281-675 PrM × 3 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J42 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3C6D The pseudo-atomic structure of dengue immature virus 提交 2008-02-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric
链 A 281–675（395 aa）
链 B 281–675（395 aa）
链 C 281–675（395 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；12 mM Tris-HCl, 120 mM NaCl, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.50 Å
3C6D The pseudo-atomic structure of dengue immature virus 提交 2008-02-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 281–675（395 aa）
链 B 281–675（395 aa）
链 C 281–675（395 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；12 mM Tris-HCl, 120 mM NaCl, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.50 Å
3C6D The pseudo-atomic structure of dengue immature virus 提交 2008-02-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 A 281–675（395 aa）
链 B 281–675（395 aa）
链 C 281–675（395 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；12 mM Tris-HCl, 120 mM NaCl, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.50 Å
3C6D The pseudo-atomic structure of dengue immature virus 提交 2008-02-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 A 281–675（395 aa）
链 B 281–675（395 aa）
链 C 281–675（395 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；12 mM Tris-HCl, 120 mM NaCl, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.50 Å
3C6D The pseudo-atomic structure of dengue immature virus 提交 2008-02-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 281–675（395 aa）
链 B 281–675（395 aa）
链 C 281–675（395 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；12 mM Tris-HCl, 120 mM NaCl, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.50 Å
3IXY The pseudo-atomic structure of dengue immature virus in complex with Fab fragments of the anti-fusion loop antibody E53 提交 2009-02-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 600 PDB 声明：600-MERIC
链 A 281–675（395 aa）
链 B 281–675（395 aa）
链 C 281–675（395 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；12 mM Tris-HCl, 120 mM NaCl, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 A small vial of ethane is placed inside a larger liquid nitrogen reservoir. The grid holding a few microliters of the sample is held in place at the bottom of a plunger by the means of fine tweezers. Once the ethane in the vial is completely frozen, it needs to be slightly melted. When the liquid ethane is ready, a piece of filter paper is then pressed against the sample to blot of excess buffer, sufficient to leave a thin layer on the grid. After a predetermined time, the filter paper is removed, and the plunger is allowed to drop into the liquid ethane. Once the grid enters the liquid ethane, the sample is rapidly frozen, and the grid is transferred under liquid nitrogen to a storage box immersed liquid nitrogen for later use in the microscope.；冷冻剂 ETHANE
分辨率 23.00 Å
3IXY The pseudo-atomic structure of dengue immature virus in complex with Fab fragments of the anti-fusion loop antibody E53 提交 2009-02-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 281–675（395 aa）
链 B 281–675（395 aa）
链 C 281–675（395 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；12 mM Tris-HCl, 120 mM NaCl, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 A small vial of ethane is placed inside a larger liquid nitrogen reservoir. The grid holding a few microliters of the sample is held in place at the bottom of a plunger by the means of fine tweezers. Once the ethane in the vial is completely frozen, it needs to be slightly melted. When the liquid ethane is ready, a piece of filter paper is then pressed against the sample to blot of excess buffer, sufficient to leave a thin layer on the grid. After a predetermined time, the filter paper is removed, and the plunger is allowed to drop into the liquid ethane. Once the grid enters the liquid ethane, the sample is rapidly frozen, and the grid is transferred under liquid nitrogen to a storage box immersed liquid nitrogen for later use in the microscope.；冷冻剂 ETHANE
分辨率 23.00 Å
3IXY The pseudo-atomic structure of dengue immature virus in complex with Fab fragments of the anti-fusion loop antibody E53 提交 2009-02-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：50-meric
链 A 281–675（395 aa）
链 B 281–675（395 aa）
链 C 281–675（395 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；12 mM Tris-HCl, 120 mM NaCl, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 A small vial of ethane is placed inside a larger liquid nitrogen reservoir. The grid holding a few microliters of the sample is held in place at the bottom of a plunger by the means of fine tweezers. Once the ethane in the vial is completely frozen, it needs to be slightly melted. When the liquid ethane is ready, a piece of filter paper is then pressed against the sample to blot of excess buffer, sufficient to leave a thin layer on the grid. After a predetermined time, the filter paper is removed, and the plunger is allowed to drop into the liquid ethane. Once the grid enters the liquid ethane, the sample is rapidly frozen, and the grid is transferred under liquid nitrogen to a storage box immersed liquid nitrogen for later use in the microscope.；冷冻剂 ETHANE
分辨率 23.00 Å
3IXY The pseudo-atomic structure of dengue immature virus in complex with Fab fragments of the anti-fusion loop antibody E53 提交 2009-02-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric
链 A 281–675（395 aa）
链 B 281–675（395 aa）
链 C 281–675（395 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；12 mM Tris-HCl, 120 mM NaCl, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 A small vial of ethane is placed inside a larger liquid nitrogen reservoir. The grid holding a few microliters of the sample is held in place at the bottom of a plunger by the means of fine tweezers. Once the ethane in the vial is completely frozen, it needs to be slightly melted. When the liquid ethane is ready, a piece of filter paper is then pressed against the sample to blot of excess buffer, sufficient to leave a thin layer on the grid. After a predetermined time, the filter paper is removed, and the plunger is allowed to drop into the liquid ethane. Once the grid enters the liquid ethane, the sample is rapidly frozen, and the grid is transferred under liquid nitrogen to a storage box immersed liquid nitrogen for later use in the microscope.；冷冻剂 ETHANE
分辨率 23.00 Å
3IXY The pseudo-atomic structure of dengue immature virus in complex with Fab fragments of the anti-fusion loop antibody E53 提交 2009-02-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 281–675（395 aa）
链 B 281–675（395 aa）
链 C 281–675（395 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；12 mM Tris-HCl, 120 mM NaCl, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 A small vial of ethane is placed inside a larger liquid nitrogen reservoir. The grid holding a few microliters of the sample is held in place at the bottom of a plunger by the means of fine tweezers. Once the ethane in the vial is completely frozen, it needs to be slightly melted. When the liquid ethane is ready, a piece of filter paper is then pressed against the sample to blot of excess buffer, sufficient to leave a thin layer on the grid. After a predetermined time, the filter paper is removed, and the plunger is allowed to drop into the liquid ethane. Once the grid enters the liquid ethane, the sample is rapidly frozen, and the grid is transferred under liquid nitrogen to a storage box immersed liquid nitrogen for later use in the microscope.；冷冻剂 ETHANE
分辨率 23.00 Å
6ZQU Cryo-EM structure of mature Dengue virus 2 at 3.1 angstrom resolution 提交 2020-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric
链 B 206–280（75 aa）
链 D 206–280（75 aa）
链 F 206–280（75 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 360 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å

共 3 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 O11875_9FLAV
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–390； UniProt 281–675 作者链 B； PDB构建体 1–390； UniProt 281–675 作者链 C； PDB构建体 1–390； UniProt 281–675

PrM

物种未注明

UniProt Q3BCY5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 720 PDB 声明：720-meric（720） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–81 链 E； UniProt 1–81 链 F； UniProt 1–81 片段：UNP residues 1-81 Envelope protein E × 180 （O11875） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 180 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 180 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
2 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–81 链 E； UniProt 1–81 链 F； UniProt 1–81 片段：UNP residues 1-81 Envelope protein E × 3 （O11875） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
3 信息不足 异源复合物 蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–81 链 E； UniProt 1–81 链 F； UniProt 1–81 片段：UNP residues 1-81 Envelope protein E × 15 （O11875） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 15 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 15 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
4 信息不足 异源复合物 蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric（72） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–81 链 E； UniProt 1–81 链 F； UniProt 1–81 片段：UNP residues 1-81 Envelope protein E × 18 （O11875） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 18 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 18 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
5 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–81 链 E； UniProt 1–81 链 F； UniProt 1–81 片段：UNP residues 1-81 Envelope protein E × 3 （O11875） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q3BCY5_9FLAV
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81 作者链 E； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81 作者链 F； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera

Mus musculus

UniProt P01783

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 720 PDB 声明：720-meric（720） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 17–119 链 I； UniProt 17–119 链 K； UniProt 17–119 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 180 （O11875） PrM × 180 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 180 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
2 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 17–119 链 I； UniProt 17–119 链 K； UniProt 17–119 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
3 信息不足 异源复合物 蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 17–119 链 I； UniProt 17–119 链 K； UniProt 17–119 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 15 （O11875） PrM × 15 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 15 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
4 信息不足 异源复合物 蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric（72） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 17–119 链 I； UniProt 17–119 链 K； UniProt 17–119 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 18 （O11875） PrM × 18 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 18 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
5 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 17–119 链 I； UniProt 17–119 链 K； UniProt 17–119 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J42 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1IGC IGG1 FAB FRAGMENT (MOPC21) COMPLEX WITH DOMAIN III OF PROTEIN G FROM STREPTOCOCCUS 提交 1994-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–136（120 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å
4KVC 2H2 Fab fragment of immature Dengue virus 提交 2013-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 17–119（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；25% PEG 6000 0.1 M MES 0.2M NH4Cl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.31 Å R-free 0.234

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HVM16_MOUSE
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–103； UniProt 17–119 作者链 I； PDB构建体 1–103； UniProt 17–119 作者链 K； PDB构建体 1–103； UniProt 17–119

Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera

Mus musculus

UniProt Q6PIP8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 720 PDB 声明：720-meric（720） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 120–230 链 I； UniProt 120–230 链 K； UniProt 120–230 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 180 （O11875） PrM × 180 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 180 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
2 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 120–230 链 I； UniProt 120–230 链 K； UniProt 120–230 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
3 信息不足 异源复合物 蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 120–230 链 I； UniProt 120–230 链 K； UniProt 120–230 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 15 （O11875） PrM × 15 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 15 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
4 信息不足 异源复合物 蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric（72） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 120–230 链 I； UniProt 120–230 链 K； UniProt 120–230 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 18 （O11875） PrM × 18 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 18 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
5 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 120–230 链 I； UniProt 120–230 链 K； UniProt 120–230 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera × 3 （P01634,Q7TS98） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J42 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2AI0 Anti-Cocaine Antibody 7.5.21, Crystal Form III 提交 2005-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 21–234（214 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 7 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG8000, 0.3M ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.279
2AI0 Anti-Cocaine Antibody 7.5.21, Crystal Form III 提交 2005-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 21–234（214 aa）
链 J 21–234（214 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 12 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG8000, 0.3M ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.279
2AI0 Anti-Cocaine Antibody 7.5.21, Crystal Form III 提交 2005-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 21–234（214 aa）
链 K 21–234（214 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 12 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG8000, 0.3M ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.279
2AI0 Anti-Cocaine Antibody 7.5.21, Crystal Form III 提交 2005-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 21–234（214 aa）
链 I 21–234（214 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 15 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG8000, 0.3M ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.279
2AI0 Anti-Cocaine Antibody 7.5.21, Crystal Form III 提交 2005-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 21–234（214 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 8 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG8000, 0.3M ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.279
2AI0 Anti-Cocaine Antibody 7.5.21, Crystal Form III 提交 2005-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 21–234（214 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG8000, 0.3M ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.279
2AI0 Anti-Cocaine Antibody 7.5.21, Crystal Form III 提交 2005-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 21–234（214 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG8000, 0.3M ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.279
2AI0 Anti-Cocaine Antibody 7.5.21, Crystal Form III 提交 2005-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 21–234（214 aa）
链 I 21–234（214 aa）
链 J 21–234（214 aa）
链 K 21–234（214 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 27 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG8000, 0.3M ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.279
2AI0 Anti-Cocaine Antibody 7.5.21, Crystal Form III 提交 2005-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 21–234（214 aa）
链 I 21–234（214 aa）
链 J 21–234（214 aa）
链 K 21–234（214 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 27 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG8000, 0.3M ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.279
2AI0 Anti-Cocaine Antibody 7.5.21, Crystal Form III 提交 2005-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 21–234（214 aa）
链 I 21–234（214 aa）
链 J 21–234（214 aa）
链 K 21–234（214 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 27 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG8000, 0.3M ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.279
2AI0 Anti-Cocaine Antibody 7.5.21, Crystal Form III 提交 2005-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 21–234（214 aa）
链 I 21–234（214 aa）
链 J 21–234（214 aa）
链 K 21–234（214 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 27 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG8000, 0.3M ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.279
2AI0 Anti-Cocaine Antibody 7.5.21, Crystal Form III 提交 2005-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 21–234（214 aa）
链 K 21–234（214 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 15 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG8000, 0.3M ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.279
2IPT PFA1 Fab Fragment 提交 2006-10-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 123–234（112 aa）
未记录 ACM ACETAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；0.1 M Hepes, 25% PEG3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
分辨率 2.00 Å R-free 0.223
4KVC 2H2 Fab fragment of immature Dengue virus 提交 2013-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 120–230（111 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；25% PEG 6000 0.1 M MES 0.2M NH4Cl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.31 Å R-free 0.234

共 3 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6PIP8_MOUSE
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 106–216； UniProt 120–230 作者链 I； PDB构建体 106–216； UniProt 120–230 作者链 K； PDB构建体 106–216； UniProt 120–230

Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera

Mus musculus

UniProt P01634

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 720 PDB 声明：720-meric（720） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 30–136 链 J； UniProt 30–136 链 L； UniProt 30–136 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 180 （O11875） PrM × 180 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 180 （P01783,Q6PIP8） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
2 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 30–136 链 J； UniProt 30–136 链 L； UniProt 30–136 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
3 信息不足 异源复合物 蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 30–136 链 J； UniProt 30–136 链 L； UniProt 30–136 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 15 （O11875） PrM × 15 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 15 （P01783,Q6PIP8） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
4 信息不足 异源复合物 蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric（72） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 30–136 链 J； UniProt 30–136 链 L； UniProt 30–136 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 18 （O11875） PrM × 18 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 18 （P01783,Q6PIP8） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
5 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 30–136 链 J； UniProt 30–136 链 L； UniProt 30–136 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J42 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1IGC IGG1 FAB FRAGMENT (MOPC21) COMPLEX WITH DOMAIN III OF PROTEIN G FROM STREPTOCOCCUS 提交 1994-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 30–136（107 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å
4KVC 2H2 Fab fragment of immature Dengue virus 提交 2013-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 30–136（107 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；25% PEG 6000 0.1 M MES 0.2M NH4Cl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.31 Å R-free 0.234

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KV5A2_MOUSE
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–107； UniProt 30–136 作者链 J； PDB构建体 1–107； UniProt 30–136 作者链 L； PDB构建体 1–107； UniProt 30–136

Ig kappa chain V-V region MOPC 21, Anti-colorectal carcinoma light chain chimera

Mus musculus

UniProt Q7TS98

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 720 PDB 声明：720-meric（720） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 130–234 链 J； UniProt 130–234 链 L； UniProt 130–234 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 180 （O11875） PrM × 180 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 180 （P01783,Q6PIP8） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
2 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 130–234 链 J； UniProt 130–234 链 L； UniProt 130–234 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
3 信息不足 异源复合物 蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 130–234 链 J； UniProt 130–234 链 L； UniProt 130–234 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 15 （O11875） PrM × 15 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 15 （P01783,Q6PIP8） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
4 信息不足 异源复合物 蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric（72） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 130–234 链 J； UniProt 130–234 链 L； UniProt 130–234 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 18 （O11875） PrM × 18 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 18 （P01783,Q6PIP8） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å
5 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 130–234 链 J； UniProt 130–234 链 L； UniProt 130–234 片段：SEE REMARK 999 Envelope protein E × 3 （O11875） PrM × 3 （Q3BCY5） Ig heavy chain V region MOPC 21, Igh protein chimera × 3 （P01783,Q6PIP8） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：100 mM phosphate buffer；pH 7；100 mM phosphate buffer cryo-EM玻璃化条件：100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (homemade plunger) 分辨率 21.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J42 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1D5B UNLIGANDED MATURE OXY-COPE CATALYTIC ANTIBODY 提交 1999-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–129（107 aa） 片段：chimeric fab fragment (UNP Q7TS98 reisues 23-129, P01834 residues 1-104)
链 L 23–129（107 aa） 片段：chimeric fab fragment (UNP Q7TS98 reisues 23-129, P01834 residues 1-104)
未记录 CD CADMIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；25%PEG 1000, 100mM sodium acetate, 300mM CdCl2, 100mM ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.285
1D5B UNLIGANDED MATURE OXY-COPE CATALYTIC ANTIBODY 提交 1999-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 23–129（107 aa） 片段：chimeric fab fragment (UNP Q7TS98 reisues 23-129, P01834 residues 1-104)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；25%PEG 1000, 100mM sodium acetate, 300mM CdCl2, 100mM ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.285
1D5B UNLIGANDED MATURE OXY-COPE CATALYTIC ANTIBODY 提交 1999-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–129（107 aa） 片段：chimeric fab fragment (UNP Q7TS98 reisues 23-129, P01834 residues 1-104)
未记录 CD CADMIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；25%PEG 1000, 100mM sodium acetate, 300mM CdCl2, 100mM ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.285
1D5I UNLIGANDED GERMLINE PRECURSOR OF AN OXY-COPE CATALYTIC ANTIBODY 提交 1999-10-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 23–129（107 aa） 片段：chimeric fab fragment (UNP Q7TS98 reisues 23-129, P01834 residues 1-104)
未记录 CD CADMIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；75mM Hepes pH 7.0 9% PEG 4000 150 mM Ammonium Sulfate 20% 1,4 butanediol 100 mM Cadmium Chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.263
1D6V CONFORMATION EFFECTS IN BIOLOGICAL CATALYSIS INTRODUCED BY OXY-COPE ANTIBODY MATURATION 提交 1999-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 23–129（107 aa） 片段：chimeric fab fragment (UNP Q7TS98 reisues 23-129, P01834 residues 1-104)
未记录 CD CADMIUM ION × 4 HOP (1S,2S,5S)2-(4-GLUTARIDYLBENZYL)-5-PHENYL-1-CYCLOHEXANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；9% polyethylene glycol 4000 250mM ammonium sulfate 80mM Cadmium Chloride 75mM Hepes 20% 1,4 butanediol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 19K
分辨率 2.00 Å R-free 0.264
4KVC 2H2 Fab fragment of immature Dengue virus 提交 2013-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 130–234（105 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；25% PEG 6000 0.1 M MES 0.2M NH4Cl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.31 Å R-free 0.234
5TR8 Crystal structure of vaccine-elicited pan- influenza H1N1 neutralizing murine antibody 441D6. 提交 2016-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 132–234（103 aa）
未记录 NI NICKEL (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；273 K；12% PEG3350, 100 mM HEPES pH 7.5, 5 mM MgCl2, 5mM NiCl2
分辨率 2.01 Å R-free 0.198
5VPL CRYSTAL STRUCTURE OF DER F 1 COMPLEXED WITH FAB 4C1 提交 2017-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 24–235（212 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.1M HEPES, 18% W/V PEG12K, PH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.194

共 6 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q7TS98_MOUSE
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 108–212； UniProt 130–234 作者链 J； PDB构建体 108–212； UniProt 130–234 作者链 L； PDB构建体 108–212； UniProt 130–234

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 3j42

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 3j42
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3j42
沉积日期 deposition_date2013-06-13
结构标题 titleObstruction of Dengue Virus Maturation by Fab Fragments of the 2H2 Antibody
关键词 keywordsDengue, maturation, immature, antibody, VIRUS-IMMUNE SYSTEM complex; VIRUS/IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier62.73 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron71.39 Å
零角强度 I(0) i01321070000.00
分子量 molecular_weight297300.0 kDa
排除体积 excluded_volume365440 ų
包络体积 envelope_volume537970 ų
水化壳体积 shell_volume79573 ų
包络直径 envelope_diameter205.8 Å
壳层 Rg shell_rg53.50 Å
包络 Rg envelope_rg66.95 Å
形状 Rg shape_rg49.56 Å
总 Rg total_rg96.07 Å
总原子数 total_atoms9813
残基数 n_residues1284
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax221.1 Å
Rg (实空间) rg_real62.91 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.16 Å
I(0) (实空间) i0_real1.3210e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.8190e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal62.56 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1320000000.0000
解质量估计 total_estimate0.6518
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary70.7 Å
偏度 Skewness skewness0.278
峰度 Kurtosis kurtosis-0.547
角度范围 angular_range— – 0.1250 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0087
最高正则化参数 α highest_alpha43990000.0000
实空间数据点数 n_real_points26
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.874; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.848
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)