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3ldc

High resolution open MthK pore structure crystallized in 100 mM K+

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 49.4 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Calcium-gated potassium channel mthK

Methanothermobacter thermautotrophicus

UniProt O27564

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 18–99 片段：MthK K+ channel, residues 28-99 突变：S68H, V77C K POTASSIUM ION × 20 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；3.0-3.5 M 1,6-Hexandiol, 100 mM HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K 分辨率 1.45 Å R-free 0.202

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3LDC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1LNQ CRYSTAL STRUCTURE OF MTHK AT 3.3 A 提交 2002-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；PEGMME350, CaCl2, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.318
2AEF Crystal Structures of the MthK RCK Domain in Ca2+ bound form 提交 2005-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 107–336（230 aa） 片段：isoform Soluble
链 B 107–336（230 aa） 片段：isoform Soluble
未记录 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；PEG 4000, calcium chloride, Ammonium formate, sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.268
2AEJ Crystal Structures of the MthK RCK Domain in no Ca2+ bound form 提交 2005-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 107–336（230 aa） 片段：isoform Soluble
链 B 107–336（230 aa） 片段：isoform Soluble
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；PEG 4000, Ammonium formate, sodium acetate , pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
2AEM Crystal Structures of the MthK RCK Domain 提交 2005-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 107–336（230 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；PEG 400, Ammonium sulfate, cacodylate , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.263
2FY8 Crystal structure of MthK rck domain in its ligand-free gating-ring form 提交 2006-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 107–336（230 aa） 片段：soluble isoform, residues 107-336
链 B 107–336（230 aa） 片段：soluble isoform, residues 107-336
链 C 107–336（230 aa） 片段：soluble isoform, residues 107-336
链 D 107–336（230 aa） 片段：soluble isoform, residues 107-336
突变：D184N 突变：D184N 突变：D184N 突变：D184N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.6 M Na/K PO4, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.79 Å R-free 0.254
2FY8 Crystal structure of MthK rck domain in its ligand-free gating-ring form 提交 2006-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 107–336（230 aa） 片段：soluble isoform, residues 107-336
链 F 107–336（230 aa） 片段：soluble isoform, residues 107-336
链 G 107–336（230 aa） 片段：soluble isoform, residues 107-336
链 H 107–336（230 aa） 片段：soluble isoform, residues 107-336
突变：D184N 突变：D184N 突变：D184N 突变：D184N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.6 M Na/K PO4, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.79 Å R-free 0.254
2OGU Crystal structure of the isolated MthK RCK domain 提交 2007-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 107–336（230 aa） 片段：RCK domain: Residues 107-336
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；0.1M Sodium cacodylate pH 6.5, 1.3-1.5M Lithium sulfate, 2% Benzamidine-HCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.23 Å R-free 0.299
2OGU Crystal structure of the isolated MthK RCK domain 提交 2007-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 107–336（230 aa） 片段：RCK domain: Residues 107-336
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；0.1M Sodium cacodylate pH 6.5, 1.3-1.5M Lithium sulfate, 2% Benzamidine-HCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.23 Å R-free 0.299
3KXD Crystal structure of the mthk rck in complex with cadmium 提交 2009-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 116–336（221 aa） 片段：RCK DOMAIN
链 B 116–336（221 aa） 片段：RCK DOMAIN
未记录 CD CADMIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.7；318 K；1M NH4-FORMATE, 10% PEG 4000, 0.1M NA ACETATE, PH 4.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 318K
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
3LDD High resolution open MthK pore structure crystallized in 100 mM K+ and further soaked in 99 mM Na+/1 mM K+. 提交 2010-01-12 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 18–99（82 aa） 片段：MthK K+ channel, residues 28-99
突变：S68R, V77C K POTASSIUM ION × 20 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；3.0-3.5 M 1,6-Hexandiol, 100 mM HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.45 Å R-free 0.216
3LDE High resolution open MthK pore structure crystallized in 100 mM K+ and further soaked in 100 mM Na+. 提交 2010-01-12 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 18–99（82 aa） 片段：MthK K+ channel, residues 28-99
突变：S68H, V77C NA SODIUM ION × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；3.0-3.5 M 1,6-Hexandiol, 100 mM HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.21 Å R-free 0.208
3OUS MthK channel pore T59A mutant 提交 2010-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 18–99（82 aa）
突变：T59A K POTASSIUM ION × 20 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1M 1,6-hexanediol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.75 Å R-free 0.236
3R65 MthK channel pore E92Q mutant 提交 2011-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 18–99（82 aa） 片段：CALCIUM-GATED POTASSIUM CHANNEL MTHK PORE (UNP Residues 18-99)
突变：E92Q K POTASSIUM ION × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；3.0-3.5 M 1,6-Hexandiol, 100 mM MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
3RBX MthK RCK domain D184N mutant, Ca2+-bound 提交 2011-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 107–336（230 aa） 片段：unp residues 107-336
链 B 107–336（230 aa） 片段：unp residues 107-336
突变：D184N 突变：D184N CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；20% PEG 3350, 0.1 M CaCl2, 0.1 M MES, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K, pH 5.7
分辨率 2.80 Å R-free 0.274
3RBX MthK RCK domain D184N mutant, Ca2+-bound 提交 2011-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 107–336（230 aa） 片段：unp residues 107-336
链 D 107–336（230 aa） 片段：unp residues 107-336
突变：D184N 突变：D184N CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；20% PEG 3350, 0.1 M CaCl2, 0.1 M MES, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K, pH 5.7
分辨率 2.80 Å R-free 0.274
3RBX MthK RCK domain D184N mutant, Ca2+-bound 提交 2011-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 107–336（230 aa） 片段：unp residues 107-336
链 F 107–336（230 aa） 片段：unp residues 107-336
突变：D184N 突变：D184N CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；20% PEG 3350, 0.1 M CaCl2, 0.1 M MES, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K, pH 5.7
分辨率 2.80 Å R-free 0.274
3RBZ MthK channel, Ca2+-bound 提交 2011-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
突变：G85A, E92A, E96T, M107I 突变：G85A, E92A, E96T, M107I 突变：G85A, E92A, E96T, M107I 突变：G85A, E92A, E96T, M107I CA CALCIUM ION × 24 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；26% PEG 350-MME, 0.2 M CaCl2, 0.1 M MES, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K, pH 6.5
分辨率 3.40 Å R-free 0.288
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 J 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 K 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 L 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 13 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 M 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 14 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 N 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 15 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 O 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 16 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4EI2 Crystal Structures of MthK RCK gating ring bound to Barium 提交 2012-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 I 107–336（230 aa） 片段：residues 115-336
未记录 BA BARIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；28% polyethylene glycol (PEG) 300, 100 mM BaCl2, 100 mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295 K
分辨率 3.11 Å R-free 0.242
4HYO Crystal Structure of MthK Pore 提交 2012-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
链 B 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
链 C 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
链 D 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
突变：S68H, V77C 突变：S68H, V77C 突变：S68H, V77C 突变：S68H, V77C K POTASSIUM ION × 4 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；3.5-4.0M 1,6-hexanediol, 100mM MES , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.65 Å R-free 0.181
4HYO Crystal Structure of MthK Pore 提交 2012-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
链 F 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
链 G 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
链 H 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
突变：S68H, V77C 突变：S68H, V77C 突变：S68H, V77C 突变：S68H, V77C K POTASSIUM ION × 4 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；3.5-4.0M 1,6-hexanediol, 100mM MES , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.65 Å R-free 0.181
4HZ3 MthK pore crystallized in presence of TBSb 提交 2012-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
链 B 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
链 C 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
链 D 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
突变：S68H, V77C 突变：S68H, V77C 突变：S68H, V77C 突变：S68H, V77C K POTASSIUM ION × 4 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；3.5 4.0M 1,6-hexanediol, 100mM MES, 10mM TBSb , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.192
4HZ3 MthK pore crystallized in presence of TBSb 提交 2012-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
链 F 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
链 G 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
链 H 11–101（91 aa） 片段：unp residues 11-101
突变：S68H, V77C 突变：S68H, V77C 突变：S68H, V77C 突变：S68H, V77C K POTASSIUM ION × 4 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；3.5 4.0M 1,6-hexanediol, 100mM MES, 10mM TBSb , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.192
4L73 Ca2+-bound MthK RCK domain at 2.5 Angstrom 提交 2013-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
链 B 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
未记录 CA CALCIUM ION × 5 NA SODIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；12% PEG4000, 1 M ammonium formate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.8, 1 M calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.50 Å R-free 0.226
4L74 Ca2+-bound MthK RCK domain at 1.9 Angstrom with single ligand 提交 2013-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
链 B 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
未记录 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；6% PEG4000, 1 M ammonium formate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.8, 0.2 M calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.84 Å R-free 0.253
4L75 Ca2+-bound D184N mutant MthK RCK domain at 2.4 Angstrom 提交 2013-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
链 B 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
突变：D184N 突变：D184N CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；7% PEG4000, 1 M ammonium formate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.8, 0.3 M calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.39 Å R-free 0.245
4L75 Ca2+-bound D184N mutant MthK RCK domain at 2.4 Angstrom 提交 2013-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
链 D 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
突变：D184N 突变：D184N CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；7% PEG4000, 1 M ammonium formate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.8, 0.3 M calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.39 Å R-free 0.245
4L75 Ca2+-bound D184N mutant MthK RCK domain at 2.4 Angstrom 提交 2013-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
链 F 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
突变：D184N 突变：D184N CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；7% PEG4000, 1 M ammonium formate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.8, 0.3 M calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.39 Å R-free 0.245
4L76 Ca2+-bound E212Q mutant MthK RCK domain 提交 2013-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
链 B 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
突变：E212Q 突变：E212Q CA CALCIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；8% PEG4000, 1 M ammonium formate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.8, 0.2 M calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.99 Å R-free 0.263
4L76 Ca2+-bound E212Q mutant MthK RCK domain 提交 2013-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
链 D 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
突变：E212Q 突变：E212Q CA CALCIUM ION × 5 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；8% PEG4000, 1 M ammonium formate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.8, 0.2 M calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.99 Å R-free 0.263
4L76 Ca2+-bound E212Q mutant MthK RCK domain 提交 2013-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
链 F 107–336（230 aa） 片段：RCK domain (UNP residues 107-336)
突变：E212Q 突变：E212Q CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；8% PEG4000, 1 M ammonium formate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.8, 0.2 M calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.99 Å R-free 0.263
4QE7 Open MthK pore structure soaked in 10 mM Ba2+/100 mM Na+ 提交 2014-05-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 19–99（81 aa） 片段：UNP residues 19-99
突变：S68H, V77C BA BARIUM ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；3.0-3.5M 1,6-Hexandiol, 100mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.265
4QE9 Open MthK pore structure soaked in 10 mM Ba2+/100 mM K+ 提交 2014-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 18–100（83 aa） 片段：UNP residues 18-100
突变：S51H, V60C K POTASSIUM ION × 24 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；3.0-3.5M 1,6-Hexandiol, 100mM HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.15 Å R-free 0.257
4RO0 Crystal structure of MthK gating ring in a ligand-free form 提交 2014-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 B 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 C 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 D 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 a 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 b 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 c 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 d 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.4 M KCl, 0.1 M Tris and 20-25% PEGMME 350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.18 Å R-free 0.301
4RO0 Crystal structure of MthK gating ring in a ligand-free form 提交 2014-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 F 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 G 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 H 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 e 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 f 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 g 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 h 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.4 M KCl, 0.1 M Tris and 20-25% PEGMME 350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.18 Å R-free 0.301
4RO0 Crystal structure of MthK gating ring in a ligand-free form 提交 2014-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 I 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 J 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 K 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 L 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 i 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 j 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 k 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 l 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.4 M KCl, 0.1 M Tris and 20-25% PEGMME 350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.18 Å R-free 0.301
4RO0 Crystal structure of MthK gating ring in a ligand-free form 提交 2014-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 M 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 N 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 O 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 P 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 m 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 n 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 o 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 p 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.4 M KCl, 0.1 M Tris and 20-25% PEGMME 350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.18 Å R-free 0.301
4RO0 Crystal structure of MthK gating ring in a ligand-free form 提交 2014-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 Q 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 R 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 S 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 T 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 q 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 r 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 s 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
链 t 107–336（230 aa） 片段：MthK RCK, UNP residues 107-336
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.4 M KCl, 0.1 M Tris and 20-25% PEGMME 350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.18 Å R-free 0.301
5BKI Blocker-free closed MthK channel in nanodisc 提交 2021-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 12 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 K POTASSIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
5BKJ TPeA-bound closed MthK channel in nanodisc 提交 2021-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 K POTASSIUM ION × 2 YQ1 1-(tripentyl-$l^{4}-azanyl)pentane × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
5BKK bbTBA-bound closed MthK channel in nanodisc 提交 2021-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 K POTASSIUM ION × 3 YQ4 (~{R})-phenyl-[4-[(tributyl-$l^{4}-azanyl)methyl]phenyl]methanol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6OLY Full-length MthK channel at 3.1 angstrom resolution 提交 2019-04-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
突变：M107I 突变：M107I 突变：M107I 突变：M107I CA CALCIUM ION × 24 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；28% PEG350-MME, 0.1M MES pH 6.5, 0.2 M CaCl2
分辨率 3.11 Å R-free 0.275
6U5N Calcium-bound MthK gating ring state 2 提交 2019-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting for 2 seconds (blot force 0)
分辨率 3.20 Å
6U5P Calcium-bound MthK gating ring state 1 提交 2019-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting for 2 seconds (blot force 0)
分辨率 3.30 Å
6U5R Calcium-bound MthK closed state 提交 2019-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting for 2 seconds (blot force 0)
分辨率 3.60 Å
6U68 Calcium-bound MthK open-inactivated state 1 提交 2019-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting for 2 s (blot force 0)
分辨率 4.50 Å
6U6D MthK closed state with EDTA 提交 2019-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting for 2 s (blot force 0)
分辨率 3.60 Å
6U6E Calcium-bound MthK open-inactivated state 2 提交 2019-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.30 Å
6U6H Calcium-bound MthK open-inactivated state 3 提交 2019-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
6U9P Wild-type MthK pore in ~150 mM K+ 提交 2019-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 18–99（82 aa） 片段：UNP residues 18-99
未记录 K POTASSIUM ION × 20 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；1:1 protein (in 100 mM potassium chloride, 10 mM MOPS-KOH, pH 8.0) + 3.5-4.0 M 1,6-hexanediol, 100 mM MES-KOH, pH 6.75
分辨率 1.65 Å R-free 0.207
6U9T Wild-type MthK pore in 50 mM K+ 提交 2019-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 18–99（82 aa） 片段：UNP residues 18-99
未记录 K POTASSIUM ION × 20 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；1:1 protein (in 100 mM sodium chloride, 1 mM potassium chloride, 10 mM MOPS, pH 8.0) + 3.5-4.0 M 1,6-hexanediol, 100 mM MES-NaOH, pH 6.75
分辨率 1.55 Å R-free 0.210
6U9Y Wild-type MthK pore in 11 mM K+ 提交 2019-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 18–99（82 aa） 片段：UNP residues 18-99
突变：UNP residues 18-99 K POTASSIUM ION × 20 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；1:1 protein (in 100 mM sodium chloride, 1 mM potassium chloride, 10 mM MOPS, pH 8.0) + 3.5-4.0 M 1,6-hexanediol, 100 mM MES-NaOH, 10 mM potassium chloride
分辨率 1.80 Å R-free 0.217
6U9Z Wild-type MthK pore in 6 mM K+ 提交 2019-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 18–99（82 aa） 片段：UNP residues 18-99
未记录 K POTASSIUM ION × 20 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；protein (in 100 mM sodium chloride, 1 mM potassium chloride, 10 mM MOPS) + 3.5-4.0 M 1,6-hexanediol, 100 mM MES-NaOH, pH 6.75, 5 mM potassium chloride
分辨率 1.95 Å R-free 0.226
6UWN MthK N-terminal truncation RCK domain state 1 bound with calcium 提交 2019-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6UX4 MthK N-terminal truncation RCK domain state 2 bound with calcium 提交 2019-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6UX7 MthK N-terminal truncation state 1 bound with calcium 提交 2019-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6UXA MthK N-terminal truncation state 2 bound with calcium 提交 2019-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6UXB MthK N-terminal truncation state 3 bound with calcium 提交 2019-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
8DJB MthK-A90L mutant in closed state with 0 Ca2+ 提交 2022-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BLOTTING FOR 2 S (BLOT FORCE 1)
分辨率 3.18 Å
8FZ7 TpeA bound closed MthK-A88F mutant in nanodisc 提交 2023-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 YQ1 1-(tripentyl-$l^{4}-azanyl)pentane × 1 K POTASSIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BLOTTING FOR 2 S (BLOT FORCE 0)
分辨率 2.88 Å
9Z2M Ca2+-bound MthK WT in lipid nanodiscs composed of 14:1PC (75%) and POPG (25%) 提交 2025-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5；20 mM HEPES-KOH pH 8.5 100 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9Z2V Ca2+-bound MthK WT in lipid nanodiscs composed of 22:1PC (75%) and POPG (25%) 提交 2025-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–336（336 aa）
链 B 1–336（336 aa）
链 C 1–336（336 aa）
链 D 1–336（336 aa）
链 E 1–336（336 aa）
链 F 1–336（336 aa）
链 G 1–336（336 aa）
链 H 1–336（336 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5；20 mM HEPES-KOH pH 8.5 100 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å

共 47 个其他 PDB 条目、76 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MTHK_METTH
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–82； UniProt 18–99

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 3ldc

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 3ldc
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3ldc
沉积日期 deposition_date2010-01-12
结构标题 titleHigh resolution open MthK pore structure crystallized in 100 mM K+
关键词 keywords;transmembrane, ion channel, open conformation, potassium, ion transport, Alternative initiation, Cell membrane, Ionic channel, Membrane, Metal-binding, Potassium transport, TRANSPORT PROTEIN ;; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier14.20 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron13.43 Å
零角强度 I(0) i01244440.00
分子量 molecular_weight9206.0 kDa
排除体积 excluded_volume12228 ų
包络体积 envelope_volume13097 ų
水化壳体积 shell_volume8959 ų
包络直径 envelope_diameter48.7 Å
壳层 Rg shell_rg18.04 Å
包络 Rg envelope_rg13.78 Å
形状 Rg shape_rg13.38 Å
总 Rg total_rg14.89 Å
总原子数 total_atoms645
残基数 n_residues82
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax49.4 Å
Rg (实空间) rg_real14.31 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.37 Å
I(0) (实空间) i0_real1.2440e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2750e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal14.30 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1244000.0000
解质量估计 total_estimate0.8263
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary14.4 Å
偏度 Skewness skewness0.469
峰度 Kurtosis kurtosis-0.282
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha152300.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.657; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.801; Smooth: 0.965
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id3ldcA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 —
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)