SAXSdb — 3kdf

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Replication protein A 14 kDa subunit

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–121 链 C； UniProt 1–121	突变：M1S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Replication protein A 32 kDa subunit × 2 （P15927） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；11% PEG 8000, 50 mM BisTris-propane pH 7.0, 50 mM NaCl, 5 mM HEPES pH 7.0, 0.3 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.98 Å R-free 0.206
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–121	突变：M1S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；11% PEG 8000, 50 mM BisTris-propane pH 7.0, 50 mM NaCl, 5 mM HEPES pH 7.0, 0.3 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.98 Å R-free 0.206
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–121	突变：M1S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；11% PEG 8000, 50 mM BisTris-propane pH 7.0, 50 mM NaCl, 5 mM HEPES pH 7.0, 0.3 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.98 Å R-free 0.206

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3KDF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1L1O Structure of the human Replication Protein A (RPA) trimerization core 提交 2002-02-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–121（121 aa）片段：RPA14 链 D 1–121（121 aa）片段：RPA14	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；300 K；0.1 M Hepes, 9% glycerol, and 1.6 M ammonium sulfate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1QUQ COMPLEX OF REPLICATION PROTEIN A SUBUNITS RPA14 AND RPA32 提交 1999-07-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–121（121 aa）片段：RPA14 链 D 1–121（121 aa）片段：RPA14	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES, 0.75 M AMMONIUM SULPHATE, 20% PEG 8K, 10 MM DTT., pH 6.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.291
1QUQ COMPLEX OF REPLICATION PROTEIN A SUBUNITS RPA14 AND RPA32 提交 1999-07-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–121（121 aa）片段：RPA14	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES, 0.75 M AMMONIUM SULPHATE, 20% PEG 8K, 10 MM DTT., pH 6.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.291
1QUQ COMPLEX OF REPLICATION PROTEIN A SUBUNITS RPA14 AND RPA32 提交 1999-07-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–121（121 aa）片段：RPA14	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES, 0.75 M AMMONIUM SULPHATE, 20% PEG 8K, 10 MM DTT., pH 6.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.291
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–121（121 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–121（121 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–121（121 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–121（121 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PQA Crystal Structure of Full-length Human RPA 14/32 Heterodimer 提交 2007-05-01	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–121（121 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Bicine pH 9, 20% saturated ammonium sulfate, 10% acetonitrile, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 9.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.280
2PQA Crystal Structure of Full-length Human RPA 14/32 Heterodimer 提交 2007-05-01	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–121（121 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Bicine pH 9, 20% saturated ammonium sulfate, 10% acetonitrile, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 9.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.280
2Z6K Crystal structure of full-length human RPA14/32 heterodimer 提交 2007-08-03	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–121（121 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.9；293 K；0.95M KNa tartrate, 0.1M MES, 10mM DTT, pH 5.9, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.269
2Z6K Crystal structure of full-length human RPA14/32 heterodimer 提交 2007-08-03	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–121（121 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.9；293 K；0.95M KNa tartrate, 0.1M MES, 10mM DTT, pH 5.9, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.269
8RK2 Human Replication protein A (RPA; trimeric core) - ssDNA complex 提交 2023-12-22	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–121（121 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9MJ5 Catalytic domain of human DNA polymerase alpha in complex with DNA and RPA 提交 2024-12-13	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 A 1–121（121 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 P 1–121（121 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9PD4 NER dual incision complex - DuIM 提交 2025-06-30	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 P 1–121（121 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 9 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RFA3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–121； UniProt 1–121 作者链 C； PDB构建体 1–121； UniProt 1–121

Replication protein A 32 kDa subunit

Homo sapiens

UniProt P15927

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 41–172 链 D； UniProt 41–172	片段：Residues 41-172 突变：A41S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Replication protein A 14 kDa subunit × 2 （P35244） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；11% PEG 8000, 50 mM BisTris-propane pH 7.0, 50 mM NaCl, 5 mM HEPES pH 7.0, 0.3 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.98 Å R-free 0.206
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 41–172	片段：Residues 41-172 突变：A41S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；11% PEG 8000, 50 mM BisTris-propane pH 7.0, 50 mM NaCl, 5 mM HEPES pH 7.0, 0.3 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.98 Å R-free 0.206
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 41–172	片段：Residues 41-172 突变：A41S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；11% PEG 8000, 50 mM BisTris-propane pH 7.0, 50 mM NaCl, 5 mM HEPES pH 7.0, 0.3 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.98 Å R-free 0.206

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3KDF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1DPU SOLUTION STRUCTURE OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF HUMAN RPA32 COMPLEXED WITH UNG2(73-88) 提交 1999-12-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 202–270（69 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN (RESIDUES 172-270)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM PHOSPHATE, 50mM NACL；压力 AMBIENT NMR样品组成 1MM RPA32(172-270) U- 15N,13C; 1.2 MM UNG2(73- 88) NA; 25MM PHOSPHATE BUFFER NA; 50MM NACL; 5 MM DTT NA	分辨率未提供
1L1O Structure of the human Replication Protein A (RPA) trimerization core 提交 2002-02-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 44–171（128 aa）片段：RPA32 central domain (residues 44-171) 链 E 44–171（128 aa）片段：RPA32 central domain (residues 44-171)	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；300 K；0.1 M Hepes, 9% glycerol, and 1.6 M ammonium sulfate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1QUQ COMPLEX OF REPLICATION PROTEIN A SUBUNITS RPA14 AND RPA32 提交 1999-07-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 43–171（129 aa）片段：CENTRAL DOMAIN, RESIDUES 43-171 链 C 43–171（129 aa）片段：CENTRAL DOMAIN, RESIDUES 43-171	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES, 0.75 M AMMONIUM SULPHATE, 20% PEG 8K, 10 MM DTT., pH 6.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.291
1QUQ COMPLEX OF REPLICATION PROTEIN A SUBUNITS RPA14 AND RPA32 提交 1999-07-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 43–171（129 aa）片段：CENTRAL DOMAIN, RESIDUES 43-171	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES, 0.75 M AMMONIUM SULPHATE, 20% PEG 8K, 10 MM DTT., pH 6.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.291
1QUQ COMPLEX OF REPLICATION PROTEIN A SUBUNITS RPA14 AND RPA32 提交 1999-07-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 43–171（129 aa）片段：CENTRAL DOMAIN, RESIDUES 43-171	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES, 0.75 M AMMONIUM SULPHATE, 20% PEG 8K, 10 MM DTT., pH 6.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.291
1Z1D Structural Model for the interaction between RPA32 C-terminal domain and SV40 T antigen origin binding domain. 提交 2005-03-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 172–270（99 aa）片段：RPA32 C-terminal domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.03 M；压力 ambient NMR样品组成 0.2mM RPA32C U-15N, 0.6mM Tag-OBD, 20mM Tris buffer pH 7.0, 2 mM DTT, 5mM MgCl2, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.2mM Tag-OBD U-15N, 0.6mM RPA32C, 20mM Tris buffer pH 7.0, 2mM DTT, 5mM MgCl2, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–270（270 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–270（270 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–270（270 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–270（270 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PQA Crystal Structure of Full-length Human RPA 14/32 Heterodimer 提交 2007-05-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 42–172（131 aa）片段：UNP residues 42-172	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Bicine pH 9, 20% saturated ammonium sulfate, 10% acetonitrile, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 9.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.280
2PQA Crystal Structure of Full-length Human RPA 14/32 Heterodimer 提交 2007-05-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 42–172（131 aa）片段：UNP residues 42-172	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Bicine pH 9, 20% saturated ammonium sulfate, 10% acetonitrile, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 9.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.280
2Z6K Crystal structure of full-length human RPA14/32 heterodimer 提交 2007-08-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–270（270 aa）片段：residues 42-175	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.9；293 K；0.95M KNa tartrate, 0.1M MES, 10mM DTT, pH 5.9, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.269
2Z6K Crystal structure of full-length human RPA14/32 heterodimer 提交 2007-08-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–270（270 aa）片段：residues 42-175	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.9；293 K；0.95M KNa tartrate, 0.1M MES, 10mM DTT, pH 5.9, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.269
4MQV Crystal complex of Rpa32c and Smarcal1 N-terminus 提交 2013-09-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 202–270（69 aa）片段：C-Terminal domain, UNP residues 202-270	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；298 K；25% PEG 4000, 0.2M Sodium Acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 1.95 Å R-free 0.220
4MQV Crystal complex of Rpa32c and Smarcal1 N-terminus 提交 2013-09-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 202–270（69 aa）片段：C-Terminal domain, UNP residues 202-270	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；298 K；25% PEG 4000, 0.2M Sodium Acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 1.95 Å R-free 0.220
4OU0 Crystal Structure of RPA32C 提交 2014-02-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 202–270（69 aa）片段：UNP RESIDUES 202-270	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；294 K；50 mM Sodium Acetate, 20% PEG 3350, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 1.40 Å R-free 0.238
8RK2 Human Replication protein A (RPA; trimeric core) - ssDNA complex 提交 2023-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–270（270 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9MJ5 Catalytic domain of human DNA polymerase alpha in complex with DNA and RPA 提交 2024-12-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 B 35–270（236 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 O 1–270（270 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9PD4 NER dual incision complex - DuIM 提交 2025-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 O 1–270（270 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 13 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RFA2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–132； UniProt 41–172 作者链 D； PDB构建体 1–132； UniProt 41–172

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3kdf
沉积日期 deposition_date	2009-10-22
结构标题 title	X-ray Crystal Structure of the Human Replication Protein A Complex from Wheat Germ Cell Free Expression
关键词 keywords	;Wheat germ cell free, protein complex, Center for Eukaryotic Structural Genomics, PSI, replication protein A, Homo sapiens, Protein Structure Initiative, CESG, Acetylation, Alternative splicing, DNA replication, Nucleus, Phosphoprotein, Polymorphism, REPLICATION ;; REPLICATION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	26.48 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	25.83 Å
零角强度 I(0) i0	46842600.00
分子量 molecular_weight	53876.0 kDa
排除体积 excluded_volume	67500 Å³
包络体积 envelope_volume	81515 Å³
水化壳体积 shell_volume	26742 Å³
包络直径 envelope_diameter	89.4 Å
壳层 Rg shell_rg	32.62 Å
包络 Rg envelope_rg	26.09 Å
形状 Rg shape_rg	25.82 Å
总 Rg total_rg	26.60 Å
总原子数 total_atoms	3712
残基数 n_residues	450
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	85.4 Å
Rg (实空间) rg_real	26.49 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.52 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.6840e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.6270e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	26.49 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	46840000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9000
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	27.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.301
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.529
角度范围 angular_range	— – 0.3000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	13360000.0000
实空间数据点数 n_real_points	61
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.918; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.966; Smooth: 0.975

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Replication protein A 14 kDa subunit
分子量 formula_weight	13774.1 kDa
突变 mutation	M1S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	4185

SVDMMDLPRSRINAGMLAQFIDKPVCFVGRLEKIHPTGKMFILSDGEGKNGTIELMEPLDEEISGIVEVVGRVTAKATILCTSYVQFKEDSHPFDLGLYNEAVKIIHDFPQFYPLGIVQHD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	cell-free synthesis

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Replication protein A 32 kDa subunit
分子量 formula_weight	14982.4 kDa
突变 mutation	A41S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,B

SRAQHIVPCTISQLLSATLVDEVFRIGNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDTSSENTVVPPETYVKVAGHLRSFQNKKSLVAFKIMPLEDMNEFTTHILEVINAHMVLSKA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	cell-free synthesis

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	258

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d3kdfa_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.4 — Nucleic acid-binding proteins
家族 Family family	b.40.4.3 — Single strand DNA-binding domain, SSB

结构域编号 domain_id	d3kdfb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.4 — Nucleic acid-binding proteins
家族 Family family	b.40.4.3 — Single strand DNA-binding domain, SSB

结构域编号 domain_id	d3kdfc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.4 — Nucleic acid-binding proteins
家族 Family family	b.40.4.3 — Single strand DNA-binding domain, SSB

结构域编号 domain_id	d3kdfd_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.4 — Nucleic acid-binding proteins
家族 Family family	b.40.4.3 — Single strand DNA-binding domain, SSB

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	3kdfA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	3kdfB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	3kdfC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	3kdfD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	66.680 Å
晶胞边长 b length_b	77.700 Å
晶胞边长 c length_c	121.300 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.975 Å
最低分辨率 resolution_low	36.999 Å
R 因子 r_factor	0.1920
R_work r_work	0.1920
R_free r_free	0.2060

fit	/app/data/saxs_computation/kd/3kdf/3kdf.fit
pddf	/app/data/pr_computation/kd/3kdf/3kdf.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/kd/3kdf/3kdf.dat

X-ray Crystal Structure of the Human Replication Protein A Complex from Wheat Germ Cell Free Expression

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Replication protein A 14 kDa subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Replication protein A 32 kDa subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)