3kbt

Crystal structure of the ankyrin binding domain of human erythroid beta spectrin (repeats 13-15) in complex with the spectrin binding domain of human erythroid ankyrin (ZU5-ANK)

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Spectrin beta chain, erythrocyte

Homo sapiens

UniProt P11277

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Ankyrin-1 × 1 (P16157) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Ankyrin-1 × 1 (P16157) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SPTB1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–326; UniProt 1583–1906 作者链 B; PDB构建体 3–326; UniProt 1583–1906

Ankyrin-1

Homo sapiens

UniProt P16157

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Spectrin beta chain, erythrocyte × 1 (P11277) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Spectrin beta chain, erythrocyte × 1 (P11277) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ANK1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 4–161; UniProt 911–1068 作者链 D; PDB构建体 4–161; UniProt 911–1068

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3kbt
沉积日期 deposition_date2009-10-20
结构标题 titleCrystal structure of the ankyrin binding domain of human erythroid beta spectrin (repeats 13-15) in complex with the spectrin binding domain of human erythroid ankyrin (ZU5-ANK)
关键词 keywords;complex, spectrin, spectrin repeat, three helix bundle, ankyrin binding, disease mutation, structural protein, ankyrin, ZU5, beta sandwich, spectrin binding, cytoskeleton, membrane skeleton, Actin capping, Actin-binding, Elliptocytosis, Hereditary hemolytic anemia, Phosphoprotein, Alternative promoter usage, ANK repeat, Lipoprotein, Membrane, Sarcoplasmic reticulum ;; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3kbt__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3kbt__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3kbt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)35.93 Å
Rg(电子密度)36.51 Å
总 Rg36.17 Å
原子数3483
残基数435
排除体积61563 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3kbt__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3kbt__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3kbtA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 —
结构域编号 domain_id3kbtB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 —
结构域编号 domain_id3kbtC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology220 — Chondroitinase Ac; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
结构域编号 domain_id3kbtD00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology220 — Chondroitinase Ac; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
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7. 引用文献 (1)